# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh12074.fasta.huge -Q ../query/KIAA0778.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0778, 1049 aa vs ./tmplib.23663 library 1986456 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.7012+/-0.0052; mu= 24.1020+/- 0.354 mean_var=85.6160+/-20.100, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 148 in 1/39 Lambda= 0.138611 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1347 ( 918 res) fj00739 ( 918) 519 114.6 6.1e-26 KIAA0703 ( 1051 res) hg02861(revised) (1051) 515 113.9 1.1e-25 KIAA1825 ( 1203 res) fj04975 (1203) 166 44.2 0.00012 KIAA0956 ( 672 res) hj05590 ( 672) 146 39.8 0.0015 KIAA0611 ( 912 res) hg00483 ( 912) 139 38.6 0.0046 >>KIAA1347 ( 918 res) fj00739 (918 aa) initn: 1119 init1: 471 opt: 519 Z-score: 557.6 bits: 114.6 E(): 6.1e-26 Smith-Waterman score: 1300; 32.193% identity (63.679% similar) in 848 aa overlap (72-906:27-804) 50 60 70 80 90 100 KIAA07 ATTAENGGGKKKQKEKELDELKKEVAMDDHKLSLDELGRKYQVDLSKGLTNQRAQDVLAR .: ..:.. :.::..::.. ... : KIAA13 RLHVFKKIPNGENETMIPVLTSKKASELPVSEVASILQADLQNGLNKCEVSHRRAF 10 20 30 40 50 110 120 130 140 150 160 KIAA07 DGPNALTPPPTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAAMEDEPSNDNLYLGV : : . : : :. :. . . .:: .:.. : . .. :. .. KIAA13 HGWNEFDISEDEPLWKKYISQFKNPLIMLLLASAVISVLMHQFDDAV-----------SI 60 70 80 90 100 170 180 190 200 210 220 KIAA07 VLAAVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMDSFKNMVPQQALVIREGEKMQINAEEVVVGDLVEVK ..: ...:: .. :: .: : .. ....:: . .:::. . :...: :: : .. KIAA13 TVAILIVVT--VAFVQEYRSEKSLEELSKLVPPECHCVREGKLEHTLARDLVPGDTVCLS 110 120 130 140 150 160 230 240 250 260 270 KIAA07 GGDRVPADLRIISSHGCKVDNSSLTGESEPQTR--SPEFTHEN-PLETR-NICFFSTNCV :::::::::.. . ..:.::::::. : .. .:. . : : .: :: :..: KIAA13 VGDRVPADLRLFEAVDLSIDESSLTGETTPCSKVTAPQPAATNGDLASRSNIAFMGTLVR 170 180 190 200 210 220 280 290 300 310 320 330 KIAA07 EGTARGIVIATGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAMEIEHFIQLITGVAV-FLGVSFFVL : :.:.::.::. . .:.. . .. :. .::. .. . . .. . ..:. ..: KIAA13 CGKAKGVVIGTGENSEFGEVFKMMQAEEAPKTPLQKSMDLLGKQLSFYSFGIIGIIMLV- 230 240 250 260 270 280 340 350 360 370 380 390 KIAA07 SLILGYSWLEAVIFLIGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGS . .:: . :: . ... :: .:::: .::: :.: . ::..: .::.: ::::: KIAA13 GWLLGKDILEMFTISVSLAVAAIPEGLPIVVTVTLALGVMRMVKKRAIVKKLPIVETLGC 290 300 310 320 330 340 400 410 420 430 440 450 KIAA07 TSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGATFDKRSPTWTALSRIAGLCN ..::::::::::.:.:::.:.. .. .: :..: :. ... . . . . . :. : KIAA13 CNVICSDKTGTLTKNEMTVTHIFTSDGLH-AEVT----GVGYNQFGEVIVDGDVVHGFYN 350 360 370 380 390 460 470 480 490 500 510 KIAA07 RAVFK---AGQE-NISVSKRDT-AGDASESALLKCIELSCGSVRKMRDRNPKVAEIPFNS :: . :: : .: . .: : .:.::. . .. : ..: : :: ::.: KIAA13 PAVSRIVEAGCVCNDAVIRNNTLMGKPTEGALIA-LAMKMGLDGLQQDYIRK-AEYPFSS 400 410 420 430 440 450 520 530 540 550 560 KIAA07 TNKYQL--SIHE-REDSPQSHVLVMKGAPERILDRCSTILVQGKEIPLDKEMQDAFQNAY .:.. .:. ..: :. . :::: :... :.: .:. . : ....:..:. KIAA13 EQKWMAVKCVHRTQQDRPE--ICFMKGAYEQVIKYCTTYQSKGQTLTLTQQQRDVYQQEK 460 470 480 490 500 510 570 580 590 600 610 620 KIAA07 MELGGLGERVLGFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNFPTEKLCFVGLMSMIDPPRAAVPDA ..:. : :::. : :: : ::. .: :.::...:::::..: .: KIAA13 ARMGSAGLRVLA-----LASG--P--------ELG----QLTFLGLVGIIDPPRTGVKEA 520 530 540 550 630 640 650 660 670 680 KIAA07 VGKCRSAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPMSQVNPREAKA : ..:... :.::: :: :::. .:. :. ...: KIAA13 VTTLIASGVSIKMITGDSQETAVAIASRLGLYSKTSQSVS-------------------- 560 570 580 590 690 700 710 720 730 740 KIAA07 CVVHGSDLKDMTSEQLDEILKNHTEIVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVNDS : .. : .::..:. . :: :.::..:. :... :..:..::.:::::::. KIAA13 ----GEEIDAMDVQQLSQIVPK--VAVFYRASPRHKMKIIKSLQKNGSVVAMTGDGVNDA 600 610 620 630 640 750 760 770 780 790 800 KIAA07 PALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLTS ::: ::::.::: .:.:: :.::::::.::.: .:....:::. :..:.:. . . :.. KIAA13 VALKAADIGVAMGQTGTDVCKEAADMILVDDDFQTIMSAIEEGKGIYNNIKNFVRFQLST 650 660 670 680 690 700 810 820 830 840 850 860 KIAA07 NIPEITPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNSQTD .: .: . : . :.: ::... :: :.. : :: ::. : ...:.... ::: . . KIAA13 SIAALTLISLATLMNFPNPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDVIRKPPRNWKDS 710 720 730 740 750 760 870 880 890 900 910 920 KIAA07 KLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIRLDWDDRTMNDLEDSY :... .... ..: : . : .:... : .: . : KIAA13 ILTKNLILKILVSSI--IIVCGTLFVFWRELRDNVITPRDTTMTFTCFVFFDMFNALSSR 770 780 790 800 810 820 930 940 950 960 970 980 KIAA07 GQEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLLEET KIAA13 SQTKSVFEIGLCSNRMFCYAVLGSIMGQLLVIYFPPLQKVFQTESLSILDLLFLLGLTSS 830 840 850 860 870 880 >>KIAA0703 ( 1051 res) hg02861(revised) (1051 aa) initn: 1202 init1: 468 opt: 515 Z-score: 552.7 bits: 113.9 E(): 1.1e-25 Smith-Waterman score: 1209; 32.781% identity (61.065% similar) in 845 aa overlap (82-902:174-936) 60 70 80 90 100 110 KIAA07 KKQKEKELDELKKEVAMDDHKLSLDELGRKYQVDLSKGLTN-QRAQDVLARDGPNALTPP .:::: ::.. . .: ::. : : .. KIAA07 MEAAAFQSGSLYPVASFLAAPMSELVPDLSFQVDLHTGLSEFSVTQRRLAH-GWNEFVAD 150 160 170 180 190 200 120 130 140 150 160 170 KIAA07 PTTPEWVKFCRQLFGGFSILLWIGAILCFLAYGIQAAMEDEPSNDNLYLGVVLAAVVIVT . : : :. : : . ::: .:. : . . .:: : .. :..:.:: KIAA07 NSEPVWKKYLDQ-FKNPLILLLLGSALVSV---LTKEYEDAVS-------IATAVLVVVT 210 220 230 240 250 180 190 200 210 220 230 KIAA07 GCFSYYQEAKSSKIMDSFKNMVPQQALVIREGEKMQINAEEVVVGDLVEVKGGDRVPADL .. :: .: : .. . ..:: . .:::. ... :.:.: ::.: .. :::.:::. KIAA07 --VAFIQEYRSEKSLEELTKLVPPECNCLREGKLQHLLARELVPGDVVSLSIGDRIPADI 260 270 280 290 300 240 250 260 270 280 KIAA07 RIISSHGCKVDNSSLTGESEP--QTRSPEFTHENPLET-RNICFFSTNCVEGTARGIVIA :. ::.::.:::.:: .: :: .: . : : :: :..: : ..:.::. KIAA07 RLTEVTDLLVDESSFTGEAEPCSKTDSP-LTGGGDLTTLSNIVFMGTLVQYGRGQGVVIG 310 320 330 340 350 360 290 300 310 320 330 340 KIAA07 TGDRTVMGRIATLASGLEVGRTPIAMEIEHFIQLITGVAVFLGVSFFVLSLILGYSWLEA ::. . .:.. . .. :. .::. .... . .: .: :: ...::. .: .. KIAA07 TGESSQFGEVFKMMQAEETPKTPLQKSMDRLGKQLT---LF---SFGIIGLIMLIGWSQG 370 380 390 400 410 420 350 360 370 380 390 400 KIAA07 ----VIFLIGI--IVANVPEGLLATVTVCLTLTAKRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTIC .: ::. :: .:::: .: : :.: . :::.: .::.: ::::: :..: KIAA07 KQLLSMFTIGVSLAVAAIPEGLPIVVMVTLVLGVLRMAKKRVIVKKLPIVETLGCCSVLC 430 440 450 460 470 480 410 420 430 440 450 KIAA07 SDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSGATFDKRS-----PTWTALSRIAGLCN :::::::: :.:::... .. .. . ::. .: .. :. ........ KIAA07 SDKTGTLTANEMTVTQLVTSDGLRA-----EVSGVGYDGQGTVCLLPSKEVIKEFSNVSV 490 500 510 520 530 460 470 480 490 500 510 KIAA07 RAVFKAG--QENISVSKRDTAGDASESALLK-CIELSCGSVRKMRDRNPKVAEIPFNSTN . .:: .: . : . :. .:.::. .... ..... :. ::::.: . KIAA07 GKLVEAGCVANNAVIRKNAVMGQPTEGALMALAMKMDLSDIKNSYIRKK---EIPFSSEQ 540 550 560 570 580 590 520 530 540 550 560 570 KIAA07 KYQLSIHEREDSPQSHVLVMKGAPERILDRCSTILVQGKEIPLDKEMQDAFQNAYMELGG :.. . : . :::: :... :. : .:: .... . ..:. KIAA07 KWMAVKCSLKTEDQEDIYFMKGALEEVIRYCTMYNNGGIPLPLTPQQRSFCLQEEKRMGS 600 610 620 630 640 650 580 590 600 610 620 630 KIAA07 LGERVLGFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNFPTEKLCFVGLMSMIDPPRAAVPDAVGKCR :: :::. : :: : ::. .: :.::...:::::..: .:: KIAA07 LGLRVLA-----LASG--P--------ELG----RLTFLGLVGIIDPPRVGVKEAVQVLS 660 670 680 690 640 650 660 670 680 690 KIAA07 SAGIKVIMVTGDHPITAKAIAKGVGIISEGNETVEDIAARLNIPMSQVNPREAKACVVHG .:..: :.::: :: ::....:. : . KIAA07 ESGVSVKMITGDALETALAIGRNIGL-----------------------------C---N 700 710 720 700 710 720 730 740 KIAA07 SDLKDMTSEQLDEILKNHTE------IVFARTSPQQKLIIVEGCQRQGAIVAVTGDGVND . :. :..:..: . :.. :: ::::..:: :... :..:::::.::::::: KIAA07 GKLQAMSGEEVDSVEKGELADRVGKVSVFFRTSPKHKLKIIKALQESGAIVAMTGDGVND 730 740 750 760 770 780 750 760 770 780 790 800 KIAA07 SPALKKADIGIAMGISGSDVSKQAADMILLDDNFASIVTGVEEGRLIFDNLKKSIAYTLT . :::.:::::::: .:.::::.::.:::.::.:..:...::::. :: :.:. . . :. KIAA07 AVALKSADIGIAMGQTGTDVSKEAANMILVDDDFSAIMNAVEEGKGIFYNIKNFVRFQLS 790 800 810 820 830 840 810 820 830 840 850 860 KIAA07 SNIPEITPFLLFIIANIPLPLGTVTILCIDLGTDMVPAISLAYEAAESDIMKRQPRNSQT ..: .. . : . :.: ::... :: :.. : :: ::. : ...: ... :: : KIAA07 TSISALSLITLSTVFNLPSPLNAMQILWINIIMDGPPAQSLGVEPVDKDAFRQPPR-SVR 850 860 870 880 890 900 870 880 890 900 910 920 KIAA07 DKLVNERLISMAYGQIGMIQALGGFFTYFVILAENGFLPSRLLGIRLDWDDRTMNDLEDS : .... :: . ..: . : .: .. . :. KIAA07 DTILSRALILKILMSAAIIIS-GTLFIFWKEMPEDRASTPRTTTMTFTCFVFFDLFNALT 910 920 930 940 950 960 930 940 950 960 970 980 KIAA07 YGQEWTYEQRKVVEFTCHTAFFASIVVVQWADLIICKTRRNSVFQQGMKNKILIFGLLEE KIAA07 CRSQTKLIFEIGFLRNHMFLYSVLGSILGQLAVIYIPPLQRVFQTENLGALDLLFLTGLA 970 980 990 1000 1010 1020 >>KIAA1825 ( 1203 res) fj04975 (1203 aa) initn: 319 init1: 149 opt: 166 Z-score: 175.0 bits: 44.2 E(): 0.00012 Smith-Waterman score: 382; 22.880% identity (53.440% similar) in 625 aa overlap (193-760:297-880) 170 180 190 200 210 220 KIAA07 LAAVVIVTGCFSYYQEAKSSKIMDSFKNMVPQQALVIREGEKMQINAEEVVVGDLVEVKG :.. : : . : ..:.: ::.: . KIAA18 FTLSMLVAFEASLVQQQMRNMSEIRKMGNKPHMIQVYRSRKWRPIASDEIVPGDIVSIGR 270 280 290 300 310 320 230 240 250 260 270 KIAA07 GDR---VPADLRIISSHGCKVDNSSLTGESEPQTRSP--EFTHENPLETR-----NICFF . . :: :. .. .. : ::.. ::::: :: . : ... . :. . .. : KIAA18 SPQENLVPCDVLLLRGR-CIVDEAMLTGESVPQMKEPIEDLSPDRVLDLQADSRLHVIFG 330 340 350 360 370 380 280 290 300 310 320 KIAA07 STNCVEGTARGIVIATGDRTV-MGRIA-TLASGLEVGRTPIAMEIEHFIQLITG--VAVF .:. :. . .:: . : : .: .: .:..... . : .. .:. . .: KIAA18 GTKVVQHIPPQKA-TTGLKPVDSGCVAYVLRTGFNTSQGKLLRTILFGVKRVTANNLETF 390 400 410 420 430 440 330 340 350 360 370 KIAA07 LGVSFFVLSLILG--YSWLEAV---------IFL--IGIIVANVPEGLLATVTVCLTLTA . . :... : . : :.:.. .:: :... :: : ... .. . KIAA18 IFILFLLVFAIAAAAYVWIEGTKDPSRNRYKLFLECTLILTSVVPPELPIELSLAVNTSL 450 460 470 480 490 500 380 390 400 410 420 430 KIAA07 KRMARKNCLVKNLEAVETLGSTSTICSDKTGTLTQNRMTVAHMWFDNQIHEADTTEDQSG .:. . . :.. . : :::::::.. ..: : KIAA18 IALAKLYMYCTEPFRIPFAGKVEVCCFDKTGTLTSDSLVV------------------RG 510 520 530 540 440 450 460 470 480 490 KIAA07 ATFDKRSPTWTALSRIAGLCNRAVFKAGQENISVSKRDTAGDASESALLKCIELSCGSVR .. . . : .: : .::. . . .... .:: :.:.: .. . . . KIAA18 VAGLRDGKEVTPVSSIPVETHRAL-ASCHSLMQLDDGTLVGDPLEKAMLTAVDWTLTKDE 550 560 570 580 590 600 500 510 520 530 540 KIAA07 KMRDRNPKVAEIP------FNSTNKYQ--LSIHEREDSPQ-SHVLVMKGAPERILDRCST :. :. :. . : :. : . :. .:. : . .. ..::::: . . : KIAA18 KVFPRSIKTQGLKIHQRFHFASALKRMSVLASYEKLGSTDLCYIAAVKGAPETLHSMFS- 610 620 630 640 650 660 550 560 570 580 590 600 KIAA07 ILVQGKEIPLDKEMQDAFQNAYMELGGLGERVL--GFCQLNLPSGKFPRGFKFDTDELNF . : : ... . :.. : ::: :. .:. . . : : .. : . 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