# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk05261.fasta.nr -Q ../query/KIAA0776.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0776, 799 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7827030 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5845+/-0.000186; mu= 11.3090+/- 0.010 mean_var=84.6108+/-16.319, 0's: 42 Z-trim: 43 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.139432 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|183986040|gb|AAI66498.1| RGD1309308 protein [Ra ( 793) 4662 948.1 0 gi|124297897|gb|AAI32196.1| RIKEN cDNA 1810074P20 ( 793) 4646 944.9 0 gi|26328475|dbj|BAC27976.1| unnamed protein produc ( 793) 4634 942.5 0 gi|12841902|dbj|BAB25395.1| unnamed protein produc ( 793) 4631 941.9 0 gi|194381530|dbj|BAG58719.1| unnamed protein produ ( 729) 4615 938.6 0 gi|126310345|ref|XP_001367653.1| PREDICTED: hypoth ( 794) 4367 888.8 0 gi|123229910|emb|CAM19989.1| novel protein (181007 ( 713) 4107 836.5 0 gi|148673579|gb|EDL05526.1| RIKEN cDNA 1810074P20, ( 717) 4107 836.5 0 gi|157151710|ref|NP_001096671.1| hypothetical prot ( 789) 3897 794.2 0 gi|148673578|gb|EDL05525.1| RIKEN cDNA 1810074P20, ( 575) 3312 676.5 8.3e-192 gi|47208652|emb|CAF93798.1| unnamed protein produc ( 779) 3295 673.1 1.1e-190 gi|149045544|gb|EDL98544.1| similar to RIKEN cDNA ( 454) 2574 527.9 3.4e-147 gi|156221179|gb|EDO42037.1| predicted protein [Nem ( 790) 2289 470.8 9.4e-130 gi|26349957|dbj|BAC38618.1| unnamed protein produc ( 385) 2210 454.7 3.3e-125 gi|221046294|dbj|BAH14824.1| unnamed protein produ ( 301) 1905 393.2 8e-107 gi|190584965|gb|EDV25034.1| hypothetical protein T ( 780) 1825 377.4 1.2e-101 gi|26378830|dbj|BAC25404.1| unnamed protein produc ( 317) 1812 374.5 3.6e-101 gi|212509509|gb|EEB12878.1| conserved hypothetical ( 781) 1772 366.8 1.9e-98 gi|115957603|ref|XP_780358.2| PREDICTED: hypotheti ( 558) 1768 365.9 2.5e-98 gi|115961929|ref|XP_001196622.1| PREDICTED: hypoth (1315) 1768 366.1 5e-98 gi|108880970|gb|EAT45195.1| conserved hypothetical ( 777) 1715 355.3 5.3e-95 gi|193892479|gb|EDV91345.1| GH17388 [Drosophila gr ( 783) 1655 343.2 2.3e-91 gi|7298866|gb|AAF54073.1| CG1104, isoform A [Droso ( 782) 1625 337.2 1.5e-89 gi|167871357|gb|EDS34740.1| conserved hypothetical ( 785) 1621 336.4 2.6e-89 gi|193914972|gb|EDW13839.1| GI23931 [Drosophila mo ( 783) 1619 336.0 3.5e-89 gi|194133657|gb|EDW55173.1| GM10514 [Drosophila se ( 782) 1608 333.8 1.6e-88 gi|116123478|gb|EAA12385.3| AGAP007742-PA [Anophel ( 784) 1608 333.8 1.6e-88 gi|194198357|gb|EDX11933.1| GD19511 [Drosophila si ( 782) 1605 333.2 2.5e-88 gi|190650839|gb|EDV48094.1| GG10135 [Drosophila er ( 782) 1603 332.8 3.2e-88 gi|210086094|gb|EEA34527.1| hypothetical protein B ( 716) 1595 331.1 9.3e-88 gi|194151761|gb|EDW67195.1| GJ24026 [Drosophila vi ( 778) 1586 329.4 3.5e-87 gi|194182813|gb|EDW96424.1| GE25823 [Drosophila ya ( 784) 1565 325.1 6.5e-86 gi|190626259|gb|EDV41783.1| GF17327 [Drosophila an ( 784) 1560 324.1 1.3e-85 gi|215498820|gb|EEC08314.1| conserved hypothetical ( 791) 1522 316.5 2.6e-83 gi|23170622|gb|AAN13356.1| CG1104, isoform B [Dros ( 739) 1450 302.0 5.7e-79 gi|194166899|gb|EDW81800.1| GK12257 [Drosophila wi ( 785) 1426 297.2 1.7e-77 gi|54638953|gb|EAL28355.1| GA10722 [Drosophila pse ( 785) 1383 288.5 6.8e-75 gi|194112005|gb|EDW34048.1| GL22034 [Drosophila pe ( 785) 1377 287.3 1.6e-74 gi|156545525|ref|XP_001607207.1| PREDICTED: simila ( 766) 1339 279.7 3.1e-72 gi|221126040|ref|XP_002160620.1| PREDICTED: simila ( 710) 1208 253.3 2.5e-64 gi|210106759|gb|EEA54726.1| hypothetical protein B ( 702) 1085 228.5 7e-57 gi|193629576|ref|XP_001942970.1| PREDICTED: simila ( 763) 1075 226.6 3e-56 gi|157337390|emb|CAO21736.1| unnamed protein produ ( 820) 694 149.9 3.7e-33 gi|7799010|emb|CAB90949.1| putative protein [Arabi ( 804) 667 144.5 1.6e-31 gi|169659199|dbj|BAG12784.1| hypothetical protein ( 725) 632 137.4 1.9e-29 gi|187039105|emb|CAP21869.1| Hypothetical protein ( 735) 588 128.6 9e-27 gi|211967719|gb|EEB02915.1| hypothetical protein T ( 808) 576 126.2 5.2e-26 gi|221482504|gb|EEE20852.1| conserved hypothetical ( 778) 575 126.0 5.8e-26 gi|221504543|gb|EEE30216.1| conserved hypothetical ( 778) 574 125.8 6.6e-26 gi|162667824|gb|EDQ54444.1| predicted protein [Phy ( 814) 572 125.4 9.1e-26 >>gi|183986040|gb|AAI66498.1| RGD1309308 protein [Rattus (793 aa) initn: 3221 init1: 3142 opt: 4662 Z-score: 5065.4 bits: 948.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 4662; 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89.718% identity (97.746% similar) in 710 aa overlap (90-799:9-717) 60 70 80 90 100 110 KIAA07 EYITPAQISKEMRDELHVRGGRVNIVDLQQVINVDLIHIENRIGDIIKSEKHVQLVLGQL :::::: :::.:..::::::::::.::::: gi|148 ETSYMSEVVINVDLTHIESRVSDIIKSEKHVQMVLGQL 10 20 30 120 130 140 150 160 170 KIAA07 IDENYLDRLAEEVNDKLQESGQVTISELCKTYDLPGNFLTQALTQRLGRIISGHIDLDNR :::::::.:.::::::::::::::.:::::.:::::.::::::::::::::.::.::::: gi|148 IDENYLDQLSEEVNDKLQESGQVTVSELCKAYDLPGDFLTQALTQRLGRIINGHLDLDNR 40 50 60 70 80 90 180 190 200 210 220 230 KIAA07 GVIFTEAFVARHKARIRGLFSAITRPTAVNSLISKYGFQEQLLYSVLEELVNSGRLRGTV ::::::::::::::::::::::::::: ::::.:::::::::::::::.::..::::::: gi|148 GVIFTEAFVARHKARIRGLFSAITRPTPVNSLVSKYGFQEQLLYSVLEDLVSTGRLRGTV 100 110 120 130 140 150 240 250 260 270 280 290 KIAA07 VGGRQDKAVFVPDIYSRTQSTWVDSFFRQNGYLEFDALSRLGIPDAVSYIKKRYKTTQLL :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.:::: gi|148 VGGRQDKAVFVPDIYSRTQSTWVDSFFRQNGYLEFDALSRLGIPDAVNYIKKRYKNTQLL 160 170 180 190 200 210 300 310 320 330 340 350 KIAA07 FLKAACVGQGLVDQVEASVEEAISSGTWVDIAPLLPTSLSVEDAAILLQQVMRAFSKQAS ::::.::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::.::::::: :.: :: gi|148 FLKATCVGQGLVDQVEASVEEAISSGTWVDISPLLPSSLSVEDAAMLLQQVMRPFGKLAS 220 230 240 250 260 270 360 370 380 390 400 410 KIAA07 TVVFSDTVVVSEKFINDCTELFRELMHQKAEKEMKNNPVHLITEEDLKQISTLESVSTSK ..:::::::::::::.::: :: : :::::::::::::::::::::::::: ::::.::: gi|148 AIVFSDTVVVSEKFITDCTGLFSERMHQKAEKEMKNNPVHLITEEDLKQISILESVNTSK 280 290 300 310 320 330 420 430 440 450 460 470 KIAA07 KDKKDERRRKATEGSGSMRGGGGGNAREYKIKKVKKKGRKDDDSDDESQSSHTGKKKPEI ::::::::.::::::::.:::::::::::::::.:::::::.:::::::::: :::::.: gi|148 KDKKDERRKKATEGSGSVRGGGGGNAREYKIKKTKKKGRKDEDSDDESQSSHGGKKKPDI 340 350 360 370 380 390 480 490 500 510 520 530 KIAA07 SFMFQDEIEDFLRKHIQDAPEEFISELAEYLIKPLNKTYLEVVRSVFMSSTTSASGTGRK .::::::::: :::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::: :::::::: gi|148 TFMFQDEIEDCLRKHIQDAPEEFISELAEYLIKPLNKMYLEVVRSVFMSST-SASGTGRK 400 410 420 430 440 450 540 550 560 570 580 590 KIAA07 RTIKDLQEEVSNLYNNIRLFEKGMKFFADDTQAALTKHLLKSVCTDITNLIFNFLASDLM :::::::::::::::::::::::::.::::::.::::::::.::::::::.:::::::.. gi|148 RTIKDLQEEVSNLYNNIRLFEKGMKYFADDTQTALTKHLLKTVCTDITNLMFNFLASDFL 460 470 480 490 500 510 600 610 620 630 640 650 KIAA07 MAVDDPAAITSEIRKKILSKLSEETKVALTKLHNSLNEKSIEDFISCLDSAAEACDIMVK :::..::::::.:::::::::.::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::: gi|148 MAVEEPAAITSDIRKKILSKLTEETKVALTKLHNSLNEKSIEDFLSCLDSATEACDIMVK 520 530 540 550 560 570 660 670 680 690 700 710 KIAA07 RGDKKRERQILFQHRQALAEQLKVTEDPALILHLTSVLLFQFSTHSMLHAPGRCVPQIIA .::::::::::::::::: ::::::::::::::::.:::::.:::::::::::::::::: gi|148 KGDKKRERQILFQHRQALCEQLKVTEDPALILHLTAVLLFQLSTHSMLHAPGRCVPQIIA 580 590 600 610 620 630 720 730 740 750 760 770 KIAA07 FLNSKIPEDQHALLVKYQGLVVKQLVSQSKKTGQGDYPLNNELDKEQEDVASTTRKELQE ::.::::::::.::::::::::::::::.::::::. : ..::::::.::...::::::: gi|148 FLHSKIPEDQHTLLVKYQGLVVKQLVSQNKKTGQGEDPSSDELDKEQHDVTNATRKELQE 640 650 660 670 680 690 780 790 KIAA07 LSSSIKDLVLKSRKSSVTEE :: ::::::::::::::::: gi|148 LSLSIKDLVLKSRKSSVTEE 700 710 >>gi|157151710|ref|NP_001096671.1| hypothetical protein (789 aa) initn: 3927 init1: 3526 opt: 3897 Z-score: 4233.8 bits: 794.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 3897; 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