# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk05119.fasta.huge -Q ../query/KIAA0772.ptfa ./tmplib.23663 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA0772, 469 aa
 vs ./tmplib.23663 library

1987036 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.0434+/-0.00538; mu= 19.8547+/- 0.366
 mean_var=96.5149+/-22.836, 0's: 0 Z-trim: 5  B-trim: 52 in 1/39
 Lambda= 0.130550

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
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KIAA1664  ( 920 res)   fj04751s1                   ( 920)  707 143.8 4.6e-35
KIAA1451  ( 939 res)   bg00289                     ( 939)  455 96.3   9e-21
KIAA1534  ( 865 res)   fh03661(revised)            ( 865)  421 89.9 7.3e-19


>>KIAA0704  ( 919 res)   hg02921s2                        (919 aa)
 initn: 701 init1: 306 opt: 786  Z-score: 801.8  bits: 158.7 E(): 1.5e-39
Smith-Waterman score: 963;  38.356% identity (63.014% similar) in 438 aa overlap (24-459:522-903)

                      10        20        30        40        50   
KIAA07        RMNGEEEFFDAVTEANQKVTGMIDLDTSKNNRIGKTGERPSQENGIQKHRTSL
                                     :::. ... .: . .  : ... ...:: :
KIAA07 SPSSSENEISDDDSYVSDISDNLSLDNLSNDLDNERQT-LGPVLD--SGREAKSRRRTCL
             500       510       520        530         540        

            60        70        80        90       100       110   
KIAA07 PAPMFSRSDFSVWTILKKCVGLELSKITMPIAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHRASCQP
       :::  : :..:.:.::.. .: .:::..::. .::::. :::. : .:.  :. .:.  :
KIAA07 PAPCPSSSNISLWNILRNNIGKDLSKVAMPVELNEPLNTLQRLCEELEYSELLDKAAQIP
      550       560       570       580       590       600        

           120       130        140       150       160       170  
KIAA07 QPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTG-KPFNPLLGETYELIREDLGFRFISEQVSHHPPIS
       .:::::  :::::.:: ::.. :.: :::::.:::::: :::: ::.:.:::::::::::
KIAA07 SPLERMVYVAAFAISAYASSYYRAGSKPFNPVLGETYECIREDKGFQFFSEQVSHHPPIS
      610       620       630       640       650       660        

            180       190       200       210       220       230  
KIAA07 AFHSEGLNHDFLFHGSIYPKLKFWGKSVEAEPRGTITLELLKHNEAYTWTNPTCCVHNVI
       : :.:. :  :.:  ..  : ::::::.:  : ::  . :   .. . :.. : :.::..
KIAA07 ACHAESRN--FVFWQDVRWKNKFWGKSMEIVPIGTTHVTLPVFGDHFEWNKVTSCIHNIL
      670         680       690       700       710       720      

            240        250       260       270       280       290 
KIAA07 IGKLWIEQYGTVEILN-HRTGHKCVLHFKPCGLFGKELHKVEGHIQDKNKKKLFMIYGKW
        :. :::.:: . : : :  .  : ..:     .. . :..:: . :.. : .  ..:::
KIAA07 SGQRWIEHYGEIVIKNLHDDSCYCKVNFIKAKYWSTNAHEIEGTVFDRSGKAVHRLFGKW
        730       740       750       760       770       780      

             300       310       320       330       340       350 
KIAA07 TECLWGIDPVSYESFKKQERRGDHLRKAKLDEDSGKADSDVADDVPVAQETVQVIPGSKL
        : ..                             : ..:                  :  
KIAA07 HESIY----------------------------CGGGSS------------------SAC
        790                                                     800

             360       370       380       390       400       410 
KIAA07 LWRINTRPPNSAQMYNFTSFTVSLNELETGMEKTLPPTDCRLRPDIRGMENGNMDLASQE
       .:: :  : .  :.:.::.:.. :::.. . .. ::::: :.::: : .:.::.. :  .
KIAA07 VWRANPMPKGYEQYYSFTQFALELNEMDPSSKSLLPPTDTRFRPDQRFLEEGNLEEAEIQ
              810       820       830       840       850       860

             420       430       440       450       460           
KIAA07 KERLEEKQREARRERAKEEAEWQTRWFYPGNNPYTGTPDWLYAGDYFERNFSDCPDIY  
       :.:.:. ::: ::   ....: : :.:  ...      .:.  : :.:            
KIAA07 KQRIEQLQRERRRVLEENHVEHQPRFFRKSDDD-----SWVSNGTYLELRKDLGFSKLDH
              870       880       890            900       910     

KIAA07 PVLW
           

>>KIAA1664  ( 920 res)   fj04751s1                        (920 aa)
 initn: 714 init1: 558 opt: 707  Z-score: 721.4  bits: 143.8 E(): 4.6e-35
Smith-Waterman score: 936;  36.895% identity (61.089% similar) in 496 aa overlap (2-469:460-920)

                                            10              20     
KIAA07                              RMNGEEEFFDAVTEANQKV------TGMIDL
                                     :.    :. ..:::..        ::  ..
KIAA16 NPSKSFIEGSLLTPKGEDSEEDEDTEYFDAMEDSTSFITVITEAKEDSRKAEGSTGTSSV
     430       440       450       460       470       480         

           30        40        50         60        70        80   
KIAA07 D-TSKNNRIGKTGERPSQENGIQKHRTSLPA-PMFSRSDFSVWTILKKCVGLELSKITMP
       : .: .: .  ..  :.  . . :.:. .:  : .:   ...:.:.:.:.: :::.: ::
KIAA16 DWSSADNVLDGASLVPKGSSKV-KRRVRIPNKPNYS---LNLWSIMKNCIGRELSRIPMP
     490       500       510        520          530       540     

            90       100       110       120       130       140   
KIAA07 IAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHRASCQPQPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTGKPFNP
       . ::::::.:::.:: .:. .:. .:    . .:.:  ::::.::. ..  .: .:::::
KIAA16 VNFNEPLSMLQRLTEDLEYHHLLDKAVHCTSSVEQMCLVAAFSVSSYSTTVHRIAKPFNP
         550       560       570       580       590       600     

           150        160       170       180       190       200  
KIAA07 LLGETYELIR-EDLGFRFISEQVSHHPPISAFHSEGLNHDFLFHGSIYPKLKFWGKSVEA
       .::::.:: : .:.:.: . :::::::: :: :    .: . .   :  . :: :: .  
KIAA16 MLGETFELDRLDDMGLRSLCEQVSHHPP-SAAHYVFSKHGWSLWQEITISSKFRGKYISI
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            210       220       230       240       250       260  
KIAA07 EPRGTITLELLKHNEAYTWTNPTCCVHNVIIGKLWIEQYGTVEILNHRTGHKCVLHFKPC
        : :.: ::.   .. :.: . :  :::.:.:::::.: : .::.::.:. .: :.: : 
KIAA16 MPLGAIHLEFQASGNHYVWRKSTSTVHNIIVGKLWIDQSGDIEIVNHKTNDRCQLKFLPY
          670       680       690       700       710       720    

             270       280       290       300       310       320 
KIAA07 GLFGKEL-HKVEGHIQDKNKKKLFMIYGKWTECLWGIDPVSYESFKKQERRGDHLRKAKL
       . :.::  .:: : ..:.. :  ... :.: :                     ... .:.
KIAA16 SYFSKEAARKVTGVVSDSQGKAHYVLSGSWDE---------------------QMECSKV
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             330       340       350       360       370       380 
KIAA07 DEDSGKADSDVADDVPVAQETVQVIPGSKLLWRINTRPPNSAQMYNFTSFTVSLNELETG
        ..: .. :  .:     :.::    ..::::.    : :. .:: :. ....::: : :
KIAA16 MHSSPSSPS--SDG---KQKTVYQTLSAKLLWKKYPLPENAENMYYFSELALTLNEHEEG
           770            780       790       800       810        

             390       400       410       420                  430
KIAA07 MEKTLPPTDCRLRPDIRGMENGNMDLASQEKERLEEKQREARRER-----------AKEE
       .     ::: ::::: : ::.:  : :. ::.::::::: .::.:           ..::
KIAA16 VA----PTDSRLRPDQRLMEKGRWDEANTEKQRLEEKQRLSRRRRLEACGPGSSCSSEEE
      820           830       840       850       860       870    

                 440       450           460         
KIAA07 AE---WQTRWFYPGNNPYTGTPDWLYAGDYFE----RNFSDCPDIY
        :   .   ::    .: ::    .: : :.:    ...  ::.:.
KIAA16 KEADAYTPLWFEKRLDPLTGEMACVYKGGYWEAKEKQDWHMCPNIF
          880       890       900       910       920

>>KIAA1451  ( 939 res)   bg00289                          (939 aa)
 initn: 505 init1: 249 opt: 455  Z-score: 464.8  bits: 96.3 E(): 9e-21
Smith-Waterman score: 468;  26.852% identity (55.787% similar) in 432 aa overlap (30-453:434-793)

                10        20        30        40        50         
KIAA07  RMNGEEEFFDAVTEANQKVTGMIDLDTSKNNRIGKTGERPSQENGIQKHRTSLPAPMFS
                                     ....:..::  :: . ....  ::      
KIAA14 DTDTSERQDDSYIEPEPVEPLKETTYTEQSHEELGEAGE-ASQTETVSEENKSL------
           410       420       430       440        450            

      60        70         80        90       100       110        
KIAA07 RSDFSVWTILKKCV-GLELSKITMPIAFNEPLSFLQRITEYMEHVYLIHRASCQPQPLER
            .::.::.   :..:::...:  . :: :::.....:. :. .. .:. . .:  :
KIAA14 -----IWTLLKQVRPGMDLSKVVLPTFILEPRSFLDKLSDYYYHADFLSEAALEENPYFR
             460       470       480       490       500       510 

      120       130       140       150           160       170    
KIAA07 MQSVAAFAVSAVASQWERTGKPFNPLLGETYELI----REDLGFRFISEQVSHHPPISAF
       ...:. . .:.  .. .   ::.::.::::.. .    : .    .:.::::::::::::
KIAA14 LKKVVKWYLSGFYKKPKGLKKPYNPILGETFRCLWIHPRTNSKTFYIAEQVSHHPPISAF
             520       530       540       550       560       570 

          180       190       200       210       220       230    
KIAA07 HSEGLNHDFLFHGSIYPKLKFWGKSVEAEPRGTITLELLKHNEAYTWTNPTCCVHNVIIG
       .  . .  : . :::  : ::.:.:. :  .:   : .:...: :. : :    .... :
KIAA14 YVSNRKDGFCLSGSILAKSKFYGNSLSAILEGEARLTFLNRGEDYVMTMPYAHCKGILYG
             580       590       600       610       620       630 

          240       250       260         270       280       290  
KIAA07 KLWIEQYGTVEILNHRTGHKCVLHFKPCGLFGKE--LHKVEGHIQDKNKKKLFMIYGKWT
        . .:  :::.:  ..::.. .:.::   ..:.   .... :...  .:. :  . :.: 
KIAA14 TMTLELGGTVNITCQKTGYSAILEFKLKPFLGSSDCVNQISGKLK-LGKEVLATLEGHWD
             640       650       660       670        680       690

            300       310       320       330       340       350  
KIAA07 ECLWGIDPVSYESFKKQERRGDHLRKAKLDEDSGKADSDVADDVPVAQETVQVIPGSKLL
         ..  :                           :.:.                  :...
KIAA14 SEVFITDK--------------------------KTDN------------------SEVF
                                        700                        

            360       370       380       390        400       410 
KIAA07 WRINTRPPNSAQMYNFTSFTVSLNELETGMEKTLPPTDCRLRPDI-RGMENGNMDLASQE
       :     :  . ... .   ::...: .  .:.       .:   . :...  ..  :.::
KIAA14 WN----PTPDIKQWRLIRHTVKFEE-QGDFESE------KLWQRVTRAINAKDQTEATQE
            710       720        730             740       750     

             420       430       440       450       460           
KIAA07 KERLEEKQREARRERAKEEAEWQTRWFYPGNNPYTGTPDWLYAGDYFERNFSDCPDIY  
       :  ::: ::.: :.:  .. ::. . :    .: ::  .: :                  
KIAA14 KYVLEEAQRQAARDRKTKNEEWSCKLFEL--DPLTG--EWHYKFADTRPWDPLNDMIQFE
         760       770       780           790       800       810 

KIAA14 KDGVIQTKVKHRTPMVSVPKMKHKPTRQQKKVAKGYSSPEPDIQDSSGSEAQSVKPSTRR
             820       830       840       850       860       870 

>>KIAA1534  ( 865 res)   fh03661(revised)                 (865 aa)
 initn: 505 init1: 234 opt: 421  Z-score: 430.5  bits: 89.9 E(): 7.3e-19
Smith-Waterman score: 449;  28.463% identity (52.645% similar) in 397 aa overlap (65-453:357-693)

           40        50        60        70         80        90   
KIAA07 KTGERPSQENGIQKHRTSLPAPMFSRSDFSVWTILKKCV-GLELSKITMPIAFNEPLSFL
                                     .::.::.   :..::....:    :: :::
KIAA15 TTYVEQVQEELGELGEASQVETVSEENKSLMWTLLKQLRPGMDLSRVVLPTFVLEPRSFL
        330       340       350       360       370       380      

           100       110       120       130       140       150   
KIAA07 QRITEYMEHVYLIHRASCQPQPLERMQSVAAFAVSAVASQWERTGKPFNPLLGETYELI-
       .....:. :. :. ::. . .   ::. :  . .:.  .. .   ::.::.::::..   
KIAA15 NKLSDYYYHADLLSRAAVEEDAYSRMKLVLRWYLSGFYKKPKGIKKPYNPILGETFRCCW
        390       400       410       420       430       440      

               160       170       180       190       200         
KIAA07 ---REDLGFRFISEQVSHHPPISAFHSEGLNHDFLFHGSIYPKLKFWGKSVEAEPRGTIT
          . :    .:.::::::::.::::  . .  : . :::  : .:.:.:. :   :  :
KIAA15 FHPQTDSRTFYIAEQVSHHPPVSAFHVSNRKDGFCISGSITAKSRFYGNSLSALLDGKAT
        450       460       470       480       490       500      

     210       220       230       240       250       260         
KIAA07 LELLKHNEAYTWTNPTCCVHNVIIGKLWIEQYGTVEILNHRTGHKCVLHFKPCGLFG--K
       : .:.. : :: : :    .... : . .:  : : :   ... .  :.::   .::   
KIAA15 LTFLNRAEDYTLTMPYAHCKGILYGTMTLELGGKVTIECAKNNFQAQLEFKLKPFFGGST
        510       520       530       540       550       560      

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KIAA07 ELHKVEGHIQDKNKKKLFMIYGKWTECLWGIDPVSYESFKKQERRGDHLRKAKLDEDSGK
        .... :.: . ... :  . :.: .          . : :.:  :.             
KIAA15 SINQISGKITS-GEEVLASLSGHWDR----------DVFIKEEGSGS-------------
        570        580       590                 600               

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KIAA07 ADSDVADDVPVAQETVQVIPGSKLLWRINTRPPNSAQMYNFTSFTVSLNELETGMEKTLP
                            : :.:     : . ..   . . :: :.: .: .:.   
KIAA15 ---------------------SALFWT----PSGEVRRQRLRQHTVPLEE-QTELESE--
                                     610       620        630      

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KIAA07 PTDCRLRPDI-RGMENGNMDLASQEKERLEEKQREARRERAKEEAEWQTRWFYPGNNPYT
           ::   . :.. .:..  :.:::  ::: ::.  ::: .    :. . :.   .: :
KIAA15 ----RLWQHVTRAISKGDQHRATQEKFALEEAQRQRARERQESLMPWKPQLFHL--DPIT
              640       650       660       670       680          

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KIAA07 GTPDWLYAGDYFERNFSDCPDIY                                     
          .: :                                                     
KIAA15 --QEWHYRYEDHSPWDPLKDIAQFEQDGILRTLQQEAVARQTTFLGSPGPRHERSGPDQR
        690       700       710       720       730       740      




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