# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk05113.fasta.nr -Q ../query/KIAA0771.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0771, 948 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7801023 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1027+/-0.000214; mu= 6.2180+/- 0.012 mean_var=189.3504+/-35.988, 0's: 34 Z-trim: 106 B-trim: 0 in 0/68 Lambda= 0.093205 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|119602253|gb|EAW81847.1| protein phosphatase 1, (1090) 6363 868.9 0 gi|34098677|sp|Q96KQ4.2|ASPP1_HUMAN RecName: Full= (1090) 6363 868.9 0 gi|114655059|ref|XP_510191.2| PREDICTED: protein p (1558) 6326 864.1 0 gi|109085016|ref|XP_001088783.1| PREDICTED: simila (1248) 6277 857.4 0 gi|194225403|ref|XP_001492487.2| PREDICTED: protei (1125) 5873 803.0 0 gi|33860141|sp|Q62415.2|ASPP1_MOUSE RecName: Full= (1087) 5836 798.0 0 gi|194677026|ref|XP_882829.2| PREDICTED: similar t (1081) 5653 773.4 0 gi|119602251|gb|EAW81845.1| protein phosphatase 1, ( 957) 5394 738.5 3.4e-210 gi|126290408|ref|XP_001373148.1| PREDICTED: simila (1107) 5394 738.6 3.7e-210 gi|118092225|ref|XP_421392.2| PREDICTED: similar t (1131) 5154 706.4 1.9e-200 gi|149044059|gb|EDL97441.1| protein phosphatase 1, (1042) 4547 624.7 6.9e-176 gi|57032679|gb|AAH88937.1| LOC496341 protein [Xeno (1085) 4531 622.6 3.1e-175 gi|148686661|gb|EDL18608.1| protein phosphatase 1, (1044) 4525 621.7 5.3e-175 gi|73964519|ref|XP_547996.2| PREDICTED: similar to (1064) 4451 611.8 5.3e-172 gi|31806903|gb|AAH53732.1| Ppp1r13b protein [Mus m ( 964) 4393 603.9 1.1e-169 gi|119602252|gb|EAW81846.1| protein phosphatase 1, ( 627) 3792 522.9 1.8e-145 gi|34532187|dbj|BAC86342.1| unnamed protein produc ( 628) 3712 512.2 3.1e-142 gi|50418072|gb|AAH78098.1| MGC83480 protein [Xenop (1071) 3028 420.5 2.1e-114 gi|193785731|dbj|BAG51166.1| unnamed protein produ ( 398) 2551 355.8 2.3e-95 gi|189530734|ref|XP_692033.3| PREDICTED: similar t (1076) 2207 310.1 3.7e-81 gi|47224308|emb|CAG09154.1| unnamed protein produc (1005) 2128 299.4 5.5e-78 gi|189535476|ref|XP_001923587.1| PREDICTED: hypoth (1062) 1944 274.7 1.6e-70 gi|210147577|ref|NP_001103240.2| tumor protein p53 (1063) 1944 274.7 1.6e-70 gi|94733020|emb|CAK11376.1| novel protein similar (1060) 1937 273.7 3.1e-70 gi|47123249|gb|AAH70005.1| Tumor protein p53 bindi (1060) 1787 253.6 3.6e-64 gi|189526568|ref|XP_001918932.1| PREDICTED: hypoth (1058) 1701 242.0 1.1e-60 gi|149641603|ref|XP_001513723.1| PREDICTED: simila (1141) 1625 231.8 1.4e-57 gi|126307128|ref|XP_001376253.1| PREDICTED: simila (1501) 1606 229.4 9.7e-57 gi|1399805|gb|AAC50557.1| Bbp/53BP2 gi|4885643 (1005) 1586 226.5 4.8e-56 gi|116283898|gb|AAH40247.1| TP53BP2 protein [Homo (1048) 1586 226.5 5e-56 gi|119613654|gb|EAW93248.1| tumor protein p53 bind (1067) 1586 226.5 5e-56 gi|119613653|gb|EAW93247.1| tumor protein p53 bind (1125) 1586 226.6 5.2e-56 gi|33860140|sp|Q13625.2|ASPP2_HUMAN RecName: Full= (1128) 1586 226.6 5.2e-56 gi|168277530|dbj|BAG10743.1| tumor protein p53 bin (1134) 1586 226.6 5.2e-56 gi|109018201|ref|XP_001093747.1| PREDICTED: tumor (1412) 1585 226.6 6.6e-56 gi|194378972|dbj|BAG58037.1| unnamed protein produ ( 773) 1562 223.2 3.8e-55 gi|221045594|dbj|BAH14474.1| unnamed protein produ ( 773) 1559 222.8 5e-55 gi|118087842|ref|XP_419394.2| PREDICTED: similar t (1155) 1551 221.9 1.4e-54 gi|194227319|ref|XP_001488127.2| PREDICTED: tumor (1125) 1547 221.3 2e-54 gi|55251236|emb|CAH68949.1| novel apoptosis-stimul (1069) 1539 220.2 4e-54 gi|146218551|gb|AAI39882.1| Apoptosis-stimulating (1069) 1533 219.4 7e-54 gi|213627336|gb|AAI71141.1| LOC548790 protein [Xen (1110) 1514 216.9 4.2e-53 gi|493080|gb|AAA21597.1| p53-binding protein ( 529) 1494 213.8 1.7e-52 gi|89268957|emb|CAJ83754.1| tumor protein p53 bind (1101) 1496 214.5 2.3e-52 gi|148744306|gb|AAI42600.1| Si:dkeyp-34c12.2 prote ( 996) 1491 213.7 3.4e-52 gi|118764341|gb|AAI28682.1| LOC446947 protein [Xen (1111) 1488 213.4 4.8e-52 gi|83405201|gb|AAI10930.1| LOC446947 protein [Xeno (1143) 1488 213.4 4.9e-52 gi|68533744|gb|AAH98984.1| LOC446947 protein [Xeno (1145) 1488 213.4 4.9e-52 gi|51703725|gb|AAH81262.1| LOC446947 protein [Xeno (1125) 1484 212.9 7e-52 gi|73961509|ref|XP_547518.2| PREDICTED: similar to (1263) 1481 212.5 1e-51 >>gi|119602253|gb|EAW81847.1| protein phosphatase 1, reg (1090 aa) initn: 6363 init1: 6363 opt: 6363 Z-score: 4633.5 bits: 868.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 6363; 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