# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk04860.fasta.nr -Q ../query/KIAA0766.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0766, 640 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7827121 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2433+/-0.000185; mu= 11.8535+/- 0.010 mean_var=69.6155+/-13.827, 0's: 45 Z-trim: 46 B-trim: 2564 in 2/66 Lambda= 0.153717 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|51315907|sp|Q7L775.1|EPMIP_HUMAN RecName: Full= ( 607) 4026 902.2 0 gi|55621952|ref|XP_526480.1| PREDICTED: hypothetic ( 607) 4012 899.0 0 gi|55728538|emb|CAH91011.1| hypothetical protein [ ( 607) 4005 897.5 0 gi|109042251|ref|XP_001090676.1| PREDICTED: EPM2A ( 607) 3936 882.2 0 gi|73990096|ref|XP_851144.1| PREDICTED: similar to ( 608) 3722 834.7 0 gi|149729636|ref|XP_001489396.1| PREDICTED: simila ( 608) 3678 825.0 0 gi|148677026|gb|EDL08973.1| EPM2A (laforin) intera ( 617) 3641 816.8 0 gi|51316048|sp|Q8VEH5.1|EPMIP_MOUSE RecName: Full= ( 606) 3627 813.7 0 gi|148677027|gb|EDL08974.1| EPM2A (laforin) intera ( 641) 3627 813.7 0 gi|109485509|ref|XP_001076356.1| PREDICTED: simila ( 606) 3625 813.2 0 gi|149018394|gb|EDL77035.1| rCG25289 [Rattus norve ( 640) 3625 813.2 0 gi|119914295|ref|XP_591313.3| PREDICTED: similar t ( 608) 3465 777.7 0 gi|109484011|ref|XP_236659.4| PREDICTED: similar t ( 615) 2659 599.0 1.5e-168 gi|12001954|gb|AAG43120.1|AF059751_1 My007 protein ( 377) 2297 518.6 1.5e-144 gi|126336768|ref|XP_001372983.1| PREDICTED: hypoth ( 608) 1874 424.9 3.7e-116 gi|13676494|dbj|BAB41165.1| hypothetical protein [ ( 220) 1449 330.4 3.9e-88 gi|47204330|emb|CAF95678.1| unnamed protein produc ( 539) 703 165.2 5.1e-38 gi|47206402|emb|CAF91327.1| unnamed protein produc ( 461) 689 162.0 3.8e-37 gi|146218406|gb|AAI39851.1| LOC100049737 protein [ ( 624) 670 157.9 9.1e-36 gi|157016972|gb|EAL40445.3| AGAP012527-PA [Anophel ( 591) 619 146.6 2.2e-32 gi|94470473|gb|ABF20547.1| transposase [Strongyloc ( 618) 598 141.9 5.8e-31 gi|193622596|ref|XP_001952164.1| PREDICTED: simila ( 576) 572 136.2 3e-29 gi|47212124|emb|CAG06226.1| unnamed protein produc ( 468) 553 131.9 4.7e-28 gi|221117755|ref|XP_002162968.1| PREDICTED: simila ( 544) 535 127.9 8.4e-27 gi|94470481|gb|ABF20551.1| transposase [Xenopus tr ( 656) 524 125.5 5.3e-26 gi|221119457|ref|XP_002168407.1| PREDICTED: hypoth (1062) 506 121.7 1.2e-24 gi|47215859|emb|CAG02322.1| unnamed protein produc ( 331) 472 113.8 9e-23 gi|205831547|sp|A4IFA3.1|GT2D2_BOVIN RecName: Full ( 950) 465 112.6 6.2e-22 gi|62361763|gb|AAX81414.1| GTF2IRD2 [Macaca fuscat ( 526) 460 111.3 8.3e-22 gi|149063122|gb|EDM13445.1| rCG21772 [Rattus norve ( 701) 457 110.7 1.7e-21 gi|109069222|ref|XP_001084899.1| PREDICTED: simila ( 950) 458 111.0 1.8e-21 gi|149756085|ref|XP_001494185.1| PREDICTED: simila ( 947) 457 110.8 2.1e-21 gi|81903275|sp|Q99NI3.1|GT2D2_MOUSE RecName: Full= ( 936) 456 110.6 2.4e-21 gi|62361765|gb|AAX81415.1| GTF2IRD2 [Pan troglodyt ( 520) 452 109.5 2.8e-21 gi|73957726|ref|XP_849558.1| PREDICTED: similar to ( 948) 455 110.3 2.9e-21 gi|114614047|ref|XP_001152832.1| PREDICTED: GTF2IR ( 853) 452 109.7 4.2e-21 gi|114614043|ref|XP_001153190.1| PREDICTED: GTF2IR ( 949) 452 109.7 4.6e-21 gi|114614045|ref|XP_001152892.1| PREDICTED: GTF2IR ( 954) 452 109.7 4.6e-21 gi|29387033|gb|AAH48252.1| GTF2IRD2B protein [Homo ( 444) 447 108.4 5.3e-21 gi|21754855|dbj|BAC04576.1| unnamed protein produc ( 702) 448 108.7 6.6e-21 gi|33469249|gb|AAQ19673.1| general transcription f ( 949) 449 109.0 7.2e-21 gi|158256298|dbj|BAF84120.1| unnamed protein produ ( 949) 449 109.0 7.2e-21 gi|74709247|sp|Q6EKJ0.1|GTD2B_HUMAN RecName: Full= ( 949) 447 108.6 9.8e-21 gi|30144696|gb|AAP14955.1| GTF2IRD2 [Homo sapiens] ( 949) 447 108.6 9.8e-21 gi|187607027|sp|Q86UP8.2|GTD2A_HUMAN RecName: Full ( 949) 447 108.6 9.8e-21 gi|94470467|gb|ABF20544.1| transposase [Aedes aegy ( 614) 444 107.8 1.1e-20 gi|149063159|gb|EDM13482.1| rCG21454 [Rattus norve ( 757) 443 107.6 1.5e-20 gi|150416325|sp|A4Z944.1|ZBED5_CANFA RecName: Full ( 694) 440 106.9 2.2e-20 gi|21739629|emb|CAD38861.1| hypothetical protein [ ( 496) 438 106.4 2.3e-20 gi|149719445|ref|XP_001504971.1| PREDICTED: simila ( 693) 437 106.3 3.6e-20 >>gi|51315907|sp|Q7L775.1|EPMIP_HUMAN RecName: Full=EPM2 (607 aa) initn: 4026 init1: 4026 opt: 4026 Z-score: 4820.8 bits: 902.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 4026; 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99.506% identity (100.000% similar) in 607 aa overlap (34-640:1-607) 10 20 30 40 50 60 KIAA07 ERRRCLALLRLLLSPCGLSNVGPALVASRRMWMTPKRSKMEVDEALVFRPEWTQRYLVVE :::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 MWMTPKRSKMEVDEALVFRPEWTQRYLVVE 10 20 30 70 80 90 100 110 120 KIAA07 PPEGDGALCLVCRRLIVATRERDVRRHYEAEHEYYERYVADGERAALVERLRQGDLPVAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 PPEGDGALCLVCRRLIVATRERDVRRHYEAEHEYYERYVADGERAALVERLRQGDLPVAS 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 KIAA07 FTPEERAARAGLGLCRLLALKGRGWGEGDFVYQCMEVLLREVLPEHVSVLQGVDLSPDIT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: gi|556 FTPEERAARAGLGLCRLLALKGRGWGEGDFVYQCMEVLLREVLPEHVSVLQGVDLSPEIT 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 KIAA07 RQRILSIDRNLRNQLFNRARDFKAYSLALDDQAFVAYENYLLVFIRGVGPELEVQEDLLT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 RQRILSIDRNLRNQLFNRARDFKAYSLALDDQAFVAYENYLLVFIRGVGPELEVQEDLLT 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 KIAA07 IINLTHHFSVGALMSAILESLQTAGLSLQRMVGLTTTHTLRMIGENSGLVSYMREKAVSP :::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 IINLTHHFSVGALMSAILEALQTAGLSLQRMVGLTTTHTLRMIGENSGLVSYMREKAVSP 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 KIAA07 NCWNVIHYSGFLHLELLSSYDVDVNQIINTISEWIVLIKTRGVRRPEFQTLLTESESEHG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 NCWNVIHYSGFLHLELLSSYDVDVNQIINTISEWIVLIKTRGVRRPEFQTLLTESESEHG 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 KIAA07 ERVNGRCLNNWLRRGKTLKLIFSLRKEMEAFLVSVGATTVHFSDKQWLCDFGFLVDIMEH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 ERVNGRCLNNWLRRGKTLKLIFSLRKEMEAFLVSVGATTVHFSDKQWLCDFGFLVDIMEH 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 KIAA07 LRELSEELRVSKVFAAAAFDHICTFEVKLNLFQRHIEEKNLTDFPALREVVDELKQQNKE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 LRELSEELRVSKVFAAAAFDHICTFEVKLNLFQRHIEEKNLTDFPALREVVDELKQQNKE 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 KIAA07 DEKIFDPDRYQMVICRLQKEFERHFKDLRFIKKDLELFSNPFNFKPEYAPISVRVELTKL :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 DQKIFDPDRYQMVICRLQKEFERHFKDLRFIKKDLELFSNPFNFKPEYAPISVRVELTKL 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 KIAA07 QANTNLWNEYRIKDLGQFYAGLSAESYPIIKGVACKVASLFDSNQICEKAFSYLTRNQHT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 QANTNLWNEYRIKDLGQFYAGLSAESYPIIKGVACKVASLFDSNQICEKAFSYLTRNQHT 520 530 540 550 560 570 610 620 630 640 KIAA07 LSQPLTDEHLQALFRVATTEMEPGWDDLVRERNESNP ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|556 LSQPLTDEHLQALFRVATTEMEPGWDDLVRERNESNP 580 590 600 >>gi|55728538|emb|CAH91011.1| hypothetical protein [Pong (607 aa) initn: 4005 init1: 4005 opt: 4005 Z-score: 4795.6 bits: 897.5 E(): 0 Smith-Waterman score: 4005; 99.176% identity (100.000% similar) in 607 aa overlap (34-640:1-607) 10 20 30 40 50 60 KIAA07 ERRRCLALLRLLLSPCGLSNVGPALVASRRMWMTPKRSKMEVDEALVFRPEWTQRYLVVE :::::::::::::::::::::::::::::: gi|557 MWMTPKRSKMEVDEALVFRPEWTQRYLVVE 10 20 30 70 80 90 100 110 120 KIAA07 PPEGDGALCLVCRRLIVATRERDVRRHYEAEHEYYERYVADGERAALVERLRQGDLPVAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|557 PPEGDGALCLVCRRLIVATRERDVRRHYEAEHEYYERYVADGERAALVERLRQGDLPVAS 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 KIAA07 FTPEERAARAGLGLCRLLALKGRGWGEGDFVYQCMEVLLREVLPEHVSVLQGVDLSPDIT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: gi|557 FTPEERAARAGLGLCRLLALKGRGWGEGDFVYQCMEVLLREVLPEHVSVLQGVDLSPEIT 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 KIAA07 RQRILSIDRNLRNQLFNRARDFKAYSLALDDQAFVAYENYLLVFIRGVGPELEVQEDLLT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|557 RQRILSIDRNLRNQLFNRARDFKAYSLALDDQAFVAYENYLLVFIRGVGPELEVQEDLLT 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 KIAA07 IINLTHHFSVGALMSAILESLQTAGLSLQRMVGLTTTHTLRMIGENSGLVSYMREKAVSP :::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|557 IINLTHHFSVGALMSAILEALQTAGLSLQRMVGLTTTHTLRMIGENSGLVSYMREKAVSP 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 KIAA07 NCWNVIHYSGFLHLELLSSYDVDVNQIINTISEWIVLIKTRGVRRPEFQTLLTESESEHG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|557 NCWNVIHYSGFLHLELLSSYDVDVNQIINTISEWIVLIKTRGVRRPEFQTLLTESESEHG 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 KIAA07 ERVNGRCLNNWLRRGKTLKLIFSLRKEMEAFLVSVGATTVHFSDKQWLCDFGFLVDIMEH :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|557 ERVNGRCLNNWLRRGKTLKLIFSLRKEMEAFLVSVGATTVHFSDKQWLCDFGFLVDIMEH 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 KIAA07 LRELSEELRVSKVFAAAAFDHICTFEVKLNLFQRHIEEKNLTDFPALREVVDELKQQNKE ::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|557 LRELSEELQVSKVFAAAAFDHICTFEVKLNLFQRHIEEKNLTDFPALREVVDELKQQNKE 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 KIAA07 DEKIFDPDRYQMVICRLQKEFERHFKDLRFIKKDLELFSNPFNFKPEYAPISVRVELTKL :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|557 DQKIFDPDRYQMVICRLQKEFERHFKDLRFIKKDLELFSNPFNFKPEYAPISVRVELTKL 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 KIAA07 QANTNLWNEYRIKDLGQFYAGLSAESYPIIKGVACKVASLFDSNQICEKAFSYLTRNQHT :::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|557 QANTNLWNEYRVKDLGQFYAGLSAESYPIIKGVACKVASLFDSNQICEKAFSYLTRNQHT 520 530 540 550 560 570 610 620 630 640 KIAA07 LSQPLTDEHLQALFRVATTEMEPGWDDLVRERNESNP ::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|557 LSQPLTDEHLQALFRVATTEMEPGWDDLVRERNESNP 580 590 600 >>gi|109042251|ref|XP_001090676.1| PREDICTED: EPM2A inte (607 aa) initn: 3934 init1: 3934 opt: 3936 Z-score: 4712.9 bits: 882.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 3936; 97.529% identity (99.176% similar) in 607 aa overlap (34-640:1-607) 10 20 30 40 50 60 KIAA07 ERRRCLALLRLLLSPCGLSNVGPALVASRRMWMTPKRSKMEVDEALVFRPEWTQRYLVVE :::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 MWMTPKRSKMEVDEALVFRPEWTQRYLVVE 10 20 30 70 80 90 100 110 120 KIAA07 PPEGDGALCLVCRRLIVATRERDVRRHYEAEHEYYERYVADGERAALVERLRQGDLPVAS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 PPEGDGALCLVCRRLIVATRERDVRRHYEAEHEYYERYVADGERAALVERLRQGDLPVAS 40 50 60 70 80 90 130 140 150 160 170 180 KIAA07 FTPEERAARAGLGLCRLLALKGRGWGEGDFVYQCMEVLLREVLPEHVSVLQGVDLSPDIT .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:: gi|109 LTPEERAARAGLGLCRLLALKGRGWGEGDFVYQCMEVLLREVLPEHVSVLQGIDLSPEIT 100 110 120 130 140 150 190 200 210 220 230 240 KIAA07 RQRILSIDRNLRNQLFNRARDFKAYSLALDDQAFVAYENYLLVFIRGVGPELEVQEDLLT ::::::::.:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 RQRILSIDENLRSQLFNRARDFKAYSLALDDQAFVAYENYLLVFIRGVGPELEVQEDLLT 160 170 180 190 200 210 250 260 270 280 290 300 KIAA07 IINLTHHFSVGALMSAILESLQTAGLSLQRMVGLTTTHTLRMIGENSGLVSYMREKAVSP :::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 IINLTHHFSVGALMSAILEALQTAGLSLQRMVGLTTTHTLRMIGENSGLVSYMREKAVSP 220 230 240 250 260 270 310 320 330 340 350 360 KIAA07 NCWNVIHYSGFLHLELLSSYDVDVNQIINTISEWIVLIKTRGVRRPEFQTLLTESESEHG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 NCWNVIHYSGFLHLELLSSYDVDVNQIINTISEWIVLIKTRGVRRPEFQTLLTESESEHG 280 290 300 310 320 330 370 380 390 400 410 420 KIAA07 ERVNGRCLNNWLRRGKTLKLIFSLRKEMEAFLVSVGATTVHFSDKQWLCDFGFLVDIMEH :::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 ERVNGRCLNNWLRRGKTLKLIFSLRKELEAFLVSVGATTVHFSDKQWLCDFGFLVDIMEH 340 350 360 370 380 390 430 440 450 460 470 480 KIAA07 LRELSEELRVSKVFAAAAFDHICTFEVKLNLFQRHIEEKNLTDFPALREVVDELKQQNKE :::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 LRELSEELGVSKVFAAAAFDHICTFEVKLNLFQRHIEEKNLTDFPALREVVDELKQQNKE 400 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 KIAA07 DEKIFDPDRYQMVICRLQKEFERHFKDLRFIKKDLELFSNPFNFKPEYAPISVRVELTKL :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 DQKIFDPDRYQMVICRLQKEFERHFKDLRFIKKDLELFSNPFNFKPEYAPISVRVELTKL 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 600 KIAA07 QANTNLWNEYRIKDLGQFYAGLSAESYPIIKGVACKVASLFDSNQICEKAFSYLTRNQHT :::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 QANTNLWNEYRVKDLGQFYAGLSAESYPIIKGVACKVASLFDSNQICEKAFSYLTRNQHT 520 530 540 550 560 570 610 620 630 640 KIAA07 LSQPLTDEHLQALFRVATTEMEPGWDDLVRERNESNP ::::::::::::::::: :::::::::::::: . : gi|109 LSQPLTDEHLQALFRVAHTEMEPGWDDLVRERMNLIP 580 590 600 >>gi|73990096|ref|XP_851144.1| PREDICTED: similar to EPM (608 aa) initn: 3173 init1: 3173 opt: 3722 Z-score: 4456.4 bits: 834.7 E(): 0 Smith-Waterman score: 3722; 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