# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk04668s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0762.ptfa ./tmplib.23663 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
KIAA0762, 724 aa
vs ./tmplib.23663 library
1986781 residues in 2037 sequences
Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.3779+/-0.00548; mu= 19.7066+/- 0.374
mean_var=97.9954+/-22.492, 0's: 0 Z-trim: 14 B-trim: 13 in 1/39
Lambda= 0.129560
FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16
The best scores are: opt bits E(2037)
KIAA1312 ( 1471 res) fh11767 (1471) 360 78.5 5.1e-15
KIAA0605 ( 1031 res) hg03238a (1031) 337 74.0 8.2e-14
KIAA0550 ( 1524 res) hh15909 (1524) 329 72.7 2.9e-13
KIAA0960 ( 1502 res) hj05779s1 (1502) 289 65.2 5.1e-11
KIAA0366 ( 1201 res) hh00124 (1201) 255 58.7 3.7e-09
KIAA1679 ( 1536 res) fh22954 (1536) 252 58.3 6.2e-09
KIAA2036 ( 1322 res) pf06513 (1322) 244 56.7 1.6e-08
KIAA1233 ( 1023 res) fh08611 (1023) 236 55.1 3.9e-08
KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202) 236 55.2 4.3e-08
KIAA1777 ( 954 res) fh19201x1 ( 954) 181 44.8 4.7e-05
KIAA0149 ( 830 res) ha01221 ( 830) 147 38.3 0.0036
KIAA1346 ( 999 res) fj00671 ( 999) 145 38.1 0.0051
>>KIAA1312 ( 1471 res) fh11767 (1471 aa)
initn: 336 init1: 183 opt: 360 Z-score: 361.5 bits: 78.5 E(): 5.1e-15
Smith-Waterman score: 459; 26.434% identity (51.122% similar) in 401 aa overlap (354-724:715-1081)
330 340 350 360 370 380
KIAA07 RIARKGEQCNIVPDNVDDIVADLAPEEKDEDDTPETCIYSNWSPWSACSSSTCDKGKRMR
.: :. ... .::.:::. : .:.: :
KIAA13 DRIEQELLLQVLSVGKLYNPDVRYSFNIPIEDKPQQFYWNSHGPWQACSKP-C-QGERKR
690 700 710 720 730 740
390 400 410 420 430 440
KIAA07 QRMLKAQLDLSVPCPDTQDFQPCMGPGCSDED-GSTCTMSEW--ITWSPCSISCGMGMRS
. . . : . . : : :: : :. : . .: . : :: .::.:.:.
KIAA13 KLVCTRESDQLTVSDQRCDRLP--QPGHITEPCGTDCDL-RWHVASRSECSAQCGLGYRT
750 760 770 780 790
450 460 470 480 490
KIAA07 RERYVKQFPE-DGSVCTLPT---EETEKCTVNEECSPSSCLMTEW--GEWDECSATCGMG
. : .. . ::.. . : . :.:: . : : . : ::: .: :
KIAA13 LDIYCAKYSRLDGKTEKVDDGFCSSHPKPSNREKCS-GECNTGGWRYSAWTECSKSCDGG
800 810 820 830 840 850
500 510 520 530 540 550
KIAA07 MKKRHRMIKMNPADGSMCKAETSQAEKCMMPECHTIPCLLSPWS--EWSDCSVTCGKGMR
..: : : .: . . .. .. :: . .: .:: :. .::.: :::::: .
KIAA13 TQRR-RAICVNTRNDVLDDSKCTHQEKVTIQRCSEFPC--PQWKSGDWSECLVTCGKGHK
860 870 880 890 900 910
560 570 580 590 600
KIAA07 TRQRMLK-SLAELGD--CNEDLE--QVEKCMLPECPIDCELTEWSQ--WSECNKSCGKGH
:: . . .:.: :. . . ... :. ::: . :. :..:. .::.:.
KIAA13 HRQVWCQFGEDRLNDRMCDPETKPTSMQTCQQPEC------ASWQAGPWGQCSVTCGQGY
920 930 940 950 960
610 620 630 640 650
KIAA07 VIR-------TRM-IQMEPQFGGAPCPETVQRKKCRIRKCLRNPSIQKLRWREARESRRS
.: : : . . . ..: : .: :.. .: :. : :.:::
KIAA13 QLRAVKCIIGTYMSVVDDNDCNAATRPTDTQ--DCELPSCHPPPA--------APETRRS
970 980 990 1000 1010
660 670 680 690 700 710
KIAA07 EQLKEESEGEQFPGCRMRPWTAWSECTKLCGGGIQERYMTVKKRFKS-SQFTSCKDKKEI
. : . : . .:. :. :: : . ::.. . . : .. ..: .
KIAA13 TY--------SAPRTQWR-FGSWTPCSATCGKGTRMRYVSCRDENGSVADESACATLPRP
1020 1030 1040 1050 1060 1070
720
KIAA07 RA---CNVHPC
: :.: ::
KIAA13 VAKEECSVTPCGQWKALDWSSCSVTCGQGRATRQVMCVNYSDHVIDRSECDQDYIPETDQ
1080 1090 1100 1110 1120 1130
>>KIAA0605 ( 1031 res) hg03238a (1031 aa)
initn: 325 init1: 128 opt: 337 Z-score: 339.8 bits: 74.0 E(): 8.2e-14
Smith-Waterman score: 360; 28.235% identity (49.118% similar) in 340 aa overlap (339-641:679-991)
310 320 330 340 350 360
KIAA07 PEGGSITQVARVVIERIARKGEQCNIVPDNVDDIVAD--LAPEEKDEDDTPETCIYSNW-
::: : :: : . . : :
KIAA06 KLSSHEPCSATCTTGVMSAYAMCVRYDGVEVDDSYCDALTRPEPVHEFCAGREC-QPRWE
650 660 670 680 690 700
370 380 390 400 410
KIAA07 -SPWSACSSSTCDKGKRMR----QRMLKAQLDLSVP---CPDTQDFQP-----CMGPGCS
: :: :: :: .: ..: .::. .: :: : .. .: : .:.:
KIAA06 TSSWSECSR-TCGEGYQFRVVRCWKMLSPGFDSSVYSDLCEAAEAVRPEERKTCRNPAC-
710 720 730 740 750 760
420 430 440 450 460 470
KIAA07 DEDGSTCTMSEWITWSPCSISCGMGMRSRERYVKQFPEDGSVCTLPTEETEKCTVNEECS
: :::: : :. .:: :: . :: ..: . . . . ...:.
KIAA06 ---GPQWEMSEW---SECTAKCGE--RSVVTRDIRCSEDEKLC----DPNTRPVGEKNCT
770 780 790 800 810
480 490 500 510 520
KIAA07 PSSCLMTEW--GEWDECSATCGMGMKKRHRMIKMNPADG-----SMCKAETSQAEKCMMP
: .: ..: ::..::.: :: . : . :: :.:. ::. . :
KIAA06 GPPCD-RQWTVSDWGPCSGSCGQGRTIRHVYCKTS--DGRVVPESQCQMETKPLA--IHP
820 830 840 850 860
530 540 550 560 570 580
KIAA07 ECHTIPCLLSPW--SEWSDCSVTCGKGMRTRQRMLKSLAELGDCNEDLEQVEKCMLPECP
: : . : ..: :..:::.:.. .:.. . ::.. . . .. .: : . :
KIAA06 -CGDKNCP-AHWLAQDWERCNTTCGRGVK--KRLVLCM-ELANGKPQTRSGPECGLAKKP
870 880 890 900 910 920
590 600 610 620 630
KIAA07 ID---C---ELTEW--SQWSECNKSCGKGHVIRTRMIQ----MEPQFGGAPCPETVQRKK
. : .: : ::::.:.:: : .: : .. . : : . : :.
KIAA06 PEESTCFERPCFKWYTSPWSECTKTCGVG--VRMRDVKCYQGTDIVRGCDPLVKPVGRQA
930 940 950 960 970 980
640 650 660 670 680 690
KIAA07 CRIRKCLRNPSIQKLRWREARESRRSEQLKEESEGEQFPGCRMRPWTAWSECTKLCGGGI
: .. : .:
KIAA06 CDLQPCPTEPPDDSCQDQPGTNCALAIKVNLCGHWYYSKACCRSCRPPHS
990 1000 1010 1020 1030
>>KIAA0550 ( 1524 res) hh15909 (1524 aa)
initn: 333 init1: 193 opt: 329 Z-score: 330.0 bits: 72.7 E(): 2.9e-13
Smith-Waterman score: 456; 31.651% identity (55.963% similar) in 218 aa overlap (423-637:298-509)
400 410 420 430 440 450
KIAA07 LSVPCPDTQDFQPCMGPGCSDEDGSTCTMSEWITWSPCSISCGMGMRSRERY-VKQFPED
:: :: ::..::.: . : : :. .
KIAA05 RPRSVHEKRVPQEQADAAKFMAQTGESGVEEWSQWSTCSVTCGQGSQVRTRTCVSPY---
270 280 290 300 310 320
460 470 480 490 500 510
KIAA07 GSVCTLPTEETEKCTVNEECSPSSCLMTEWGEWDECSATCGMGMKKRHRMIKMNPADGSM
:. :. : .:.. :. . : : . ::. :. :: ::: :.. : : :
KIAA05 GTHCSGPLRESRVCNNTALC-PVHGVWEEWSPWSLCSFTCGRGQRTRTRSCTPPQYGGRP
330 340 350 360 370 380
520 530 540 550 560 570
KIAA07 CKAETSQAEKCMMPECHTIPCLLSPWSEWSDCSVTCGKGMRTRQRMLKSLAELG-DCNED
:.. .. . : . : . . :: ::.:::::..: . :.:. . :. : .:
KIAA05 CEGPETHHKPCNIALC-PVDGQWQEWSSWSQCSVTCSNGTQQRSRQCTAAAHGGSECRGP
390 400 410 420 430 440
580 590 600 610 620
KIAA07 LEQVEKCMLPECPIDCELTEWSQWSECNKSCGKGHVIRTRMIQMEPQFGGAPCPETVQR-
. ..:. ::: . . ..:..:: :.::: : : : : . : : : ..
KIAA05 WAESRECYNPECTANGQWNQWGHWSGCSKSCDGGWERRIRTCQGAV-ITGQQCEGTGEEV
450 460 470 480 490 500
630 640 650 660 670 680
KIAA07 KKCRIRKCLRNPSIQKLRWREARESRRSEQLKEESEGEQFPGCRMRPWTAWSECTKLCGG
..: ..:
KIAA05 RRCSEQRCPAPYEICPEDYLMSMVWKRTPAGDLAFNQCPLNATGTTSRRCSLSLHGVAFW
510 520 530 540 550 560
>>KIAA0960 ( 1502 res) hj05779s1 (1502 aa)
initn: 387 init1: 212 opt: 289 Z-score: 289.7 bits: 65.2 E(): 5.1e-11
Smith-Waterman score: 539; 26.623% identity (49.784% similar) in 462 aa overlap (357-724:878-1319)
330 340 350 360 370 380
KIAA07 RKGEQCNIVPDNVDDIVADLAPEEKDEDDTPETCIYSNWSPWSACSSSTCDKGKRMRQRM
: : :.:: :: ::.: : .: ..:..
KIAA09 MACYDQNGRLVETSRCNSHGYIEEACIIPCPSDCKLSEWSNWSRCSKS-CGSGVKVRSKW
850 860 870 880 890 900
390 400 410 420 430
KIAA07 LKAQ-LDLSVPCP------DTQDFQ--PCMGPGCSDEDGSTCTMSEWIT--WSPCSIS--
:. . . . ::: ..: .. :: : :.. :.: :: :...
KIAA09 LREKPYNGGRPCPKLDHVNQAQVYEVVPCH---------SDCNQYLWVTEPWSICKVTFV
910 920 930 940 950
440 450 460 470
KIAA07 -----CGMGMRSRERYVKQFPEDGSVCTLPTEETEK--CTVNEE------CS---PSSCL
:: :...:. : :: :.:..: : .: :. : .:.
KIAA09 NMRENCGEGVQTRKVRCMQNTADG-----PSEHVEDYLCDPEEMPLGSRVCKLPCPEDCV
960 970 980 990 1000 1010
480 490 500 510 520 530
KIAA07 MTEWGEWDECSATCGMG-MKKRHRMIKMNPAD-GSMCKAETSQAEKCMMPE-CHTIPCLL
..::: : .: :... ...: .::: : : .. . : : . . :. .
KIAA09 ISEWGPWTQCVLPCNQSSFRQRSADPIRQPADEGRSCP-NAVEKEPCNLNKNCYHYDYNV
1020 1030 1040 1050 1060 1070
540 550 560 570 580
KIAA07 SPWSEWSDCSVT----CGKGMRTRQ----RMLKSLAELGDCN-----EDLEQVEKCMLPE
..:: :... ::.:..::. : . ..: :. .. .. .::. :
KIAA09 ---TDWSTCQLSEKAVCGNGIKTRMLDCVRSDGKSVDLKYCEALGLEKNWQMNTSCMV-E
1080 1090 1100 1110 1120
590 600 610 620 630
KIAA07 CPIDCELTEWSQWSECNKSCG-KGHVIRTRMIQMEPQFGGAPCPETV-QRKKCRIRKCLR
::..:.:..:: ::::...:: :..:: : . . : : ::: . : : : .. : :
KIAA09 CPVNCQLSDWSPWSECSQTCGLTGKMIRRRTVTQPFQGDGRPCPSLMDQSKPCPVKPCYR
1130 1140 1150 1160 1170 1180
640 650 660
KIAA07 ------NP-SIQKLRWREARESRR--------------------------------SEQL
.: ..:. . :. ..: ....
KIAA09 WQYGQWSPCQVQEAQCGEGTRTRNISCVVSDGSADDFSKVVDEEFCADIELIIDGNKNMV
1190 1200 1210 1220 1230 1240
670 680 690 700 710
KIAA07 KEESEGEQFPG-CRMRPWTAWSECTKLC--G-----GGIQERYMTVKKRFKSSQFTSCKD
::: .. :: : .. :..:: : : : :::: : : . .: ..
KIAA09 LEESCSQPCPGDCYLKDWSSWSLCQLTCVNGEDLGFGGIQVRSRPVIIQELENQHLCPEQ
1250 1260 1270 1280 1290 1300
720
KIAA07 KKEIRACNVHPC
: ..: :
KIAA09 MLETKSCYDGQCYEYKWMASAWKGSSRTVWCQRSDGINVTGGCLVMSQPDADRSCNPPCS
1310 1320 1330 1340 1350 1360
>>KIAA0366 ( 1201 res) hh00124 (1201 aa)
initn: 168 init1: 95 opt: 255 Z-score: 256.3 bits: 58.7 E(): 3.7e-09
Smith-Waterman score: 261; 29.545% identity (54.545% similar) in 176 aa overlap (423-582:844-1011)
400 410 420 430 440 450
KIAA07 LSVPCPDTQDFQPCMGPGCSDEDGSTCTMSEWI--TWSPCSISCGMGMRSRERYVKQFPE
:: .:: : :: :.. . .. .
KIAA03 SSLTYKYIIHEDSVPTINSNNVIQEELDTFEWALKSWSQVSKPCGGGFQYTKYGCRRKSD
820 830 840 850 860 870
460 470 480 490 500
KIAA07 DGSVCTLPTEETEK-CTVNEECSPSSCLMTEW--GEWDECSATCGMGMKKRHRMIKMNPA
. : : ..: . . :. . : : ::..:. ::: . . . . ..:
KIAA03 NKMVHRSFCEANKKPKPIRRMCNIQECTHPLWVAEEWEHCTKTCGSSGYQLRTVRCLQPL
880 890 900 910 920 930
510 520 530 540 550
KIAA07 -DGSMCKAETSQAEKCM--MPE----CHTIPCLLSPWSE--WSDCSVTCGKGMRTRQRML
::. .. ... :: :: :. .:: . :. ::.::::::.: ..:: .
KIAA03 LDGT---NRSVHSKYCMGDRPESRRPCNRVPCP-AQWKTGPWSECSVTCGEGTEVRQVLC
940 950 960 970 980
560 570 580 590 600 610
KIAA07 KSLAELGD-CN-EDLEQVEKCMLPECPIDCELTEWSQWSECNKSCGKGHVIRTRMIQMEP
.. :: :. : :.:. :.:: :
KIAA03 RA----GDHCDGEKPESVRACQLPPCNDEPCLGDKSIFCQMEVLARYCSIPGYNKLCCES
990 1000 1010 1020 1030 1040
>>KIAA1679 ( 1536 res) fh22954 (1536 aa)
initn: 530 init1: 198 opt: 252 Z-score: 252.2 bits: 58.3 E(): 6.2e-09
Smith-Waterman score: 593; 30.000% identity (52.174% similar) in 460 aa overlap (349-724:918-1360)
320 330 340 350 360 370
KIAA07 RVVIERIARKGEQCNIVPDNVDDIVADLAPEEKDEDDTPETCIYSNWSPWSACSSSTCDK
.:: : : :.:: :..:::: :
KIAA16 GEGLRFRAVACSDKNGRPVDPSFCSSSGYIQEKCVIPCPFDCKLSDWSSWGSCSSS-CGI
890 900 910 920 930 940
380 390 400 410 420 430
KIAA07 GKRMRQRMLKAQ-LDLSVPCP--DTQD-FQPCMGPGCSDEDGSTCTMSEWIT--WSPCSI
: :.:.. :: . . . ::: : .. : . : .: :.. :.. :: :.:
KIAA16 GVRIRSKWLKEKPYNGGRPCPKLDLKNQAQVHEAVPCYSE----CNQYSWVVEHWSSCKI
950 960 970 980 990 1000
440 450 460 470
KIAA07 S-------CGMGMRSRE-RYVKQFPEDG-----SVCT---LPTEETEKCTVNEECSPSSC
. :: : .::. : :. .: ..:. .: : :..:.. : :. :
KIAA16 NNELRSLRCGGGTQSRKIRCVNTADGEGGAVDSNLCNQDEIPPE-TQSCSLM--C-PNEC
1010 1020 1030 1040 1050
480 490 500 510 520 530
KIAA07 LMTEWGEWDECSATCG-MGMKKRHRMIKMNPADGSMCKAETSQAEKCMMPE-CHTIPCLL
.:.::: :..: .: :..: : . . :. .: :: ::.. :.. : : . :
KIAA16 VMSEWGLWSKCPQSCDPHTMQRRTRHL-LRPSLNSRTCAEDSQVQPCLLNENCFQFQYNL
1060 1070 1080 1090 1100 1110
540 550 560 570 580
KIAA07 SPWSEWSDCSVT----CGKGMRTRQRMLKSLAELG------DCNE-DLEQVEKCMLP---
. ::: :... ::.:.::: .:. . : .:.. .::. .. .:
KIAA16 T---EWSTCQLSENAPCGQGVRTR--LLSCVCSDGKPVSMDQCEQHNLEKPQRMSIPCLV
1120 1130 1140 1150 1160 1170
590 600 610 620 630
KIAA07 ECPIDCELTEWSQWSECNKSCGKG-HVIRTRMIQMEPQFGGAPCP-ETVQRKKCRIRKC-
:: ..:.:. :. :.::...::.: .. :::.: : : : ::: : .:.: : . :
KIAA16 ECVVNCQLSGWTAWTECSQTCGHGGRMSRTRFIIMPTQGEGRPCPTELTQEKTCPVTPCY
1180 1190 1200 1210 1220 1230
640 650 660
KIAA07 ---LRNPSIQKLRWREARE----------------SRRSEQLKEESEGEQ-F--------
: : : ::. . : :. . .... ::. :
KIAA16 SWVLGNWSACKLEGGDCGEGVQIRSLSCMVHSGSISHAAGRVEDALCGEMPFQDSILKQL
1240 1250 1260 1270 1280 1290
670 680 690 700 710
KIAA07 -----PG-CRMRPWTAWSECTKLCGGGIQERYMTVKKRFKSSQFT--------SCKDKK-
:: :.. :. :: : : : . . :: .. .: : :: ..
KIAA16 CSVPCPGDCHLTEWSEWSTCELTCIDG--RSFETVGRQSRSRTFIIQSFENQDSCPQQVL
1300 1310 1320 1330 1340 1350
720
KIAA07 EIRACNVHPC
: : :. :
KIAA16 ETRPCTGGKCYHYTWKASLWNNNERTVWCQRSDGVNVTGGCSPQARPAAIRQCIPACRKP
1360 1370 1380 1390 1400 1410
>>KIAA2036 ( 1322 res) pf06513 (1322 aa)
initn: 245 init1: 100 opt: 244 Z-score: 244.8 bits: 56.7 E(): 1.6e-08
Smith-Waterman score: 301; 26.113% identity (47.181% similar) in 337 aa overlap (335-641:676-971)
310 320 330 340 350 360
KIAA07 PFYDPEGGSITQVARVVIERIARKGEQCNIVPDNVDDIVADLA-PEEKDEDDTPETC-IY
.: .: : : . : . . . : .
KIAA20 TCIGFQLVRVGVGGGGGSAMLPPSTRALTPLPPQVCDGQPDCGRPGQVGPSPEEQGCGAW
650 660 670 680 690 700
370 380 390 400 410
KIAA07 SNWSPWSACSSSTCD---KGKRMRQRMLKAQLDLSVPCPDTQDFQPCMGPGCSDEDGSTC
. ::::. :: :: .:. : : . . : :. :. : :. .: ::
KIAA20 GPWSPWGPCSR-TCGPWGQGRSRRCSPLGLLVLQNCPGPEHQS-QACFTAACP-VDG---
710 720 730 740 750
420 430 440 450 460 470
KIAA07 TMSEWITWSP---CSISCGMGMRSRERYVKQFPEDGSVCT-LP-----TEETEKCTVNEE
:: :::: :: : : .:.: .. . : .:. :: :..:. : ..
KIAA20 ---EWSTWSPWSVCSEPC-RGTMTRQRQCHSPQNGGRTCAALPGGLHSTRQTKPCP-QDG
760 770 780 790 800 810
480 490 500 510 520
KIAA07 CSPSSCLMTEWGE--WDECSATCGMGMKKRHRMIKMNP-----ADGSMC-KAETSQAEK-
: ..: :: .. : : : . .. : . : : .... .:
KIAA20 CPNATCS----GELMFQPC-APCPLTCDDISGQVTCPPDWPCGSPGCWCPEGQVLGSEGW
820 830 840 850 860
530 540 550 560 570
KIAA07 CMMP-ECHTIPCLLSPWSEWSDCSVTCGKGMRTRQRMLKSLAELGDCNEDLEQVEKCML-
:. : .: :::.. : :.: .:. .: :.. . ..: :
KIAA20 CVWPRQC---PCLVDGARYWP--------GQR-----IKADCQLCICQDG--RPRRCRLN
870 880 890 900 910
580 590 600 610 620 630
KIAA07 PECPIDCELTEWSQWSECNKSCGKGHVIRTRMIQMEPQFGGAPCPETVQRKKCR-----I
:.: .:: . :: :..: :: .. :: . .. : : . . ..::
KIAA20 PDCAVDCGWSSWSPWAKCLGPCG------SQSIQWSFRSSNNPRP-SGRGRQCRGIHRKA
920 930 940 950 960
640 650 660 670 680 690
KIAA07 RKCLRNPSIQKLRWREARESRRSEQLKEESEGEQFPGCRMRPWTAWSECTKLCGGGIQER
:.: .:
KIAA20 RRCQTEPCEGCEHQGQVHRVGERWHGGPCRVCQCLHNLTAHCSPYCPLGSCPQGWVLVEG
970 980 990 1000 1010 1020
>>KIAA1233 ( 1023 res) fh08611 (1023 aa)
initn: 166 init1: 104 opt: 236 Z-score: 237.8 bits: 55.1 E(): 3.9e-08
Smith-Waterman score: 298; 27.018% identity (53.333% similar) in 285 aa overlap (405-660:24-291)
380 390 400 410 420 430
KIAA07 TCDKGKRMRQRMLKAQLDLSVPCPDTQDFQPCMGPGCSDEDGSTCTMSEWI--TWSPCSI
: :. .:. : : .: .:.:::
KIAA12 AVCLHIQTQQTVNDSLCDMVHRPPAMSQACNTEP---CP-PRWHVGSWGPCSA
10 20 30 40
440 450 460 470 480
KIAA07 SCGMGMRSRERYVKQFPEDGSVCTLPTEET--EKCTVNEECSPSSCLMTEWG--EWDECS
.::.:...:. : . : . : :: :: . . :. .: : ::..::
KIAA12 TCGVGIQTRDVYCLHPGETPA----PPEECRDEKPHALQACNQFDC-PPGWHIEEWQQCS
50 60 70 80 90 100
490 500 510 520 530 540
KIAA07 ATCGMGMKKRHRMIKMNPADGS-------MCKAETSQAEK-CMMPECHTIPCLLSPWSEW
::: : ..:. .. .::: .:.. ....: : .: : :. ..:
KIAA12 RTCGGGTQNRRVTCRQLLTDGSFLNLSDELCQGPKASSHKSCARTDC---PPHLAV-GDW
110 120 130 140 150 160
550 560 570 580
KIAA07 SDCSVTCGKGMRTRQRMLKSLAELGD--------CNE--DLEQVEKCMLPECP-IDCEL-
: :::.:: :.. :... . :: : : . : :..:..::: : :.
KIAA12 SKCSVSCGVGIQRRKQVCQRLAAKGRRIPLSEMMCRDLPGLPLVRSCQMPECSKIKSEMK
170 180 190 200 210 220
590 600 610 620 630 640
KIAA07 TEWSQWSECNKSCGKGHVIRTRMIQMEPQFGGAP--CPETVQRKKCRIRKCLRNPSIQKL
:. .. . : . .. . ... .:. :.: :: .:. ... ::
KIAA12 TKLGEQGPQILSVQRVYIQTREEKRINLTIGSRAYLLPNTSVIIKCPVRR-FQKSLIQ--
230 240 250 260 270
650 660 670 680 690 700
KIAA07 RW-REARESRRSEQLKEESEGEQFPGCRMRPWTAWSECTKLCGGGIQERYMTVKKRFKSS
: ...: . :..:
KIAA12 -WEKDGRCLQNSKRLGITKSGSLKIHGLAAPDIGVYRCIAGSAQETVVLKLIGTDNRLIA
280 290 300 310 320 330
>>KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202 aa)
initn: 291 init1: 143 opt: 236 Z-score: 237.1 bits: 55.2 E(): 4.3e-08
Smith-Waterman score: 422; 25.250% identity (46.750% similar) in 400 aa overlap (362-724:663-1015)
340 350 360 370 380 390
KIAA07 CNIVPDNVDDIVADLAPEEKDEDDTPETCIYSNWSPWSACSSSTCDKGKRMRQRMLKAQL
.. ::::. : :.. . .:.
KIAA14 CSTLEDSSNMSLWTQNITACPVRNVTRDGGFGPWSPWQPCEHLDGDNSGSC---LCRAR-
640 650 660 670 680
400 410 420 430 440
KIAA07 DLSVPCPDTQDFQPCMGPG-----CSDEDGSTCTMSEWITWSPCSISCGMGMRSRERYVK
. . : : .. :.::. :: ..:. . : .:. :: :::.:.. :.: .
KIAA14 SCDSPRPRCGGLD-CLGPAIHIANCS-RNGA---WTPWSSWALCSTSCGIGFQVRQRSCS
690 700 710 720 730 740
450 460 470 480 490 500
KIAA07 Q-FPEDGS-VCTLPTEETEKCTVNEECSPSSCLMTEWGEWDECSATCGMGMKKRHRMIKM
. :. :. .:. ..: . :. : : : . . :: :..::..:: ::..:.: .
KIAA14 NPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPC-PVPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSRRRACE-
750 760 770 780 790 800
510 520 530 540 550 560
KIAA07 NPADGSMCKAETSQAEKCMMPECHTIPCLLSPWSEWSDCSVTCGKGMRTRQRM-LKSLAE
.:. : . . . : : . .::. : .:: : : : .::. . :
KIAA14 ---NGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVR-RNTPWTPWLPVNVTQG-GARQEQRFRFTCRAP
810 820 830 840 850
570 580 590
KIAA07 LGDCNEDLEQVEKCMLPECPID----CE---LTE-------------------WSQWSEC
:.: . .. :: : :. :.: :. :: :
KIAA14 LADPHGLQFGRRRTETRTCPADGSGSCDTDALVEDLLRSGSTSPHTVSGGWAAWGPWSSC
860 870 880 890 900 910
600 610 620 630 640 650
KIAA07 NKSCGKGHVIRTRM-IQMEPQFGGAPC-PETVQRKKCRIRKCLRNPSIQKLRWREARESR
...: : .: : . ::. :: :: .... . : . : : . :
KIAA14 SRDCELGFRVRKRTCTNPEPRNGGLPCVGDAAEYQDCNPQAC---PV--RGAW-------
920 930 940 950 960
660 670 680 690 700 710
KIAA07 RSEQLKEESEGEQFPGCRMRPWTAWSECTKLCGGGIQERYMTVKKRFKSSQFTSCKDKKE
.: ::.:: :. :::: .: . . : : .
KIAA14 ---------------SC----WTSWSPCSASCGGGHYQRTRSCTSPAPSPGEDICLGLHT
970 980 990 1000
720
KIAA07 IRA-CNVHPC
.: : .. :
KIAA14 EEALCATQACPEGWSPWSEWSKCTDDGAQSRSRHCEELLPGSSACAGNSSQSRPCPYSEI
1010 1020 1030 1040 1050 1060
>>KIAA1777 ( 954 res) fh19201x1 (954 aa)
initn: 224 init1: 114 opt: 181 Z-score: 182.6 bits: 44.8 E(): 4.7e-05
Smith-Waterman score: 196; 24.893% identity (45.494% similar) in 233 aa overlap (425-638:138-361)
400 410 420 430 440 450
KIAA07 VPCPDTQDFQPCMGPGCSDEDGSTCTMSEWITWSPCSISCGMGMRSRERYV-KQFPEDGS
..:: . : . : :. :.: .: .
KIAA17 SGLKVREVFINVTRQQVEDFHGPEDYWCQCVAWSHLGTSKSRKASVRIAYLRKNFEQDPQ
110 120 130 140 150 160
460 470 480 490 500
KIAA07 VCTLPTEETEKCTVNEECSPSSCL---MTEWGEWDE---CSATCGMGMKKRHRMI----K
.: : . .: : . .:: . .: .. . : .: .
KIAA17 GREVPIEGM----IVLHCRPPEGVPAAEVEWLKNEEPIDSEQDENIDTRADHNLIIRQAR
170 180 190 200 210 220
510 520 530 540 550 560
KIAA07 MNPADGSMCKAETSQAEKCMMPECHTIPCL--LSPWSEWSDCSVTCGKGMRTRQRMLKSL
.. . . : : . :.. . .. : :.::: :.: ::.: . :.: .
KIAA17 LSDSGNYTCMAANIVAKRRSLSATVVVYVNGGWSSWTEWSACNVRCGRGWQKRSRTCTNP
230 240 250 260 270 280
570 580 590 600 610
KIAA07 AEL--GDCNEDLEQVEK--CMLPECPIDCELTEWSQWSECNKSCGKGHVIRTRMIQMEP-
: : : : . .:.: : ::.: ::.:: :. : : .: : :
KIAA17 APLNGGAFCEGM-SVQKITCT-SLCPVDGSWEVWSEWSVCSPECE--H-LRIRECTAPPP
290 300 310 320 330
620 630 640 650 660 670
KIAA07 QFGGAPCPETVQRKK-CRIRKCLRNPSIQKLRWREARESRRSEQLKEESEGEQFPGCRMR
. :: : :... : :.
KIAA17 RNGGKFCEGLSQESENCTDGLCILDKKPLHEIKPQSIENASDIALYSGLGAAVVAVAVLV
340 350 360 370 380 390
724 residues in 1 query sequences
1986781 residues in 2037 library sequences
Scomplib [34.26]
start: Thu Dec 18 15:15:02 2008 done: Thu Dec 18 15:15:03 2008
Total Scan time: 0.550 Total Display time: 0.220
Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]