# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk04655s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA0761.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0761, 551 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7825870 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3104+/-0.000188; mu= 12.2336+/- 0.010 mean_var=84.5813+/-16.316, 0's: 37 Z-trim: 40 B-trim: 21 in 2/63 Lambda= 0.139456 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|114558155|ref|XP_513612.2| PREDICTED: Mid-1-rel ( 551) 3758 765.9 0 gi|109012665|ref|XP_001087523.1| PREDICTED: simila ( 551) 3647 743.6 3.4e-212 gi|122134301|sp|Q1LZF8.1|CLCC1_BOVIN RecName: Full ( 542) 3069 627.3 3.4e-177 gi|194036565|ref|XP_001927252.1| PREDICTED: chlori ( 556) 3003 614.0 3.5e-173 gi|51858922|gb|AAH81736.1| Clcc1 protein [Rattus n ( 541) 2718 556.7 6.2e-156 gi|81869808|sp|Q9WU61.1|CLCC1_RAT RecName: Full=Ch ( 541) 2707 554.5 2.9e-155 gi|12804163|gb|AAH02939.1| CLCC1 protein [Homo sap ( 501) 2689 550.8 3.3e-154 gi|81880236|sp|Q99LI2.1|CLCC1_MOUSE RecName: Full= ( 539) 2662 545.4 1.5e-152 gi|122889904|emb|CAM14497.1| chloride channel CLIC ( 544) 2662 545.4 1.5e-152 gi|148670033|gb|EDL01980.1| chloride channel CLIC- ( 556) 2662 545.4 1.6e-152 gi|73959387|ref|XP_537044.2| PREDICTED: similar to ( 512) 2594 531.7 1.9e-148 gi|109012668|ref|XP_001087176.1| PREDICTED: simila ( 501) 2580 528.9 1.3e-147 gi|126311528|ref|XP_001381929.1| PREDICTED: simila ( 564) 2517 516.2 9.5e-144 gi|149708824|ref|XP_001493137.1| PREDICTED: chlori ( 530) 2369 486.5 8.4e-135 gi|149025713|gb|EDL81956.1| chloride channel CLIC- ( 507) 2293 471.1 3.2e-130 gi|17736804|dbj|BAB79264.1| Mid-1-related chloride ( 507) 2291 470.7 4.3e-130 gi|149025715|gb|EDL81958.1| chloride channel CLIC- ( 394) 2259 464.2 3.1e-128 gi|149025709|gb|EDL81952.1| chloride channel CLIC- ( 395) 2259 464.2 3.1e-128 gi|17736810|dbj|BAB79267.1| Mid-1-related chloride ( 394) 2250 462.4 1.1e-127 gi|17736808|dbj|BAB79266.1| Mid-1-related chloride ( 395) 2250 462.4 1.1e-127 gi|17736800|dbj|BAB79262.1| Mid-1-related chloride ( 430) 2168 445.9 1.1e-122 gi|109012671|ref|XP_001087055.1| PREDICTED: simila ( 430) 2060 424.2 3.7e-116 gi|149025712|gb|EDL81955.1| chloride channel CLIC- ( 360) 1834 378.7 1.6e-102 gi|17736806|dbj|BAB79265.1| Mid-1-related chloride ( 360) 1834 378.7 1.6e-102 gi|17736802|dbj|BAB79263.1| Mid-1-related chloride ( 366) 1698 351.3 2.8e-94 gi|149410604|ref|XP_001505350.1| PREDICTED: simila ( 581) 1696 351.1 5.2e-94 gi|118094012|ref|XP_422186.2| PREDICTED: similar t ( 514) 1636 339.0 2e-90 gi|109012674|ref|XP_001086934.1| PREDICTED: simila ( 366) 1595 330.6 4.8e-88 gi|73959383|ref|XP_866359.1| PREDICTED: similar to ( 425) 1581 327.8 3.8e-87 gi|55960057|emb|CAI14362.1| chloride channel CLIC- ( 262) 1507 312.8 8e-83 gi|193786863|dbj|BAG52186.1| unnamed protein produ ( 262) 1503 312.0 1.4e-82 gi|82110023|sp|Q91892.1|CLCC1_XENLA RecName: Full= ( 508) 1257 262.7 1.8e-67 gi|213626239|gb|AAI70076.1| Unknown (protein for M ( 561) 1244 260.1 1.2e-66 gi|73959385|ref|XP_866374.1| PREDICTED: similar to ( 361) 1141 239.2 1.5e-60 gi|189539413|ref|XP_695342.3| PREDICTED: similar t ( 503) 1102 231.5 4.4e-58 gi|194687663|ref|XP_001256542.2| PREDICTED: simila ( 195) 920 194.5 2.3e-47 gi|47225727|emb|CAG08070.1| unnamed protein produc ( 261) 571 124.4 3.9e-26 gi|210080840|gb|EEA30014.1| hypothetical protein B ( 669) 550 120.6 1.5e-24 gi|210129478|gb|EEA77152.1| hypothetical protein B ( 685) 541 118.8 5.2e-24 gi|123121900|emb|CAM17753.1| chloride channel CLIC ( 84) 462 102.1 6.7e-20 gi|149025708|gb|EDL81951.1| chloride channel CLIC- ( 93) 427 95.1 9.6e-18 gi|148670032|gb|EDL01979.1| chloride channel CLIC- ( 112) 420 93.7 2.9e-17 gi|156224281|gb|EDO45108.1| predicted protein [Nem ( 487) 386 87.5 9.9e-15 gi|210132024|gb|EEA79691.1| hypothetical protein B ( 247) 253 60.4 6.8e-07 gi|41352440|gb|AAS00947.1| ORF57 [Ostreid herpesvi ( 316) 239 57.7 5.8e-06 gi|221122647|ref|XP_002154667.1| PREDICTED: simila ( 531) 237 57.5 1.1e-05 gi|72160273|ref|XP_790217.1| PREDICTED: similar to ( 87) 203 50.0 0.00034 gi|210120094|gb|EEA67815.1| hypothetical protein B ( 402) 202 50.4 0.0012 >>gi|114558155|ref|XP_513612.2| PREDICTED: Mid-1-related (551 aa) initn: 3758 init1: 3758 opt: 3758 Z-score: 4086.5 bits: 765.9 E(): 0 Smith-Waterman score: 3758; 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