# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk04642s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0760.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0760, 1224 aa vs ./tmplib.23663 library 1986281 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8256+/-0.00664; mu= 14.2476+/- 0.450 mean_var=174.6524+/-44.238, 0's: 0 Z-trim: 70 B-trim: 16 in 1/39 Lambda= 0.097048 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1954 ( 468 res) fk02322 ( 468) 456 76.8 8.9e-15 KIAA2033 ( 766 res) ej00602s1 ( 766) 403 69.7 2e-12 KIAA1827 ( 469 res) fk01409 ( 469) 389 67.4 5.9e-12 KIAA1198 ( 553 res) fg01911 ( 553) 376 65.7 2.3e-11 KIAA0972 ( 702 res) hj06859 ( 702) 377 66.0 2.4e-11 KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 ( 821) 374 65.7 3.5e-11 KIAA2007 ( 580 res) fj01689 ( 580) 371 65.0 3.8e-11 KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 ( 579) 367 64.5 5.7e-11 KIAA1710 ( 515 res) fj18457 ( 515) 359 63.3 1.2e-10 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 359 63.3 1.2e-10 KIAA0557 ( 493 res) hh01334 ( 493) 357 63.0 1.4e-10 KIAA1431 ( 891 res) fj00022 ( 891) 357 63.3 1.9e-10 KIAA1615 ( 484 res) fj13419 ( 484) 353 62.4 2e-10 KIAA1349 ( 752 res) fj00940 ( 752) 354 62.8 2.3e-10 KIAA1956 ( 680 res) fk08713 ( 680) 353 62.6 2.4e-10 KIAA1982 ( 599 res) fk06527(revised) ( 599) 351 62.2 2.7e-10 KIAA1508 ( 573 res) hk06576 ( 573) 350 62.1 2.9e-10 KIAA1015 ( 841 res) hk03609(revised) ( 841) 352 62.6 3e-10 KIAA0628 ( 540 res) hh01433 ( 540) 347 61.6 3.8e-10 KIAA0426 ( 613 res) hh01274 ( 613) 346 61.6 4.5e-10 KIAA1979 ( 309 res) fj09511 ( 309) 342 60.6 4.5e-10 KIAA1611 ( 813 res) fj12627 ( 813) 346 61.7 5.3e-10 KIAA1396 ( 551 res) hj08221 ( 551) 342 60.9 6.2e-10 KIAA1806 ( 481 res) fk00438 ( 481) 337 60.2 9.4e-10 KIAA1962 ( 746 res) hm00158 ( 746) 339 60.7 9.9e-10 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 340 61.0 1e-09 KIAA2003 ( 460 res) ah02593 ( 460) 335 59.8 1.1e-09 KIAA0065 ( 848 res) ha00946 ( 848) 338 60.6 1.2e-09 KIAA1559 ( 544 res) fh19195 ( 544) 335 59.9 1.2e-09 KIAA1948 ( 487 res) fh24556 ( 487) 334 59.7 1.3e-09 KIAA0326 ( 927 res) hg00579 ( 927) 337 60.6 1.4e-09 KIAA1969 ( 595 res) fk06944 ( 595) 331 59.4 1.9e-09 KIAA1141 ( 914 res) hk01833 ( 914) 329 59.4 2.9e-09 KIAA0441 ( 702 res) hh00601s1 ( 702) 325 58.7 3.7e-09 KIAA0924 ( 617 res) hh02883 ( 617) 324 58.5 3.8e-09 KIAA1947 ( 608 res) fh23660 ( 608) 322 58.2 4.6e-09 KIAA0961 ( 530 res) hj05830 ( 530) 321 58.0 4.7e-09 KIAA1231 ( 1061 res) fh08195s1 (1061) 325 59.0 4.7e-09 KIAA0798 ( 682 res) hk06584 ( 682) 321 58.1 5.4e-09 KIAA0412 ( 720 res) hg03242 ( 720) 321 58.2 5.6e-09 KIAA1829 ( 557 res) hj00069 ( 557) 319 57.7 5.8e-09 KIAA1588 ( 613 res) fj08823 ( 613) 314 57.1 1e-08 KIAA1020 ( 638 res) fg00473s1 ( 638) 308 56.3 1.8e-08 KIAA0478 ( 1253 res) hh05955 (1253) 305 56.3 3.6e-08 KIAA1388 ( 599 res) fj06552 ( 599) 299 55.0 4.2e-08 KIAA1782 ( 545 res) aj00273 ( 545) 296 54.5 5.4e-08 KIAA1190 ( 174 res) hg03443a ( 174) 283 52.0 9.9e-08 KIAA0236 ( 1696 res) ha04654 (1696) 286 53.8 2.7e-07 KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 278 52.1 3.5e-07 KIAA1993 ( 532 res) bg00180 ( 532) 261 49.6 1.6e-06 >>KIAA1954 ( 468 res) fk02322 (468 aa) initn: 1192 init1: 393 opt: 456 Z-score: 357.2 bits: 76.8 E(): 8.9e-15 Smith-Waterman score: 502; 27.040% identity (53.147% similar) in 429 aa overlap (7-373:43-463) 10 20 30 KIAA07 MEDESIYTCDHCQQDFESLADLTDH-RAHRCPG--- : ::.:.. : ..:: : ..:. : KIAA19 RPSECETLGSNLGHNADLLNENNILAKKKPYKCDKCRKAFIHRSSLTKHEKTHKGEGAFP 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 KIAA07 DGDDD---PQLSWVASSPSSKDVASPTQM-----IGDG-----CDL---------GLGEE .: :. : . . .: ::. : : :.. .::.. 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KIAA11 ---TYECKECGKAFLYSTH-FRIHERTHTREKPYE---CKQC----GRVFIYFSHLRRHE 450 460 470 480 410 420 430 440 450 460 KIAA07 KNHAYPVMQFGNISAFHCNYCPEMFADINSLQEHIRVSHCGPNANPSDGNNAFFCNQCSM ..:. ... .:. : . :. .:::. : :. : : . : : ::. KIAA11 RSHT-------GVKPCECKQCGKAFTCLNSLKVHKRI-HTG--------ERPFQCRQCGK 490 500 510 520 530 470 480 490 500 510 520 KIAA07 GFLTESSLTEHIQQAHCSVGSAKLESPVVQPTQSFMEVYSCPYCTNSPIFGSILKLTKHI .: .:: : ...: KIAA11 AFSYSKSLHVH-ERTHSRQKP 540 550 >>KIAA0972 ( 702 res) hj06859 (702 aa) initn: 1778 init1: 375 opt: 377 Z-score: 295.6 bits: 66.0 E(): 2.4e-11 Smith-Waterman score: 444; 29.348% identity (57.246% similar) in 276 aa overlap (7-265:423-677) 10 20 KIAA07 MEDESIYTCDHCQQDFESLADLTDH-RAH------R : :..: ..: . . : .: :.: . KIAA09 VKSSEYHENKKSYQTSVHRVRRRSHSMMKPYKCNECGKSFCQKGHLIQHQRTHTGEKPFE 400 410 420 430 440 450 30 40 50 60 70 80 KIAA07 CPGDGDDDPQLSWVASSPSSKDVASPTQMIGDGCDLGL-------GEEEGGTGL-PYPCQ : : : : ... . . .: . . : . :... :: :: :. KIAA09 CSECGKTFSQKSHLSTHQRIHTAEKPYKC--NECGKTFVQKSTLRGHQRIHTGEKPYECS 460 470 480 490 500 510 90 100 110 120 130 140 KIAA07 FCDKSFIRLSYLKRHEQIHSDKLPFKCTYCSRLFKHKRSRDRHIKLHTGDKKYHCHECEA : :.:.. : :. :..::. . :.:. :.. : .: . : . :::.: :.:.::: KIAA09 ECGKTFVQKSTLRDHHRIHTGEKSFQCNQCGKTFGQKSNLRIHQRTHTGEKTYQCNECEK 520 530 540 550 560 570 150 160 170 180 190 200 KIAA07 AFSRSDHLKIHLKTHSSSKPFKCTVCKRGFSSTSSLQSHMQAHKKNKEHLAKSEKEAKKD .: :.::: : :::.. :::::. : . :. ::.:. :.. : .: KIAA09 SFWRKDHLIQHQKTHTGEKPFKCNECGKTFARTSTLRVHQRIHTGEKP------------ 580 590 600 610 210 220 230 240 250 260 KIAA07 DFMCDYCEDTFSQTEELEKHVLTRHPQL-SEKADLQCIHCPEVFVDENTLLAHIHQAHAN : :. : : ..: .:. : .. . . .:: .: ..: ....: : ...:.. KIAA09 -FKCNECGKKF-----VRKAILSDHQRIHTGEKPFQCNKCGKTFGQKSNLRIH-QRTHSG 620 630 640 650 660 670 270 280 290 300 310 KIAA07 QK-HKCPMCPEQFSSVEGVYCHLDSHRQPDSSNHSVSPDPVLGSVASMSSATPDSSASVE .: ..: KIAA09 EKSYECNEYGKLCKKSTLSLYQKIQGEGNPY 680 690 700 >>KIAA1871 ( 821 res) hj05256s1 (821 aa) initn: 2368 init1: 343 opt: 374 Z-score: 292.6 bits: 65.7 E(): 3.5e-11 Smith-Waterman score: 740; 25.035% identity (52.900% similar) in 707 aa overlap (78-767:141-767) 50 60 70 80 90 100 KIAA07 SSKDVASPTQMIGDGCDLGLGEEEGGTGLPYPCQFCDKSFIRLSYLKRHEQIHSDKLPFK : :. :.:.: : : : :..::. . :. KIAA18 SSHRYEVSGQNFKQKSGLTEHQKIHNINKTYECKECEKTFNRSSNLIIHQRIHTGNKPYV 120 130 140 150 160 170 110 120 130 140 150 160 KIAA07 CTYCSRLFKHKRSRDRHIKLHTGDKKYHCHECEAAFSRSDHLKIHLKTHSSSKPFKCTVC :. :.. ... . : ..::: : : :::: :..:..: : . ::...:..: : KIAA18 CNECGKDSNQSSNLIIHQRIHTGKKPYICHECGKDFNQSSNLVRHKQIHSGGNPYECKEC 180 190 200 210 220 230 170 180 190 200 210 220 KIAA07 KRGFSSTSSLQSHMQAHKKNKEHLAKSEKEAKKDDFMCDYCEDTFSQTEELEKHVLTRHP ..:...:.: :.. :...: .: :. : .:::. .: : : KIAA18 GKAFKGSSNLVLHQRIHSRGKPYL-------------CNKCGKAFSQSTDLIIH----HR 240 250 260 270 230 240 250 260 270 280 KIAA07 QLSEKADLQCIHCPEVFVDENTLLAHIHQAHANQKH-KCPMCPEQFSSVEGVYCHLDSHR . . .: : ..: . . :. : .. :...: :: : . : . . :: :. KIAA18 IHTGEKPYECYDCGQMFSQSSHLVPH-QRIHTGEKPLKCNECEKAFRQ----HSHLTEHQ 280 290 300 310 320 290 300 310 320 330 340 KIAA07 QPDSSNHSVS----PDPVLGSVASMSSATPDSSASVERGSTPDSTLKPLRGQKKMRDDGQ . :... : .: .. .. ..:. : . :: ....... . KIAA18 RLHSGEKPYECHRCGKTFSGRTAFLKHQRLHAGEKIEECEKTFSKDEELREEQRIHQEEK 330 340 350 360 370 380 350 360 370 380 390 400 KIAA07 GWTKVVYSCPYCSKRDFNSLAVLEIHLKTIHADKPQQSHTCQICLDSMPTLYNLNEHVRK . : : :. :.:.. . : : : ..:: . :. : . .: . . . KIAA18 A-----YWCNQCG-RNFQGTSDLIRHQVTHTGEKPYE---CKECGKT----FNQSSDLLR 390 400 410 420 430 410 420 430 440 450 460 KIAA07 LHKNHAYPVMQFGNISAFHCNYCPEMFADINSLQEHIRVSHCGPNANPSDGNNAFFCNQC :. :. :. :. : . : ..: .: :: : : .. . :..: KIAA18 HHRIHS------GEKPCV-CSKCGKSFRGSSDLIRHHRV-HTG--------EKPYECSEC 440 450 460 470 470 480 490 500 510 KIAA07 SMGFLTESSLTEHIQQAH-------CS-VGSA-KLESPVVQPTQ--SFMEVYSCPYCTNS . .: .: :. : :. : :. :.: . .: ..: . : . : : : . KIAA18 GKAFSQRSHLVTH-QKIHTGEKPYQCTECGKAFRRRSLLIQHRRIHSGEKPYECKEC--G 480 490 500 510 520 530 520 530 540 550 560 570 KIAA07 PIFGSILKLTKHIKENHKNIPLAHSKKSKAEQSPVSSDVEVSSPKRQRLSASANSISNGE .: . : .: :... :. .. .. :.: :. . .. . :.: KIAA18 KLF---IWRTAFLK--HQSL---HTGEKLECEKTFSQDEELRGEQKIHQEAKA------- 540 550 560 570 580 580 590 600 610 620 630 KIAA07 YPCNQCDLKFSNFESFQTHLKLHLELLLRKQACPQCKEDFDSQESLLQHLTVHYMTTSTH : :::: :.. .. : : . . : .: . :... .::.: .: . KIAA18 YWCNQCGRAFQGSSDLIRHQVTHTRE--KPYECKECGKTFNQSSDLLRHHRIH--SGEKP 590 600 610 620 630 640 650 660 670 680 690 KIAA07 YVCESCDKQFSSVDDLQKHLLDMHTFVL-YHCTLCQEVFDSKVSIQVHLAVKHSNEKKMY :::..: :.: . .:: :: .:: :.:. : ..:... . .: . :..:: : KIAA18 YVCNKCGKSFRGSSDLIKHH-RIHTGEKPYECSECGKAFSQRSHLATHQKI-HTGEKP-Y 640 650 660 670 680 690 700 710 720 730 740 750 KIAA07 RCTACNWDFRKEADLQVHVKHSHLGNPAKAHKCIFCGETFSTEVELQCHITTHSKKYNCK .:. :. ::... : ..: .: . : ..: ::. : .. . : :. . . . 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KIAA20 GEKAFD-------CSDSGKSFINHSHLQGH------LRTHNGESL-HEWKECGRGFIHST 190 200 210 220 100 110 120 130 140 150 KIAA07 YLKRHEQIHSDKLPFKCTYCSRLFKHKRSRDRHIKLHTGDKKYHCHECEAAFSRSDHLKI : . : : .. :.:: :.. :... . :. ::::. :.:.:: ::.:: .: KIAA20 DLAVRIQTHRSEKPYKCKECGKGFRYSAYLNIHMGTHTGDNPYECKECGKAFTRSCQLTQ 230 240 250 260 270 280 160 170 180 190 200 210 KIAA07 HLKTHSSSKPFKCTVCKRGFSSTSSLQSHMQAHKKNKEHLAKSEKEAKKDDFMCDYCEDT : :::.. ::.:: : :.:. .: :..::. : .: . : : . KIAA20 HRKTHTGEKPYKCKDCGRAFTVSSCLSQHMKIHVGEKP-------------YECKECGIA 290 300 310 320 330 220 230 240 250 260 270 KIAA07 FSQTEELEKHVLTRHPQLSEKADLQCIHCPEVFVDENTLLAHIHQAHANQKHKCPMCPEQ :... .: .: : : . : ..: : . : . . : :.. . . .:: : . KIAA20 FTRSSQLTEH-LKTH---TAKDPFECKICGKSFRNSSCLSDHFRIHTGIKPYKCKDCGKA 340 350 360 370 380 390 280 290 300 310 320 330 KIAA07 FSSVEGVYCHLDSHRQPDSSNHSVSPDPVLGSVASMSSATPDSSASVERGSTPDSTLKPL :.. . : .: :.. :.. . :: . . . . : : .: KIAA20 FTQNSDLTKHARTH-----SGERPYECKECGKAFARSSRLSEHTRT-HTGEKPFECVKCG 400 410 420 430 440 340 350 360 370 380 KIAA07 RGQKKMRDDGQGWTKV-----VYSCPYCSKRDFNSLAVLEIHLKTIHADKPQQSHTCQIC .. . .. .: .. . : :.: :. . :. :..: : :: ::. : KIAA20 KAFA-ISSNLSGHLRIHTGEKPFECLECGKA-FTHSSSLNNHMRTHSAKKP---FTCMEC 450 460 470 480 490 500 390 400 410 420 430 440 KIAA07 LDSM--PTLYNLNEHVRKLHKNHAYPVMQFGNISAFHCNYCPEMFADINSLQEHIRVSHC .. :: :: :.: .: .. : ..:. : . :. ::.: : : .: KIAA20 GKAFKFPTCVNL--HMR-IHTGEK-P---------YKCKQCGKSFSYSNSFQLHER-THT 510 520 530 540 450 460 470 480 490 500 KIAA07 GPNANPSDGNNAFFCNQCSMGFLTESSLTEHIQQAHCSVGSAKLESPVVQPTQSFMEVYS : .: . :..:. .: . ::. .: KIAA20 GE--KP------YECKECGKAFSSSSSFRNHERRHADERLSA 550 560 570 580 510 520 530 540 550 560 KIAA07 CPYCTNSPIFGSILKLTKHIKENHKNIPLAHSKKSKAEQSPVSSDVEVSSPKRQRLSASA >>KIAA1874 ( 579 res) hk07257s1 (579 aa) initn: 1755 init1: 363 opt: 367 Z-score: 288.9 bits: 64.5 E(): 5.7e-11 Smith-Waterman score: 446; 27.336% identity (57.785% similar) in 289 aa overlap (4-288:326-579) 10 20 30 KIAA07 MEDESIYTCDHCQQDFESLADLTDH-RAHRCPG :. :::..: ..: :.:: : :.: KIAA18 KEKKPHKCNDCGELFTYHSVLIRHQRVHTGEKPYTCNECGKSFSHRANLTKHQRTHT--- 300 310 320 330 340 350 40 50 60 70 80 90 KIAA07 DGDDDPQLSWVASSPSSKDVASPTQMIGDGCDLGLGEEEGGTGLPYPCQFCDKSFIRLSY .. . : : . . .. .. . .::. :: :. : :.: : .. 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