# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh06485.fasta.nr -Q ../query/KIAA0754.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0754, 1174 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7771878 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4883+/-0.000216; mu= 3.3283+/- 0.012 mean_var=205.9353+/-40.292, 0's: 37 Z-trim: 207 B-trim: 431 in 1/67 Lambda= 0.089374 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|149773456|ref|NP_055853.1| hypothetical protein (1427) 7623 997.0 0 gi|114555669|ref|XP_001170899.1| PREDICTED: hypoth (1363) 5990 786.4 0 gi|34534555|dbj|BAC87042.1| unnamed protein produc ( 980) 5553 729.9 1.7e-207 gi|57472005|gb|AAW51128.1| minus agglutinin [Chlam (4027) 832 121.8 7.8e-24 gi|60678627|gb|AAX33674.1| plus agglutinin [Chlamy (2371) 789 116.0 2.5e-22 gi|70905619|gb|AAZ14258.1| hypothetical protein, c (1514) 782 114.9 3.5e-22 gi|41400384|gb|AAS07044.1| plus agglutinin [Chlamy (3409) 785 115.7 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gi|117606933|gb|ABK42021.1| vegetative cell wall p ( 613) 649 97.3 2.8e-17 gi|126341726|ref|XP_001380909.1| PREDICTED: simila (1945) 650 98.0 5.5e-17 gi|194183437|gb|EDW97048.1| GE24546 [Drosophila ya ( 879) 641 96.5 7.3e-17 gi|198429187|ref|XP_002120948.1| PREDICTED: simila ( 739) 639 96.1 7.8e-17 gi|126235390|gb|ABN98790.1| hypothetical protein M ( 946) 632 95.4 1.7e-16 gi|76262500|gb|ABA41400.1| pherophorin-C2 protein ( 853) 631 95.2 1.7e-16 gi|129558608|gb|EAL93999.2| PT repeat family prote (2170) 635 96.1 2.3e-16 gi|221041954|dbj|BAH12654.1| unnamed protein produ ( 853) 624 94.3 3.3e-16 gi|221043636|dbj|BAH13495.1| unnamed protein produ ( 904) 624 94.3 3.4e-16 gi|211591430|emb|CAP97660.1| Pc22g03720 [Penicilli (1373) 627 94.9 3.4e-16 gi|194156816|gb|EDW71717.1| GK24124 [Drosophila wi ( 673) 620 93.7 4e-16 gi|46227103|gb|EAK88053.1| large low complexity pr (1610) 626 94.8 4.2e-16 gi|1572721|gb|AAB09089.1| megakaryocyte stimulatin (1404) 624 94.5 4.6e-16 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gi|210127071|gb|EEA74755.1| hypothetical protein B (1028) 604 91.8 2.2e-15 gi|163965366|ref|NP_001106674.1| nascent polypepti (2078) 608 92.6 2.5e-15 gi|6458143|gb|AAF10038.1|AE001904_14 hypothetical ( 839) 600 91.2 2.8e-15 gi|194199693|gb|EDX13269.1| GD20599 [Drosophila si ( 908) 600 91.2 2.9e-15 >>gi|149773456|ref|NP_055853.1| hypothetical protein LOC (1427 aa) initn: 7623 init1: 7623 opt: 7623 Z-score: 5321.8 bits: 997.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 7623; 100.000% identity (100.000% similar) in 1174 aa overlap (1-1174:254-1427) 10 20 30 KIAA07 FSSATWPRATKSLAKGGFSEKQHPLGDTAC :::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 HSANPPHEFQPVESEAVATSGNTDVMQESRFSSATWPRATKSLAKGGFSEKQHPLGDTAC 230 240 250 260 270 280 40 50 60 70 80 90 KIAA07 TVEMPPLSPCLSEELLDPELHVLITPSLREKTESELKFEEDERWIMMEAEGEWEEEKLSD :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|149 TVEMPPLSPCLSEELLDPELHVLITPSLREKTESELKFEEDERWIMMEAEGEWEEEKLSD 290 300 310 320 330 340 100 110 120 130 140 150 KIAA07 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