# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk04424.fasta.huge -Q ../query/KIAA0751.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0751, 1200 aa vs ./tmplib.23663 library 1986305 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.5001+/-0.00722; mu= -4.6732+/- 0.486 mean_var=277.3428+/-66.127, 0's: 0 Z-trim: 12 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.077013 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0340 ( 1053 res) hg01396 (1053) 2145 252.6 2.3e-67 KIAA0237 ( 315 res) ha06286 ( 315) 1145 141.0 2.7e-34 KIAA0559 ( 1212 res) hh01510 (1212) 264 43.7 0.00021 KIAA0747 ( 1072 res) hk04143 (1072) 253 42.4 0.00045 KIAA0985 ( 697 res) hj08038 ( 697) 213 37.8 0.0072 >>KIAA0340 ( 1053 res) hg01396 (1053 aa) initn: 2759 init1: 1766 opt: 2145 Z-score: 1301.1 bits: 252.6 E(): 2.3e-67 Smith-Waterman score: 2886; 55.930% identity (73.023% similar) in 860 aa overlap (34-883:261-1047) 10 20 30 40 50 60 KIAA07 REGEKKRKKMQFETLRQVCNSVLSHFHGVFSSPPNILQN-ELFGQTLNNARKRSPSVSRD :.::. .. : :.:. .:.. : ::. 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KIAA05 RLHSYVKAEEDPMEDPYELKLLKHQIKQEFRRGTESLDHLAGLSHYYHADTSYRHFPKSE 380 390 400 410 420 430 130 140 150 160 170 KIAA07 EYIVDDEDVESRDEYERQRREE-------EYQSRYRS---DPNLARYPVKPQPYEEQMRI .: . :: :.: .. . ::.... ::..... .: .:. . KIAA05 KYSI------SRLTLEKQAAKQLPAAILYQKQSKHKKSLIDPKMSKF----SPIQESRDL 440 450 460 470 480 180 190 200 210 220 KIAA07 HAEVSRARHERRHS--DVSLANADLEDSRISMLRMDRPSRQR----SISERRAAMENQRS . . : : .: :.:. :: . ..:. :.. ... : KIAA05 EPDYSSYMTSSTSSIGGISSRARLLQDDITFGLRKNITDQQKFMGSSLGTGLGTLGNTIR 490 500 510 520 530 540 230 240 250 260 270 280 KIAA07 YSMERTREAQGPSSYAQRTTNHSPPTPRRS-PLPIDRPDLRRTDSLRKQHH--LDPS-SA ... ::. : : ..:. : :. . : : : . . :. :. :: : : KIAA05 SALQ--DEADKPYSSGSRSRPSSRPSSVYGLDLSIKRDSSSSSLRLKAQEAEALDVSFSH 550 560 570 580 590 600 290 300 310 320 330 KIAA07 VRKTKREKMETMLRNDS-----LSSDQSESVRPPPP--KPHKSKKG--GKMRQISLSSSE . .. : : .. ..: . ...:: : : .: .. : . :: .... KIAA05 ASSSARTKPTSLPISQSRGRIPIVAQNSEEESPLSPVGQPMGMARAAAGPLPPIS-ADTR 610 620 630 640 650 660 340 350 360 370 380 390 KIAA07 EELASTPEYTSCDDVEIESESVSEKGDSQKGKRKTSEQAVLSDSNTRSERQKEMMYFGGH ....:. .. ... :: .. : . . . : ..:::.. :..: .: . KIAA05 DQFGSSHSLPEVQQ-HMREESRTRGYDRDIAFIMDDFQHAMSDSEAYHLRREETDWFD-K 670 680 690 700 710 720 400 410 420 430 440 450 KIAA07 SLEEDLEWSEPQIKDSGVDTCSSTTLNEEHSHSDKHPVTWQPSKDGDRLI---GRILLNK : :: . :.: : . . :... : . . : .:: ... KIAA05 PRESRLE------NGHGLDRKLPERLVHSRPLSQHQEQIIQMNGKTMHYIFPHARIKITR 730 740 750 760 770 460 470 480 490 500 510 KIAA07 RLKDGSVPRDSGAMLGLKVVGGKMT--ESGRLCAFITKVKKGSLADTVGHLRPGDEVLEW :: .: :: ::...:::: .::.. :.:.:. :. :. .:.: : .:::: KIAA05 DSKDHTV---SGNGLGIRIVGGKEIPGHSGEIGAYIAKILPGGSAEQTGKLMEGMQVLEW 780 790 800 810 820 830 520 530 540 550 KIAA07 NGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQV----------------ELVVSRPIGDIPRI---- :: : . :.::: .:: ... : .. .: . .: . . KIAA05 NGIPLTSKTYEEVQSIISQQSGEAEICVRLDLNMLSDSENSQHLELHEPPKAVDKAKSPG 840 850 860 870 880 890 560 570 580 KIAA07 --PDSTHAQLESSS---------------SSFESQKMDRPSISVTSPMSPGM-------- : . :.:.. : : .: . : :: :: .:: KIAA05 VDPKQLAAELQKVSLQQSPLVLSSVVEKGSHVHSGPTSAGSSSVPSPGQPGSPSVSKKKH 900 910 920 930 940 950 590 600 610 620 630 KIAA07 --------LRDVPQFLSGQLSIKLWFDKVGHQLIVTILGAKDLPSREDGRPRNPYVKIYF . : . ..:...... .: .:. ::. :: :..: :... .:.::.:. KIAA05 GSSKPTDGTKVVSHPITGEIQLQINYD-LGN-LIIHILQARNLVPRDNNGYSDPFVKVYL 960 970 980 990 1000 1010 640 650 660 670 680 KIAA07 LPDR---------SDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYSPVHRREFRERMLEITLWDQAR :: : : . ::::: :.:.:.:.:::: ::. . ...... ::.:.:: : KIAA05 LPGRGQVMVVQNASAEYKRRTKHVQKSLNPEWNQTVIYKSISMEQLKKKTLEVTVWDYDR 1020 1030 1040 1050 1060 1070 690 700 710 720 730 KIAA07 VREEESEFLGEILIELE-TALLDDEPHWYKL--QTHDV-------SSLPLPHPSPYMPRR ..::::.::.: :. ::. :.:: : ::... :. :.: . . KIAA05 FSS--NDFLGEVLIDLSSTSHLDNTPRWYPLKEQTESIDHGKSHSSQSSQQSPKPSVIKS 1080 1090 1100 1110 1120 1130 740 750 760 770 780 790 KIAA07 QLHG--ESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSDYRHDGRDLQSSTLSVPEQVMSS . :: .:.. .: KIAA05 RSHGIFPDPSKDMQVPTIEKSHSSPGSSKSSSEGHLRSHGPSRSQSKTSVTQTHLEDAGA 1140 1150 1160 1170 1180 1190 >>KIAA0747 ( 1072 res) hk04143 (1072 aa) initn: 150 init1: 124 opt: 253 Z-score: 164.9 bits: 42.4 E(): 0.00045 Smith-Waterman score: 253; 29.744% identity (60.000% similar) in 195 aa overlap (536-719:877-1063) 510 520 530 540 550 560 KIAA07 DEVLEWNGRLLQGATFEEVYNIILESKPEPQVELVVSRPIGDIPRIPDSTHAQLESSSSS :. ..::. : . .:. .:::: KIAA07 PLSELLVADQLCLDRWFTLSSGQGQVLLRAQLGILVSQHSG----VEAHSHSYSHSSSSL 850 860 870 880 890 900 570 580 590 600 610 KIAA07 FESQKMDR--PSISVTSPMSPGMLRDVPQFLS------GQLSIKLWFDKVGHQLIVTILG : ... : :. ..: : : . : ::... ::. . ..:. . : KIAA07 SEEPELSGGPPHITSSAPELRQRLTHVDSPLEAPAGPLGQVKLTLWYYSEERKLVSIVHG 910 920 930 940 950 960 620 630 640 650 660 670 KIAA07 AKDLPSREDGR-PRNPYVKIYFLPDRSDKNKRRTKTVKKTLEPKWNQTFIYS-PVHRREF ..: :..:: : .:::.. .:::.. .::::. :.:: :..:. : . :. : KIAA07 CRSL--RQNGRDPPDPYVSLLLLPDKNRGTKRRTSQKKRTLSPEFNERFEWELPLD--EA 970 980 990 1000 1010 680 690 700 710 720 730 KIAA07 RERMLEITLWDQARVREEESEFLGEILIEL-ETALLDDEPHWYKLQTHDVSSLPLPHPSP ..: :.... ... .: :.::.. ..: :: : . .:: : KIAA07 QRRKLDVSVKSNSSFMSRERELLGKVQLDLAETDLSQGVARWYDLMDNKDKGSS 1020 1030 1040 1050 1060 1070 740 750 760 770 780 790 KIAA07 YMPRRQLHGESPTRRLQRSKRISDSEVSDYDCDDGIGVVSDYRHDGRDLQSSTLSVPEQV >>KIAA0985 ( 697 res) hj08038 (697 aa) initn: 343 init1: 169 opt: 213 Z-score: 143.4 bits: 37.8 E(): 0.0072 Smith-Waterman score: 213; 33.333% identity (68.468% similar) in 111 aa overlap (596-706:397-505) 570 580 590 600 610 620 KIAA07 FESQKMDRPSISVTSPMSPGMLRDVPQFLSGQLSIKLWFDKVGHQLIVTILGAKDLPSRE : : ..: .:. . .: ::. :: : . 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