# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk04328.fasta.nr -Q ../query/KIAA0749.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0749, 678 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7811859 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3043+/-0.00021; mu= 8.9350+/- 0.012 mean_var=145.1104+/-27.635, 0's: 27 Z-trim: 57 B-trim: 0 in 0/67 Lambda= 0.106469 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|119578435|gb|EAW58031.1| dendrin [Homo sapiens] ( 711) 4725 737.8 3.1e-210 gi|22653704|sp|O94850.2|DEND_HUMAN RecName: Full=D ( 657) 4584 716.1 9.7e-204 gi|109096430|ref|XP_001105260.1| PREDICTED: dendri ( 712) 4513 705.2 2e-200 gi|73996813|ref|XP_851155.1| PREDICTED: similar to ( 704) 3629 569.4 1.5e-159 gi|149714484|ref|XP_001491757.1| PREDICTED: simila ( 639) 3531 554.3 4.7e-155 gi|169234955|ref|NP_001013763.1| dendrin [Mus musc ( 710) 3479 546.4 1.3e-152 gi|149032121|gb|EDL87033.1| dendrin [Rattus norveg ( 707) 3469 544.8 3.7e-152 gi|1235591|emb|CAA65407.1| dendrin [Rattus norvegi ( 719) 3388 532.4 2.1e-148 gi|22654228|sp|P50617.2|DEND_RAT RecName: Full=Den ( 653) 3350 526.5 1.1e-146 gi|62510626|sp|Q80TS7|DEND_MOUSE Dendrin gi|74 ( 656) 3349 526.4 1.2e-146 gi|151553748|gb|AAI49381.1| DDN protein [Bos tauru ( 622) 3345 525.7 1.8e-146 gi|74211137|dbj|BAE37653.1| unnamed protein produc ( 617) 3099 487.9 4.3e-135 gi|114582192|ref|XP_001163769.1| PREDICTED: simila (1412) 311 60.1 6.2e-06 gi|158272841|gb|EDO98636.1| predicted protein [Chl (1170) 307 59.4 8.3e-06 gi|149016264|gb|EDL75510.1| similar to procollagen (1618) 293 57.4 4.6e-05 gi|209364566|ref|NP_001129231.1| collagen, type IV (1670) 293 57.4 4.7e-05 gi|82175621|sp|Q9YIB4.1|CO1A1_CYNPY RecName: Full= (1450) 292 57.2 4.7e-05 gi|114643600|ref|XP_001151718.1| PREDICTED: hypoth ( 594) 283 55.4 6.8e-05 gi|114582182|ref|XP_001163292.1| PREDICTED: simila (1408) 287 56.4 7.9e-05 gi|114582194|ref|XP_001163731.1| PREDICTED: simila (1439) 287 56.4 8e-05 gi|114582184|ref|XP_001163598.1| PREDICTED: simila (1457) 287 56.4 8.1e-05 gi|114582180|ref|XP_515975.2| PREDICTED: similar t (1457) 287 56.4 8.1e-05 gi|114582188|ref|XP_001163443.1| PREDICTED: simila (1457) 287 56.4 8.1e-05 gi|30058|emb|CAA32583.1| prepro-alpha-1 type 3 col (1466) 287 56.4 8.1e-05 gi|124056490|sp|P02461.4|CO3A1_HUMAN RecName: Full (1466) 287 56.4 8.1e-05 gi|126631239|gb|AAI33729.1| Col1a1 protein [Rattus (1453) 279 55.2 0.00019 gi|149463902|ref|XP_001506662.1| PREDICTED: simila (2677) 282 55.9 0.00021 gi|83301554|sp|P02454.4|CO1A1_RAT RecName: Full=Co (1453) 277 54.9 0.00023 gi|930045|emb|CAA33387.1| alpha-1 (III) collagen [ (1078) 274 54.3 0.00026 gi|126308289|ref|XP_001367735.1| PREDICTED: simila (1455) 275 54.6 0.00029 gi|126308291|ref|XP_001367777.1| PREDICTED: simila (1462) 275 54.6 0.00029 gi|67087633|gb|EAM07099.1| hypothetical protein Av ( 829) 267 53.1 0.00047 gi|74762504|sp|Q8IZC6.1|CORA1_HUMAN RecName: Full= (1860) 270 53.9 0.00058 gi|126345428|ref|XP_001373320.1| PREDICTED: hypoth (1908) 269 53.8 0.00066 gi|18025526|gb|AAK95470.1| LF3 [cercopithicine her ( 890) 262 52.3 0.00083 gi|119607820|gb|EAW87414.1| collagen, type XXVII, (1860) 266 53.3 0.00089 gi|118094982|ref|XP_422641.2| PREDICTED: hypotheti ( 646) 258 51.6 0.001 gi|47222238|emb|CAG11117.1| unnamed protein produc (1403) 262 52.5 0.0011 gi|208609649|dbj|BAG72202.1| collagen type I alpha (1450) 261 52.4 0.0013 gi|74184771|dbj|BAE27985.1| unnamed protein produc (1464) 261 52.4 0.0013 gi|197245782|gb|AAI68784.1| Unknown (protein for M (1468) 260 52.3 0.0014 gi|211588630|emb|CAP86746.1| Pc20g14170 [Penicilli ( 875) 256 51.4 0.0016 gi|70875278|gb|EAN88854.1| hypothetical protein, c (1435) 259 52.1 0.0016 gi|158108439|gb|ABW10636.1| translation initiation (1046) 257 51.6 0.0016 gi|152030422|gb|ABS28190.1| LigA [Anaeromyxobacter ( 547) 251 50.4 0.0019 gi|114643598|ref|XP_001151662.1| PREDICTED: hypoth ( 582) 251 50.4 0.002 gi|114671636|ref|XP_001169766.1| PREDICTED: simila (1677) 257 51.9 0.0022 gi|114582198|ref|XP_001163483.1| PREDICTED: simila (1162) 254 51.2 0.0023 gi|20380052|gb|AAH28178.1| COL3A1 protein [Homo sa (1163) 254 51.2 0.0023 gi|20380522|gb|AAH28248.1| Col3a1 protein [Mus mus (1222) 252 50.9 0.003 >>gi|119578435|gb|EAW58031.1| dendrin [Homo sapiens] (711 aa) initn: 4725 init1: 4725 opt: 4725 Z-score: 3930.6 bits: 737.8 E(): 3.1e-210 Smith-Waterman score: 4725; 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