# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk04140.fasta.nr -Q ../query/KIAA0746.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0746, 1029 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7825586 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2621+/-0.000185; mu= 13.8655+/- 0.010 mean_var=75.6755+/-14.641, 0's: 32 Z-trim: 44 B-trim: 0 in 0/65 Lambda= 0.147434 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|51491223|emb|CAH18677.1| hypothetical protein [ (1097) 7001 1499.3 0 gi|114593385|ref|XP_517134.2| PREDICTED: hypotheti (1097) 6981 1495.0 0 gi|194209250|ref|XP_001497334.2| PREDICTED: hypoth (1092) 6482 1388.9 0 gi|154689957|ref|NP_766298.2| hypothetical protein (1137) 6219 1333.0 0 gi|148705726|gb|EDL37673.1| RIKEN cDNA 2310045A20, (1141) 6219 1333.0 0 gi|109499771|ref|XP_341224.3| PREDICTED: hypotheti (1277) 6132 1314.5 0 gi|73951913|ref|XP_545967.2| PREDICTED: hypothetic ( 937) 5951 1275.9 0 gi|26326485|dbj|BAC26986.1| unnamed protein produc ( 979) 5897 1264.4 0 gi|109734537|gb|AAI17917.1| RIKEN cDNA 2310045A20 ( 979) 5893 1263.6 0 gi|63101621|gb|AAH94607.1| RIKEN cDNA 2310045A20 g ( 979) 5885 1261.9 0 gi|109500674|ref|XP_001055920.1| PREDICTED: hypoth (1202) 5860 1256.6 0 gi|149412323|ref|XP_001513944.1| PREDICTED: simila (1294) 5818 1247.7 0 gi|118090654|ref|XP_420754.2| PREDICTED: hypotheti (1092) 4878 1047.7 0 gi|148705725|gb|EDL37672.1| RIKEN cDNA 2310045A20, (1060) 3817 822.0 0 gi|149047206|gb|EDL99875.1| similar to RIKEN cDNA ( 776) 3791 816.4 0 gi|194390450|dbj|BAG61987.1| unnamed protein produ ( 539) 3656 787.6 0 gi|26332058|dbj|BAC29759.1| unnamed protein produc ( 725) 3497 753.8 6.9e-215 gi|56403762|emb|CAI29670.1| hypothetical protein [ ( 642) 3051 658.9 2.3e-186 gi|20071863|gb|AAH26655.1| 2310045A20Rik protein [ ( 426) 2584 559.5 1.3e-156 gi|210123117|gb|EEA70820.1| hypothetical protein B (1064) 2001 435.8 5.7e-119 gi|210090847|gb|EEA39113.1| hypothetical protein B (1064) 1995 434.5 1.4e-118 gi|52139084|gb|AAH82656.1| LOC494674 protein [Xeno ( 489) 1536 336.6 1.9e-89 gi|66910430|gb|AAH97088.1| LOC559843 protein [Dani ( 493) 1100 243.9 1.5e-61 gi|190585693|gb|EDV25761.1| hypothetical protein T (1035) 820 184.6 2.3e-43 gi|189528189|ref|XP_688322.3| PREDICTED: hypotheti ( 494) 705 159.9 3e-36 gi|47227832|emb|CAG08995.1| unnamed protein produc ( 639) 582 133.8 2.8e-28 gi|162692865|gb|EDQ79220.1| predicted protein [Phy ( 618) 558 128.7 9.3e-27 gi|157343702|emb|CAO68208.1| unnamed protein produ ( 674) 556 128.3 1.3e-26 gi|114681074|ref|XP_525270.2| PREDICTED: similar t ( 606) 555 128.0 1.4e-26 gi|149023429|gb|EDL80323.1| similar to dJ842G6.2 ( ( 576) 554 127.8 1.6e-26 gi|119630709|gb|EAX10304.1| hCG39756, isoform CRA_ ( 549) 551 127.1 2.4e-26 gi|81883672|sp|Q5XI05.1|SE1L2_RAT RecName: Full=Pr ( 688) 552 127.4 2.4e-26 gi|119630711|gb|EAX10306.1| hCG39756, isoform CRA_ ( 576) 551 127.1 2.5e-26 gi|56203417|emb|CAI22983.1| chromosome 20 open rea ( 593) 551 127.2 2.5e-26 gi|158706355|sp|Q5TEA6.2|SE1L2_HUMAN RecName: Full ( 688) 551 127.2 2.8e-26 gi|162678606|gb|EDQ65062.1| predicted protein [Phy ( 612) 549 126.7 3.5e-26 gi|222858542|gb|EEE96089.1| predicted protein [Pop ( 682) 549 126.8 3.8e-26 gi|123785578|sp|Q3V172.1|SE1L2_MOUSE RecName: Full ( 688) 549 126.8 3.8e-26 gi|222869105|gb|EEF06236.1| predicted protein [Pop ( 683) 548 126.6 4.4e-26 gi|118489046|gb|ABK96330.1| unknown [Populus trich ( 683) 542 125.3 1.1e-25 gi|8671775|gb|AAF78381.1|AC069551_14 T10O22.22 [Ar ( 678) 531 122.9 5.3e-25 gi|162692920|gb|EDQ79275.1| predicted protein [Phy ( 571) 530 122.7 5.4e-25 gi|194044276|ref|XP_001926281.1| PREDICTED: sel-1 ( 687) 527 122.1 9.7e-25 gi|14532716|gb|AAK64159.1| unknown protein [Arabid ( 678) 525 121.7 1.3e-24 gi|73991497|ref|XP_542886.2| PREDICTED: similar to ( 615) 518 120.1 3.4e-24 gi|109092942|ref|XP_001083908.1| PREDICTED: simila ( 688) 518 120.2 3.7e-24 gi|194224142|ref|XP_001915149.1| PREDICTED: sel-1 ( 688) 514 119.3 6.6e-24 gi|158277402|gb|EDP03170.1| sel-1 like protein [Ch ( 481) 511 118.6 7.8e-24 gi|210115582|gb|EEA63332.1| hypothetical protein B ( 585) 509 118.2 1.2e-23 gi|210115792|gb|EEA63541.1| hypothetical protein B ( 585) 509 118.2 1.2e-23 >>gi|51491223|emb|CAH18677.1| hypothetical protein [Homo (1097 aa) initn: 7001 init1: 7001 opt: 7001 Z-score: 8039.6 bits: 1499.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 7001; 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