# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fg05988b.fasta.huge -Q ../query/KIAA0732.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0732, 1449 aa vs ./tmplib.23663 library 1986056 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3433+/-0.00765; mu= 14.5288+/- 0.517 mean_var=212.6261+/-52.005, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 123 in 1/39 Lambda= 0.087956 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0250 ( 1122 res) ha02790 (1122) 340 57.1 2.1e-08 KIAA1089 ( 1033 res) ha02541 (1033) 247 45.3 7.2e-05 >>KIAA0250 ( 1122 res) ha02790 (1122 aa) initn: 295 init1: 171 opt: 340 Z-score: 242.7 bits: 57.1 E(): 2.1e-08 Smith-Waterman score: 348; 24.063% identity (52.071% similar) in 507 aa overlap (590-1077:12-438) 560 570 580 590 600 610 KIAA07 YPVGPTNGVYPGPYYPGYPTPSGQYVCSPLPTSTMSPEEVEQHMRNLQQQELHRLLRVAD : : .:.... . : . .: . . . 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