# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk02972.fasta.huge -Q ../query/KIAA0726.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0726, 973 aa vs ./tmplib.23663 library 1986532 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.6075+/-0.00474; mu= 18.7559+/- 0.324 mean_var=79.3754+/-18.258, 0's: 0 Z-trim: 9 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.143957 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0911 ( 1056 res) hj05129(revised) (1056) 2983 629.8 5.5e-181 KIAA1775 ( 858 res) hk03826 ( 858) 190 49.6 2e-06 KIAA0327 ( 898 res) hg00605 ( 898) 160 43.4 0.00015 KIAA1621 ( 787 res) hj04505 ( 787) 152 41.7 0.00045 KIAA0811 ( 1123 res) hj04806 (1123) 150 41.4 0.00075 KIAA0588 ( 938 res) hj02685 ( 938) 143 39.9 0.0018 >>KIAA0911 ( 1056 res) hj05129(revised) (1056 aa) initn: 3219 init1: 1451 opt: 2983 Z-score: 3341.1 bits: 629.8 E(): 5.5e-181 Smith-Waterman score: 3405; 52.188% identity (80.256% similar) in 937 aa overlap (40-962:107-1024) 10 20 30 40 50 60 KIAA07 CELSGSTRVVVGVEALLTGASSPLPGVGPANKHKPWIEAEYQGIVMENDNTVLLNPPLFA ::::::.: :.::: ::::::::.:::.: KIAA09 LRRPAPALAPAARLLLAGLLCGGGVWAARVNKHKPWLEPTYHGIVTENDNTVLLDPPLIA 80 90 100 110 120 130 70 80 90 100 110 KIAA07 LDKDAPLRYA----------GEICGFRLHGSGVPFEAVILDKATGEGLIRAKEPVDCEAQ ::::::::.: ::::::..::..:::.::..::.::::.::.:: .::: : KIAA09 LDKDAPLRFAESFEVTVTKEGEICGFKIHGQNVPFDAVVVDKSTGEGVIRSKEKLDCELQ 140 150 160 170 180 190 120 130 140 150 160 170 KIAA07 KEHTFTIQAYDCGEGPDGANTKKSHKATVHVRVNDVNEFAPVFVERLYRAAVTEGKLYDR :...:::::::::.::::.:.:::::::::..::::::.:::: :. :.:.: ::: :: KIAA09 KDYSFTIQAYDCGKGPDGTNVKKSHKATVHIQVNDVNEYAPVFKEKSYKATVIEGKQYDS 200 210 220 230 240 250 180 190 200 210 220 230 KIAA07 ILRVEAIDGDCSPQYSQICYYEILTPNTPFLIDNDGNIENTEKLQYSGERLYKFTVTAYD ::::::.:.:::::.:::: :::.::..:: .:.:: :.:::::.:. :. ::.:::::: KIAA09 ILRVEAVDADCSPQFSQICSYEIITPDVPFTVDKDGYIKNTEKLNYGKEHQYKLTVTAYD 260 270 280 290 300 310 240 250 260 270 280 290 KIAA07 CGKKRAADDAEVEIQVKPTCKPSWQGWNKRIEYAPGAGSLALFPGIRLETCDEPLWNIQA ::::::..:. :.:..:::: :.:::::.:::: ::.:.::.::.:.:::::::. ..:: KIAA09 CGKKRATEDVLVKISIKPTCTPGWQGWNNRIEYEPGTGALAVFPNIHLETCDEPVASVQA 320 330 340 350 360 370 300 310 320 330 340 350 KIAA07 TIELQTSHVAKGCDRDNYSERALRKLCGAATGEVDLLPMPGPNANWTAGLSVHYSQDSSL :.::.:::..::::::.:::..:..:::::.: ..::: :. . ::: :: . ..::. 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