# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pf12310.fasta.nr -Q ../query/KIAA0714.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0714, 1780 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7824452 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0668+/-0.000187; mu= 16.1436+/- 0.010 mean_var=73.6453+/-14.575, 0's: 34 Z-trim: 48 B-trim: 1154 in 2/65 Lambda= 0.149452 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|114684319|ref|XP_514851.2| PREDICTED: zinc fing (1812) 11639 2520.3 0 gi|160113245|sp|O94822.5|ZN294_HUMAN RecName: Full (1766) 11610 2514.0 0 gi|187954961|gb|AAI40791.1| Zinc finger protein 29 (1766) 11602 2512.3 0 gi|109065710|ref|XP_001103642.1| PREDICTED: simila (1853) 11456 2480.9 0 gi|194226164|ref|XP_001915227.1| PREDICTED: simila (1766) 10759 2330.6 0 gi|194664182|ref|XP_597748.4| PREDICTED: zinc fing (1766) 10576 2291.1 0 gi|109492780|ref|XP_001055727.1| PREDICTED: simila (1798) 10272 2225.6 0 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::::.:::::::.::::::::.:::::::::::::.::::::: gi|109 TLTYISKDQLLSHKLPKRLVASQKTNLPEHLQTLLNTLTPLLLFRARPVQIAAYHMLYKL 1390 1400 1410 1420 1430 1440 1430 1440 1450 1460 1470 1480 KIAA07 MPELPQYDQDNLKSYGDEEEEPALSPPAALMSLLSIQEDLLENVLGCIPVGQIVTIKPLS : ::::.:::::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::.:::::: ::::: gi|109 MAELPQHDQDNLKSYGDEEEEPALSPPAALMSLLSTQEELLENVLGCVPVGQIVPIKPLS 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1490 1500 1510 1520 1530 1540 KIAA07 EDFCYVLGYLLTWKLILTFFKAASSQLRALYSMYLRKTKSLNKLLYHLFRLMPENPTYAE ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.: gi|109 EDFCYVLGYLLTWKLILTFFKAASSQLRALYSMYLRKTKSLNKLLYHLFRLMPENPTYGE 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1550 1560 1570 1580 1590 1600 KIAA07 TAVEVPNKDPKTFFTEELQLSIRETTMLPYHIPHLACSVYHMTLKDLPAMVRLWWNSSEK ::.:: :::::::::::::::::::. ::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|109 TAIEVSNKDPKTFFTEELQLSIRETATLPYHIPHLACSVYHMTLKDLPAMVRLWWNSSEK 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1610 1620 1630 1640 1650 1660 KIAA07 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.:..:::.::. :::::::::. :::::::::.::::::::. .::::. gi|198 WEAKADVEQDAETVYNLEKVLLSFWERLSEICIEKISEPEADVKSVLGVSNLVGILQKPE 470 480 490 500 510 520 550 560 570 580 590 KIAA07 SSLKSSKKKNGKVRFADEILESNKENEKCVSSEGEKIEGWELT-TEPSLTHNSSGLLSPL :::::..:.::::::. . :. : .:::::::::. :: : : ::...:: ..::: gi|198 SSLKSNRKRNGKVRFVIDTPEAPKGSEKCVSSEGENSEGSEGGGTGSSLSYKSSDVVSPL 530 540 550 560 570 580 600 610 620 630 640 650 KIAA07 RKKPLEDLVCKLADISINYVNERKSEQHLRFLSTLLDSFSSSRVFKMLLGDEKQSIVQAK :::::::::::::..::..:::.::::::.:::::::::::..:::.::::....::.:: gi|198 RKKPLEDLVCKLAEVSISFVNEQKSEQHLQFLSTLLDSFSSGQVFKILLGDKQKNIVKAK 590 600 610 620 630 640 660 670 680 690 700 710 KIAA07 PLEIAKLVQKNPAVQFLYQKLIGWLNEDQRKDFGFLVDILYSALRCCDNDMERKKVLDDL ::::.::..:::::::::.:::::::..:..: :::::::::::::::.:.:::.::::: gi|198 PLEITKLAEKNPAVQFLYHKLIGWLNDSQKEDGGFLVDILYSALRCCDSDVERKEVLDDL 650 660 670 680 690 700 720 730 740 750 760 770 KIAA07 TKVDLKWNSLLKIIEKACPSSDKHALVTPWLKGDILGEKLVNLADCLCNEDLESRVSSES :. ::::.:::..::::: 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