# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg04169.fasta.nr -Q ../query/KIAA0712.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0712, 1770 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7816181 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3455+/-0.0002; mu= 10.9484+/- 0.011 mean_var=118.7893+/-22.399, 0's: 25 Z-trim: 73 B-trim: 0 in 0/64 Lambda= 0.117675 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|119588142|gb|EAW67738.1| Rho GTPase-activating (2061) 11826 2020.2 0 gi|205829172|sp|A7KAX9.1|RICS_HUMAN RecName: Full= (2087) 11826 2020.3 0 gi|28569546|gb|AAO43677.1| rac GTPase activating p (1738) 11732 2004.2 0 gi|73954831|ref|XP_546401.2| PREDICTED: similar to (1966) 10404 1778.8 0 gi|109484470|ref|XP_001056872.1| PREDICTED: simila (2332) 10245 1751.9 0 gi|109483229|ref|XP_236020.4| PREDICTED: similar t (2049) 10219 1747.4 0 gi|206558298|sp|Q811P8.2|RICS_MOUSE RecName: Full= (2089) 10202 1744.5 0 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gi|119588146|gb|EAW67742.1| Rho GTPase-activating ( 619) 2021 355.2 1e-94 gi|47216829|emb|CAG02720.1| unnamed protein produc (1273) 1941 341.9 2.1e-90 gi|118089253|ref|XP_423515.2| PREDICTED: hypotheti ( 652) 1927 339.3 6.7e-90 gi|89268976|emb|CAJ83966.1| novel protein containi ( 656) 1828 322.5 7.7e-85 gi|118096071|ref|XP_001231290.1| PREDICTED: simila ( 702) 1673 296.2 6.7e-77 gi|33990390|gb|AAH00277.2| RICS protein [Homo sapi ( 322) 1536 272.6 3.8e-70 gi|119588145|gb|EAW67741.1| Rho GTPase-activating ( 568) 1538 273.2 4.6e-70 gi|189530265|ref|XP_698214.3| PREDICTED: similar t (1877) 1535 273.1 1.6e-69 gi|118113564|ref|XP_001236976.1| PREDICTED: hypoth ( 616) 1463 260.5 3.3e-66 gi|25396407|dbj|BAC24802.1| Rho GTPase activating ( 218) 1445 257.0 1.3e-65 gi|118128763|ref|XP_422973.2| PREDICTED: similar t ( 516) 1447 257.7 1.9e-65 gi|148692067|gb|EDL24014.1| sorting nexin 26 [Mus (1064) 1390 248.3 2.7e-62 gi|68566198|sp|Q80YF9.1|TCGAP_MOUSE RecName: Full= (1305) 1390 248.4 3.1e-62 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