# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg03359s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0705.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0705, 1483 aa vs ./tmplib.23663 library 1986022 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.5100+/-0.0107; mu= -11.9868+/- 0.724 mean_var=482.5302+/-115.953, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.058386 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1634 ( 874 res) fh21781(revised) ( 874) 1054 104.4 1e-22 >>KIAA1634 ( 874 res) fh21781(revised) (874 aa) initn: 2726 init1: 565 opt: 1054 Z-score: 499.8 bits: 104.4 E(): 1e-22 Smith-Waterman score: 2834; 50.325% identity (71.537% similar) in 924 aa overlap (340-1263:38-858) 310 320 330 340 350 360 KIAA07 PSQPYPAPVYSQPEELKEQMDDTKPTKPEDNEEPDPLPDNWEMAYTEKGEVYFIDHNTKT .: .::: :::::::. : .::::::::: KIAA16 RHSESSDWMKTVPSYNQTNSSMDFRNYMMRDETLEPLPKNWEMAYTDTGMIYFIDHNTKT 10 20 30 40 50 60 370 380 390 400 410 420 KIAA07 TSWLDPRLAKKAKPPEECKENELPYGWEKIDDPIYGTYYVDHINRRTQFENPVLEAKRKL :.:::::: :::: ::.:...:::::::::.:: ::::::::.:..::::::: ::::: KIAA16 TTWLDPRLCKKAKAPEDCEDGELPYGWEKIEDPQYGTYYVDHLNQKTQFENPVEEAKRKK 70 80 90 100 110 120 430 440 450 460 470 480 KIAA07 QQHNMPHTELGTKPLQAPGFREKPLFTRDASQLKGTFLSTTLKKSNMGFGFTIIGGDEPD : . ..:.:.. : . :: :::: :::::... ..::::.:::::::::::.:: KIAA16 Q---LGQVEIGSSK---PDM-EKSHFTRDPSQLKGVLVRASLKKSTMGFGFTIIGGDRPD 130 140 150 160 170 180 490 500 510 520 530 540 KIAA07 EFLQVKSVIPDGPAAQDGKMETGDVIVYINEVCVLGHTHADVVKLFQSVPIGQSVNLVLC ::::::.:. :::::::::. ::::: :: :::::::::::..:: ::..: :::.:: KIAA16 EFLQVKNVLKDGPAAQDGKIAPGDVIVDINGNCVLGHTHADVVQMFQLVPVNQYVNLTLC 190 200 210 220 230 240 550 560 570 580 590 600 KIAA07 RGYPLPFDPEDPANSMVPPLAIMERPPPVMVNGRHNYETYLEYISRTSQSVPDITDRPPH :::::: : :::. ..: :: .::. . . . . . .. . 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KIAA16 VTLTVIAEEEHHGPPSGTNSARQSPALQHRPMGQS---------------------QANH 680 690 700 710 1090 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA07 LQGHENSYRSEVKARQDVKPDIRQPPFTDYRQPPLDYRQPPGGDYQQPPPLDYRQPPLLD . : ... ..:. .::. :.::. :... KIAA16 IPGDRSALEGEIG--KDVS--------TSYRHSWSDHKH--------------------- 720 730 740 1150 1160 1170 1180 1190 1200 KIAA07 YRQHSPDTRQYPLSDYRQPQDFDYFTVDMEKGAKGFGFSIRGGREYKMDLYVLRLAEDGP .::: . :. :.. . :..:.: .:::::.:::.::.: :..:::::::: KIAA16 --LAQPDTAVISVVGSRHNQNLGCYPVELERGPRGFGFSLRGGKEYNMGLFILRLAEDGP 750 760 770 780 790 800 1210 1220 1230 1240 1250 1260 KIAA07 AIRNGRMRVGDQIIEINGESTRDMTHARAIELIKSGGRRVRLLLKRGTGQVPEYDEPAPW ::..::..:::::.::::: :. .::.::::::..:: .: :::. ::: .:.. 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