# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg00360s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA0698.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0698, 1104 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7825470 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1492+/-0.000188; mu= 14.2042+/- 0.011 mean_var=74.2603+/-14.785, 0's: 38 Z-trim: 43 B-trim: 1483 in 2/63 Lambda= 0.148832 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|52782976|sp|Q9BQS7.3|HEPH_HUMAN RecName: Full=H (1158) 7610 1644.3 0 gi|119625790|gb|EAX05385.1| hephaestin, isoform CR (1161) 7610 1644.3 0 gi|18693071|emb|CAC35365.2| hephaestin [Homo sapie (1158) 7605 1643.2 0 gi|37183098|gb|AAQ89349.1| HEPH [Homo sapiens] (1160) 7593 1640.6 0 gi|109131038|ref|XP_001099464.1| PREDICTED: simila (1158) 7416 1602.6 0 gi|74007529|ref|XP_549046.2| PREDICTED: similar to (1198) 6956 1503.9 0 gi|194227978|ref|XP_001504914.2| PREDICTED: hephae (1161) 6767 1463.3 0 gi|123211690|emb|CAM22078.1| hephaestin [Mus muscu (1157) 6710 1451.0 0 gi|148682267|gb|EDL14214.1| hephaestin, isoform CR (1169) 6710 1451.0 0 gi|4322374|gb|AAD16035.1| hephaestin [Mus musculus (1157) 6708 1450.6 0 gi|52782991|sp|Q9Z0Z4.2|HEPH_MOUSE RecName: Full=H (1157) 6704 1449.7 0 gi|148682268|gb|EDL14215.1| hephaestin, isoform CR (1168) 6695 1447.8 0 gi|29387064|gb|AAH48237.1| Hephaestin [Mus musculu (1156) 6689 1446.5 0 gi|52782851|sp|Q920H8.1|HEPH_RAT RecName: Full=Hep (1157) 6681 1444.8 0 gi|57208217|emb|CAI42807.1| hephaestin [Homo sapie ( 891) 6141 1328.8 0 gi|109131044|ref|XP_001099362.1| PREDICTED: simila ( 891) 5981 1294.4 0 gi|118089267|ref|XP_420165.2| PREDICTED: similar t (1112) 5102 1105.8 0 gi|126342087|ref|XP_001377105.1| PREDICTED: simila (1226) 4566 990.7 0 gi|149635174|ref|XP_001513275.1| PREDICTED: hypoth (1390) 4040 877.8 0 gi|118085185|ref|XP_417192.2| PREDICTED: similar t (1151) 4024 874.3 0 gi|205785679|sp|Q6MZM0.2|HPHL1_HUMAN RecName: Full (1159) 4006 870.4 0 gi|55636831|ref|XP_508699.1| PREDICTED: hypothetic (1298) 3996 868.3 0 gi|194679697|ref|XP_597804.4| PREDICTED: similar t (1157) 3989 866.8 0 gi|109108335|ref|XP_001086917.1| PREDICTED: simila (1202) 3983 865.5 0 gi|194213340|ref|XP_001491367.2| PREDICTED: hephae (1275) 3967 862.1 0 gi|73987809|ref|XP_542245.2| PREDICTED: similar to (1160) 3958 860.1 0 gi|205785707|sp|Q3V1H3.2|HPHL1_MOUSE RecName: Full (1159) 3939 856.0 0 gi|149259830|ref|XP_146812.7| PREDICTED: hypotheti (1135) 3923 852.6 0 gi|109483090|ref|XP_576357.2| PREDICTED: similar t (1180) 3824 831.4 0 gi|194376836|dbj|BAG57564.1| unnamed protein produ ( 558) 3812 828.5 0 gi|118095426|ref|XP_001235149.1| PREDICTED: simila (1079) 3810 828.3 0 gi|194380474|dbj|BAG58390.1| unnamed protein produ ( 558) 3797 825.3 0 gi|149259504|ref|XP_991609.2| PREDICTED: hephaesti (1135) 3799 826.0 0 gi|119884990|ref|XP_592003.3| PREDICTED: cerulopla (1060) 3664 797.0 0 gi|149048530|gb|EDM01071.1| ceruloplasmin, isoform (1059) 3661 796.3 0 gi|149048531|gb|EDM01072.1| ceruloplasmin, isoform (1084) 3658 795.7 0 gi|6970046|gb|AAF34175.1|AF202115_1 GPI-anchored c (1084) 3643 792.5 0 gi|2506226|sp|P13635.3|CERU_RAT RecName: Full=Ceru (1059) 3623 788.2 0 gi|148702937|gb|EDL34884.1| ceruloplasmin, isoform (1059) 3603 783.9 0 gi|148702941|gb|EDL34888.1| ceruloplasmin, isoform (1060) 3603 783.9 0 gi|148702936|gb|EDL34883.1| ceruloplasmin, isoform (1085) 3603 783.9 0 gi|148702938|gb|EDL34885.1| ceruloplasmin, isoform (1108) 3603 783.9 0 gi|161784289|sp|Q61147.2|CERU_MOUSE RecName: Full= (1061) 3599 783.0 0 gi|110815853|ref|NP_001036076.1| ceruloplasmin iso (1086) 3599 783.0 0 gi|1224108|gb|AAB07996.1| ceruloplasmin [Mus muscu (1062) 3543 771.0 0 gi|126338232|ref|XP_001371162.1| PREDICTED: simila (1060) 3540 770.3 0 gi|149020649|gb|EDL78454.1| similar to hephaestin ( 914) 3417 743.9 9.2e-212 gi|149408772|ref|XP_001508540.1| PREDICTED: simila ( 962) 3387 737.5 8.4e-210 gi|126338230|ref|XP_001371118.1| PREDICTED: simila (1073) 3332 725.7 3.3e-206 gi|119587327|gb|EAW66923.1| hCG1810904 [Homo sapie ( 863) 3265 711.2 5.9e-202 >>gi|52782976|sp|Q9BQS7.3|HEPH_HUMAN RecName: Full=Hepha (1158 aa) initn: 7610 init1: 7610 opt: 7610 Z-score: 8822.3 bits: 1644.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 7610; 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