# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk03410.fasta.huge -Q ../query/KIAA0688.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0688, 849 aa vs ./tmplib.23663 library 1986656 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9417+/-0.00599; mu= 18.8944+/- 0.406 mean_var=118.1580+/-27.729, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 99 in 2/38 Lambda= 0.117989 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1346 ( 999 res) fj00671 ( 999) 2656 463.6 4.7e-131 KIAA1312 ( 1471 res) fh11767 (1471) 1961 345.5 2.4e-95 KIAA0366 ( 1201 res) hh00124 (1201) 1130 204.0 8.3e-53 KIAA2029 ( 1021 res) pj01256 (1021) 825 151.9 3.2e-37 KIAA0605 ( 1031 res) hg03238a (1031) 535 102.6 2.3e-22 KIAA0021 ( 703 res) ha00117(revised) ( 703) 240 52.1 2.4e-07 KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202) 242 52.8 2.6e-07 KIAA1777 ( 954 res) fh19201x1 ( 954) 205 46.4 1.8e-05 KIAA0550 ( 1524 res) hh15909 (1524) 203 46.3 3e-05 KIAA2036 ( 1322 res) pf06513 (1322) 201 45.9 3.5e-05 KIAA0149 ( 830 res) ha01221 ( 830) 153 37.4 0.0077 >>KIAA1346 ( 999 res) fj00671 (999 aa) initn: 2633 init1: 1584 opt: 2656 Z-score: 2444.6 bits: 463.6 E(): 4.7e-131 Smith-Waterman score: 2792; 50.060% identity (73.302% similar) in 839 aa overlap (50-830:68-891) 20 30 40 50 60 70 KIAA06 PGRGLAGRWLWGAQPCLLLPIVPLSWLVWLLLLLLASLLP-SARLASPLPREEEIVFPEK :::: :.:: : :. : ..::.: :: KIAA13 PEGFGRRKLGSDMGNAERAPGSRSFGPVPTLLLLAAALLAVSDALGRPSEEDEELVVPE- 40 50 60 70 80 90 80 90 100 110 120 130 KIAA06 LNGSVLPGSGTPARLLCRLQAFGETLLLELEQDSGVQVEGLTVQYLGQAPELLGGAE--- :. . :: :: .:: ::.:: . : :::. ::. . :.:.: .:. .:.: KIAA13 LERA--PGHGT-TRL--RLHAFDQQLDLELRPDSSFLAPGFTLQNVGRK----SGSETPL 100 110 120 130 140 140 150 160 170 180 KIAA06 PGT-----YLTGTINGDPESVASLHWDGGALLGVLQYRGAELHLQPLEGGTPNSA-GGPG : : . .::.:::: :.:.: : . :.. : .::: ... : ..:: KIAA13 PETDLAHCFYSGTVNGDPSSAAALSLCEG-VRGAFYLLGEAYFIQPLPAASERLATAAPG 150 160 170 180 190 200 190 200 210 KIAA06 A--------HILRR--KSPASG----------------------------QGPMCNVKAP :.::: .. ..: .::. . . : KIAA13 EKPPAPLQFHLLRRNRQGDVGGTCGVVDDEPRPTGKAETEDEDEGTEGEDEGPQWSPQDP 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 KIAA06 ----LGSPSPRPR-RAKRFASLSRFVETLVVADDKMAAFHGAGLKRYLLTVMAAAAKAFK .:.:. : :::.: :.:::..:::..:: :::.:::.::::....::. .: KIAA13 ALQGVGQPTGTGSIRKKRFVSSHRYVETMLVADQSMAEFHGSGLKHYLLTLFSVAARLYK 270 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 KIAA06 HPSIRNPVSLVVTRLVILGSGEEGPQVGPSAAQTLRSFCAWQRGLNTPEDSDPDHFDTAI :::::: :::::...... . ..::.: .:: :::.:: ::. : : : : .:.:::: KIAA13 HPSIRNSVSLVVVKILVIHDEQKGPEVTSNAALTLRNFCNWQKQHNPPSDRDAEHYDTAI 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 380 KIAA06 LFTRQDLCGVSTCDTLGMADVGTVCDPARSCAIVEDDGLQSAFTAAHELGHVFNMLHDNS ::::::::: .::::::::::::::::.:::...::::::.:::.:::::::::: ::.. KIAA13 LFTRQDLCGSQTCDTLGMADVGTVCDPSRSCSVIEDDGLQAAFTTAHELGHVFNMPHDDA 390 400 410 420 430 440 390 400 410 420 430 440 KIAA06 KPCISLNGPLSTSRHVMAPVMAHVDPEEPWSPCSARFITDFLDNGYGHCLLDKPEAPLHL : : :::: .. . :.:: .....: .::::::: .::.:::::.:.::.:::. :..: KIAA13 KQCASLNG-VNQDSHMMASMLSNLDHSQPWSPCSAYMITSFLDNGHGECLMDKPQNPIQL 450 460 470 480 490 500 450 460 470 480 490 500 KIAA06 PVTFPGKDYDADRQCQLTFGPDSRHCPQLPPPCAALWCSGHLNGHAMCQTKHSPWADGTP : .:: .:::.::::.::: ::.:::. :..:::.: .: .::::: :::::: KIAA13 PGDLPGTSYDANRQCQFTFGEDSKHCPDAASTCSTLWCTGTSGGVLVCQTKHFPWADGTS 510 520 530 540 550 560 510 520 530 540 550 560 KIAA06 CGPAQACMGGRCLHMDQLQDFNIPQAGGWGPWGPWGDCSRTCGGGVQFSSRDCTRPVPRN :: .. :..:.:.. . . :. : :.:: ::::::::::::::::.. :.: :::.: KIAA13 CGEGKWCINGKCVNKTDRKHFDTPFHGSWGMWGPWGDCSRTCGGGVQYTMRECDNPVPKN 570 580 590 600 610 620 570 580 590 600 610 620 KIAA06 GGKYCEGRRTRFRSCNTEDCPTGSALTFREEQCAAYNHRTDLFKSF-PGP-MDWVPRYTG :::::::.:.:.:::: :::: ... ::::::: :.:. . :: :: ..:.:.:.: KIAA13 GGKYCEGKRVRYRSCNLEDCPDNNGKTFREEQCEAHNEFSK--ASFGSGPAVEWIPKYAG 630 640 650 660 670 680 630 640 650 660 670 680 KIAA06 VAPQDQCKLTCQARALGYYYVLEPRVVDGTPCSPDSSSVCVQGRCIHAGCDRIIGSKKKF :.:.:.::: :::...::..::.:.:::::::::::.::::::.:..::::::: ::::: KIAA13 VSPKDRCKLICQAKGIGYFFVLQPKVVDGTPCSPDSTSVCVQGQCVKAGCDRIIDSKKKF 690 700 710 720 730 740 690 700 710 720 730 740 KIAA06 DKCMVCGGDGSGCSKQSGSFRKFRYGYNNVVTIPAGATHILVRQQGNPGHRSI--YLALK ::: ::::.:: :.: ::: . . ::....:::.:::.: :.:... : :. .::.: KIAA13 DKCGVCGGNGSTCKKISGSVTSAKPGYHDIITIPTGATNIEVKQRNQRGSRNNGSFLAIK 750 760 770 780 790 800 750 760 770 780 790 800 KIAA06 LPDGSYALNGEYTLMPSPTDVVLPGAVSLRYSGATAASETLSGHGPLAQPLTLQVLVAGN ::.: :::.::: :.. :.: :::::..:: : . . .:: .:::.:::..:: KIAA13 AADGTYILNGDYTLSTLEQDIMYKGVV-LRYSGSSAALERIRSFSPLKEPLTIQVLTVGN 810 820 830 840 850 860 810 820 830 840 KIAA06 PQDTRLRYSFFVPRPTPS-TPRPTPQDWLHRRAQILEILRRRPWAGRK ...:..:: . : . :: . :. KIAA13 ALRPKIKYTYFVKKKKESFNAIPTFSAWVIEEWGECSKSCELGWQRRLVECRDINGQPAS 870 880 890 900 910 920 >>KIAA1312 ( 1471 res) fh11767 (1471 aa) initn: 1464 init1: 498 opt: 1961 Z-score: 1803.5 bits: 345.5 E(): 2.4e-95 Smith-Waterman score: 1961; 46.013% identity (74.086% similar) in 602 aa overlap (220-815:125-713) 190 200 210 220 230 240 KIAA06 AHILRRKSPASGQGPMCNVKAPLGSPSPRPRRAKRFASLSRFVETLVVADDKMAAFHGAG ::.::: : ::::.:::::..:...:: . KIAA13 DVAALNSGLATEAFSAYGNKTDNTREKRTHRRTKRFLSYPRFVEVLVVADNRMVSYHGEN 100 110 120 130 140 150 250 260 270 280 290 300 KIAA06 LKRYLLTVMAAAAKAFKHPSIRNPVSLVVTRLVILGSGEEGPQVGPSAAQTLRSFCAWQR :..:.::.:. .:. .: ::: : ...:.. :... . ..::... .: ::..:: ::. KIAA13 LQHYILTLMSIVASIYKDPSIGNLINIVIVNLIVIHNEQDGPSISFNAQTTLKNFCQWQH 160 170 180 190 200 210 310 320 330 340 350 360 KIAA06 GLNTPEDSDPDHFDTAILFTRQDLCGV-STCDTLGMADVGTVCDPARSCAIVEDDGLQSA . :.: : :::.:.::::.: . . :::::.:..::.::: :::.: ::.::..: KIAA13 SKNSPGGI---HHDTAVLLTRQDICRAHDKCDTLGLAELGTICDPYRSCSISEDSGLSTA 220 230 240 250 260 270 370 380 390 400 410 420 KIAA06 FTAAHELGHVFNMLHDNSKPCISLNGPLSTSRHVMAPVMAHVDPEEPWSPCSARFITDFL :: :::::::::: ::... : . .: ... .:::::.. :: :: ..::.:: KIAA13 FTIAHELGHVFNMPHDDNNKC-KEEG-VKSPQHVMAPTLNFYTNPWMWSKCSRKYITEFL 280 290 300 310 320 430 440 450 460 470 480 KIAA06 DNGYGHCLLDKPEA-PLHLPVTFPGKDYDADRQCQLTFGPDSRHCPQLPPPCAALWCSGH :.:::.:::..::. : ::: .:: :....::.: ::: :. :: . : :::. . KIAA13 DTGYGECLLNEPESRPYPLPVQLPGILYNVNKQCELIFGPGSQVCPYMMQ-CRRLWCN-N 330 340 350 360 370 380 490 500 510 520 530 540 KIAA06 LNG-HAMCQTKHSPWADGTPCGPAQACMGGRCLHMDQLQDFNIPQA-GGWGPWGPWGDCS .:: : :.:.:.:::::: : :.. : : :. .....: . :.:: :.:.: :: KIAA13 VNGVHKGCRTQHTPWADGTECEPGKHCKYGFCVP----KEMDVPVTDGSWGSWSPFGTCS 390 400 410 420 430 440 550 560 570 580 590 600 KIAA06 RTCGGGVQFSSRDCTRPVPRNGGKYCEGRRTRFRSCNTEDCPTGSALTFREEQCAAYNHR ::::::.. . :.:.:: :.:::::: ::: .:.::::: : . ::.:::: .. . KIAA13 RTCGGGIKTAIRECNRPEPKNGGKYCVGRRMKFKSCNTEPC-LKQKRDFRDEQCAHFDGK 450 460 470 480 490 500 610 620 630 640 650 660 KIAA06 TDLFKSFPGPMDWVPRYTGVAPQDQCKLTCQARALGYYYVLEPRVVDGTPCSPDSSSVCV .... . :::.:.:. .:.::: :.. . :: :. ::.:::::. :....:: KIAA13 HFNINGLLPNVRWVPKYSGILMKDRCKLFCRVAGNTAYYQLRDRVIDGTPCGQDTNDICV 510 520 530 540 550 560 670 680 690 700 710 720 KIAA06 QGRCIHAGCDRIIGSKKKFDKCMVCGGDGSGCSKQSGSFRKFRYGYNNVVTIPAGATHIL :: : .::::....:: . ::: :::::.:.:. .:.: .::::.:: ::::::.: KIAA13 QGLCRQAGCDHVLNSKARRDKCGVCGGDNSSCKTVAGTFNTVHYGYNTVVRIPAGATNID 570 580 590 600 610 620 730 740 750 760 770 780 KIAA06 VRQQGNPGHRS--IYLALKLPDGSYALNGEYTLMPSPTDVVLPGAVSLRYSGATAASETL :::.. :. . ::::. : . :::.... . .. . .:: ..:::. .: : . KIAA13 VRQHSFSGETDDDNYLALSSSKGEFLLNGNFVVTMAKREIRIGNAV-VEYSGSETAVERI 630 640 650 660 670 680 790 800 810 820 830 840 KIAA06 SGHGPLAQPLTLQVLVAGNPQDTRLRYSFFVPRPTPSTPRPTPQDWLHRRAQILEILRRR .. . : : :::: .:. . .:::: .: KIAA13 NSTDRIEQELLLQVLSVGKLYNPDVRYSFNIPIEDKPQQFYWNSHGPWQACSKPCQGERK 690 700 710 720 730 740 KIAA06 PWAGRK KIAA13 RKLVCTRESDQLTVSDQRCDRLPQPGHITEPCGTDCDLRWHVASRSECSAQCGLGYRTLD 750 760 770 780 790 800 >>KIAA0366 ( 1201 res) hh00124 (1201 aa) initn: 846 init1: 248 opt: 1130 Z-score: 1039.9 bits: 204.0 E(): 8.3e-53 Smith-Waterman score: 1226; 31.807% identity (56.743% similar) in 786 aa overlap (87-814:70-822) 60 70 80 90 100 110 KIAA06 LLPSARLASPLPREEEIVFPEKLNGSVLPGSGTPARLLCRLQAFGETLLLELEQDSGVQV :..: .:. . :::. . :.:. .. . . KIAA03 LVTPVSTNLEGRYLSHTLSASHKKRSARDVSSNPEQLFFNITAFGKDFHLRLKPNTQLVA 40 50 60 70 80 90 120 130 140 150 KIAA06 EGLTVQYL------GQAPELLGGAEPG--TY-------------LTGTINGDP-ESVASL : .:.. :. . ... .:: :: .: : : ::: KIAA03 PGAVVEWHETSLVPGNITDPINNHQPGSATYRIRKTEPLQTNCAYVGDIVDIPGTSVAIS 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200 210 KIAA06 HWDGGALLGVLQYRGAELHLQPLEGGTPNSAGGPGAHILRRKSPASGQGPMCNVKA---- . :: : :... . : ..::: : :.. ..: : :.:. : KIAA03 NCDG--LAGMIKSDNEEYFIEPLERGKQMEEEKGRIHVVYKRS-AVEQAPIDMSKDFHYR 160 170 180 190 200 210 220 230 240 250 KIAA06 --------PLGS-------PSPRPRRAKRFASLSRF-VETLVVADDKMAAFHGA-GLKRY ::. . : .: :. . . .:.:. .::... ::: .. : KIAA03 ESDLEGLDDLGTVYGNIHQQLNETMRRRRHAGENDYNIEVLLGVDDSVVRFHGKEHVQNY 220 230 240 250 260 270 260 270 280 290 300 310 KIAA06 LLTVMAAAAKAFKHPSIRNPVSLVVTRLVILGSGEEGPQV---GPSAAQTLRSFCAWQRG :::.: . . .. :. ...:..:...:: .. . .:: ..:.. : : KIAA03 LLTLMNIVNEIYHDESLGVHINVVLVRMIMLGYAKSISLIERGNPS--RSLENVCRWASQ 280 290 300 310 320 330 320 330 340 350 360 370 KIAA06 LNTPEDSDPDHFDTAILFTRQDLCGVSTCDTLGMADVGTVCDPARSCAIVEDDGLQSAFT . . . .: : ::..::::. . :.: : .: :.:::.. ..::..:::. KIAA03 QQRSDLNHSEHHDHAIFLTRQDF---GPAGMQGYAPVTGMCHPVRSCTLNHEDGFSSAFV 340 350 360 370 380 390 380 390 400 410 420 KIAA06 AAHELGHVFNMLHDNS-KPCISLNGPLSTSRHVMAPVMAHVDPEEPWSPCSARFITDFLD .::: :::..: ::.. . : : .. ::::.. . . :: ::.. . .. KIAA03 VAHETGHVLGMEHDGQGNRC----GDETAMGSVMAPLVQAAFHRYHWSRCSGQELKRYI- 400 410 420 430 440 430 440 450 460 470 480 KIAA06 NGYGHCLLDKP---EAPLHLPVTFPGKDYDADRQCQLTFGPDSRHCPQLPP--PCAALWC ..: :::: : . : .:: .:: .:. :.::.. :: . : . :: ::: KIAA03 HSYD-CLLDDPFDHDWP-KLP-ELPGINYSMDEQCRFDFGVGYKMCTAFRTFDPCKQLWC 450 460 470 480 490 500 490 500 510 520 530 540 KIAA06 SGHLNGHAMCQTKHSPWADGTPCGPAQACMGGRCLHMDQLQDFNIPQAGGWGPWGPWGDC : : .. .:.::..: ::: :. .. :. :.:. . :. : :.:: : .:.: KIAA03 S-HPDNPYFCKTKKGPPLDGTECAAGKWCYKGHCMWKNANQQ---KQDGNWGSWTKFGSC 510 520 530 540 550 550 560 570 580 590 600 KIAA06 SRTCGGGVQFSSRDCTRPVPRNGGKYCEGRRTRFRSCNTEDCPTGSALTFREEQCAAYNH ::::: ::.: .:.:. :.: :::. : : ... ::::.: :: .:: .. KIAA03 SRTCGTGVRFRTRQCNNPMPINGGQDCPGVNFEYQLCNTEECQKHFE-DFRAQQC---QQ 560 570 580 590 600 610 610 620 630 640 650 660 KIAA06 RTDLFKSFPGPMDWVPRYTGVAPQDQCKLTCQARALGYYYVLEPRVVDGTPCS-PDSSSV :.. :. :.: : :. .:.: ::.. : .. : ::: :: : :. KIAA03 RNSHFEYQNTKHHWLP-YEHPDPKKRCHLYCQSKETGDVAYMKQLVHDGTHCSYKDPYSI 620 630 640 650 660 670 670 680 690 700 710 720 KIAA06 CVQGRCIHAGCDRIIGSKKKFDKCMVCGGDGSGCSKQSGSFRKF--RYGYNNVVTIPAGA ::.:.:...:::. :::.: ::: :::::.: : .:.: . . :: .. :: :: KIAA03 CVRGECVKVGCDKEIGSNKVEDKCGVCGGDNSHCRTVKGTFTRTPRKLGYLKMFDIPPGA 680 690 700 710 720 730 730 740 750 760 770 780 KIAA06 THILVRQQGNPGHRSIYLALK-LPDGSYALNGEYTLMPSPTDVVLPGAVSLRYSGATAAS :.:.... : ::.: : : :::. : : . : .: :. KIAA03 RHVLIQEDEASPH---ILAIKNQATGHYILNGKGEEAKSRTFIDL--GVEWDYNIEDDI- 740 750 760 770 780 790 800 810 820 830 KIAA06 ETLSGHGPLAQPLTLQVLVAGNPQDTR--LRYSFFVPRPTPSTPRPTPQDWLHRRAQILE :.: ::: .:. ::. . .::: : :.... KIAA03 ESLHTDGPLHDPVI--VLIIPQENDTRSSLTYKYIIHEDSVPTINSNNVIQEELDTFEWA 790 800 810 820 830 840 840 KIAA06 ILRRRPWAGRK KIAA03 LKSWSQVSKPCGGGFQYTKYGCRRKSDNKMVHRSFCEANKKPKPIRRMCNIQECTHPLWV 850 860 870 880 890 900 >>KIAA2029 ( 1021 res) pj01256 (1021 aa) initn: 1089 init1: 291 opt: 825 Z-score: 760.1 bits: 151.9 E(): 3.2e-37 Smith-Waterman score: 1322; 35.571% identity (58.000% similar) in 700 aa overlap (159-835:12-677) 130 140 150 160 170 180 KIAA06 ELLGGAEPGTYLTGTINGDPESVASLHWDGGALLGVLQYRGAELHLQPLEGGTPNSAGGP :: .. : :: :::.. . : : KIAA20 LYKRSTEPHAPGASEVLVTSRTWELAHQPLHS-SDLRLGLP 10 20 30 40 190 200 210 220 230 240 KIAA06 GA-HILRRKSPASGQGPMCNVKAPLGSPSPRPRRAKRFASLSRF-------VETLVVADD :. :.. : : .. : . : :: :: :. ::::::.: KIAA20 QKQHFCGRRKKYMPQPPKEDLFI-LPDEYKSCLRHKR--SLLRYHRNEELNVETLVVVDK 50 60 70 80 90 250 260 270 280 290 KIAA06 KMAAFHG-AGLKRYLLTVMAAAAKAFKHPSIRNPVSLVVTRLVILGSGEEGPQVGPSAAQ :: :: .. :.::.. .. :: .: . ...... :..: . . : .. : . KIAA20 KMMQNHGHENITTYVLTILNMVSALFKDGTIGGNINIAIVGLILLEDEQPGLVISHHADH 100 110 120 130 140 150 300 310 320 330 340 350 KIAA06 TLRSFCAWQRGLNTPEDSDPDHFDTAILFTRQDLCGVST--CDTLGMADVGTVCDPARSC :: ::: :: :: . . :: :::.: :.:. .. :::::.: .. .:. ::: KIAA20 TLSSFCQWQSGLMGKDGTRHDH---AILLTGLDICSWKNEPCDTLGFAPISGMCSKYRSC 160 170 180 190 200 210 360 370 380 390 400 410 KIAA06 AIVEDDGLQSAFTAAHELGHVFNMLHDN-SKPCISLNGPLSTSRHVMAPVMAHVDPEEPW .: :: :: ::: ::: :: :.:.::. .. : . .: ..:.:..: . : KIAA20 TINEDTGLGLAFTIAHESGHNFGMIHDGEGNMCKKSEG------NIMSPTLAGRNGVFSW 220 230 240 250 260 420 430 440 450 460 470 KIAA06 SPCSARFITDFLDNGYGHCLLDKPEAPLH---LPVTFPGKDYDADRQCQLTFGPDSRHCP :::: ... ::... . :: :.:. :.. : .::. :::. ::. :: .. : KIAA20 SPCSRQYLHKFLSTAQAICLADQPK-PVKEYKYPEKLPGELYDANTQCKWQFGEKAKLCM 270 280 290 300 310 320 480 490 500 510 520 530 KIAA06 Q--LPPPCAALWCSGHLNGHAMCQTKHSPWADGTPCGPAQACMGGRCLHMDQLQDFNIPQ : :::: : :. :.:: : :.:: :: . : ::.:... .. : KIAA20 LDFKKDICKALWC--HRIGRK-CETKFMPAAEGTICGHDMWCRGGQCVKYG--DEGPKPT 330 340 350 360 370 380 540 550 560 570 580 590 KIAA06 AGGWGPWGPWGDCSRTCGGGVQFSSRDCTRPVPRNGGKYCEGRRTRFRSCNTEDCPTGSA : :. :. :. :::::::::. :: :: : : .:::.::: .. ::.. :: : KIAA20 HGHWSDWSSWSPCSRTCGGGVSHRSRLCTNPKPSHGGKFCEGSTRTLKLCNSQKCPRDS- 390 400 410 420 430 440 600 610 620 630 640 650 KIAA06 LTFREEQCAAYNHRTDLFKSFPG-PMDWVPRYTGVAPQDQCKLTCQARALGYYYVLEPRV . :: ::: .: : : : . : : :: : :: ::: : :... ... : .: KIAA20 VDFRAAQCAEHNSRR-----FRGRHYKWKP-YTQVEDQDLCKLYCIAEGFDFFFSLSNKV 450 460 470 480 490 660 670 680 690 700 710 KIAA06 VDGTPCSPDSSSVCVQGRCIHAGCDRIIGSKKKFDKCMVCGGDGSGCSKQSGSFRKFRYG :::::: :: .::..: : ..::: ..:: : : ::.:..:.:. . : . : .. KIAA20 KDGTPCSEDSRNVCIDGICERVGCDNVLGSDAVEDVCGVCNGNNSACTIHRGLYTKHHHT 500 510 520 530 540 550 720 730 740 750 760 KIAA06 --YNNVVTIPAGATHILVRQQG-NPGHRSIYLALKLPDGSYALNGEYTLMPSPTDVVLPG : ..::::.:: : . ... . .. :. ::. : :::..:. : . : KIAA20 NQYYHMVTIPSGARSIRIYEMNVSTSYISVRNALR----RYYLNGHWTV-DWPGRYKFSG 560 570 580 590 600 610 770 780 790 800 810 820 KIAA06 AVSLRYSGATAASETLSGHGPLAQPLTLQVLVAGNPQDTRLRYSFFVPR-PTPSTPRPTP . .. : . :.: . :: . : ...: : . .:: .:: : . : : KIAA20 T-TFDYRRSYNEPENLIATGPTNETLIVELLFQGRNPGVAWEYS--MPRLGTEKQPPAQP 620 630 640 650 660 830 840 KIAA06 Q-DWLHRRAQILEILRRRPWAGRK . : :.. KIAA20 SYTWAIVRSECSVSCGGGQMTVREGCYRDLKFQVNMSFCNPKTRPVTGLVPCKVSACPPS 670 680 690 700 710 720 >>KIAA0605 ( 1031 res) hg03238a (1031 aa) initn: 368 init1: 184 opt: 535 Z-score: 493.3 bits: 102.6 E(): 2.3e-22 Smith-Waterman score: 535; 33.876% identity (57.003% similar) in 307 aa overlap (535-824:130-421) 510 520 530 540 550 560 KIAA06 TPCGPAQACMGGRCLHMDQLQDFNIPQAGGWGPWGPWGDCSRTCGGGVQFSSRDCT---- :: : : ::.::::: . : : KIAA06 VAGDTVSTGSTDNSPTSNSLEGGTDATAFWWGEWTKWTAFSRSCGGGVTSQERHCLQQRR 100 110 120 130 140 150 570 580 590 600 610 KIAA06 RPVPRNGGKYCEGRRTRFRSCNTEDCPTGSALTFREEQCAA-----YNHRTDLFKSFPGP . :: :.. : : :.. : ...:: .. .::::::.. :: :: .: . : KIAA06 KSVPGPGNRTCTGTSKRYQLCRVQECPP-DGRSFREEQCVSFNSHVYNGRTHQWKPLY-P 160 170 180 190 200 210 620 630 640 650 660 670 KIAA06 MDWVPRYTGVAPQDQCKLTCQARALGYYYVLEPRVVDGTPCS-PDSSSVCVQGRCIHAGC :.: . . : : : : . . : .. : . ::: :. : .:::.:.: :: KIAA06 DDYV--HISSKP---CDLHCTT-VDGQRQLMVP-ARDGTSCKLTDLRGVCVSGKCEPIGC 220 230 240 250 260 270 680 690 700 710 720 730 KIAA06 DRIIGSKKKFDKCMVCGGDGSGCSKQSGSFRK--FRYGYNNVVTIPAGATHILVRQQGNP : .. : . .::: .: ::::.:.. .:..:: . ::. :. ::::: : . .. . KIAA06 DGVLFSTHTLDKCGICQGDGSSCTHVTGNYRKGNAHLGYSLVTHIPAGARDIQIVERKKS 280 290 300 310 320 330 740 750 760 770 780 KIAA06 GHRSIYLALKLPDGSYALNGEYTLMPSPTDVVLPGAVSLRYSGATAASET----LSGHGP . ::: : : .::.: . :: . . :.: ..: . :: . ..:: KIAA06 AD---VLALADEAGYYFFNGNYKV-DSPKNFNIAGTV-VKYRRPMDVYETGIEYIVAQGP 340 350 360 370 380 790 800 810 820 830 840 KIAA06 LAQPLTLQVLVA-GNPQDTRLRYSFFVPRPTPSTPRPTPQDWLHRRAQILEILRRRPWAG : :...: :. . ..:... : : : :.: KIAA06 TNQGLNVMVWNQNGKSPSITFEYTLLQP-PHESRPQPIYYGFSESAESQGLDGAGLMGFI 390 400 410 420 430 440 KIAA06 RK KIAA06 PHNGSLYGQASSERLGLDNRLFGHPGLDMELGPSQGQETNEVCEQAGGGACEGPPRGKGF 450 460 470 480 490 500 >>KIAA0021 ( 703 res) ha00117(revised) (703 aa) initn: 206 init1: 80 opt: 240 Z-score: 223.6 bits: 52.1 E(): 2.4e-07 Smith-Waterman score: 267; 23.077% identity (47.215% similar) in 754 aa overlap (142-827:2-684) 120 130 140 150 160 170 KIAA06 SGVQVEGLTVQYLGQAPELLGGAEPGTYLTGTINGDPESVASLHWDGGALLGVLQYRGAE : ..: .: .: : .: :.:. ..: KIAA00 QGYVEGVHNSSIALS-DCFGLRGLLHLENAS 10 20 30 180 190 200 210 KIAA06 LHLQPLEGGTPNSAGGPGAHILRRKSPASGQGPMCNV------KAPLGSPSPRP------ ..::. ::. ::. : . . . :.: : . .: KIAA00 YGIEPLQ----NSSHFE--HIIYRMDDVYKEPLKCGVSNKDIEKETAKDEEEEPPSMTQL 40 50 60 70 80 220 230 240 250 260 270 KIAA06 -RRAKRFASLSRFVETLVVADDKMAAFHGAGLKRYLLTVMAAAAKAFKHPSIRNPVSLVV :: . .:.:: ..:.: . . : . . . : :. . : . .:. KIAA00 LRRRRAVLPQTRYVELFIVVDKERYDMMGRN-QTAVREEMILLANYLDSMYIMLNIRIVL 90 100 110 120 130 140 280 290 300 310 320 330 KIAA06 TRLVILGSGEEGPQVGPSAAQTLRSFCAWQRGLNTPEDSDPDHFDTAILFTRQDLCGVST . : : .:. :: .:...: .: :.. . . : :.: : .. . : KIAA00 VGLEIWTNGNLINIVG-GAGDVLGNFVQWREKFLITRRR---H-DSAQLVLKKGFGG--- 150 160 170 180 190 340 350 360 370 380 390 KIAA06 CDTLGMADVGTVCDPARSCAI-VEDDGLQSAFTA--AHELGHVFNMLHDNSKPCISLNGP : ::: :::::. ... .: : . .:.. :::::: ..: ::... : : KIAA00 --TAGMAFVGTVCSRSHAGGINVFGQITVETFASIVAHELGHNLGMNHDDGRDCSC--GA 200 210 220 230 240 250 400 410 420 430 440 450 KIAA06 LSTSRHVMAPVMAHVDPEEPWSPCSARFITDFLDNGYGHCLLD--KPEAPLHLPVTFPGK : .: . .. . .: :::. . . : :.:::. ::. : . .: KIAA00 KSC---IMN---SGASGSRNFSSCSAEDFEKLTLNKGGNCLLNIPKPDEAYSAP-SCGNK 260 270 280 290 300 460 470 480 490 500 KIAA06 DYDADRQCQLTFGPDSRHCPQLPPPCAALWCSGHLNGHAMC-------QTKHSPWADGTP :: ..:. : ..: .: : : . : .:.. : : . . : :: KIAA00 LVDAGEECDCGT-P--KEC-ELDPCCEGSTC--KLKSFAECAYGDCCKDCRFLP--GGTL 310 320 330 340 350 510 520 530 540 550 KIAA06 C-GPAQAC-MGGRCLHMDQLQDFNIPQAGGWGPWGPWGDCSRTCGGGV-QFSSRDC---- : : .. : . : .:. . .. .:. : . . : .:. :. . .: KIAA00 CRGKTSECDVPEYCNGSSQFCQPDVFIQNGY----PCQNNKAYCYNGMCQYYDAQCQVIF 360 370 380 390 400 410 560 570 580 590 600 610 KIAA06 ---TRPVPRNGGKYCEGRRTRFRSCNT-----EDCPTGSALTFREEQCAAYNHRTDLFKS .. .:.. ... :: .:. . : ::.:: . :: .. .: KIAA00 GSKAKAAPKDCFIEVNSKGDRFGNCGFSGNEYKKCATGNALCGKL-QCENV-QEIPVFGI 420 430 440 450 460 470 620 630 640 650 660 KIAA06 FPGPMDWVPRYTGVAPQDQC-KLTCQARALGYYYVLEPRVVD-GTPCSPDSSSVCVQGRC :. .. : : .: . : :: : .: .:. :: :. ....: . .: KIAA00 VPAIIQTPSRGT------KCWGVDFQ---LGSD-VPDPGMVNEGTKCG--AGKICRNFQC 480 490 500 510 670 680 690 700 710 KIAA06 IHAG-----CD-------RIIGSKKKFDKCMV------CGGDGSGCSKQSG-SFRKFRYG . :. :: . . ...: .: : : : : .:: .. .. . KIAA00 VDASVLNYDCDVQKKCHGHGVCNSNKNCHCENGWAPPNCETKGYGGSVDSGPTYNEMNTA 520 530 540 550 560 570 720 730 740 750 760 KIAA06 YNN------VVTIPAGATHILVRQQGNPGHRSIYLALKLPDGSYALNGEYTLMPSPTDVV . . .: . :.. . . :: . : . .: .:. :: KIAA00 LRDGLLVFFFLIVPLIVCAIFIFIKRDQLWRSYFR--KKRSQTYESDGKNQANPSRQ--- 580 590 600 610 620 630 770 780 790 800 810 820 KIAA06 LPGAVSLRYSGATAASETLSGHGPL-AQPLTLQVLVAGNPQDTRLRYSFFVPRPTPSTPR ::.: . : .: :. :. :. ... . .: .::. : :: : :. KIAA00 -PGSVPRHVSPVTPPREV-----PIYANRFAVPTYAAKQPQQ-------FPSRPPPPQPK 640 650 660 670 680 830 840 KIAA06 PTPQDWLHRRAQILEILRRRPWAGRK . : KIAA00 VSSQGNLIPARPAPAPPLYSSLT 690 700 >>KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202 aa) initn: 578 init1: 241 opt: 242 Z-score: 223.0 bits: 52.8 E(): 2.6e-07 Smith-Waterman score: 258; 34.400% identity (52.800% similar) in 125 aa overlap (465-587:663-771) 440 450 460 470 480 490 KIAA06 CLLDKPEAPLHLPVTFPGKDYDADRQCQLTFGPDSRHCPQLPPPCAALWCSGHLNGHAMC ::: : : :: : .: .: .: KIAA14 CSTLEDSSNMSLWTQNITACPVRNVTRDGGFGPWS---PW--QPCEHL--DGDNSGSCLC 640 650 660 670 680 500 510 520 530 540 550 KIAA06 QTKHSPWADGTPC-GPAQACMGGRCLHMDQLQDFNIPQAGGWGPWGPWGDCSRTCGGGVQ ... : .: : : :: .. : . :.: ::. :. :: .:: : : KIAA14 RARS--------CDSPRPRCGGLDCLG-PAIHIANCSRNGAWTPWSSWALCSTSCGIGFQ 690 700 710 720 730 560 570 580 590 600 610 KIAA06 FSSRDCTRPVPRNGGKYCEGRRTRFRSCNTED-CPTGSALTFREEQCAAYNHRTDLFKSF .:.:. :.::.::. : :. . : :: . :: KIAA14 VRQRSCSNPAPRHGGRICVGKSREERFCNENTPCPVPIFWASWGSWSKCSSNCGGGMQSR 740 750 760 770 780 790 620 630 640 650 660 670 KIAA06 PGPMDWVPRYTGVAPQDQCKLTCQARALGYYYVLEPRVVDGTPCSPDSSSVCVQGRCIHA KIAA14 RRACENGNSCLGCGVEFKTCNPEGCPEVRRNTPWTPWLPVNVTQGGARQEQRFRFTCRAP 800 810 820 830 840 850 >>KIAA1777 ( 954 res) fh19201x1 (954 aa) initn: 255 init1: 195 opt: 205 Z-score: 190.0 bits: 46.4 E(): 1.8e-05 Smith-Waterman score: 205; 47.458% identity (62.712% similar) in 59 aa overlap (533-590:254-311) 510 520 530 540 550 560 KIAA06 DGTPCGPAQACMGGRCLHMDQLQDFNIPQAGGWGPWGPWGDCSRTCGGGVQFSSRDCTRP :::. : :. :. :: : : :: :: : KIAA17 LSDSGNYTCMAANIVAKRRSLSATVVVYVNGGWSSWTEWSACNVRCGRGWQKRSRTCTNP 230 240 250 260 270 280 570 580 590 600 610 620 KIAA06 VPRNGGKYCEGRRTRFRSCNTEDCPT-GSALTFREEQCAAYNHRTDLFKSFPGPMDWVPR .: ::: .::: .. .: : ::. :: KIAA17 APLNGGAFCEGMSVQKITC-TSLCPVDGSWEVWSEWSVCSPECEHLRIRECTAPPPRNGG 290 300 310 320 330 340 >>KIAA0550 ( 1524 res) hh15909 (1524 aa) initn: 214 init1: 126 opt: 203 Z-score: 186.1 bits: 46.3 E(): 3e-05 Smith-Waterman score: 220; 25.229% identity (44.037% similar) in 218 aa overlap (386-587:317-510) 360 370 380 390 400 KIAA06 SCAIVEDDGLQSAFTAAHELGHVFNMLHDNSKPCIS-----LNGPLSTSR----HVMAPV .. :.: .::: :: .. :: KIAA05 FMAQTGESGVEEWSQWSTCSVTCGQGSQVRTRTCVSPYGTHCSGPLRESRVCNNTALCPV 290 300 310 320 330 340 410 420 430 440 450 KIAA06 MAHVDPEEPWSPCS------ARFIT-DFLDNGYGHCLLDKPEAPLHLPVTFPGKDYDADR . . ::: :: : : . :: . ::. : : .. :.. 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KIAA20 PEQLCDGIPDCPQGEDELDCGGLPALGGPNRTGLPCPEYTCPNGTCIGFQLVRVGVGGGG 610 620 630 640 650 660 500 510 520 530 540 550 KIAA06 -TKHSPWADG--TPCGPAQACMGG-RCLHMDQLQDFNIPQA-GGWGPWGPWGDCSRTCGG . : . :: : :.: : : . :. :. :.::::.::: :::::: KIAA20 GSAMLPPSTRALTPL-PPQVCDGQPDCGRPGQVGPSPEEQGCGAWGPWSPWGPCSRTCGP 670 680 690 700 710 720 560 570 580 590 KIAA06 GVQFSSRDCTRPVPRNGGKYCEGRRTRFRSCNTEDCPT-GSALTF--------------- : :: :. :. . : : . . ..: : ::. : :. KIAA20 WGQGRSRRCS-PLGLLVLQNCPGPEHQSQACFTAACPVDGEWSTWSPWSVCSEPCRGTMT 730 740 750 760 770 600 610 620 630 640 650 KIAA06 REEQCAAYNHRTDLFKSFPGPMDWVPRYTGVAPQDQC-KLTCQARALGYYYVLEPRVVDG :..:: . .. ..:: . : : ::: : . ::... . . : . : KIAA20 RQRQCHSPQNGGRTCAALPGGLH-STRQTKPCPQDGCPNATCSGELMFQPCAPCPLTCDD 780 790 800 810 820 830 660 670 680 KIAA06 ----TPCSPD-----------------SSSVCVQGR---CIHAGCDRIIGSKKKFDKCMV . : :: : . :: : :. : :.. : : :.. KIAA20 ISGQVTCPPDWPCGSPGCWCPEGQVLGSEGWCVWPRQCPCLVDGARYWPGQRIKAD-CQL 840 850 860 870 880 890 690 700 710 720 730 740 KIAA06 CGGDGSGCSKQSGSFRKFRYGYNNVVTIPAGATHILVRQQGNPGHRSIYLALKLPDGSYA : : :.: :. : . . .: .. .. : : .:: ... KIAA20 CI-----C--QDGRPRRCRLNPDCAVDCGWSSWSPWAKCLGPCGSQSIQWSFRSSNNPRP 900 910 920 930 940 950 750 760 770 780 790 800 KIAA06 LNGEYTLMPSPTDVVLPGAVSLRYSGATAASETLSGHGPLAQPLTLQVLVAGNPQDTRLR KIAA20 SGRGRQCRGIHRKARRCQTEPCEGCEHQGQVHRVGERWHGGPCRVCQCLHNLTAHCSPYC 960 970 980 990 1000 1010 849 residues in 1 query sequences 1986656 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:12:09 2008 done: Thu Dec 18 15:12:10 2008 Total Scan time: 0.610 Total Display time: 0.310 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]