# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fk02589.fasta.nr -Q ../query/KIAA0683.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0683, 844 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7827077 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5579+/-0.000187; mu= 12.2556+/- 0.010 mean_var=82.7442+/-15.971, 0's: 38 Z-trim: 41 B-trim: 0 in 0/66 Lambda= 0.140996 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|168273054|dbj|BAG10366.1| telomere maintenance ( 837) 5454 1119.6 0 gi|109127149|ref|XP_001089282.1| PREDICTED: simila ( 837) 5132 1054.1 0 gi|148690452|gb|EDL22399.1| RIKEN cDNA 1200003M09, ( 851) 4082 840.5 0 gi|148690453|gb|EDL22400.1| RIKEN cDNA 1200003M09, ( 851) 4073 838.7 0 gi|62655853|ref|XP_220236.3| PREDICTED: similar to ( 834) 4054 834.8 0 gi|15029722|gb|AAH11077.1| Telo2 protein [Mus musc ( 840) 4054 834.8 0 gi|74185842|dbj|BAE32791.1| unnamed protein produc ( 840) 4054 834.8 0 gi|166987395|sp|Q9DC40.2|TELO2_MOUSE RecName: Full ( 840) 4049 833.8 0 gi|148690451|gb|EDL22398.1| RIKEN cDNA 1200003M09, ( 840) 4048 833.6 0 gi|26324594|dbj|BAC26051.1| unnamed protein produc ( 840) 4048 833.6 0 gi|12835850|dbj|BAB23388.1| unnamed protein produc ( 840) 4045 833.0 0 gi|194376844|dbj|BAG57568.1| unnamed protein produ ( 612) 3796 782.2 0 gi|74180647|dbj|BAE25556.1| unnamed protein produc ( 770) 3720 766.8 0 gi|194219389|ref|XP_001915287.1| PREDICTED: simila ( 821) 3282 677.8 5.1e-192 gi|76652563|ref|XP_604456.2| PREDICTED: similar to ( 825) 3215 664.1 6.5e-188 gi|148690454|gb|EDL22401.1| RIKEN cDNA 1200003M09, ( 952) 2776 574.9 5.5e-161 gi|134024339|gb|AAI35214.1| MGC147554 protein [Xen ( 825) 2690 557.3 9.1e-156 gi|123884475|sp|Q08CY4.1|TELO2_XENTR RecName: Full ( 829) 2686 556.5 1.6e-155 gi|166987396|sp|Q6GPP1.2|TELO2_XENLA RecName: Full ( 835) 2681 555.5 3.3e-155 gi|49118943|gb|AAH73072.1| Telo2 protein [Xenopus ( 851) 2681 555.5 3.3e-155 gi|194378638|dbj|BAG63484.1| unnamed protein produ ( 431) 2661 551.2 3.3e-154 gi|149052084|gb|EDM03901.1| similar to 1200003M09R ( 521) 2550 528.7 2.4e-147 gi|114660344|ref|XP_510730.2| PREDICTED: similar t ( 670) 2474 513.3 1.3e-142 gi|118098268|ref|XP_415052.2| PREDICTED: similar t ( 727) 2393 496.9 1.3e-137 gi|149052085|gb|EDM03902.1| similar to 1200003M09R ( 505) 2210 459.5 1.5e-126 gi|73959626|ref|XP_547196.2| PREDICTED: hypothetic ( 826) 1928 402.3 4.2e-109 gi|119935194|ref|XP_001256900.1| PREDICTED: simila ( 548) 1830 382.3 3e-103 gi|149463379|ref|XP_001520471.1| PREDICTED: simila ( 540) 1758 367.6 7.7e-99 gi|210098245|gb|EEA46358.1| hypothetical protein B ( 798) 1734 362.9 3.1e-97 gi|166987393|sp|Q7T006.2|TELO2_DANRE RecName: Full ( 822) 1582 332.0 6.4e-88 gi|116487600|gb|AAI25896.1| Zgc:153824 [Danio reri ( 822) 1580 331.5 8.5e-88 gi|193785998|dbj|BAG50974.1| unnamed protein produ ( 360) 1489 312.8 1.7e-82 gi|26337249|dbj|BAC32309.1| unnamed protein produc ( 304) 1410 296.7 1e-77 gi|115699881|ref|XP_793501.2| PREDICTED: similar t ( 640) 1161 246.2 3.2e-62 gi|156218965|gb|EDO39854.1| predicted protein [Nem ( 778) 884 190.0 3.4e-45 gi|47225976|emb|CAG04350.1| unnamed protein produc ( 889) 873 187.8 1.8e-44 gi|190587596|gb|EDV27638.1| hypothetical protein T ( 713) 784 169.6 4.2e-39 gi|198438296|ref|XP_002126698.1| PREDICTED: simila ( 849) 766 166.0 6.1e-38 gi|212505926|gb|EEB10272.1| epsin 4/enthoprotin, p (1333) 607 133.8 4.7e-28 gi|210127176|gb|EEA74859.1| hypothetical protein B ( 828) 526 117.2 3e-23 gi|215505328|gb|EEC14822.1| hypothetical protein I ( 359) 413 93.9 1.3e-16 gi|163778636|gb|EDQ92251.1| predicted protein [Mon ( 772) 380 87.4 2.4e-14 gi|156555650|ref|XP_001603684.1| PREDICTED: simila (1186) 335 78.4 1.9e-11 gi|60465244|gb|EAL63338.1| hypothetical protein DD ( 935) 328 76.9 4.3e-11 gi|217404961|gb|EEC44906.1| predicted protein [Pha ( 869) 295 70.2 4.3e-09 gi|167875258|gb|EDS38641.1| epsin 4/enthoprotin [C (1095) 292 69.6 7.9e-09 gi|159104295|gb|EDP43185.1| hypothetical protein M ( 972) 282 67.6 2.9e-08 gi|193647939|ref|XP_001947994.1| PREDICTED: simila ( 840) 274 65.9 8.1e-08 gi|198131883|gb|EDY68017.1| GA26538 [Drosophila ps (1428) 273 65.9 1.4e-07 gi|157328104|emb|CAO17205.1| unnamed protein produ (1031) 270 65.1 1.7e-07 >>gi|168273054|dbj|BAG10366.1| telomere maintenance prot (837 aa) initn: 5454 init1: 5454 opt: 5454 Z-score: 5991.2 bits: 1119.6 E(): 0 Smith-Waterman score: 5454; 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