# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk02382.fasta.huge -Q ../query/KIAA0672.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0672, 824 aa vs ./tmplib.23663 library 1986681 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.1284+/-0.0138; mu= -31.8087+/- 0.934 mean_var=785.3005+/-185.016, 0's: 0 Z-trim: 20 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.045767 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1722 ( 1499 res) pf00674s1 (1499) 385 41.3 0.00094 KIAA0712 ( 1770 res) hg04169 (1770) 371 40.4 0.002 KIAA1501 ( 735 res) hh12863 ( 735) 354 38.9 0.0024 KIAA1424 ( 1944 res) ha06448 (1944) 366 40.1 0.0027 KIAA1204 ( 1445 res) fg03451 (1445) 343 38.5 0.0063 >>KIAA1722 ( 1499 res) pf00674s1 (1499 aa) initn: 319 init1: 239 opt: 385 Z-score: 159.3 bits: 41.3 E(): 0.00094 Smith-Waterman score: 385; 28.676% identity (62.868% similar) in 272 aa overlap (244-506:1233-1499) 220 230 240 250 260 270 KIAA06 EIDYANYFQTLIEVQAEYHRKSLTLLQAVLPQIKAQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGRE :. . . .: :. :: :: .: . 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