# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk02075.fasta.huge -Q ../query/KIAA0666.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0666, 1085 aa vs ./tmplib.23663 library 1986420 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 14.6425+/- 0.011; mu= -29.2884+/- 0.746 mean_var=672.5212+/-161.382, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 8 in 1/39 Lambda= 0.049456 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0381 ( 1114 res) ah04695 (1114) 3284 250.1 1.3e-66 KIAA2014 ( 1032 res) ff00951s1 (1032) 835 75.3 4.8e-14 KIAA1902 ( 1112 res) hj04383 (1112) 769 70.7 1.3e-12 KIAA1727 ( 1130 res) pg00153 (1130) 613 59.5 3e-09 >>KIAA0381 ( 1114 res) ah04695 (1114 aa) initn: 4058 init1: 2175 opt: 3284 Z-score: 1288.0 bits: 250.1 E(): 1.3e-66 Smith-Waterman score: 4857; 67.736% identity (85.793% similar) in 1091 aa overlap (8-1085:47-1114) 10 20 30 KIAA06 EIEQNSAMAPRKRGGRGISFIFCCFRNNDHPEITYRL ::::::. .:..:. ::: ..: :::. : KIAA03 AAGARAPWGPRNHNEDLGHLSADAPWPAVTMAPRKRSHHGLGFL-CCFGGSDIPEINLR- 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 90 KIAA06 RNDSNFALQTMEPALPMPPVEELDVMFSELVDELDLTDKHREAMFALPAEKKWQIYCSKK .: :: :: . :.: .:::.. :.:::::::::::.:::::::: ::::::::::: KIAA03 ---DNHPLQFMEFSSPIPNAEELNIRFAELVDELDLTDKNREAMFALPPEKKWQIYCSKK 80 90 100 110 120 130 100 110 120 130 140 150 KIAA06 KDQEE-NKGATSWPEFYIDQLNSMAARKSLLALEKEEEEERSKTIESLKTALRTKPMRFV :.::. :: :::::..:::..::::: .:: :...:: : :....:.:::::::.::::: KIAA03 KEQEDPNKLATSWPDYYIDRINSMAAMQSLYAFDEEETEMRNQVVEDLKTALRTQPMRFV 140 150 160 170 180 190 160 170 180 190 200 210 KIAA06 TRFIDLDGLSCILNFLKTMDYETSESRIHTSLIGCIKALMNNSQGRAHVLAHSESINVIA ::::.:.::.:.::::..::. : :::::::::::::::::::::::::::. :.:..:: KIAA03 TRFIELEGLTCLLNFLRSMDHATCESRIHTSLIGCIKALMNNSQGRAHVLAQPEAISTIA 200 210 220 230 240 250 220 230 240 250 260 270 KIAA06 QSLSTENIKTKVAVLEILGAVCLVPGGHKKVLQAMLHYQKYASERTRFQTLINDLDKSTG ::: ::: ::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::.:.::.: : KIAA03 QSLRTENSKTKVAVLEILGAVCLVPGGHKKVLQAMLHYQVYAAERTRFQTLLNELDRSLG 260 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 KIAA06 RYRDEVSLKTAIMSFINAVLSQGAGVESLDFRLHLRYEFLMLGIQPVIDKLREHENSTLD ::::::.:::::::::::::. ::: ..:.::::::::::::::::::::::.:::. :: KIAA03 RYRDEVNLKTAIMSFINAVLNAGAGEDNLEFRLHLRYEFLMLGIQPVIDKLRQHENAILD 320 330 340 350 360 370 340 350 360 370 380 390 KIAA06 RHLDFFEMLRNEDELEFAKRFELVHIDTKSATQMFELTRKRLTHSEAYPHFMSILHHCLQ .:::::::.::::.::.:.::..::::::::.::::: .:.: ..:::: ..:.:::::: KIAA03 KHLDFFEMVRNEDDLELARRFDMVHIDTKSASQMFELIHKKLKYTEAYPCLLSVLHHCLQ 380 390 400 410 420 430 400 410 420 430 440 450 KIAA06 MPYKRSGNTVQYWLLLDRIIQQIVIQNDKGQDPDSTPLENFNIKNVVRMLVNENEVKQWK :::::.:. : : :::::.::::.:...: ::: .::::::.::.: ::.::::::::. 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KIAA03 PPLPPGGPPTPPGAPPCLGMGLPLPQDPYPSSDVPLRKKRVPQPSHPLKSFNWVKLNEER 610 620 630 640 650 660 630 640 650 660 670 680 KIAA06 LEGTVWTEIDDTKVFKILDLEDLERTFSAYQRQQDFFVNSNSKQKEADAIDDTLSSKLKV . ::::.:::: .::.::::::.:. ::::::.: :: . .: .. :: KIAA03 VPGTVWNEIDDMQVFRILDLEDFEKMFSAYQRHQ----------KELGSTEDIYLASRKV 670 680 690 700 710 690 700 710 720 730 740 KIAA06 KELSVIDGRRAQNCNILLSRLKLSNDEIKRAILTMDEQEDLPKDMLEQLLKFVPEKSDID :::::::::::::: ::::.:::::.::..::: ::::::: ::::::::::.::::::: KIAA03 KELSVIDGRRAQNCIILLSKLKLSNEEIRQAILKMDEQEDLAKDMLEQLLKFIPEKSDID 720 730 740 750 760 770 750 760 770 780 790 800 KIAA06 LLEEHKHELDRMAKADRFLFEMSRINHYQQRLQSLYFKKKFAERVAEVKPKVEAIRSGSE ::::::::..:::.:::::.:::::.:::::::.:.::::: ::.::.::::::: .:. KIAA03 LLEEHKHEIERMARADRFLYEMSRIDHYQQRLQALFFKKKFQERLAEAKPKVEAILLASR 780 790 800 810 820 830 810 820 830 840 850 860 KIAA06 EVFRSGALKQLLEVVLAFGNYMNKGQRGNAYGFKISSLNKIADTKSSIDKNITLLHYLIT :. :: :.:.:::.::.::.:::::::.::::...:::::::::::::.::.:::::: KIAA03 ELVRSKRLRQMLEVILAIGNFMNKGQRGGAYGFRVASLNKIADTKSSIDRNISLLHYLIM 840 850 860 870 880 890 870 880 890 900 910 920 KIAA06 IVENKYPSVLNLNEELRDIPQAAKVNMTELDKEISTLRSGLKAVETELEYQKSQPPQPGD :.:...:..::. ::. .:.:::::..::.::...:: ::.:::.:::::. : .:.: KIAA03 ILEKHFPDILNMPSELQHLPEAAKVNLAELEKEVGNLRRGLRAVEVELEYQRRQVREPSD 900 910 920 930 940 950 930 940 950 960 970 980 KIAA06 KFVSVVSQFITVASFSFSDVEDLLAEAKDLFTKAVKHFGEEAGKIQPDEFFGIFDQFLQA ::: :.:.::::.:::::..:: : ::.: :.::. ::::. .:.:::::::::: :::: KIAA03 KFVPVMSDFITVSSFSFSELEDQLNEARDKFAKALMHFGEHDSKMQPDEFFGIFDTFLQA 960 970 980 990 1000 1010 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA06 VSEAKQENENMRKKKEEEERRARMEAQLKEQRERERKMRKAK-----ENSEESGEFDDLV :::.:. : ::..::::::::::::.::::::::: .:. : . ::.::::::: KIAA03 FSEARQDLEAMRRRKEEEERRARMEAMLKEQRERERWQRQRKVLAAGSSLEEGGEFDDLV 1020 1030 1040 1050 1060 1070 1050 1060 1070 1080 KIAA06 SALRSGEVFDKDLSKLKRNRKRITNQMTDSSRERPITKLNF ::::::::::::: ::::.::: .: . .::: :..::. KIAA03 SALRSGEVFDKDLCKLKRSRKRSGSQALEVTRERAINRLNY 1080 1090 1100 1110 >>KIAA2014 ( 1032 res) ff00951s1 (1032 aa) initn: 715 init1: 286 opt: 835 Z-score: 344.1 bits: 75.3 E(): 4.8e-14 Smith-Waterman score: 1148; 26.782% identity (56.399% similar) in 1094 aa overlap (52-1047:31-1005) 30 40 50 60 70 80 KIAA06 FCCFRNNDHPEITYRLRNDSNFALQTMEPALPMPPVEELDVMFSELVDELDLTDKHREAM .::: ::. :. ... ..: . . . KIAA20 GGPAAMGNLESAEGVPGEPPSVPLLLPPGKMPMPEPCELEERFALVLSSMNLPPDKARLL 10 20 30 40 50 60 90 100 110 120 130 140 KIAA06 FALPAEKKWQIYCSKKKDQEENKGATSWPEFYIDQLNSMAARKSLLALEKEEEEERSKTI ::::.. :.... : .: :. ::..:.:. . ... .: .:.. KIAA20 RQYDNEKKWDLICDQERFQVKNP-----PHTYIQKLQSFLDPSVTRKKFRRRVQESTKVL 70 80 90 100 110 150 160 170 180 KIAA06 ESLKTALRTKPMRFVTRFIDLD--GLSCILNFLK------TMDYETSES-------RI-- . :. .:::. . .: .:.. . ::. ....:. .:.: :: .. KIAA20 RELEISLRTNHIGWVREFLNDENKGLDVLVDYLSFAQCSVMFDFEGLESGDDGAFDKLRS 120 130 140 150 160 170 190 KIAA06 --------------------------------HTSLIG---------------------C ...: : : KIAA20 WSRSIEDLQPPSALSAPFTNSLARSARQSVLRYSTLPGRRALKNSRLVSQKDDVHVCILC 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 250 KIAA06 IKALMNNSQGRAHVLAHSESINVIAQSLSTENIKTKVAVLEILGAVCLVPGGHKKVLQAM ..:.:: . : :..: ...: :: ::...: .::. :::.:.::::: :::. .: :. KIAA20 LRAIMNYQYGFNLVMSHPHAVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLVRGGHEIILAAF 240 250 260 270 280 290 260 270 280 290 300 310 KIAA06 LHYQKYASERTRFQTLINDLDKSTGRYRD-EVSLKTAIMSFINAVLSQGAGVESLDFRLH .... .: ::. :.. . : .: .... .: :.::: :. .::...::.: KIAA20 DNFKEVCKELHRFEKLMEYF-----RNEDSNIDFMVACMQFINIVVH---SVEDMNFRVH 300 310 320 330 340 320 330 340 350 360 370 KIAA06 LRYEFLMLGIQPVIDKLREHENSTLDRHLDFFEMLRNEDELEFAKRFELVHIDTKSATQM :.::: ::.. ..: :. :. :. ... ...: .. .. KIAA20 LQYEFTKLGLEEFLQKSRHTESEKLQVQIQ-------------------AYLD--NVFDV 350 360 370 380 380 390 400 410 420 430 KIAA06 FELTRKRLTHSEAYPHFMSILHHCLQMPYKRSGNTVQYWLLLDRIIQQIVIQNDKGQDPD : . :.. : . . .: .. : ::: KIAA20 GGLLEDAETKNVALEKVEELEEHVSHLTEK----------LLD----------------- 390 400 410 440 450 460 470 480 490 KIAA06 STPLENFNIKNVVRMLVNENEVKQWKEQAEKMRKEHNELQQKLEKKERECDAKTQEKEEM ::: :. :... :... : ... :.... ... ..... .: .:::: KIAA20 ---LENENMMRVAEL---EKQLLQREKELESIKETYENTSHQVHTLRRL----IKEKEEA 420 430 440 450 460 500 510 520 530 540 550 KIAA06 MQTLNKMKEKLEKETTEHKQVKQQVADLTAQLHELSRRAVCASIPGGPSPGAPGGPFPSS .: ... ... . ... .:. :.: : . :. . ::. : KIAA20 FQRRCHLEPNVRGLESVDSEALARVG--PAELSE-------GMPPSDLDLLAPAPPPEEV 470 480 490 500 510 520 560 570 580 590 600 610 KIAA06 VPGSLLPPPPPPPLPGGMLPPPPPPLPPGGPPPPPGPPPLGAIMPPPGAPMGLALKKKSI .: ::::: :::: ::::::: :: :: : :: :.. . ..:. : KIAA20 LP---LPPPPAPPLP-----PPPPPLPDKCPPAPPLP---GA---APSVVLTVGLSAIRI 530 540 550 560 620 630 640 650 660 KIAA06 PQPTNA---LKSFNWSKLPENKLEGTVWTEIDDTKVFKILDLEDLERTFS--AYQRQQDF .: .. : :::. : :.. :::..:.:: :... :::. .:. :. : :. KIAA20 KKPIKTKFRLPVFNWTALKPNQISGTVFSELDDEKILEDLDLDKFEELFKTKAQGPALDL 570 580 590 600 610 620 670 680 690 700 710 720 KIAA06 FVNSNSKQKEADAIDDTLSSKLKVKELSVIDGRRAQNCNILLSRLKLSNDEIKRAILTMD . ..:. ..: .::. ..... ::.: : : . : .:: ::: :.: KIAA20 ICSKNKTAQKA-------ASKV-----TLLEANRAKNLAITLRKAGRSAEEICRAIHTFD 630 640 650 660 670 730 740 750 760 770 780 KIAA06 EQEDLPKDMLEQLLKFVPEKSDIDLLEEHKHE---LDRMAKADRFLFEMSRINHYQQRLQ : :: :..: :..:.: .... ::.....: :...: :::.. .:.... ::. KIAA20 LQT-LPVDFVECLMRFLPTEAEVKLLRQYERERQPLEELAAEDRFMLLFSKVERLTQRMA 680 690 700 710 720 730 790 800 810 820 830 840 KIAA06 SLYFKKKFAERVAEVKPKVEAIRSGSEEVFRSGALKQLLEVVLAFGNYMNKGQRGNAYGF .. : .: . . . :...:: ..: : : :::.::..::.:::::...:: .::: KIAA20 GMAFLGNFQDNLQMLTPQLNAIIAASASVKSSQKLKQMLEIILALGNYMNSSKRGAVYGF 740 750 760 770 780 790 850 860 870 880 890 900 KIAA06 KISSLNKIADTKSSIDKNITLLHYLITIVENKYPSVLNLNEELRDIPQAAKVNMTELDKE :..::. . ::::. :...::::.. :..:::.. :. .::. . .:: :.. .. . KIAA20 KLQSLDLLLDTKST-DRKMTLLHFIALTVKEKYPDLANFWHELHFVEKAAAVSLENVLLD 800 810 820 830 840 850 910 920 930 940 950 960 KIAA06 ISTLRSGLKAVETELEYQKSQPPQPGDKFVSVVSQFITVASFSFSDVEDLLAEAKDLFTK .. : :.. .. : . . ::. .:... ... .. :.. .. KIAA20 VKELGRGMELIRRECSIHDN----------SVLRNFLSTNEGKLDKLQRDAKTAEEAYNA 860 870 880 890 900 970 980 990 1000 1010 KIAA06 AVKHFGEEAGKIQPDEFFGIFDQFLQAVSEAKQENENMRKKKEEEERRA-------RMEA .:..::: :. :: .: .:... .::.:::: :::.:: :. ...: KIAA20 VVRYFGESPKTTPPSVFFPVFVRFIRSYKEAEQENEA-RKKQEEVMREKQLAQEAKKLDA 910 920 930 940 950 960 1020 1030 1040 1050 1060 KIAA06 QLKEQRER--------ERKMRKAKENSE----ESGEFDDLVSALRSGEVFDKDLSKLKRN . ::.. : . :.:::. ..: ..:....: KIAA20 KTPSQRNKWQQQELIAELRRRQAKEHRPVYEGKDGTIEDIITGLHCQPMVVRHQARSAAP 970 980 990 1000 1010 1020 1070 1080 KIAA06 RKRITNQMTDSSRERPITKLNF KIAA20 PSGPPRAPGPH 1030 >>KIAA1902 ( 1112 res) hj04383 (1112 aa) initn: 334 init1: 313 opt: 769 Z-score: 318.2 bits: 70.7 E(): 1.3e-12 Smith-Waterman score: 1259; 27.148% identity (56.873% similar) in 1164 aa overlap (41-1081:31-1111) 20 30 40 50 60 70 KIAA06 RKRGGRGISFIFCCFRNNDHPEITYRLRNDSNFALQTMEPALPMPPVEELDVMFSELVDE ..: ... :::: ::. :. ... KIAA19 FPTRTLGARSSPRPRRAADMGNAGSMDSQQTDFRAHNVPLKLPMPEPGELEERFAIVLNA 10 20 30 40 50 60 80 90 100 110 120 130 KIAA06 LDLTDKHREAMFALPAEKKWQIYCSKKKDQEENKGATSWPEFYIDQLNSMAARKSLLALE ..: . . . ::::.. :.... : .: :. ::..:... KIAA19 MNLPPDKARLLRQYDNEKKWELICDQERFQVKNP-----PHTYIQKLKGYLDPAVTRKKF 70 80 90 100 110 140 150 160 170 180 KIAA06 KEEEEERSKTIESLKTALRTKPMRFVTRFIDLD--GLSCILNFLK------TMDYETSES ... .: ..... :. .:::. . .: .:.. . ::. ....:. :.:.:. :: KIAA19 RRRVQESTQVLRELEISLRTNHIGWVREFLNEENKGLDVLVEYLSFAQYAVTFDFESVES 120 130 140 150 160 170 190 KIAA06 RIHTSL----------------------IG------------------------------ ...:. .: KIAA19 TVESSVDKSKPWSRSIEDLHRGSNLPSPVGNSVSRSGRHSALRYNTLPSRRTLKNSRLVS 180 190 200 210 220 230 200 210 220 230 240 KIAA06 ----------CIKALMNNSQGRAHVLAHSESINVIAQSLSTENIKTKVAVLEILGAVCLV :..:.:: . : :..: ...: :: ::...: .::. :::.:.::::: KIAA19 KKDDVHVCIMCLRAIMNYQYGFNMVMSHPHAVNEIALSLNNKNPRTKALVLELLAAVCLV 240 250 260 270 280 290 250 260 270 280 290 KIAA06 PGGHKKVLQAMLHYQKYASERTRFQTLINDLDKSTGRYRDE-VSLKTAIMSFINAVLSQG :::. .:.:. .... .:. ::. :.. . : .:. ... .: :.::: :. KIAA19 RGGHEIILSAFDNFKEVCGEKQRFEKLMEHF-----RNEDNNIDFMVASMQFINIVVH-- 300 310 320 330 340 300 310 320 330 340 350 KIAA06 AGVESLDFRLHLRYEFLMLGIQPVIDKLREHENSTLDRHLDFFEMLRNEDELEFAKRFEL .::...::.::.::: ::.. .:::.. :.. :. ... . : : : : KIAA19 -SVEDMNFRVHLQYEFTKLGLDEYLDKLKHTESDKLQVQIQAY--LDNV----FDVGALL 350 360 370 380 390 400 360 370 380 390 400 410 KIAA06 VHIDTKSATQMFELTRKRLTHSEAYPHFMSILHHCLQMPYKRSGNTVQYWLLLDRIIQQI .::.:. : . : . .: : . :: ... . . ... KIAA19 EDAETKNAA---------LERVEELEENISHLSEKLQDTENEAMSKIVE-------LEKQ 410 420 430 440 420 430 440 450 460 470 KIAA06 VIQNDKGQDPDSTPLENFNIK-NVVRMLVNENEVKQWKEQAEKMRKEHNELQQKLEKKER ..: .: : .. : . ...: .: ::. : .... . :..:... :. KIAA19 LMQRNKELDVVREIYKDANTQVHTLRKMV--------KEKEEAIQRQ-STLEKKIHELEK 450 460 470 480 490 480 490 500 510 520 530 KIAA06 ECDAKTQEKEE----MMQTLNKMKEKLEKETTEHKQVKQQVADLTAQLHELSRRAVCASI . : :.: . .. .. . .. .:.. ..: .. : . . KIAA19 QGTIKIQKKGDGDIAILPVVASGTLSMGSEVVAGNSVGPTMG-----------AASSGPL 500 510 520 530 540 540 550 560 570 580 KIAA06 PGGPSPGAPGGPFPSSVP-GSLLPP-PPPPPLPGGMLPPPPPPLPPGGPPPP-PGP---- : : : :.. : .: : . :: ::::: : :::::: :: :::: ::: KIAA19 PPPPPPLPPSSDTPETVQNGPVTPPMPPPPPPP----PPPPPPPPPPPPPPPLPGPASET 550 560 570 580 590 600 590 600 610 620 630 KIAA06 ---PPLGAIMP--PP----GAPM-----GLALKKKSIPQPTN-ALKSFNWSKLPENKLEG :::. .: :: ..: ::: : . : :. . ::: : :...: KIAA19 VPAPPLAPPLPSAPPLPGTSSPTVVFNSGLAAVKIKKPIKTKFRMPVFNWVALKPNQING 610 620 630 640 650 660 640 650 660 670 680 690 KIAA06 TVWTEIDDTKVFKILDLEDLERTFSAYQRQQDFFVN-SNSKQKEADAIDDTLSSKLKVKE ::..:::: .... :.....:. :.. . : .. :.:::: : . :.:. 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