# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk01789.fasta.huge -Q ../query/KIAA0656.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0656, 912 aa vs ./tmplib.23663 library 1986593 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 13.9316+/-0.0122; mu= -28.4491+/- 0.827 mean_var=614.4301+/-149.215, 0's: 0 Z-trim: 12 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.051741 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 355 42.5 0.0009 KIAA0618 ( 1052 res) hg03971 (1052) 319 39.4 0.0027 KIAA0754 ( 1174 res) hh06485 (1174) 306 38.5 0.0057 KIAA1683 ( 832 res) fh24307 ( 832) 299 37.8 0.0064 >>KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053 aa) initn: 234 init1: 120 opt: 355 Z-score: 159.6 bits: 42.5 E(): 0.0009 Smith-Waterman score: 413; 24.581% identity (49.581% similar) in 716 aa overlap (257-893:949-1643) 230 240 250 260 270 280 KIAA06 FFEMKKGQCKDALEIYKRFLTRMTRVSEFLKVAEQVGIDKGDIPDLTQAPSSLMETLEQH .....: .. . :: :. . ... 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