# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/fh18335.fasta.nr -Q ../query/KIAA0654.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0654, 1267 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7809175 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9545+/-0.000211; mu= 8.0898+/- 0.012 mean_var=163.2482+/-31.561, 0's: 28 Z-trim: 92 B-trim: 449 in 2/63 Lambda= 0.100381 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|42558941|sp|O75145.3|LIPA3_HUMAN RecName: Full= (1194) 7774 1138.9 0 gi|75517675|gb|AAI01519.1| Protein tyrosine phosph (1194) 7770 1138.3 0 gi|76641965|ref|XP_581408.2| PREDICTED: similar to (1194) 7706 1129.0 0 gi|109458729|ref|XP_341857.3| PREDICTED: similar t (1355) 7679 1125.2 0 gi|190148195|gb|ACE63189.1| liprin-alpha 3 [Mus mu (1194) 7623 1117.0 0 gi|42558929|sp|Q91Z79.2|LIPA3_RAT RecName: Full=Li (1192) 7577 1110.3 0 gi|149055940|gb|EDM07371.1| rCG54528 [Rattus norve (1034) 6556 962.4 0 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