# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj04122.fasta.nr -Q ../query/KIAA0649.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0649, 1253 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7820863 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1880+/-0.000202; mu= 11.2125+/- 0.011 mean_var=123.8355+/-24.081, 0's: 34 Z-trim: 43 B-trim: 609 in 2/66 Lambda= 0.115253 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|114627523|ref|XP_520352.2| PREDICTED: 1A6/DRIM (1636) 8298 1392.1 0 gi|194226009|ref|XP_001917418.1| PREDICTED: simila (1303) 2788 475.8 7.5e-131 gi|194671826|ref|XP_876074.3| PREDICTED: similar t (1173) 2530 432.9 5.7e-118 gi|73967785|ref|XP_548400.2| PREDICTED: hypothetic (1182) 1715 297.3 3.6e-77 gi|148676433|gb|EDL08380.1| mCG59727 [Mus musculus (1101) 1441 251.8 1.8e-63 gi|149039197|gb|EDL93417.1| rCG45515 [Rattus norve (1102) 1166 206.0 1e-49 gi|109467956|ref|XP_001063635.1| PREDICTED: simila (1165) 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