# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj03289.fasta.huge -Q ../query/KIAA0636.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0636, 540 aa vs ./tmplib.23663 library 1986965 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.6584+/-0.00459; mu= 21.2451+/- 0.313 mean_var=87.0239+/-20.318, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.137485 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1599 ( 608 res) fj09928 ( 608) 1453 298.5 9.3e-82 KIAA1342 ( 426 res) fj00418 ( 426) 160 41.8 0.00012 KIAA0985 ( 697 res) hj08038 ( 697) 149 39.9 0.00072 KIAA0559 ( 1212 res) hh01510 (1212) 145 39.5 0.0017 >>KIAA1599 ( 608 res) fj09928 (608 aa) initn: 1178 init1: 677 opt: 1453 Z-score: 1559.7 bits: 298.5 E(): 9.3e-82 Smith-Waterman score: 1813; 52.080% identity (75.588% similar) in 553 aa overlap (10-534:38-585) 10 20 30 KIAA06 TQDMAAQCVTKVALNVSCANLLDKDIGSKSDPLCVLFLN ::: ..::: ::::::. ::::::::.. . 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