# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj03253.fasta.nr -Q ../query/KIAA0635.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0635, 864 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7806531 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4291+/-0.000202; mu= 6.6123+/- 0.011 mean_var=142.5439+/-27.715, 0's: 34 Z-trim: 128 B-trim: 446 in 1/65 Lambda= 0.107424 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|62288025|sp|Q66GS9.1|CP135_HUMAN RecName: Full= (1140) 5366 844.3 0 gi|187953263|gb|AAI36536.1| Centrosomal protein 13 (1140) 5362 843.7 0 gi|114594686|ref|XP_517281.2| PREDICTED: centrosom (1140) 5341 840.5 0 gi|119625883|gb|EAX05478.1| hCG2027094 [Homo sapie ( 846) 5249 826.1 0 gi|149702945|ref|XP_001491802.1| PREDICTED: centro (1139) 4897 771.6 0 gi|73975305|ref|XP_539276.2| PREDICTED: similar to ( 919) 4853 764.7 0 gi|194667888|ref|XP_001789241.1| PREDICTED: centro (1139) 4797 756.1 1.8e-215 gi|109499601|ref|XP_223341.4| PREDICTED: similar t (1140) 4509 711.5 5e-202 gi|109074801|ref|XP_001084949.1| PREDICTED: simila (1131) 4506 711.0 6.9e-202 gi|62288026|sp|Q6P5D4.1|CP135_MOUSE RecName: Full= (1140) 4488 708.3 4.8e-201 gi|148705959|gb|EDL37906.1| centrosomal protein 13 (1152) 4488 708.3 4.8e-201 gi|63092069|emb|CAI93867.1| centrosomal protein 13 (1145) 4423 698.2 5.2e-198 gi|74209432|dbj|BAE23283.1| unnamed protein produc (1031) 3812 603.4 1.5e-169 gi|149487048|ref|XP_001518640.1| PREDICTED: simila (1143) 3620 573.7 1.5e-160 gi|126331725|ref|XP_001370634.1| PREDICTED: simila (1188) 3498 554.8 7.6e-155 gi|118090502|ref|XP_420699.2| PREDICTED: similar t (1163) 3467 550.0 2.1e-153 gi|110665674|gb|ABG81483.1| centrosome protein 4 [ ( 845) 3056 486.2 2.5e-134 gi|158706461|sp|Q5RG45.2|CP135_DANRE Centrosomal p (1164) 2625 419.5 4e-114 gi|148705960|gb|EDL37907.1| centrosomal protein 13 (1189) 2552 408.2 1e-110 gi|166796870|gb|AAI59174.1| LOC100145206 protein [ ( 916) 2123 341.6 8.9e-91 gi|29127003|gb|AAH48022.1| LOC398577 protein [Xeno ( 936) 2052 330.6 1.9e-87 gi|62020284|gb|AAH12003.1| CEP135 protein [Homo sa ( 365) 1819 294.1 7.2e-77 gi|194671321|ref|XP_616564.4| PREDICTED: similar t ( 697) 1683 273.3 2.5e-70 gi|73969397|ref|XP_531789.2| PREDICTED: similar to ( 697) 1682 273.2 2.8e-70 gi|195539891|gb|AAI68202.1| Tsga10 protein [Rattus ( 697) 1649 268.0 9.6e-69 gi|74724919|sp|Q9BZW7.1|TSG10_HUMAN RecName: Full= ( 698) 1649 268.0 9.6e-69 gi|148682582|gb|EDL14529.1| testis specific 10, is ( 690) 1648 267.9 1.1e-68 gi|81885028|sp|Q6NY15.1|TSG10_MOUSE RecName: Full= ( 697) 1648 267.9 1.1e-68 gi|22382177|gb|AAH28366.1| Testis specific, 10 [Ho ( 698) 1647 267.7 1.2e-68 gi|13508448|gb|AAK27309.1| nucleoporin NYD-SP7 [Ho ( 699) 1647 267.7 1.2e-68 gi|126337167|ref|XP_001363486.1| PREDICTED: simila ( 699) 1646 267.6 1.3e-68 gi|189053887|dbj|BAG36156.1| unnamed protein produ ( 698) 1644 267.3 1.6e-68 gi|198434276|ref|XP_002126770.1| PREDICTED: simila ( 862) 1638 266.4 3.6e-68 gi|149046339|gb|EDL99232.1| testis specific 10, is ( 788) 1631 265.3 7.2e-68 gi|149046338|gb|EDL99231.1| testis specific 10, is ( 810) 1630 265.2 8.2e-68 gi|47047249|gb|AAN01136.3| TSGA10 [Mus musculus] ( 689) 1627 264.6 1e-67 gi|47219334|emb|CAG10963.1| unnamed protein produc ( 858) 1625 264.4 1.5e-67 gi|210085239|gb|EEA33718.1| hypothetical protein B (1179) 1592 259.4 6.3e-66 gi|165971181|gb|AAI58466.1| LOC100145056 protein [ ( 379) 1559 253.8 1e-64 gi|118084268|ref|XP_416892.2| PREDICTED: similar t (1152) 1500 245.2 1.2e-61 gi|149046337|gb|EDL99230.1| testis specific 10, is ( 610) 1477 241.3 9.3e-61 gi|115689588|ref|XP_781904.2| PREDICTED: similar t (1062) 1449 237.2 2.8e-59 gi|75076511|sp|Q4R6W3.1|TSG10_MACFA RecName: Full= ( 601) 1277 210.3 2e-51 gi|148682581|gb|EDL14528.1| testis specific 10, is ( 805) 1216 201.0 1.7e-48 gi|18307574|dbj|BAB84031.1| unnamed protein produc ( 464) 1097 182.3 4.1e-43 gi|119622293|gb|EAX01888.1| testis specific, 10, i ( 462) 1080 179.7 2.5e-42 gi|148682583|gb|EDL14530.1| testis specific 10, is ( 620) 1059 176.6 3e-41 gi|49823177|gb|AAT68665.1| TSGA10 isoform [Mus mus ( 619) 1056 176.1 4.1e-41 gi|149046334|gb|EDL99227.1| testis specific 10, is ( 540) 1042 173.9 1.7e-40 gi|3851160|gb|AAC72234.1| cp431 [Rattus norvegicus ( 898) 948 159.5 5.8e-36 >>gi|62288025|sp|Q66GS9.1|CP135_HUMAN RecName: Full=Cent (1140 aa) initn: 5366 init1: 5366 opt: 5366 Z-score: 4501.0 bits: 844.3 E(): 0 Smith-Waterman score: 5366; 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