# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj03064.fasta.huge -Q ../query/KIAA0634.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0634, 1321 aa vs ./tmplib.23663 library 1986184 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4333+/-0.00691; mu= 5.6734+/- 0.468 mean_var=188.9774+/-45.226, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.093297 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0289 ( 1302 res) ha06244 (1302) 3619 500.7 6.5e-142 >>KIAA0289 ( 1302 res) ha06244 (1302 aa) initn: 3878 init1: 1666 opt: 3619 Z-score: 2639.7 bits: 500.7 E(): 6.5e-142 Smith-Waterman score: 4298; 48.933% identity (74.085% similar) in 1312 aa overlap (79-1319:24-1300) 50 60 70 80 90 100 KIAA06 LRGRPRLCFHPGPPPLLPLLLLFLLLLPPPPLLAGATAAASREPDSP--CRLKTVTVSTL : . ::::.. .:.. :.::..:::.: KIAA02 HASGPGLKMALAGLCALLACCWGPAAVLATAAGDVDPSKELECKLKSITVSAL 10 20 30 40 50 110 120 130 140 150 160 KIAA06 PALRESDIGWSGARAGAGAGTGAGAAAAAASPGSPGSAGTAAESRLLLFVRNELPGRIAV : :::.:. . :: .:.: .::. :::..::...: KIAA02 PFLRENDL------------------SIMHSP-------SASEPKLLFSVRNDFPGEMVV 60 70 80 170 180 190 200 210 220 KIAA06 QDDLDNTELPFFTLEMSGTAADISLVHWRQQWLENGTLYFHVSMSSSGQLAQATAPTLQE :::.:::::.:.::.::.. :: ::.::::::::::: ::. .... . :: . 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KIAA02 --LSDSGTKRMAAGVRMECQSKGRCPSSCPLCHVTSSPDTPAEPVLLEVTKAAPIYELVT 930 940 950 960 970 980 1010 1020 1030 1040 1050 1060 KIAA06 DNGTKEAFKSALMSSYWCSGKGDVIDDWCRCDLSAFDANGLPNCSPLLQPVLRLSPTVEP .: :.. .. : ::: :::: ::::.:::::: .:: :.:::.:.:: ::::::: . :: KIAA02 NNQTQRLLQEATMSSLWCSGTGDVIEDWCRCDSTAFGADGLPTCAPLPQPVLRLSTVHEP 990 1000 1010 1020 1030 1040 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA06 SSTVVSLEWVDVQPAIGTKVSDYILQHKKVDEYTD-TDLYTGEFLSFADDLLSGLGTSCV :::.: ::: .: ::... ::.:...:: . : . . : :::.::..:: . :. KIAA02 SSTLVVLEWEHSEPPIGVQIVDYLLRQEKVTDRMDHSKVETETVLSFVDDIISGAKSPCA 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1120 1130 1140 1150 1160 1170 KIAA06 AAGRSHGEVPE--VSIYSVIFKCLEPDGLYKFTLYAVDTRGRHSELSTVTLRTACPLVDD . .::. .. :.:..::::: .: :::..::. ::.:. : : ..: ::.::: KIAA02 MPS----QVPDKQLTTISLIIRCLEPDTIYMFTLWGVDNTGRRSRPSDVIVKTPCPVVDD 1110 1120 1130 1140 1150 1180 1190 1200 1210 1220 1230 KIAA06 NKAEEIADKIYNLYNGYTSGKEQQMAYNTLMEVSASMLFRVQHHYNSHYEKFGDFVWRSE ::.:::::::::.:::::::::: :::::..... : :: .:::.:::.::.:.:: : KIAA02 VKAQEIADKIYNLFNGYTSGKEQQTAYNTLLDLGSPTLHRVLYHYNQHYESFGEFTWRCE 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1240 1250 1260 1270 1280 1290 KIAA06 DELGPRKAHLILRRLERVSSHCSSLLRSAYIQSRVETVPYLFCRSEEVRPAGMVWYSILK :::::::: ::: .: .:: :..::. :. : .. :: :: :..: :. : . . KIAA02 DELGPRKAGLILSQLGDLSSWCNGLLQEPKISLRRSSLKYLGCRYSEIKPYGLDWAELSR 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1300 1310 1320 KIAA06 DTKITCEEKMVSMARNTYGESKGR : . ::::. .:. : ::.:: KIAA02 DLRKTCEEQTLSIPYNDYGDSKEI 1280 1290 1300 1321 residues in 1 query sequences 1986184 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:10:04 2008 done: Thu Dec 18 15:10:05 2008 Total Scan time: 0.770 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]