# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj02892.fasta.huge -Q ../query/KIAA0633.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0633, 1316 aa vs ./tmplib.23663 library 1986189 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.0937+/- 0.01; mu= -3.6205+/- 0.681 mean_var=377.7582+/-89.406, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.065988 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0977 ( 1207 res) hj07018 (1207) 730 84.5 1.2e-16 >>KIAA0977 ( 1207 res) hj07018 (1207 aa) initn: 859 init1: 357 opt: 730 Z-score: 390.6 bits: 84.5 E(): 1.2e-16 Smith-Waterman score: 896; 26.506% identity (53.270% similar) in 1162 aa overlap (40-1081:26-1105) 10 20 30 40 50 60 KIAA06 RCPPPARVGGRWVSAEKVNEGGSGGGGSQRLTRRARSTARVPAPGTMDA--PRASAAKPP .::: . ::. .::. :: . : : KIAA09 RSASFAPASGRRASRPDPPASPTPAVTRRLGAGARAAPRRAMDGRTPRPQDA--P 10 20 30 40 50 70 80 90 100 110 120 KIAA06 TGRKMKARAPPPPGKAATLHVHSDQKPPHDGALGSQQNLVRMKEALRASTMDVTVVLPSG . :: ::.:: ::... : : .. :. .: :: . . ....::::. 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