# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/pf00524.fasta.nr -Q ../query/KIAA0629.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0629, 1272 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826519 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7355+/-0.000187; mu= 11.6382+/- 0.010 mean_var=83.7034+/-16.220, 0's: 41 Z-trim: 42 B-trim: 41 in 1/65 Lambda= 0.140185 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|13431310|sp|Q9UKA4.1|AKA11_HUMAN RecName: Full= (1901) 8281 1685.7 0 gi|114651409|ref|XP_001151723.1| PREDICTED: A-kina (1901) 8159 1661.0 0 gi|109120661|ref|XP_001091086.1| PREDICTED: A-kina (1925) 7500 1527.8 0 gi|114651411|ref|XP_001151787.1| PREDICTED: A-kina (1873) 7213 1469.7 0 gi|149730340|ref|XP_001492688.1| PREDICTED: simila (1906) 6700 1366.0 0 gi|73989321|ref|XP_851781.1| PREDICTED: similar to (1940) 6554 1336.4 0 gi|194671953|ref|XP_612396.4| PREDICTED: similar t (1905) 6267 1278.4 0 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hCG1644232, isoform CR (1340) 259 63.2 1.3e-06 gi|26386868|dbj|BAC25605.1| unnamed protein produc ( 685) 255 62.2 1.3e-06 gi|119591293|gb|EAW70887.1| hCG1644232, isoform CR ( 397) 251 61.2 1.4e-06 gi|51476683|emb|CAH18317.1| hypothetical protein [ (1671) 259 63.3 1.5e-06 gi|217416352|ref|NP_085126.2| sphingosine kinase t (1671) 259 63.3 1.5e-06 gi|26332715|dbj|BAC30075.1| unnamed protein produc (1586) 258 63.1 1.6e-06 gi|119591291|gb|EAW70885.1| hCG1644232, isoform CR (1340) 257 62.8 1.7e-06 gi|109101337|ref|XP_001111626.1| PREDICTED: simila (1671) 257 62.9 2e-06 gi|114583741|ref|XP_001137938.1| PREDICTED: hypoth (1671) 256 62.7 2.3e-06 gi|126338286|ref|XP_001373368.1| PREDICTED: hypoth (1696) 254 62.3 3e-06 gi|51476324|emb|CAH18152.1| hypothetical protein [ (1369) 251 61.6 3.9e-06 gi|119888532|ref|XP_612993.3| PREDICTED: similar t (1726) 252 61.9 4.1e-06 gi|121941477|sp|Q2M3C7.1|SPKAP_HUMAN RecName: Full (1700) 251 61.7 4.7e-06 gi|109101335|ref|XP_001111587.1| PREDICTED: simila (1700) 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(1901 aa) initn: 8159 init1: 8159 opt: 8159 Z-score: 8907.9 bits: 1661.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 8159; 98.506% identity (99.528% similar) in 1272 aa overlap (1-1272:630-1901) 10 20 30 KIAA06 DLQYVKKQIFTNTVARFAADLAEELVFEGI ::.::::::::::::::::::::::::::: gi|114 RRQRAFSLKERAISGLANFLVSEALSNALKDLRYVKKQIFTNTVARFAADLAEELVFEGI 600 610 620 630 640 650 40 50 60 70 80 90 KIAA06 MEVCQFSYPQTPASPQCGSFDFEDKVVKLYAKDLSESVIQEAFIELSQVDVTFTTKAAVS :::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::: ::::::: gi|114 MEVCQFSYPQTPASPQCGSFDFEDKVVKSYAKDLSESVIQEAFIELSQVDVTCTTKAAVS 660 670 680 690 700 710 100 110 120 130 140 150 KIAA06 VSTDNIKYVSAESVVPSTQAVTFSPSFHNQAIMVTKPVQEYKKEYTVQQALFCTSGIVTS :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: gi|114 VSTDNIKYVSAESVVPSTQAVTFSPSFHNQAIMVTKPVQEYKKEYTVQQALFCTSGIVTS 720 730 740 750 760 770 160 170 180 190 200 210 KIAA06 IPVPLAGSALLPYHISSTACQAKAHLSSDDSNSNGDSAQVHIATKNREEKAACLRNICLP ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::: gi|114 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