# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh01433.fasta.huge -Q ../query/KIAA0628.ptfa ./tmplib.23663 2
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA0628, 540 aa
 vs ./tmplib.23663 library

1986965 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8066+/-0.00561; mu= 13.9094+/- 0.384
 mean_var=122.7127+/-30.768, 0's: 0 Z-trim: 80  B-trim: 16 in 1/39
 Lambda= 0.115779

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width:  16
The best scores are:                                      opt bits E(2037)
KIAA1611  ( 813 res)   fj12627                     ( 813) 1685 293.3 4.5e-80
KIAA1349  ( 752 res)   fj00940                     ( 752) 1657 288.6 1.1e-78
KIAA1947  ( 608 res)   fh23660                     ( 608) 1651 287.5   2e-78
KIAA0065  ( 848 res)   ha00946                     ( 848) 1608 280.5 3.4e-76
KIAA1508  ( 573 res)   hk06576                     ( 573) 1600 278.9 6.9e-76
KIAA0326  ( 927 res)   hg00579                     ( 927) 1580 275.9 9.2e-75
KIAA0798  ( 682 res)   hk06584                     ( 682) 1575 274.8 1.4e-74
KIAA1956  ( 680 res)   fk08713                     ( 680) 1569 273.8 2.8e-74
KIAA1827  ( 469 res)   fk01409                     ( 469) 1550 270.4   2e-73
KIAA1710  ( 515 res)   fj18457                     ( 515) 1536 268.1 1.1e-72
KIAA1852  ( 948 res)   fj01514                     ( 948) 1538 268.9 1.2e-72
KIAA1982  ( 599 res)   fk06527(revised)            ( 599) 1529 267.1 2.6e-72
KIAA0412  ( 720 res)   hg03242                     ( 720) 1525 266.5 4.7e-72
KIAA1431  ( 891 res)   fj00022                     ( 891) 1525 266.7 5.2e-72
KIAA1969  ( 595 res)   fk06944                     ( 595) 1516 264.9 1.2e-71
KIAA1559  ( 544 res)   fh19195                     ( 544) 1514 264.5 1.4e-71
KIAA2033  ( 766 res)   ej00602s1                   ( 766) 1496 261.7 1.4e-70
KIAA0961  ( 530 res)   hj05830                     ( 530) 1488 260.1 2.8e-70
KIAA1473  ( 574 res)   fj03262                     ( 574) 1485 259.7 4.2e-70
KIAA1948  ( 487 res)   fh24556                     ( 487) 1476 258.1 1.1e-69
KIAA1829  ( 557 res)   hj00069                     ( 557) 1444 252.8 4.8e-68
KIAA2007  ( 580 res)   fj01689                     ( 580) 1422 249.2 6.2e-67
KIAA0426  ( 613 res)   hh01274                     ( 613) 1353 237.7 1.9e-63
KIAA1874  ( 579 res)   hk07257s1                   ( 579) 1344 236.1 5.2e-63
KIAA1396  ( 551 res)   hj08221                     ( 551) 1342 235.8 6.4e-63
KIAA2003  ( 460 res)   ah02593                     ( 460) 1333 234.2 1.6e-62
KIAA1588  ( 613 res)   fj08823                     ( 613) 1302 229.2 6.9e-61
KIAA1962  ( 746 res)   hm00158                     ( 746) 1297 228.5 1.4e-60
KIAA1198  ( 553 res)   fg01911                     ( 553) 1279 225.3 9.4e-60
KIAA1615  ( 484 res)   fj13419                     ( 484) 1278 225.0 9.8e-60
KIAA1871  ( 821 res)   hj05256s1                   ( 821) 1256 221.7 1.7e-58
KIAA0972  ( 702 res)   hj06859                     ( 702) 1197 211.7 1.4e-55
KIAA1141  ( 914 res)   hk01833                     ( 914) 1195 211.6 2.1e-55
KIAA1806  ( 481 res)   fk00438                     ( 481) 1191 210.5 2.3e-55
KIAA1015  ( 841 res)   hk03609(revised)            ( 841) 1011 180.8 3.5e-46
KIAA1388  ( 599 res)   fj06552                     ( 599)  910 163.7 3.5e-41
KIAA1954  ( 468 res)   fk02322                     ( 468)  879 158.3 1.1e-39
KIAA1339  ( 409 res)   fj00071                     ( 409)  805 145.9 5.4e-36
KIAA0441  ( 702 res)   hh00601s1                   ( 702)  748 136.7 5.4e-33
KIAA1979  ( 309 res)   fj09511                     ( 309)  662 121.8 7.2e-29
KIAA0924  ( 617 res)   hh02883                     ( 617)  633 117.4   3e-27
KIAA0557  ( 493 res)   hh01334                     ( 493)  613 113.9 2.7e-26
KIAA1951  ( 679 res)   fj05532                     ( 679)  607 113.1 6.5e-26
KIAA1703  ( 1165 res)   fj16891                    (1165)  567 106.8   9e-24
KIAA0236  ( 1696 res)   ha04654                    (1696)  536 101.9   4e-22
KIAA1675  ( 1286 res)   ae00102                    (1286)  503 96.2 1.6e-20
KIAA1231  ( 1061 res)   fh08195s1                  (1061)  482 92.6 1.6e-19
KIAA0287  ( 1523 res)   fg06332                    (1523)  461 89.3 2.2e-18
KIAA1285  ( 785 res)   hh11563(revised)            ( 785)  433 84.2 3.9e-17
KIAA1020  ( 638 res)   fg00473s1                   ( 638)  431 83.7 4.4e-17


>>KIAA1611  ( 813 res)   fj12627                          (813 aa)
 initn: 14240 init1: 1663 opt: 1685  Z-score: 1529.5  bits: 293.3 E(): 4.5e-80
Smith-Waterman score: 1685;  47.047% identity (70.866% similar) in 508 aa overlap (16-513:301-806)

                              10        20          30        40   
KIAA06                VRGKMILLSFVSDSNVGTGEK--KVTEAWISEDENSHRTTSDRLT
                                     . ::::  :  :      .::. .:  :. 
KIAA16 RRIHSGEKPYKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIH
              280       290       300       310       320       330

            50        60        70        80              90       
KIAA06 VMELPSPESEEVHEPRLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQV------TVTHWKIQTGET
       . : :   .:  .  :    : . .    : .: .   : ..       ..::.:.::: 
KIAA16 TGEKPYKCNECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEK
              340       350       360       370       380       390

       100       110       120         130       140       150     
KIAA06 AQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRELIEGEANP--CDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPY
          :.. :.   . :.: . :  .  :: .:  :. :::.: .:: : :::  :.:::::
KIAA16 PYKCNECGKAFSVRSSLAIHQT-IHTGE-KPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPY
              400       410         420       430       440        

         160       170       180       190       200       210     
KIAA06 TCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQ
        :..:::.:.. :.:  :: :::: . . :: :.: : . : : .:.:.:.::::.:: .
KIAA16 KCNECGKAFSMHSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNE
      450       460       470       480       490       500        

         220       230       240       250       260       270     
KIAA06 CGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKS
       :::::   :.:  :: .:. :.:..: ::::.:.:.: :  :. ::.::.::.:::::: 
KIAA16 CGKAFSVRSSLTTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKV
      510       520       530       540       550       560        

         280       290       300       310       320       330     
KIAA06 FIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRS
       : ..:.: ::...::  : :.:..::.::  ::.:  :: :::::.:..:.::::.: ..
KIAA16 FAQTSQLARHWRVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHN
      570       580       590       600       610       620        

         340       350       360       370       380       390     
KIAA06 SKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLI
       : :  :.::::::.:: :::::: ::. ::.: :. :::::: :.::.:::.:  .:.: 
KIAA16 SYLATHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLA
      630       640       650       660       670       680        

         400       410       420       430       440       450     
KIAA06 RHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQI
        ::. ::::. :.:.::::::  .. :: :: ::.: .:..:..:::.: :...:  :. 
KIAA16 NHQRTHTGEKPYRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRR
      690       700       710       720       730       740        

         460       470       480       490       500       510     
KIAA06 IHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQE
       :::::::: :. :::.:  ::..  :. ::: :: :.:.. :. : ...:. ...:.:  
KIAA16 IHTGEKPYRCTECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTG
      750       760       770       780       790       800        

         520       530       540
KIAA06 GLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTGNL
                                
KIAA16 EKPYK                    
      810                       

>>KIAA1349  ( 752 res)   fj00940                          (752 aa)
 initn: 9272 init1: 1622 opt: 1657  Z-score: 1504.5  bits: 288.6 E(): 1.1e-78
Smith-Waterman score: 1657;  49.451% identity (74.505% similar) in 455 aa overlap (73-519:299-751)

             50        60        70        80              90      
KIAA06 TVMELPSPESEEVHEPRLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGC------KQVTVTHWKIQTGE
                                     : .: .   :      :.   .: : .: :
KIAA13 QTGEKPYKCSECGKAFSDKSKLARHQETHNGEKPYKCDDCGKAFRNKSYLSVHQKTHTEE
      270       280       290       300       310       320        

        100       110       120         130       140       150    
KIAA06 TAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRELIEGEANP--CDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKP
           :.. :.. . :. .. .....  :: .:  :. :::..  ::.:. :  .:.::::
KIAA13 KPYQCNECGKS-FKNTTIFNVHQRIHTGE-KPFRCNECGKAYRSNSSLIVHIRTHTGEKP
      330        340       350        360       370       380      

          160       170       180       190       200       210    
KIAA06 YTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCA
       : :..:::.:.. ... :::::::::. : :: ::: ::.:: :  :.:.:.::::.::.
KIAA13 YECNECGKAFNRIANFTEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFINYSCLTVHHRMHTGEKPYKCT
        390       400       410       420       430       440      

          220       230       240       250       260       270    
KIAA06 QCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGK
       .::::: .::.:: :::.::.:.:. :.:::..:  .: :  ::::::::.::.:..: .
KIAA13 ECGKAFMRSSSLIIHQRIHTEEKPYLCNECGESFRIKSHLTVHQRIHTGEKPYKCTDCER
        450       460       470       480       490       500      

          280       290       300       310       320       330    
KIAA06 SFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIR
       .: .  .: .: .::: :: :.: .:::.:: .: :: ::: ::::.:..:::: :::  
KIAA13 AFTKMVNLKEHQKIHTGVKPYKCYDCGKSFRTKSYLIVHQRTHTGEKPYKCNECEKAFTN
        510       520       530       540       550       560      

          340       350       360       370       380       390    
KIAA06 SSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYL
       .:.:  ::: ::::.:: :::::: :...:.:. ::: ::::: ..::.:::::    ..
KIAA13 TSQLTVHQRRHTGEKPYKCNECGKVFTSNSGFNTHQRTHTGEKPFKCNDCGKAFSQMVHV
        570       580       590       600       610       620      

          400       410       420       430       440       450    
KIAA06 IRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQ
        .:::::.::. :.:  ::::: . ..:: : . :.:..:. ::.:::. :  :.: :::
KIAA13 TEHQKIHSGEKPYKCDVCGKAFRRGSYLTVHWRTHTGEKPYTCKECGKGCITLSQLTLHQ
        630       640       650       660       670       680      

          460       470       480       490       500       510    
KIAA06 IIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQ
        :::::.:: :  :::.:   :.:  : ..:: :: :.:.. :. : :....  .::.::
KIAA13 RIHTGERPYKCEECGKAFRTNSDFTVHLRMHTGEKPYKCNECGKAFRSSSSLTVHQRIHQ
        690       700       710       720       730       740      

          520       530       540
KIAA06 EGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTGNL
       .  .:                     
KIAA13 RETQLI                    
        750                      

>>KIAA1947  ( 608 res)   fh23660                          (608 aa)
 initn: 1650 init1: 1650 opt: 1651  Z-score: 1500.0  bits: 287.5 E(): 2e-78
Smith-Waterman score: 1659;  51.270% identity (74.596% similar) in 433 aa overlap (82-513:146-578)

              60        70        80         90       100       110
KIAA06 SEEVHEPRLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTV-THWKIQTGETAQVCTKSGRNHIL
                                     :.: :.  : ::.: :    :.. :.    
KIAA19 GWKPHRDTHGVEAFQSGQNNYSCTQCGKDFCHQHTLFEHQKIHTEERPYECSECGKLFRY
         120       130       140       150       160       170     

              120       130       140       150       160       170
KIAA06 NSDLLLLQRELIEGEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHL
       ::::.  ::.    .   :. :::.:... ..:.:.  :.::.:: :..:::.: ..:::
KIAA19 NSDLIKHQRNHTGERPYKCSECGKAFSLKYNVVQHQKIHTGERPYECSECGKAFLRKSHL
         180       190       200       210       220       230     

              180       190       200       210       220       230
KIAA06 MEHQRIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQ
       ..::::::  : :::. ::: :.  . :. ::..:.::.:. : .::: : .:: :::::
KIAA19 LQHQRIHTRPRPYVCSECGKAFLTQAHLVGHQKIHTGERPYGCNECGKYFMYSSALIRHQ
         240       250       260       270       280       290     

              240       250       260       270       280       290
KIAA06 RVHTRERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHT
       .::: :::: : :::: : .:  :: :::.::::.::::::::: :   :.:::: ..::
KIAA19 KVHTGERPFYCCECGKFFMDSCTLIIHQRVHTGEKPYECNECGKFFRYRSTLIRHQKVHT
         300       310       320       330       340       350     

              300       310       320       330       340       350
KIAA06 EVKQYECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERP
         : :::.:::: :   : :: :::.::::.:.:::.::: :     : .:::.:.::::
KIAA19 GEKPYECSECGKFFMDTSTLIIHQRVHTGEKPYECNKCGKFFRYCFTLNRHQRVHSGERP
         360       370       380       390       400       410     

              360       370       380       390       400       410
KIAA06 YVCNECGKRFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECK
       : :.:::: : .. .. .:::.::::. .::. :::.:   : :  ::.:::::: :::.
KIAA19 YECSECGKFFVDSCTLKSHQRVHTGERPFECSICGKSFRCRSTLDTHQRIHTGERPYECS
         420       430       440       450       460       470     

              420       430       440       450       460       470
KIAA06 ECGKAFLQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGK
       :::: : ....  .:.. : :.: ::: .::..: :.:.:. :: .:: :. : :: :::
KIAA19 ECGKFFRHNSNHIRHRRNHFGERSFECTECGRVFSQNSHLIRHQKVHTRERTYKCSKCGK
         480       490       500       510       520       530     

              480       490       500       510       520       530
KIAA06 GFIQRSNFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERS
        :.. :....:...:: :: ::::. :. :  .... ...:.:                 
KIAA19 FFMDSSTLISHERVHTGEKPYECSECGKVFRYNSSLIKHRRIHTGERPYQCSECGRVFNQ
         540       550       560       570       580       590     

              540   
KIAA06 VDKGEHTGNL   
                    
KIAA19 NSHLIQHQKVHTR
         600        

>>KIAA0065  ( 848 res)   ha00946                          (848 aa)
 initn: 6085 init1: 1576 opt: 1608  Z-score: 1459.8  bits: 280.5 E(): 3.4e-76
Smith-Waterman score: 1608;  52.174% identity (76.087% similar) in 414 aa overlap (101-513:340-752)

               80        90       100       110       120          
KIAA06 SLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRELIEGEAN-PC
                                     : .:: :   .  :  ::.   .:: .  :
KIAA00 NHYEFSDCEKFLCVKSTLSKPHGVSMKHYDCGESGNNFRRKLCLSHLQKGD-KGEKHFEC
     310       320       330       340       350       360         

     130       140       150       160       170       180         
KIAA06 DICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLYVCNVCG
       . :::.:  .: :.::.  :.:.::. :..: :.: ..:.: .::: ::::. . :: ::
KIAA00 NECGKAFWEKSHLTRHQRVHTGQKPFQCNECEKAFWDKSNLTKHQRSHTGEKPFECNECG
      370       380       390       400       410       420        

     190       200       210       220       230       240         
KIAA06 KDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKECGKGFS
       : : : :.:  :::.:.::::..:  :::.::..::: .:::.::  .:.:: ::::.: 
KIAA00 KAFSHKSALTLHQRTHTGEKPYQCNACGKTFCQKSDLTKHQRTHTGLKPYECYECGKSFR
      430       440       450       460       470       480        

     250       260       270       280       290       300         
KIAA06 QSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKAFRHRSD
        .: :  ::: ::::.:.:: :::::: ..:.: .: .::   :.:::. :::.: :.: 
KIAA00 VTSHLKVHQRTHTGEKPFECLECGKSFSEKSNLTQHQRIHIGDKSYECNACGKTFYHKSL
      490       500       510       520       530       540        

     310       320       330       340       350       360         
KIAA06 LIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQTSNFTQH
       : .:: :::: .:.:: ::::.:  .: :  ::: :::..:..: :::: ::. :...::
KIAA00 LTRHQIIHTGWKPYECYECGKTFCLKSDLTVHQRTHTGQKPFACPECGKFFSHKSTLSQH
      550       560       570       580       590       600        

     370       380       390       400       410       420         
KIAA06 QRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLTEHQKIH
        : ::::: :::.:::: :. .::: .:.. ::::. :::.:::::: ::..::.::.::
KIAA00 YRTHTGEKPYECHECGKIFYNKSYLTKHNRTHTGEKPYECNECGKAFYQKSQLTQHQRIH
      610       620       630       640       650       660        

     430       440       450       460       470       480         
KIAA06 SGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQHQKIHTEEK
        :..:..:..::::: ..: :..::  :: :::: :. :::.:  .:... :.. :: ::
KIAA00 IGEKPYKCNECGKAFCHKSALIVHQRTHTQEKPYKCNECGKSFCVKSGLIFHERKHTGEK
      670       680       690       700       710       720        

     490       500       510       520       530       540         
KIAA06 LYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTGNL         
        :::.. :. :   ...  ..:.:                                    
KIAA00 PYECNECGKFFRHKSSLTVHHRAHTGEKSCQCNECGKIFYRKSELAQHQRSHTGEKPYEC
      730       740       750       760       770       780        

>>KIAA1508  ( 573 res)   hk06576                          (573 aa)
 initn: 1600 init1: 1600 opt: 1600  Z-score: 1454.2  bits: 278.9 E(): 6.9e-76
Smith-Waterman score: 1600;  53.684% identity (81.579% similar) in 380 aa overlap (134-513:192-571)

           110       120       130       140       150       160   
KIAA06 SGRNHILNSDLLLLQRELIEGEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKG
                                     :.:  .: ...:. . .::.:: :..:::.
KIAA15 VTPTIERPHSRIRHLRVPTGRKPLKYTESRKSFREKSVFIQHQRADSGERPYKCSECGKS
             170       180       190       200       210       220 

           170       180       190       200       210       220   
KIAA06 FGQSSHLMEHQRIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHS
       :.::: ...:.. :   : . :. :::.: . . : .:::::.::.:. :..:::.: . 
KIAA15 FSQSSGFLRHRKAHGRTRTHECSECGKSFSRKTHLTQHQRVHTGERPYDCSECGKSFRQV
             230       240       250       260       270       280 

           230       240       250       260       270       280   
KIAA06 SDLIRHQRVHTRERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLI
       : ::.:::::: :::.::.::::.::.:. : ::.  ::. :::::.:::::: .:..:.
KIAA15 SVLIQHQRVHTGERPYECSECGKSFSHSTNLYRHRSAHTSTRPYECSECGKSFSHSTNLF
             290       300       310       320       330       340 

           290       300       310       320       330       340   
KIAA06 RHYQIHTEVKQYECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQR
       ::...:: :. :::.::::::     ::.:::.::::::. :.::::.: ..: ::::::
KIAA15 RHWRVHTGVRPYECSECGKAFSCNIYLIHHQRFHTGERPYVCSECGKSFGQKSVLIQHQR
             350       360       370       380       390       400 

           350       360       370       380       390       400   
KIAA06 IHTGERPYVCNECGKRFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTG
       .::::::: :.:::: :::.:.. .:.: ::  : :::.:: :.:  .. ::::: .:::
KIAA15 VHTGERPYECSECGKVFSQSSGLFRHRRAHTKTKPYECSECEKSFSCKTDLIRHQTVHTG
             410       420       430       440       450       460 

           410       420       430       440       450       460   
KIAA06 ERVYECKECGKAFLQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPY
       :: :::. :::.:..:.:: .:: .:...::.:: .:::.. ::: :: :. .::::.::
KIAA15 ERPYECSVCGKSFIRKTHLIRHQTVHTNERPYECDECGKSYSQSSALLQHRRVHTGERPY
             470       480       490       500       510       520 

           470       480       490       500       510       520   
KIAA06 VCSYCGKGFIQRSNFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAP
        :  :::.: ......::. .:: :. ::::. :..:......  ..:::          
KIAA15 ECRECGKSFTRKNHLIQHKTVHTGERPYECSECGKSFSQSSGLLRHRRVHVQ        
             530       540       550       560       570           

           530       540
KIAA06 IHLGERSVDKGEHTGNL

>>KIAA0326  ( 927 res)   hg00579                          (927 aa)
 initn: 3093 init1: 1559 opt: 1580  Z-score: 1434.1  bits: 275.9 E(): 9.2e-75
Smith-Waterman score: 1587;  45.010% identity (70.254% similar) in 511 aa overlap (29-516:88-597)

                 10        20        30        40          50      
KIAA06   VRGKMILLSFVSDSNVGTGEKKVTEAWISEDENSHRTTSDRLTVMELP--SPESEEVH
                                     .:.:. .. .: .  .:  :  ::::..  
KIAA03 GMEPETALWGPDLQGPEQSPNDAHRGAESENEEESPRQESSGEEIIMGDPAQSPESKDST
        60        70        80        90       100       110       

                  60        70          80          90       100   
KIAA06 E---------PRLGELLGNPEGQS--LGSSPSQDRGCKQV--TVTHWKIQTGETAQVCTK
       :         : . .   .: :.:  :  .   :    .:  : . :      . :  . 
KIAA03 EMSLERSSQDPSVPQNPPTPLGHSNPLDHQIPLDPPAPEVVPTPSDWTKACEASWQWGAL
       120       130       140       150       160       170       

             110       120             130       140       150     
KIAA06 SGRNH--ILNSDLLLLQRELIEGEA----NP--CDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPY
       .  :   .. ..   : :::..:.     .:  :. :::.:.  : :.::.  :.::.: 
KIAA03 TTWNSPPVVPANEPSL-RELVQGRPAGAEKPYICNECGKSFSQWSKLLRHQRIHTGERPN
       180       190        200       210       220       230      

         160       170       180       190       200       210     
KIAA06 TCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQ
       ::..:::.: :::::..::: ::::. : :  ::: :   :.:..:::.:.::::.::..
KIAA03 TCSECGKSFTQSSHLVQHQRTHTGEKPYKCPDCGKCFSWSSNLVQHQRTHTGEKPYKCTE
        240       250       260       270       280       290      

         220       230       240       250       260       270     
KIAA06 CGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKS
       : ::: .:..::.::: :: :.:..: :: ..: .:: ::.::  ::::.::.: :::: 
KIAA03 CEKAFTQSTNLIKHQRSHTGEKPYKCGECRRAFYRSSDLIQHQATHTGEKPYKCPECGKR
        300       310       320       330       340       350      

         280       290       300       310       320       330     
KIAA06 FIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRS
       : .. .:..: .::.  : :.: ::::.: . :.: .::: ::::.:.:: ::::.: .:
KIAA03 FGQNHNLLKHQKIHAGEKPYRCTECGKSFIQSSELTQHQRTHTGEKPYECLECGKSFGHS
        360       370       380       390       400       410      

         340       350       360       370       380       390     
KIAA06 SKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLI
       : ::.::: :  : :. :  ::: :. .... .::: ::::. :.: ::::.: .:: ::
KIAA03 STLIKHQRTHLREDPFKCPVCGKTFTLSATLLRHQRTHTGERPYKCPECGKSFSVSSNLI
        420       430       440       450       460       470      

         400       410       420       430       440       450     
KIAA06 RHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQI
        ::.:: ::: : : .:::.:.... : .::.::.:..:..:.::::.::.::.:. :. 
KIAA03 NHQRIHRGERPYICADCGKSFIMSSTLIRHQRIHTGEKPYKCSDCGKSFIRSSHLIQHRR
        480       490       500       510       520       530      

         460       470       480       490       500       510     
KIAA06 IHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQE
        ::::::: :  :::.: : ::.. : . : .:.:. ::. :. :  . ...... .:..
KIAA03 THTGEKPYKCPECGKSFSQSSNLITHVRTHMDENLFVCSDCGKAFLEAHELEQHRVIHER
        540       550       560       570       580       590      

         520       530       540                                   
KIAA06 GLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTGNL                                   
       :                                                           
KIAA03 GKTPARRAQGDSLLGLGDPSLLTPPPGAKPHKCLVCGKGFNDEGIFMQHQRIHIGENPYK
        600       610       620       630       640       650      

>>KIAA0798  ( 682 res)   hk06584                          (682 aa)
 initn: 1559 init1: 1559 opt: 1575  Z-score: 1430.9  bits: 274.8 E(): 1.4e-74
Smith-Waterman score: 1575;  50.116% identity (73.782% similar) in 431 aa overlap (83-513:247-677)

             60        70        80        90       100       110  
KIAA06 EEVHEPRLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNS
                                     :.  . : ...:::    ::  ..    .:
KIAA07 STKSQVSKHQRTHEIEKNHVCSECGKAFVKKSQLTDHERVHTGEKPYGCTLCAKVFSRKS
        220       230       240       250       260       270      

            120       130       140       150       160       170  
KIAA06 DLLLLQRELIEGEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLME
        :   ::   . ..  :. :::.::..: :..:. .:.::::: :..:::::  . .:. 
KIAA07 RLNEHQRIHKREKSFICSECGKVFTMKSRLIEHQRTHTGEKPYICNECGKGFPGKRNLIV
        280       290       300       310       320       330      

            180       190       200       210       220       230  
KIAA06 HQRIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRV
       ::: ::::. :.:. ::: :   : :: :::.:.::::. :..:::.:  .  .: ::: 
KIAA07 HQRNHTGEKSYICSECGKGFTGKSMLIIHQRTHTGEKPYICSECGKGFTTKHYVIIHQRN
        340       350       360       370       380       390      

            240       250       260       270       280       290  
KIAA06 HTRERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEV
       :: :.:. :.::::::...: .:.::: ::::.:: :.::::.: :.:.:: : . ::  
KIAA07 HTGEKPYICNECGKGFTMKSRMIEHQRTHTGEKPYICSECGKGFPRKSNLIVHQRNHTVE
        400       410       420       430       440       450      

            300       310       320       330       340       350  
KIAA06 KQYECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYV
       :.: :.::::.:  .: :: ::: ::::.:. :.::::.:  .:.:: ::: ::::.:: 
KIAA07 KSYLCSECGKGFTVKSMLIIHQRTHTGEKPYTCSECGKGFPLKSRLIVHQRTHTGEKPYR
        460       470       480       490       500       510      

            360       370       380       390       400       410  
KIAA06 CNECGKRFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKEC
       :.:::: :  .:..  ::: ::::: : ::::::.: ..: :. ::. ::::. . :.::
KIAA07 CSECGKGFIVNSGLMLHQRTHTGEKPYICNECGKGFAFKSNLVVHQRTHTGEKPFMCSEC
        520       530       540       550       560       570      

            420       430       440       450       460       470  
KIAA06 GKAFLQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGF
       ::.: .: .:  ::.::. ..   :..::..: . ..: ::. .::::::: :. :::::
KIAA07 GKGFTMKRYLIVHQQIHTEEKSCICSECGRGFAKETELALHKQVHTGEKPYGCNECGKGF
        580       590       600       610       620       630      

            480       490       500       510       520       530  
KIAA06 IQRSNFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVD
        ..: .. ::. :: :: . ::.  . :.:  :.  .::.:                   
KIAA07 TMKSRLIVHQRTHTGEKPFVCSECRKAFSSKRNLIVHQRTHNGNKP              
        640       650       660       670       680                

            540
KIAA06 KGEHTGNL

>>KIAA1956  ( 680 res)   fk08713                          (680 aa)
 initn: 2951 init1: 1533 opt: 1569  Z-score: 1425.5  bits: 273.8 E(): 2.8e-74
Smith-Waterman score: 1684;  51.288% identity (77.049% similar) in 427 aa overlap (89-515:252-675)

       60        70        80        90       100       110        
KIAA06 RLGELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQ
                                     : ...::.    : . :..   ...:.  :
KIAA19 FVQQQRLPSREECYCWECGKSFSKYDSVSNHQRVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQ
             230       240       250       260       270       280 

      120       130       140       150       160       170        
KIAA06 RELIEGEANPCDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHT
       :     .   :  :::.:. ...::.:.  :.::.:: : .:::.:.:.. :..:::.::
KIAA19 RVHTGKRPYECGECGKSFSHKGSLVQHQRVHTGERPYECGECGKSFSQNGTLIKHQRVHT
             290       300       310       320       330       340 

      180       190       200       210       220       230        
KIAA06 GERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERP
       ::: : :. ::: : . ..::.::: :..:.:..: .::: : ... : .:.::::::::
KIAA19 GERPYECEECGKCFTQKGNLIQHQRGHTSERPYECEECGKCFSQKGTLTEHHRVHTRERP
             350       360       370       380       390       400 

      240       250       260       270       280       290        
KIAA06 FECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECK
       .:: ::::.::... :  ::: :::::::::.:::::: :...::.: . ::  . :::.
KIAA19 YECGECGKSFSRKGHLRNHQRGHTGERPYECGECGKSFSRKGNLIQHQRSHTGERPYECR
             410       420       430       440       450       460 

      300       310       320       330       340       350        
KIAA06 ECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGK
       :: : :: .: ::::::.::::::.:::::::.:  :: .  :::.::::.:. :.::::
KIAA19 ECRKLFRGKSHLIEHQRVHTGERPYECNECGKSFQDSSGFRVHQRVHTGEKPFECSECGK
             470       480       490       500       510       520 

      360       370       380       390       400       410        
KIAA06 RFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQ
        : :. .. .:.:.::::. :::.::::.:  :: :.:::: ::.:: :::.:::: :  
KIAA19 SFPQSCSLLRHRRVHTGERPYECGECGKSFHQSSSLLRHQKTHTAERPYECRECGKFF--
             530       540       550       560       570           

      420       430       440       450       460       470        
KIAA06 KAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNF
        . : ::...:.:.::.::..:::.: . :  . :: .::  ::: :: :::.: .  ..
KIAA19 -SSLLEHRRVHTGERPYECRECGKTFTRRSAHFKHQRLHTRGKPYECSECGKSFAETFSL
      580       590       600       610       620       630        

      480       490       500       510       520       530        
KIAA06 LQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTG
        .:...:: :. ::::. :..:. ....  .:::: :                       
KIAA19 TEHRRVHTGERPYECSECGKSFHRSSSLLRHQRVHTERSPYK                  
      640       650       660       670       680                  

      540
KIAA06 NL

>>KIAA1827  ( 469 res)   fk01409                          (469 aa)
 initn: 1524 init1: 1524 opt: 1550  Z-score: 1410.0  bits: 270.4 E(): 2e-73
Smith-Waterman score: 1550;  49.647% identity (74.353% similar) in 425 aa overlap (91-513:19-440)

               70        80        90       100       110       120
KIAA06 GELLGNPEGQSLGSSPSQDRGCKQVTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRE
                                     : .  : :  :.. :.    ...   :  .
KIAA18             STHASDNFDHAPLLPQEQKAHIREKAYKCNEHGQVFRASAS---LTNQ
                           10        20        30        40        

                130       140       150       160       170        
KIAA06 LIEGEANP--CDICGKTFTFNSDLVRHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHT
       .:..  ::  :. :::.:. .: :: ::  :.::::: : .::: :...:.: .::::::
KIAA18 VIHNADNPYKCSECGKVFSCSSKLVIHRRMHTGEKPYKCHECGKLFSSNSNLSQHQRIHT
          50        60        70        80        90       100     

      180       190       200       210       220       230        
KIAA06 GERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQRVHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERP
       ::. : :. : : :   : : .:::.:.::::.:: .: :.: . . :.:::..:: :.:
KIAA18 GEKPYKCHECDKVFRSSSKLAQHQRIHTGEKPYKCHECDKVFNQIAHLVRHQKIHTGEKP
         110       120       130       140       150       160     

      240       250       260       270       280       290        
KIAA06 FECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTGERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECK
       . :..::: ::. : : .:: .::::.::.:.::::.:   :::: :  :::  : :.::
KIAA18 YSCNKCGKVFSRHSYLAEHQTVHTGEKPYKCEECGKAFSVRSSLITHQLIHTGRKPYKCK
         170       180       190       200       210       220     

      300       310       320       330       340       350        
KIAA06 ECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPFECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGK
       :: :.: ..  :  :::::: :::. :..::: : ..: ::.:.. :: :.:: ::.:: 
KIAA18 ECDKVFGRKCFLTSHQRIHTRERPYGCSQCGKIFSQKSDLIRHRKTHTDEKPYKCNKCGT
         230       240       250       260       270       280     

      360       370       380       390       400       410        
KIAA06 RFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNECGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQ
        : . :..: :  ::.::: :::.::::.:  .: :  :..:::::. :.:..:::.: .
KIAA18 AFREFSDLTAHFLIHSGEKPYECKECGKVFRYKSSLTSHHRIHTGEKPYKCNRCGKVFSR
         290       300       310       320       330       340     

      420       430       440       450       460       470        
KIAA06 KAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKAFIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNF
       ...:. :::::.:..:..:..:::.: :.: :  ::::::::.:: :: :::.:   :..
KIAA18 SSNLVCHQKIHTGEKPYKCNQCGKVFNQASYLTRHQIIHTGERPYRCSKCGKAFRGCSGL
         350       360       370       380       390       400     

      480       490       500       510       520       530        
KIAA06 LQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNSTTNVKNNQRVHQEGLSLSKAPIHLGERSVDKGEHTG
         :  ::::.: .::.. :. :.. ... :..:.:                         
KIAA18 TAHLAIHTEKKSHECKECGKIFTQKSSLTNHHRIHIGEKPYKCTLCSKVFSHNSDLAQHQ
         410       420       430       440       450       460     

      540  
KIAA06 NL  
           
KIAA18 RVHS
           

>>KIAA1710  ( 515 res)   fj18457                          (515 aa)
 initn: 3040 init1: 1529 opt: 1536  Z-score: 1396.9  bits: 268.1 E(): 1.1e-72
Smith-Waterman score: 1536;  56.812% identity (81.159% similar) in 345 aa overlap (115-458:170-514)

           90       100       110       120        130       140   
KIAA06 VTVTHWKIQTGETAQVCTKSGRNHILNSDLLLLQRELIEG-EANPCDICGKTFTFNSDLV
                                     ::...:.  : . . :. :::.:.  ::: 
KIAA17 GFESGDRSERQWGDLTAEEWVSYPLQPVTDLLVHKEVHTGIRYHICSHCGKAFSQISDLN
     140       150       160       170       180       190         

           150       160       170       180       190       200   
KIAA06 RHRISHAGEKPYTCDQCGKGFGQSSHLMEHQRIHTGERLYVCNVCGKDFIHYSGLIEHQR
       ::. .:.:..:: : .:::::..::::..::: ::::: : :: :::.: . : ::.:: 
KIAA17 RHQKTHTGDRPYKCYECGKGFSRSSHLIQHQRTHTGERPYDCNECGKSFGRSSHLIQHQT
     200       210       220       230       240       250         

           210       220       230       240       250       260   
KIAA06 VHSGEKPFKCAQCGKAFCHSSDLIRHQRVHTRERPFECKECGKGFSQSSLLIRHQRIHTG
       .:.:::: :: .:::.::. : ::.:::.:. :.:.::.::::.::.:: : .::: :::
KIAA17 IHTGEKPHKCNECGKSFCRLSHLIQHQRTHSGEKPYECEECGKSFSRSSHLAQHQRTHTG
     260       270       280       290       300       310         

           270       280       290       300       310       320   
KIAA06 ERPYECNECGKSFIRSSSLIRHYQIHTEVKQYECKECGKAFRHRSDLIEHQRIHTGERPF
       :.::::::::..: . :.::.::..::  . :.: :::: : . :::..:.: ::::.:.
KIAA17 EKPYECNECGRGFSERSDLIKHYRVHTGERPYKCDECGKNFSQNSDLVRHRRAHTGEKPY
     320       330       340       350       360       370         

           330       340       350       360       370       380   
KIAA06 ECNECGKAFIRSSKLIQHQRIHTGERPYVCNECGKRFSQTSNFTQHQRIHTGEKLYECNE
       .:::::. : : :.:.:::: ::::.:: :: ::: ::..:..  ::.:::::: :::::
KIAA17 HCNECGENFSRISHLVQHQRTHTGEKPYECNACGKSFSRSSHLITHQKIHTGEKPYECNE
     380       390       400       410       420       430         

           390       400       410       420       430       440   
KIAA06 CGKAFFLSSYLIRHQKIHTGERVYECKECGKAFLQKAHLTEHQKIHSGDRPFECKDCGKA
       : ..:   : ::.::. ::::. ::: .:::.: :...:  ::..:.:..:.:: .: :.
KIAA17 CWRSFGERSDLIKHQRTHTGEKPYECVQCGKGFTQSSNLITHQRVHTGEKPYECTECEKS
     440       450       460       470       480       490         

           450       460       470       480       490       500   
KIAA06 FIQSSKLLLHQIIHTGEKPYVCSYCGKGFIQRSNFLQHQKIHTEEKLYECSQYGRDFNST
       : .:: :. :. .::                                             
KIAA17 FSRSSALIKHKRVHTD                                            
     500       510                                                 




540 residues in 1 query   sequences
1986965 residues in 2037 library sequences
 Scomplib [34.26]
 start: Thu Dec 18 15:09:51 2008 done: Thu Dec 18 15:09:52 2008
 Total Scan time:  0.460 Total Display time:  0.150

Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]