# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh01026s2.fasta.huge -Q ../query/KIAA0627.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0627, 1324 aa vs ./tmplib.23663 library 1986181 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.0120+/-0.00667; mu= -4.1249+/- 0.450 mean_var=188.9964+/-45.799, 0's: 0 Z-trim: 4 B-trim: 13 in 1/39 Lambda= 0.093293 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0622 ( 1289 res) hg04583 (1289) 1955 276.5 2e-74 >>KIAA0622 ( 1289 res) hg04583 (1289 aa) initn: 4889 init1: 1866 opt: 1955 Z-score: 1428.1 bits: 276.5 E(): 2e-74 Smith-Waterman score: 5544; 67.865% identity (84.494% similar) in 1335 aa overlap (48-1324:1-1289) 20 30 40 50 60 70 KIAA06 FDLLVSESSLDHLMAMGDDKSFDDEESVDGNRPSSAASAFKVPAPKTSGNPA-NSARKPG ::::::.:. . :.. : . ...:. : KIAA06 NRPSSASSTSSKAPPSSRRNVGMGTTRRLG 10 20 30 80 90 100 110 120 130 KIAA06 SAGGPKVGGASKEGGAGAVDEDDFIKAFTDVPSIQIYSSRELEETLNKIREILSDDKHDW :. . ..:.::: ::::::.:::::: ::: .::::::.:::..:::::::::::::: KIAA06 SSTLGSKSSAAKEG-AGAVDEEDFIKAFDDVPVVQIYSSRDLEESINKIREILSDDKHDW 40 50 60 70 80 140 150 160 170 180 190 KIAA06 DQRANALKKIRSLLVAGAAQYDCFFQHLRLLDGALKLSAKDLRSQVVREACITVAHLSTV .::.::::::::::.::::.:: :::::::::::.::::::::::::::::::..:::.: KIAA06 EQRVNALKKIRSLLLAGAAEYDNFFQHLRLLDGAFKLSAKDLRSQVVREACITLGHLSSV 90 100 110 120 130 140 200 210 220 230 240 250 KIAA06 LGNKFDHGAEAIVPTLFNLVPNSAKVMATSGCAAIRFIIRHTHVPRLIPLITSNCTSKSV ::::::::::::.::.:::.:::::.::::: .:.:.::::::.:::::.:::::::::: KIAA06 LGNKFDHGAEAIMPTIFNLIPNSAKIMATSGVVAVRLIIRHTHIPRLIPVITSNCTSKSV 150 160 170 180 190 200 260 270 280 290 300 310 KIAA06 PVRRRSFEFLDLLLQEWQTHSLERHAAVLVETIKKGIHDADAEARVEARKTYMGLRNHFP :::: ::::::::::::::::::: .::.:::::::::::.:::.:::: : :...:: KIAA06 AVRRRCFEFLDLLLQEWQTHSLERHISVLAETIKKGIHDADSEARIEARKCYWGFHSHFS 210 220 230 240 250 260 320 330 340 350 360 370 KIAA06 GEAETLYNSLEPSYQKSLQTYLKSSGSVASLPQSDRSSSSSQESLNRPFSSKWSTANPST ::: ::..:: ::::.::..::.: :..:::::::::::::::::::.:.: : .. .: KIAA06 REAEHLYHTLESSYQKALQSHLKNSDSIVSLPQSDRSSSSSQESLNRPLSAKRSPTGSTT 270 280 290 300 310 320 380 390 400 410 420 430 KIAA06 VAGRVSAGSSKASSLPGSLQRSRSDIDVNAAAGAKAHHAAGQSVRSGRLGAGALNAGSYA .:.:. :.:. : ::::::::::::::::.::.. ....: . .:.:: :::: KIAA06 --SRASTVSTKSVSTTGSLQRSRSDIDVNAAASAKSK-VSSSSGTTPFSSAAALPPGSYA 330 340 350 360 370 380 440 450 460 470 480 KIAA06 SLEDTSDKLDGTASEDGRVRAKLSAPLAGMGNAKA-DSRGRSRTKMVSQSQ------P-- :: ::.:.. .. .. . :.. :.:::::.:.::::: : KIAA06 SL--------------GRIRTRRQSSGSATNVASTPDNRGRSRAKVVSQSQRSRSANPAG 390 400 410 420 430 490 500 510 520 530 540 KIAA06 -GSRSGSPGRVLTTTALSTVSSGVQRVLVNSASAQKRSKIPRSQGCSREASPSRLSVARS ::::.:::..: . . . ...: .: . :..::::::::::::::.::.:...::: KIAA06 AGSRSSSPGKLLGS-GYGGLTGGSSRGPPVTPSSEKRSKIPRSQGCSRETSPNRIGLARS 440 450 460 470 480 490 550 560 570 580 590 600 KIAA06 SRIPRPSVSQGCSREASRESSRDTSPVRSFQPLASRHHSRSTGALYAPEVYGASGPGYGI :::::::.::::::..::::::::::.:.: :: .: .:. KIAA06 SRIPRPSMSQGCSRDTSRESSRDTSPARGFPPL-----DR-----------------FGL 500 510 520 610 620 630 640 650 660 KIAA06 SQSSRLSSSVSAMRVLNTGSDVEEAVADALKKPARRRYESYGMHSDDDANSDASSACSER .: .:. .::.:::::.:..:.: :::::::::.::::: :::.:::::::::::.:::: KIAA06 GQPGRIPGSVNAMRVLSTSTDLEAAVADALKKPVRRRYEPYGMYSDDDANSDASSVCSER 530 540 550 560 570 580 670 680 690 700 710 720 KIAA06 SYSSRNGSIPTYMRQTEDVAEVLNRCASSNWSERKEGLLGLQNLLKNQRTLSRVELKRLC ::.::::.:: :.:::::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::: KIAA06 SYGSRNGGIPHYLRQTEDVAEVLNHCASSNWSERKEGLLGLQNLLKSQRTLSRVELKRLC 590 600 610 620 630 640 730 740 750 760 770 780 KIAA06 EIFTRMFADPHGKRVFSMFLETLVDFIQVHKDDLQDWLFVLLTQLLKKMGADLLGSVQAK :::::::::::.::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA06 EIFTRMFADPHSKRVFSMFLETLVDFIIIHKDDLQDWLFVLLTQLLKKMGADLLGSVQAK 650 660 670 680 690 700 790 800 810 820 830 840 KIAA06 VQKALDVTRESFPNDLQFNILMRFTVDQTQTPSLKVKVAILKYIETLAKQMDPGDFINSS :::::::::.::: : :::::::: :::::::.::::::::::::.::.:::: ::.::: KIAA06 VQKALDVTRDSFPFDQQFNILMRFIVDQTQTPNLKVKVAILKYIESLARQMDPTDFVNSS 710 720 730 740 750 760 850 860 870 880 890 900 KIAA06 ETRLAVSRVITWTTEPKSSDVRKAAQSVLISLFELNTPEFTMLLGALPKTFQDGATKLLH ::::::::.::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA06 ETRLAVSRIITWTTEPKSSDVRKAAQIVLISLFELNTPEFTMLLGALPKTFQDGATKLLH 770 780 790 800 810 820 910 920 930 940 950 KIAA06 NHLRNTGNGTQSSMGSP---LTRPTPRSPANWSSPLTSPTNTSQNTLSPS---------- :::.:..: .:.::: . : : .. .:::::::: :.. :::: KIAA06 NHLKNSSN---TSVGSPSNTIGRTPSRHTSSRTSPLTSPTNCSHGGLSPSRLWGWSADGL 830 840 850 860 870 880 960 970 980 KIAA06 -----------------------------AFDYDTENMNSEDIYSSLRGVTEAIQNFSFR .::::::.:::.::::::::::::..:::: KIAA06 AKHPPPFSQPNSIPTAPSHKALRRSYSPSMLDYDTENLNSEEIYSSLRGVTEAIEKFSFR 890 900 910 920 930 940 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA06 SQEDMNEPLKRDSKKDDGDSMCGGPGMSDPRA---GGDATDSSQTALDNKASLLHSMPTH ::::.:::.:::.::. : . : ..: . ::. .....::::::.:::...: . KIAA06 SQEDLNEPIKRDGKKE-CDIVSRDGGAASPATEGRGGSEVEGGRTALDNKTSLLNTQPPR 950 960 970 980 990 1000 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA06 S--SPRSRDYNPYNYSDSISPFNKSALKEAMFDDDADQFPDDLSLDHSDLVAELLKELSN . .::.:::::: :::.:. ..:.:::::.:::: .:. :. .:::::::.::::::: KIAA06 AFPGPRARDYNPYPYSDAINTYDKTALKEAVFDDDMEQL-RDVPIDHSDLVADLLKELSN 1010 1020 1030 1040 1050 1060 1100 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA06 HNERVEERKIALYELMKLTQEESFSVWDEHFKTILLLLLETLGDKEPTIRALALKVLREI ::::::::: :: ::.:.:.:.:..::.:::::::::::::::::. .::::::.::::: KIAA06 HNERVEERKGALLELLKITREDSLGVWEEHFKTILLLLLETLGDKDHSIRALALRVLREI 1070 1080 1090 1100 1110 1120 1160 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA06 LRHQPARFKNYAELTVMKTLEAHKDPHKEVVRSAEEAASVLATSISPEQCIKVLCPIIQT ::.::::::::::::.::::::::: ::::::.::::::.::.:: :::::::::::::: KIAA06 LRNQPARFKNYAELTIMKTLEAHKDSHKEVVRAAEEAASTLASSIHPEQCIKVLCPIIQT 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1220 1230 1240 1250 1260 1270 KIAA06 ADYPINLAAIKMQTKVIERVSKETLNLLLPEIMPGLIQGYDNSESSVRKACVFCLVAVHA ::::::::::::::::.::..::.: :: .:.:::.:::::.::::::: ::::::... 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