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FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007
Please cite:
 W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448

 KIAA0625, 2663 aa
 vs ./tmplib.23663 library

1984842 residues in  2037 sequences
  Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.9040+/-0.00688; mu= 5.4082+/- 0.466
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 Lambda= 0.093498

FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2
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The best scores are:                                      opt bits E(2037)
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>>KIAA0221  ( 1151 res)   ha02799                         (1151 aa)
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                                     : :.:..:  :..:    : . :    . :
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KIAA06 IHGPPGTGKSKTIVGLLYRLLTENQRKGHSDENSNAKIKQNRVLVCAPSNAAVDELMKKI
       :.:::::::. : . ..:.:     :.:..            :::::::: :::.: .::
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                   .  :    ...:::   ::      . ..::          :    :.
KIAA02 ------------HQTG----LKVVRLCA-KS------REAIDS----------PVSFLAL
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KIAA06 HKRKEFLDYQLDELSRQRALCRGGREIQRQELDENISKVSKERQELASKIKEVQGRPQKT
       :.. . .: .. ::.. . :        ..:  : .:.....: .  ..  : .      
KIAA02 HNQIRNMD-SMPELQKLQQL--------KDETGE-LSSADEKRYRALKRTAERE------
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KIAA06 QSIIILESHIICCTLSTSGGLLLESAFRGQGGVPFSCVIVDEAGQSCEIETLTPLIHRCN
          ..... .::::   .:   : .       . :  ...::. :. : : ..:..   .
KIAA02 ---LLMNADVICCTCVGAGDPRLAK-------MQFRSILIDESTQATEPECMVPVVLGAK
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KIAA06 KLILVGDPKQLPPTVISMKAQEYGYDQSMMARFCRLLEENVEHNMISRLPILQLTVQYRM
       .::::::  :: :.:.  :: . : .::.   : ::.  ...       :: .: :::::
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KIAA06 HPDICLFPSNYVYNRNLKTNRQTEAIRCSS----DWPFQPY--LVFDVGDGSER--RDND
       :: .  ::::  :. .:. :  : : : ..    .:: ::   . : : .:.:.   .. 
KIAA02 HPALSAFPSNIFYEGSLQ-NGVTAADRVKKGFDFQWP-QPDKPMFFYVTQGQEEIASSGT
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KIAA06 SYINVQEIKLVMEII-KLIKDKRKDVSFRNIGIITHYKAQKT-MIQK-DLDKEFDRKGPA
       ::.:  :   : .:  ::.:   :     .::::: :..:.. ..:  ...  .  :   
KIAA02 SYLNRTEAANVEKITTKLLKAGAKP---DQIGIITPYEGQRSYLVQYMQFSGSLHTKLYQ
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KIAA06 EVD--TVDAFQGRQKDCVIVTCVRANSIQGSIGFLASLQRLNVTITRAKYSLFILGHLRT
       ::.  .:::::::.:: .:..:::::  :: :::: . .::::..:::.:...:.:. ..
KIAA02 EVEIASVDAFQGREKDFIILSCVRANEHQG-IGFLNDPRRLNVALTRARYGVIIVGNPKA
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KIAA06 LMENQHWNQLIQDAQKRGAIIKTCDKNYRHDAVKILKLKPVLQRSLTHPPTIAPEGSRPQ
       : ..  ::.:..  ... ....   .: :.. ...   ::   :.:..  :: : :.:  
KIAA02 LSKQPLWNHLLNYYKEQKVLVEGPLNNLRESLMQFS--KP---RKLVN--TINP-GARF-
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KIAA06 GGLPSSKLDSGFAKTSVAASLYHTPSDSKEITLTVTSKDPERPPVHDQL----QDPRLLK
         . ..  :.   .. . .:.:   :...  ..   .        :::.      :  . 
KIAA02 --MTTAMYDA--REAIIPGSVYDRSSQGRPSSMYFQT--------HDQIGMISAGPSHVA
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KIAA06 RMGIEVKGGIFLWDPQPSSPQHPGATPPTGEPGFPVVHQDLSHIQQPAAVVAALSSHKPP
        :.: .  .. .  :.:       :. :..  : :                         
KIAA02 AMNIPIPFNLVM-PPMPPPGYFGQANGPAAGRGTPKGKTGRGGRQKNRFGLPGPSQTNLP
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KIAA06 VRGEPPAASPEASTCQSKCDDPEEELCHRREARAFSEGEQEKCGSETHHTRRNSRWDKRT
                                                                   
KIAA02 NSQASQDVASQPFSQGALTQGYISMSQPSQMSQPGLSQPELSQDSYLGDEFKSQIDVALS
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>>KIAA0560  ( 1521 res)   hj07625                         (1521 aa)
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Smith-Waterman score: 316;  21.739% identity (50.461% similar) in 759 aa overlap (1920-2613:828-1519)

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KIAA06 RAVLNPNPMDFCTKDLLTTTSERIIAYLRDFNEDQKKAIETAYAMVK--HSPSVAKICLI
                                     .:. ....:. ......  ..     . ..
KIAA05 KDADVEDEDTEEAKTLIVEPHVIPNRGPYPYNQPKRNTIQFTHTQIEAIRAGMQPGLTMV
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KIAA06 HGPPGTGKSKTIVGLLYRLLTENQRKGHSDENSNAKIKQNRVLVCAPSNAAVDELMKKII
        :::::::. . : ..  .        :.       . ..:.:. . :: :...:..::.
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KIAA06 -----------LEFKEKCKDKKNPLGNCGDINLV----------------RLG-P-EKSI
                  :   :.  . .. ..  : .: :                 :: : . : 
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KIAA06 NSEVLKFSLDSQVNHRMK------KELPSHVQAMHKRKEFLDYQLDELSRQRALCRGGRE
       . :.  . .  ::  : .      :.  : .  . . . :. ..    .  . . .:   
KIAA05 TCETAGYFFLYQVMSRWEEYISKVKNKGSTLPDVTEVSTFFPFHEYFANAPQPIFKGRSY
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        . .:. :    .:.:.  . .:. ::..  ...  .... ... :..::  :  : ..:
KIAA05 EEDMEIAEGCFRHIKKIFTQLEEFRASEL--LRSGLDRSKYLLVKEAKIIAMT-CTHAAL
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         ..  .   :  .. ....::.:  ::::. ::.         : .. :..:: .::::
KIAA05 KRHDLVKL--GFKYDNILMEEAAQILEIETFIPLLLQNPQDGFSRLKRWIMIGDHHQLPP
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       .. .:  :.:. ..::...:: :.            .: ..: .: : . ..: :.   :
KIAA05 VIKNMAFQKYSNMEQSLFTRFVRV-----------GVPTVDLDAQGRARASLCNLYNWRY
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           ::   .    .  ..    . ::   : :    .: . :   : :. : . :. ..
KIAA05 KNLGNLPHVQLLPEFSTANAGLLYDFQLINVEDFQGVGESEPNPYFYQNLGEAEYVVALF
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         .      ..  .:.:.: :..:: .:.  ....   .     : .: ::: :::.:.:
KIAA05 MYMCLLGYPAD--KISILTTYNGQKHLIRDIINRRCGNNPLIGRPNKVTTVDRFQGQQND
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KIAA06 CVIVTCVRANSIQGSIGFLASLQRLNVTITRAKYSLFILGHLRTLMENQHWNQLIQDAQK
        .... ::. .    .: : ...:: :...::. .:.:..                    
KIAA05 YILLSLVRTRA----VGHLRDVRRLVVAMSRARLGLYIFA--------------------
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KIAA06 RGAIIKTCDKNYRHDAVKILKLKPV-LQRSLTHP-PTIAPEGSRPQGGLPSSKLDSGFAK
       : .....: .     : . :  .:. :.   :.: ::   .: ::.  .   :    .:.
KIAA05 RVSLFQNCFE--LTPAFSQLTARPLHLHIIPTEPFPTTRKNGERPSHEVQIIKNMPQMAN
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KIAA06 TSVAASLYHTPSDSKEITLTVTSKDPERPPVHDQLQDPRL---LKRMGIEVKGGIFLWDP
         :    .:  . ...   :. .  :      ...:. .     .. .. :.. :.   :
KIAA05 F-VYNMYMHLIQTTHHYHQTLLQLPPAMVEEGEEVQNQETELETEEEAMTVQADII---P
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       .:.. .    ::       :   .. .  . : :.  :::   : : :   .:  ::.: 
KIAA05 SPTDTSCRQETPAFQTDTTP---SETGATSTPEAI-PALSETTPTVVGAV-SAPAEANTP
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KIAA06 QSKCDDPEEELCHRREARAFSEGEQEKCGSETHHTRRNSRWDKRTLEQEDSSSKKRKLL
       :.  . :::                                                  
KIAA05 QDATSAPEETK                                                
             1520                                                 

>>KIAA0083  ( 1077 res)   ha03631                         (1077 aa)
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       :  . .:  :  .:.               :::::.:  .   : ::.    ...:::: 
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       .:::: :.. .:.  :...:.. :    ::.:       .  ..::::::::.  :  . 
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