# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg04767.fasta.huge -Q ../query/KIAA0624.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0624, 1983 aa vs ./tmplib.23663 library 1985522 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2652+/-0.00701; mu= 2.9603+/- 0.476 mean_var=195.4341+/-47.566, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 16 in 1/39 Lambda= 0.091743 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0324 ( 2800 res) ee08846s1 (2800) 258 48.3 3.2e-05 >>KIAA0324 ( 2800 res) ee08846s1 (2800 aa) initn: 127 init1: 87 opt: 258 Z-score: 185.5 bits: 48.3 E(): 3.2e-05 Smith-Waterman score: 365; 20.087% identity (47.537% similar) in 1847 aa overlap (93-1878:357-2001) 70 80 90 100 110 120 KIAA06 CNETDVSQMLKQPLTYRLSKEMAKNDPIELPTSRSKNVTNQKKPTPFSSRMSFRSSFASL : :. ....:. .: .. . : . . 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