# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg04583.fasta.huge -Q ../query/KIAA0622.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0622, 1289 aa vs ./tmplib.23663 library 1986216 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.6441+/-0.00804; mu= -6.8381+/- 0.542 mean_var=274.2714+/-66.172, 0's: 0 Z-trim: 3 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.077443 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0627 ( 1324 res) hh01026s2 (1324) 1955 233.0 2.6e-61 >>KIAA0627 ( 1324 res) hh01026s2 (1324 aa) initn: 4889 init1: 1866 opt: 1955 Z-score: 1192.7 bits: 233.0 E(): 2.6e-61 Smith-Waterman score: 5544; 67.868% identity (84.535% similar) in 1332 aa overlap (1-1289:48-1324) 10 20 30 KIAA06 NRPSSASSTSSKAPPSSRRNVGMGTTRRLG ::::::.:. . :.. : . ...:. : KIAA06 FDLLVSESSLDHLMAMGDDKSFDDEESVDGNRPSSAASAFKVPAPKTSGNPA-NSARKPG 20 30 40 50 60 70 40 50 60 70 80 KIAA06 SSTLGSKSSAAKEG-AGAVDEEDFIKAFDDVPVVQIYSSRDLEESINKIREILSDDKHDW :. . ..:.::: ::::::.:::::: ::: .::::::.:::..:::::::::::::: KIAA06 SAGGPKVGGASKEGGAGAVDEDDFIKAFTDVPSIQIYSSRELEETLNKIREILSDDKHDW 80 90 100 110 120 130 90 100 110 120 130 140 KIAA06 EQRVNALKKIRSLLLAGAAEYDNFFQHLRLLDGAFKLSAKDLRSQVVREACITLGHLSSV .::.::::::::::.::::.:: :::::::::::.::::::::::::::::::..:::.: KIAA06 DQRANALKKIRSLLVAGAAQYDCFFQHLRLLDGALKLSAKDLRSQVVREACITVAHLSTV 140 150 160 170 180 190 150 160 170 180 190 200 KIAA06 LGNKFDHGAEAIMPTIFNLIPNSAKIMATSGVVAVRLIIRHTHIPRLIPVITSNCTSKSV ::::::::::::.::.:::.:::::.::::: .:.:.::::::.:::::.:::::::::: KIAA06 LGNKFDHGAEAIVPTLFNLVPNSAKVMATSGCAAIRFIIRHTHVPRLIPLITSNCTSKSV 200 210 220 230 240 250 210 220 230 240 250 260 KIAA06 AVRRRCFEFLDLLLQEWQTHSLERHISVLAETIKKGIHDADSEARIEARKCYWGFHSHFS :::: ::::::::::::::::::: .::.:::::::::::.:::.:::: : :...:: KIAA06 PVRRRSFEFLDLLLQEWQTHSLERHAAVLVETIKKGIHDADAEARVEARKTYMGLRNHFP 260 270 280 290 300 310 270 280 290 300 310 320 KIAA06 REAEHLYHTLESSYQKALQSHLKNSDSIVSLPQSDRSSSSSQESLNRPLSAKRSPTGSTT ::: ::..:: ::::.::..::.: :..:::::::::::::::::::.:.: : .. .: KIAA06 GEAETLYNSLEPSYQKSLQTYLKSSGSVASLPQSDRSSSSSQESLNRPFSSKWSTANPST 320 330 340 350 360 370 330 340 350 360 370 380 KIAA06 --SRASTVSTKSVSTTGSLQRSRSDIDVNAAASAKSK-VSSSSGTTPFSSAAALPPGSYA .:.:. :.:. : ::::::::::::::::.::.. ....: . .:.:: :::: KIAA06 VAGRVSAGSSKASSLPGSLQRSRSDIDVNAAAGAKAHHAAGQSVRSGRLGAGALNAGSYA 380 390 400 410 420 430 390 400 410 420 430 KIAA06 SL--------------GRIRTRRQSSGSATNVASTPDNRGRSRAKVVSQSQRSRSANPAG :: ::.:.. .. .. . :.. :.:::::.:.::::: : KIAA06 SLEDTSDKLDGTASEDGRVRAKLSAPLAGMGNAKA-DSRGRSRTKMVSQSQ------P-- 440 450 460 470 480 440 450 460 470 480 490 KIAA06 AGSRSSSPGKLLGS-GYGGLTGGSSRGPPVTPSSEKRSKIPRSQGCSRETSPNRIGLARS ::::.:::..: . . . ...: .: . :..::::::::::::::.::.:...::: KIAA06 -GSRSGSPGRVLTTTALSTVSSGVQRVLVNSASAQKRSKIPRSQGCSREASPSRLSVARS 490 500 510 520 530 540 500 510 520 KIAA06 SRIPRPSMSQGCSRDTSRESSRDTSPARGFPPLDR----------------------FGL :::::::.::::::..::::::::::.:.: :: .:. KIAA06 SRIPRPSVSQGCSREASRESSRDTSPVRSFQPLASRHHSRSTGALYAPEVYGASGPGYGI 550 560 570 580 590 600 530 540 550 560 570 580 KIAA06 GQPGRIPGSVNAMRVLSTSTDLEAAVADALKKPVRRRYEPYGMYSDDDANSDASSVCSER .: .:. .::.:::::.:..:.: :::::::::.::::: :::.:::::::::::.:::: KIAA06 SQSSRLSSSVSAMRVLNTGSDVEEAVADALKKPARRRYESYGMHSDDDANSDASSACSER 610 620 630 640 650 660 590 600 610 620 630 640 KIAA06 SYGSRNGGIPHYLRQTEDVAEVLNHCASSNWSERKEGLLGLQNLLKSQRTLSRVELKRLC ::.::::.:: :.:::::::::::.:::::::::::::::::::::.::::::::::::: KIAA06 SYSSRNGSIPTYMRQTEDVAEVLNRCASSNWSERKEGLLGLQNLLKNQRTLSRVELKRLC 670 680 690 700 710 720 650 660 670 680 690 700 KIAA06 EIFTRMFADPHSKRVFSMFLETLVDFIIIHKDDLQDWLFVLLTQLLKKMGADLLGSVQAK :::::::::::.::::::::::::::: .::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA06 EIFTRMFADPHGKRVFSMFLETLVDFIQVHKDDLQDWLFVLLTQLLKKMGADLLGSVQAK 730 740 750 760 770 780 710 720 730 740 750 760 KIAA06 VQKALDVTRDSFPFDQQFNILMRFIVDQTQTPNLKVKVAILKYIESLARQMDPTDFVNSS :::::::::.::: : :::::::: :::::::.::::::::::::.::.:::: ::.::: KIAA06 VQKALDVTRESFPNDLQFNILMRFTVDQTQTPSLKVKVAILKYIETLAKQMDPGDFINSS 790 800 810 820 830 840 770 780 790 800 810 820 KIAA06 ETRLAVSRIITWTTEPKSSDVRKAAQIVLISLFELNTPEFTMLLGALPKTFQDGATKLLH ::::::::.::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::: KIAA06 ETRLAVSRVITWTTEPKSSDVRKAAQSVLISLFELNTPEFTMLLGALPKTFQDGATKLLH 850 860 870 880 890 900 830 840 850 860 870 880 KIAA06 NHLKNSSNTSVGSPSNTIGRTPSRHTSSRTSPLTSPTNCSHGGLSPSRLWGWSADGLAKH :::.:..: . .: .. . : : .. .:::::::: :.. :::: KIAA06 NHLRNTGNGTQSSMGSPLTRPTPRSPANWSSPLTSPTNTSQNTLSPS------------- 910 920 930 940 950 890 900 910 920 930 940 KIAA06 PPPFSQPNSIPTAPSHKALRRSYSPSMLDYDTENLNSEEIYSSLRGVTEAIEKFSFRSQE .::::::.:::.::::::::::::..::::::: KIAA06 --------------------------AFDYDTENMNSEDIYSSLRGVTEAIQNFSFRSQE 960 970 980 950 960 970 980 990 1000 KIAA06 DLNEPIKRDGKKECDIVSRDGGAASPATEGR-GGSEVEGGRTALDNKTSLLNTQPPRAFP :.:::.:::.::. : : :: . .. : ::. .....::::::.:::...: .. KIAA06 DMNEPLKRDSKKD-DGDSMCGGPG--MSDPRAGGDATDSSQTALDNKASLLHSMPTHS-- 990 1000 1010 1020 1030 1040 1010 1020 1030 1040 1050 1060 KIAA06 GPRARDYNPYPYSDAINTYDKTALKEAVFDDDMEQL-RDVPIDHSDLVADLLKELSNHNE .::.:::::: :::.:. ..:.:::::.:::: .:. :. .:::::::.:::::::::: KIAA06 SPRSRDYNPYNYSDSISPFNKSALKEAMFDDDADQFPDDLSLDHSDLVAELLKELSNHNE 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1070 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA06 RVEERKGALLELLKITREDSLGVWEEHFKTILLLLLETLGDKDHSIRALALRVLREILRN :::::: :: ::.:.:.:.:..::.:::::::::::::::::. .::::::.:::::::. KIAA06 RVEERKIALYELMKLTQEESFSVWDEHFKTILLLLLETLGDKEPTIRALALKVLREILRH 1110 1120 1130 1140 1150 1160 1130 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA06 QPARFKNYAELTIMKTLEAHKDSHKEVVRAAEEAASTLASSIHPEQCIKVLCPIIQTADY ::::::::::::.::::::::: ::::::.::::::.::.:: ::::::::::::::::: KIAA06 QPARFKNYAELTVMKTLEAHKDPHKEVVRSAEEAASVLATSISPEQCIKVLCPIIQTADY 1170 1180 1190 1200 1210 1220 1190 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA06 PINLAAIKMQTKVVERIAKESLLQLLVDIIPGLLQGYDNTESSVRKASVFCLVAIYSVIG :::::::::::::.::..::.: :: .:.:::.:::::.::::::: ::::::...::: KIAA06 PINLAAIKMQTKVIERVSKETLNLLLPEIMPGLIQGYDNSESSVRKACVFCLVAVHAVIG 1230 1240 1250 1260 1270 1280 1250 1260 1270 1280 KIAA06 EDLKPHLAQLTGSKMKLLNLYIKRAQTTNSNSSSSSDVSTHS ..:::::.::::::::::::::::::: ..... ..::: .: KIAA06 DELKPHLSQLTGSKMKLLNLYIKRAQTGSGGADPTTDVSGQS 1290 1300 1310 1320 1289 residues in 1 query sequences 1986216 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:09:35 2008 done: Thu Dec 18 15:09:36 2008 Total Scan time: 0.800 Total Display time: 0.100 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]