# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg04539.fasta.huge -Q ../query/KIAA0621.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0621, 753 aa vs ./tmplib.23663 library 1986752 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4930+/-0.00831; mu= -6.3658+/- 0.563 mean_var=297.4044+/-71.063, 0's: 0 Z-trim: 23 B-trim: 16 in 1/39 Lambda= 0.074370 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0041 ( 781 res) ha00469s1 ( 781) 367 53.3 1.1e-07 KIAA1478 ( 570 res) fj05212 ( 570) 354 51.7 2.3e-07 KIAA1424 ( 1944 res) ha06448 (1944) 358 52.7 4.1e-07 KIAA0712 ( 1770 res) hg04169 (1770) 350 51.8 6.9e-07 KIAA1722 ( 1499 res) pf00674s1 (1499) 347 51.4 7.7e-07 KIAA1716 ( 804 res) hj06603 ( 804) 317 47.9 4.6e-06 KIAA1204 ( 1445 res) fg03451 (1445) 317 48.2 7e-06 KIAA1501 ( 735 res) hh12863 ( 735) 305 46.6 1.1e-05 KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281) 310 47.4 1.1e-05 KIAA0672 ( 824 res) hk02382 ( 824) 305 46.6 1.1e-05 KIAA0053 ( 666 res) ha01417 ( 666) 266 42.4 0.00018 KIAA0411 ( 1061 res) hg02120 (1061) 253 41.2 0.00066 KIAA0131 ( 942 res) ha01235 ( 942) 247 40.5 0.00094 KIAA0050 ( 796 res) ha01557 ( 796) 245 40.2 0.00097 KIAA1723 ( 1554 res) pf00881 (1554) 244 40.4 0.0017 KIAA1304 ( 1051 res) fh04032 (1051) 237 39.5 0.0021 KIAA0189 ( 1132 res) ha02928 (1132) 217 37.3 0.01 >>KIAA0041 ( 781 res) ha00469s1 (781 aa) initn: 106 init1: 81 opt: 367 Z-score: 229.8 bits: 53.3 E(): 1.1e-07 Smith-Waterman score: 367; 22.895% identity (61.053% similar) in 380 aa overlap (16-382:73-439) 10 20 30 40 KIAA06 DSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLEDERIRMIE .... . :: .:. :... . . ... KIAA00 KLCIAMIDTGKAFCVANKQFMNGIRDLAQYSSNDAVVETSLTKFSDSLQEMINFHTILFD 50 60 70 80 90 100 50 60 70 80 90 100 KIAA06 NASEVLITPLEKFRKEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQLQEADSQ .... . . :..: ::.. :.:::...: .:. . : :. ... ..:. ...:: . KIAA00 QTQRSIKAQLQNFVKEDLRKFKDAKKQFEKVSEEKENALVKNAQVQ-RNKQHEVEEATNI 110 120 130 140 150 160 110 120 130 140 150 KIAA06 VDLVRQHFYEVSLEYVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYEL-------AK . .:. : ...:.::.... .: .. :... .:.:. . ..:.:.::.: : KIAA00 LTATRKCFRHIALDYVLQINVLQSKRRSEILKSMLSFMYAHLAFFHQGYDLFSELGPYMK 170 180 190 200 210 220 160 170 180 190 200 210 KIAA06 DFGDFKTQLTISIQNTRNRFEGTRSEVESLMKKMKENPLEHKT--ISPYTMEGYLYVQEK :.: .:... . . ..: .: ... . .. ::... . .:::::. . . KIAA00 DLGAQLDRLVVDAAKEKREMEQKHSTIQQKDFSSDDSKLEYNVDAANGIVMEGYLFKRAS 230 240 250 260 270 280 220 230 240 250 260 270 KIAA06 RHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITMVPFDQKSGGKGGEDESVI---LKSCTRRKTDSIEKRF : : : ... . : . :... :: : .. .:. :. :: .. ..::.:: KIAA00 NAFKT-WNRRWFSIQNN--QLVY----QK---KFKDNPTVVVEDLRLCTVKHCEDIERRF 290 300 310 320 330 280 290 300 310 320 330 KIAA06 CFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLWMEAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIR ::.: . . . .:: ::. :. :..:.. . .: ..:: . .: . . . KIAA00 CFEVVSPTKSCM--LQADSEKLRQAWIKAVQTSIATAYREKGDESEKLDKKSSPSTGSLD 340 350 360 370 380 340 350 360 370 380 390 KIAA06 KCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQKLLSVLMDPKTAS-ETETDICAEWEIKTITSAL . .. : .:..: :. . . .. : ::. :: . .: : KIAA00 SGNESKEKLLKGESALQRVQCIPGNASCCDCGLADPRWASINLGITLCIECSGIHRSLGV 390 400 410 420 430 440 400 410 420 430 440 450 KIAA06 KTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLENQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLAN KIAA00 HFSKVRSLTLDTWEPELLKLMCELGNDVINRVYEANVEKMGIKKPQPGQRQEKEAYIRAK 450 460 470 480 490 500 >>KIAA1478 ( 570 res) fj05212 (570 aa) initn: 346 init1: 175 opt: 354 Z-score: 224.0 bits: 51.7 E(): 2.3e-07 Smith-Waterman score: 354; 31.020% identity (62.857% similar) in 245 aa overlap (330-568:302-538) 300 310 320 330 340 350 KIAA06 MEAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRV ::. .:.. .: ::..: ::::: : . : KIAA14 PCIPTLIGTPVKIGEGMLADFVSQTSPMIPSIVVHCVNEIEQRGLTETGLYRISGCDRTV 280 290 300 310 320 330 360 370 380 390 400 410 KIAA06 QKLLSVLMDPKTASE-TETDICAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKL ..: .. ::. ...: .:..: : :: .:: : ::. ....:.:..::.. KIAA14 KELKEKFLRVKTVPLLSKVD-----DIHAICSLLKDFLRNLKEPLLTFRLNRAFMEAAEI 340 350 360 370 380 420 430 440 450 460 470 KIAA06 ENQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANN-HKQNLMTVANLGVVFGPTLLR .... .. ... : .::. ::. : .:: :: ::.. : . : ::::. :::::.. KIAA14 TDEDNSIAAMYQAVGELPQANRDTLAFLMIHLQRVAQSPHTK--MDVANLAKVFGPTIVA 390 400 410 420 430 440 480 490 500 510 520 530 KIAA06 ---PQEETVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQ-LHLSRKKSSDSKPP :. . :. ..::: : :.: :. . .. . : . ::. ..... : : KIAA14 HAVPNPDPVTMLQDIKRQPKVVERLLSLPLEYWSQFMMVEQENIDPLHVIENSNAFSTPQ 450 460 470 480 490 500 540 550 560 570 580 590 KIAA06 SCSERPLTLFHTVQSTEKQEQRNSIINSSLESVSSNPNSILNSSSSLQPNMNSSDPDLAV . . ..:. : . :.: .. .: . : : KIAA14 T-PDIKVSLLGPVTTPEHQLLKTPSSSSLSQRVRSTLTKNTPRFGSKSKSATNLGRQGNF 510 520 530 540 550 560 600 610 620 630 640 650 KIAA06 VKPTRPNSLPPNPSPTSPLSPSWPMFSAPSSPMPTSSTSSDSSPVRSVAGFVWFSVAAVV KIAA14 FASPMLK 570 >>KIAA1424 ( 1944 res) ha06448 (1944 aa) initn: 317 init1: 231 opt: 358 Z-score: 219.6 bits: 52.7 E(): 4.1e-07 Smith-Waterman score: 358; 31.707% identity (65.366% similar) in 205 aa overlap (331-532:1150-1347) 310 320 330 340 350 360 KIAA06 EAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQ :. : . :: ::.. :.::. : :. .. KIAA14 TFEKKPTATGTFGVRLDDCPPAHTNRYIPLIVDICCKLVEERGLEYTGIYRVPGNNAAIS 1120 1130 1140 1150 1160 1170 370 380 390 400 410 KIAA06 KLLSVLMDPKTASETETDICAEW-EIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLE .. : . . . : .: ....:.: ::...: :: ::. . .::.: . : KIAA14 SMQEELNKGMADIDIQDD---KWRDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTNDKYADFIEANRKE 1180 1190 1200 1210 1220 1230 420 430 440 450 460 470 KIAA06 NQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQ . .:.. .. :.: :::.. . :..: :: .::.: ..: : ::..::::::.: . KIAA14 DPLDRLKTLKRLIHDLPEHHYETLKFLSAHLKTVAENSEKNKMEPRNLAIVFGPTLVRTS 1240 1250 1260 1270 1280 1290 480 490 500 510 520 530 KIAA06 EETVA-AIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTV-PDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSE :.... . . : ..: ::..:. .:. . :::..: .... ::.: KIAA14 EDNMTHMVTHMPDQYKIVETLIQHHDWFFTEEGAEEPLTTVQ----EESTVDSQPVPNID 1300 1310 1320 1330 1340 1350 540 550 560 570 580 590 KIAA06 RPLTLFHTVQSTEKQEQRNSIINSSLESVSSNPNSILNSSSSLQPNMNSSDPDLAVVKPT KIAA14 HLLTNIGRTGVSPGDVSDSATSDSTKSKGSWGSGKDQYSRELLVSSIFAAASRKRKKPKE 1360 1370 1380 1390 1400 1410 >>KIAA0712 ( 1770 res) hg04169 (1770 aa) initn: 243 init1: 182 opt: 350 Z-score: 215.5 bits: 51.8 E(): 6.9e-07 Smith-Waterman score: 360; 26.984% identity (57.143% similar) in 378 aa overlap (320-676:58-411) 290 300 310 320 330 340 KIAA06 ALSEEDRRLWMEAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGF---SIIRKCIHAVETRGINE : :.: :: .....: .: :: . KIAA07 FLRTFMKSRPTKQKLKQRGILKERVFGCDLGEHLLNS-GFEVPQVLQSCTAFIERYGIVD 30 40 50 60 70 80 350 360 370 380 390 400 KIAA06 QGLYRIVGVNSRVQKLLSVLMDPKTASETETDICAE---WEIKTITSALKTYLRMLPGPL :.::. :: : .:.: . :: :. : .:... : : :.: ::.:: KIAA07 -GIYRLSGVASNIQRLRH-----EFDSEHVPDLTKEPYVQDIHSVGSLCKLYFRELPNPL 90 100 110 120 130 140 410 420 430 440 450 460 KIAA06 MMYQFQRSFIKAAKLENQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMT . ::. ..: :.. ..: :. .::.....:: . . :..:: ::. .:. . . : KIAA07 LTYQLYEKFSDAVSAATDEERLIKIHDVIQQLPPPHYRTLEFLMRHLSLLADYCSITNMH 150 160 170 180 190 200 470 480 490 500 510 KIAA06 VANLGVVFGPTLLRPQE-ETV-----AAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTN . ::..:..:.::: .. :.. ::.:....:..:.:..... . .:. .: . . KIAA07 AKNLAIVWAPNLLRSKQIESACFSGTAAFMEVRIQSVVVEFILNHVDVLFSGRISMAMQE 210 220 230 240 250 260 520 530 540 550 560 570 KIAA06 AQLHLSRKKSSDSKPPSCSERPLTLFHTVQSTEKQEQRNSIINSSLESVSSNPN-SILNS . ::: :: . :: . ::: : : . .. .:: . :. : . .. KIAA07 GAASLSRPKSLLVSSPST--KLLTL------EEAQARTQAQVNSPI--VTENKYIEVGEG 270 280 290 300 310 580 590 600 610 620 630 KIAA06 SSSLQPNMNSSDPDLAVVKPTRPNSLPPNPSPTSPLSPSWPMF-----SAPSSPMPTSST ..:: .... ... . : : ::.. :: : :. : . . KIAA07 PAALQGKFHT------IIEFPLERKRPQNKMKKSPVG-SWRSFFNLGKSSSVSKRKLQRN 320 330 340 350 360 640 650 660 670 680 KIAA06 SSDSSPVRSVA---GFVWFSVAAVVLSLARSSLHAVFSLLVNFVPCHPNLHLLFDRPEEA :. : ....: : . .. .. . .::::: . : : .: KIAA07 ESEPSEMKAMALKGGRAEGTLRSAKSEESLTSLHAVDGDSKLFRPRRPRSSSDALSASFN 370 380 390 400 410 420 690 700 710 720 730 740 KIAA06 VHEDSSTPFRKAKALYACKAEHDSELSFTAGTVFDNVHPSQEPGWLEGTLNGKTGLIPEN KIAA07 GEMLGNRCNSYDNLPHDNESEEEGGLLHIPALMSPHSAEDVDLSPPDIGVASLDFDPMSF 430 440 450 460 470 480 >>KIAA1722 ( 1499 res) pf00674s1 (1499 aa) initn: 336 init1: 241 opt: 347 Z-score: 214.7 bits: 51.4 E(): 7.7e-07 Smith-Waterman score: 347; 28.333% identity (73.333% similar) in 180 aa overlap (332-511:1265-1440) 310 320 330 340 350 360 KIAA06 AMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQK :..::. .:. :.. .:.::. : .:.... KIAA17 PSITKATWESNYFGVPLTTVVTPEKPIPIFIERCIEYIEATGLSTEGIYRVSGNKSEMES 1240 1250 1260 1270 1280 1290 370 380 390 400 410 420 KIAA06 LLSVLMDPKTASETETDICAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLENQ : . . .. . .: : . ..:...:.:... :: ::. :..: ....: :.... KIAA17 LQRQFDQDHNLDLAEKD----FTVNTVAGAMKSFFSELPDPLVPYNMQIDLVEAHKINDR 1300 1310 1320 1330 1340 1350 430 440 450 460 470 480 KIAA06 ESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQEE :... .. .....:..:..... ...:: .:..:.: :::: ::.. : :::.::. KIAA17 EQKLHALKEVLKKFPKENHEVFKYVISHLNKVSHNNKVNLMTSENLSICFWPTLMRPDFS 1360 1370 1380 1390 1400 1410 490 500 510 520 530 540 KIAA06 TVAAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSERPLT :. :. . . .::..:.. .: . : KIAA17 TMDALTATRTYQTIIELFIQQCPFFFYNRPITEPPGARPSSPSAVASTVPFLTSTPVTSQ 1420 1430 1440 1450 1460 1470 >>KIAA1716 ( 804 res) hj06603 (804 aa) initn: 307 init1: 140 opt: 317 Z-score: 200.7 bits: 47.9 E(): 4.6e-06 Smith-Waterman score: 362; 25.781% identity (60.156% similar) in 384 aa overlap (9-373:70-433) 10 20 30 KIAA06 DSLNEFKFQCIGDAETDDEMCIARSLQEFATVLRNLED :: ::. :.. ::.:: :... . KIAA17 VKLCSGMVEAGKAYVSTSRLFVSGVRDLSQQCQGDT------VISECLQRFADSLQEVVN 40 50 60 70 80 90 40 50 60 70 80 90 KIAA06 ERIRMIENASEVLITPLEKFRKEQIGAAKEAKKKYDKETEKYCGILEKHLNLSSKKKESQ .. ....:.. . :..: ::.. ::.::..:: : : .. . . ... . KIAA17 YHMILFDQAQRSVRQQLQSFVKEDVRKFKETKKQFDKVREDLELSLVRNAQ-APRHRPHE 100 110 120 130 140 150 100 110 120 130 140 150 KIAA06 LQEADSQVDLVRQHFYEVSLEYVFKVQEVQERKMFEFVEPLLAFLQGLFTFYHHGYELAK ..:: . . :.:. : ...:.::.... .: .: ::... .:.:... .:...:: : . KIAA17 VEEATGALTLTRKCFRHLALDYVLQINVLQAKKKFEILDSMLSFMHAQSSFFQQGYSLLH 160 170 180 190 200 210 160 170 180 190 200 KIAA06 DFGDFKTQLT-----ISIQNTRNRFEGTRSEV----ESLMKKMK--ENPLEHKTISP--Y .. . .:. . :... .. : :... ..:.. .. :. .: . .: KIAA17 QLDPYMKKLAAELDQLVIDSAVEKREMERKHAAIQQRTLLQDFSYDESKVEFDVDAPSGV 220 230 240 250 260 270 210 220 230 240 250 260 KIAA06 TMEGYLYVQEKRHFGTSWVKHYCTYQRDSKQITMVPFDQKSGGKGGEDESVI---LKSCT .:::::. . . : : : ... . : ..:... :: : . .:. :. :. KIAA17 VMEGYLFKRASNAFKT-WNRRWFSIQ--NSQLVY----QK---KLKDALTVVVDDLRLCS 280 290 300 310 320 270 280 290 300 310 320 KIAA06 RRKTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLWMEAMDGR-EPVYNSNKDS-QSEG . ..::.::::.: . . . .:: ::. :. :..:... .: . :: :: KIAA17 VKPCEDIERRFCFEVLSPTKSCM--LQADSEKLRQAWVQAVQASIASAYRESPDSCYSER 330 340 350 360 370 380 330 340 350 360 370 KIAA06 TAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGIN-EQGLYRIVGVNSRVQKLLSVLMDPKTASETETDI . : . : : . . : ::.. :. : :. .: . : ::. :: KIAA17 LDRTASPSTSSIDSATDTRE-RGVKGESVLQRVQSVAGNSQCGDCGQPDPRWASINLGVL 390 400 410 420 430 380 390 400 410 420 430 KIAA06 CAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLENQESRVSEIHSLVHRLPEKN KIAA17 LCIECSGIHRSLGVHCSKVRSLTLDSWEPELLKLMCELGNSAVNQIYEAQCEGAGSRKPT 440 450 460 470 480 490 >>KIAA1204 ( 1445 res) fg03451 (1445 aa) initn: 349 init1: 177 opt: 317 Z-score: 197.5 bits: 48.2 E(): 7e-06 Smith-Waterman score: 329; 26.871% identity (62.585% similar) in 294 aa overlap (331-583:38-325) 310 320 330 340 350 360 KIAA06 EAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQ ....: . .::.:: . :.::. ::.: .: KIAA12 KQKLKRKGAASAFGCDLTEYLESSGQDVPYVLKSCAEFIETHGIVD-GIYRLSGVTSNIQ 10 20 30 40 50 60 370 380 390 400 410 KIAA06 KLLSVLMDPKTASETETDICAE---WEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAK .: . . .:. :. : .:. . : : :.: ::.::. :.. ..: .:.. KIAA12 RLRQ-----EFGSDQCPDLTREVYLQDIHCVGSLCKLYFRELPNPLLTYELYEKFTEAVS 70 80 90 100 110 120 420 430 440 450 460 470 KIAA06 LENQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLR .:.....:......:: .. . :. :. :::..:. ... : . ::..:..:.::: KIAA12 HCPEEGQLARIQNVIQELPPSHYRTLEYLIRHLAHIASFSSKTNMHARNLALVWAPNLLR 130 140 150 160 170 180 480 490 500 510 KIAA06 PQE-ETV-----AAIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFN-------------------TVP- .: :.. ::.. .. :..:::..... ..::: :.: KIAA12 SKEIEATGCNGDAAFLAVRVQQVVIEFILNHVDQIFNNGAPGSLENDENRPIMKSLTLPA 190 200 210 220 230 240 520 530 540 550 KIAA06 -DMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSER----------PL-TLFHTVQSTEKQEQRNSII ..:. ..:. .. .: .. :. .:: :. :::::: .... : KIAA12 LSLPMKLVSLEEAQARSLATNHPARKERRENSLPEIVPPMGTLFHTVLELPDNKRKLSSK 250 260 270 280 290 300 560 570 580 590 600 610 KIAA06 NSSLESVSSNPNSILNSSSSLQPNMNSSDPDLAVVKPTRPNSLPPNPSPTSPLSPSWPMF ... .:. . : .:.:.:. : KIAA12 SKKWKSIFNLGRSGSDSKSKLSRNGSVFVRGQRLSVEKATIRPAKSMDSLCSVPVEGKET 310 320 330 340 350 360 >>KIAA1501 ( 735 res) hh12863 (735 aa) initn: 270 init1: 212 opt: 305 Z-score: 194.2 bits: 46.6 E(): 1.1e-05 Smith-Waterman score: 305; 29.730% identity (65.946% similar) in 185 aa overlap (331-512:513-693) 310 320 330 340 350 360 KIAA06 EAMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQ :. : . ::.::.. :.::. : :. : KIAA15 IKKNKKAAPRAFGVRLEECQPATENQRVPLIVAACCRIVEARGLESTGIYRVPGNNAVV- 490 500 510 520 530 540 370 380 390 400 410 KIAA06 KLLSVLMDPKTASETETDICAE-WE-IKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKL : :.. . . . .. : :. ...:.: ::...: :: ::. . .::.: .. KIAA15 ---SSLQEQLNRGPGDINLQDERWQDLNVISSLLKSFFRKLPEPLFTDDKYNDFIEANRI 550 560 570 580 590 420 430 440 450 460 470 KIAA06 ENQESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRP :. . :. ...:.. :: . . :..:..:: ..:.. ..: : ::..::::::.: KIAA15 EDARERMRTLRKLIRDLPGHYYETLKFLVGHLKTIADHSEKNKMEPRNLALVFGPTLVRT 600 610 620 630 640 650 480 490 500 510 520 530 KIAA06 QEETVA-AIMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSE .:.... . . . ..: ::.. . .:. : KIAA15 SEDNMTDMVTHMPDRYKIVETLIQHSDWFFSDEEDKGERTPVGDKEPQAVPNIEYLLPNI 660 670 680 690 700 710 540 550 560 570 580 590 KIAA06 RPLTLFHTVQSTEKQEQRNSIINSSLESVSSNPNSILNSSSSLQPNMNSSDPDLAVVKPT KIAA15 GRTVPPGDPGSADLLEI 720 730 >>KIAA0782 ( 1281 res) hk05405s1 (1281 aa) initn: 202 init1: 202 opt: 310 Z-score: 194.1 bits: 47.4 E(): 1.1e-05 Smith-Waterman score: 310; 29.258% identity (61.135% similar) in 229 aa overlap (280-504:757-976) 250 260 270 280 290 300 KIAA06 GGEDESVILKSCTRRKTDSIEKRFCFDVEAVDRPGVITMQALSEEDRRLWMEAMDGREPV :.: .. .:. . : :. :. . . KIAA07 PEGPCEEPLQLRKLQELSIQGDSENQVLVLVERRRTLYIQGERRLDFMGWLGAI---QKA 730 740 750 760 770 780 310 320 330 340 350 360 KIAA06 YNSNKDSQSEGTAQL-DSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQKLL-SVLM : :. :: :: :: :. .:. . :.. .:.:: : .:..:.:: :. . KIAA07 AASMGDTLSE--QQLGDSDIPVIVYRCVDYITQCGLTSEGIYRKCGQTSKTQRLLESLRQ 790 800 810 820 830 840 370 380 390 400 410 420 KIAA06 DPKTASETETDICAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLENQESRVSE : ... : .: .. ..:::: .:: :: :. . ....:...:..: .::. KIAA07 DARSVHLKE----GEQHVDDVSSALKRFLRDLPDGLFTRAQRLTWLEASEIEDEEEKVSR 850 860 870 880 890 430 440 450 460 470 480 KIAA06 IHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRP--QEETVAA . :. ::: :: .. :..:: : : :.: ::..::::::.. :. .. KIAA07 YRELLVRLPPVNRATVKALISHLYCVQCFSDTNQMNVHNLAIVFGPTLFQTDGQDYKAGR 900 910 920 930 940 950 490 500 510 520 530 540 KIAA06 IMDIKFQNIVIEILIENHEKIFNTVPDMPLTNAQLHLSRKKSSDSKPPSCSERPLTLFHT ... ... :. . ....: KIAA07 VVEDLINHYVVVFSVDEEELRKQREEITAIVKMRVAGTASGTQHAGDFICTVYLEEKKAE 960 970 980 990 1000 1010 >>KIAA0672 ( 824 res) hk02382 (824 aa) initn: 298 init1: 218 opt: 305 Z-score: 193.6 bits: 46.6 E(): 1.1e-05 Smith-Waterman score: 342; 25.526% identity (61.562% similar) in 333 aa overlap (332-637:278-603) 310 320 330 340 350 360 KIAA06 AMDGREPVYNSNKDSQSEGTAQLDSIGFSIIRKCIHAVETRGINEQGLYRIVGVNSRVQK :. :. . :..:.::.:.. :...: KIAA06 AQQEAWVEKPSFGKPLEEHLTISGREIAFPIEACVTMLLECGMQEEGLFRVAPSASKLKK 250 260 270 280 290 300 370 380 390 400 410 420 KIAA06 LLSVLMDPKTASETETDICAEWEIKTITSALKTYLRMLPGPLMMYQFQRSFIKAAKLENQ : ..: : ... : . . ..:..:::.::: :: ::: ... .:.:.....: KIAA06 LKAAL-DCCVVDVQEYSA----DPHAIAGALKSYLRELPEPLMTFELYDEWIQASNVQEQ 310 320 330 340 350 360 430 440 450 460 470 480 KIAA06 ESRVSEIHSLVHRLPEKNRQMLQLLMNHLANVANNHKQNLMTVANLGVVFGPTLLRPQEE ..... . . ..::. :.. .. :.. :..... . : :: .:...:.::.:: :: : KIAA06 DKKLQALWNACEKLPKANHNNIRYLIKFLSKLSEYQDVNKMTPSNMAIVLGPNLLWPQAE 370 380 390 400 410 420 490 500 510 520 530 KIAA06 -TVAAIMD-IKFQNI-VIEILIENHEKIFNTVPDMPLTN---AQLHLSRKKSSDSKP--- ... .: ...: . .:: .:.. . .: .. .:. . .:.... . .: : KIAA06 GNITEMMTTVSLQIVGIIEPIIQHADWFFPGEIEFNITGNYGSPVHVNHNANYSSMPSPD 430 440 450 460 470 480 540 550 560 570 KIAA06 --------PSCSERPLTLFHTVQSTE--KQEQRNSIINSSLESVSSNPNSILNSS----- : ..:::.. . : :.. .: . ... ...: . .:: KIAA06 MDPADRRQPEQARRPLSVATDNMMLEFYKKDGLRKIQSMGVRVMDTNWVARRGSSAGRKV 490 500 510 520 530 540 580 590 600 610 620 630 KIAA06 SSLQPNMNSSDPDLAVVKPTRPNSLPPNP--SPTSP-LSPSWPMFSAPSSPMPTSSTSSD : :.:. : .. : :. :: .: ::..: :::: . :. ... :.. KIAA06 SCAPPSMQPPAPPAELAAPL-PSPLPEQPLDSPAAPALSPS-GLGLQPGPERTSTTKSKE 550 560 570 580 590 600 640 650 660 670 680 690 KIAA06 SSPVRSVAGFVWFSVAAVVLSLARSSLHAVFSLLVNFVPCHPNLHLLFDRPEEAVHEDSS :: KIAA06 LSPGSAQKGSPGSSQGTACAGTQPGAQPGAQPGASPSPSQPPADQSPHTLRKVSKKLAPI 610 620 630 640 650 660 753 residues in 1 query sequences 1986752 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:09:33 2008 done: Thu Dec 18 15:09:34 2008 Total Scan time: 0.570 Total Display time: 0.200 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]