# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg04117.fasta.huge -Q ../query/KIAA0619.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0619, 1428 aa vs ./tmplib.23663 library 1986077 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5906+/-0.0103; mu= 4.5234+/- 0.702 mean_var=484.4622+/-120.745, 0's: 0 Z-trim: 76 B-trim: 131 in 1/39 Lambda= 0.058270 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1124 ( 1760 res) fg05708 (1760) 1531 145.0 1.1e-34 KIAA0965 ( 489 res) hj06174s1 ( 489) 580 64.2 6.9e-11 KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164) 507 58.6 7.5e-09 KIAA0973 ( 1583 res) hj06871 (1583) 462 55.1 1.2e-07 KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329) 460 54.8 1.2e-07 KIAA0303 ( 2137 res) hg00009 (2137) 460 55.1 1.6e-07 KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308) 453 54.2 1.9e-07 KIAA1765 ( 608 res) fj12188(revised) ( 608) 439 52.5 2.9e-07 KIAA1860 ( 689 res) fh18358 ( 689) 440 52.6 2.9e-07 KIAA0175 ( 656 res) ha02337 ( 656) 434 52.1 4e-07 KIAA1278 ( 1311 res) hg03689(revised) (1311) 427 52.0 8.5e-07 KIAA0096 ( 766 res) ha01240s1 ( 766) 410 50.2 1.7e-06 KIAA0551 ( 1385 res) hh00867s1 (1385) 414 50.9 1.9e-06 KIAA0369 ( 794 res) hh00177 ( 794) 397 49.1 3.8e-06 KIAA1811 ( 715 res) ha06731 ( 715) 395 48.9 4e-06 KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064) 398 49.4 4.1e-06 KIAA0787 ( 557 res) hk05521s1 ( 557) 391 48.4 4.5e-06 KIAA0445 ( 1919 res) hg00102s1 (1919) 399 49.9 5.2e-06 KIAA0968 ( 527 res) hj06483 ( 527) 385 47.8 6.2e-06 KIAA0781 ( 950 res) hk09678 ( 950) 384 48.2 8.8e-06 KIAA0537 ( 698 res) hg03925 ( 698) 381 47.7 9e-06 KIAA0004 ( 1307 res) ha00065 (1307) 385 48.5 9.8e-06 KIAA1901 ( 1265 res) hh03635 (1265) 384 48.4 1e-05 KIAA0999 ( 1371 res) fj10213 (1371) 384 48.4 1.1e-05 KIAA1142 ( 467 res) hh05864 ( 467) 368 46.3 1.6e-05 KIAA1264 ( 753 res) hj01058 ( 753) 372 47.0 1.6e-05 KIAA1512 ( 2010 res) fg04660y1 (2010) 378 48.2 1.8e-05 KIAA0216 ( 2067 res) hf00331s1 (2067) 375 48.0 2.2e-05 KIAA1361 ( 1005 res) fj02367 (1005) 367 46.8 2.4e-05 KIAA0866 ( 1984 res) hk00546s1 (1984) 367 47.3 3.4e-05 KIAA0687 ( 1175 res) hk02992 (1175) 362 46.5 3.5e-05 KIAA1639 ( 2584 res) af14886 (2584) 364 47.2 4.7e-05 KIAA0213 ( 1626 res) ha04841s1 (1626) 359 46.4 5e-05 KIAA0623 ( 1100 res) hg04615 (1100) 349 45.3 7.3e-05 KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066) 346 45.0 8.6e-05 KIAA0178 ( 1233 res) ha02501s1 (1233) 346 45.1 9.2e-05 KIAA1995 ( 1011 res) bh00088 (1011) 334 44.0 0.00017 KIAA0378 ( 970 res) hh00502s1 ( 970) 331 43.7 0.0002 KIAA1565 ( 1313 res) bf00184 (1313) 332 44.0 0.00021 KIAA1074 ( 1715 res) hj06637 (1715) 333 44.3 0.00023 KIAA0336 ( 1635 res) hg01120 (1635) 328 43.8 0.0003 KIAA0949 ( 1559 res) af07325 (1559) 326 43.6 0.00033 KIAA1561 ( 1416 res) fh20178s1 (1416) 316 42.7 0.00057 KIAA0635 ( 864 res) hj03253 ( 864) 306 41.5 0.00079 KIAA0373 ( 1540 res) hh00281 (1540) 308 42.1 0.00094 KIAA2015 ( 996 res) fk09763 ( 996) 294 40.6 0.0017 KIAA1167 ( 834 res) hj01786(revised) ( 834) 291 40.2 0.0019 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 289 40.8 0.0034 KIAA1398 ( 1586 res) ha02572 (1586) 286 40.3 0.0034 KIAA0203 ( 1593 res) ha02320 (1593) 276 39.4 0.0062 >>KIAA1124 ( 1760 res) fg05708 (1760 aa) initn: 1331 init1: 465 opt: 1531 Z-score: 714.4 bits: 145.0 E(): 1.1e-34 Smith-Waterman score: 1699; 29.977% identity (61.232% similar) in 1331 aa overlap (12-1296:7-1255) 10 20 30 40 50 KIAA06 RQAVGPGGVPAGAGGSGAVLGP--EAAGPEREEPECGSSGGGMSRPPPTGKMPGAPETAP : :: : : : :: : : .:. :...: :. : ..: KIAA11 AGARRRGRGGEEAPLLPGLAAAEPPRARPD------GLAEPAVRGRRVG---SGP 10 20 30 40 60 70 80 90 100 110 KIAA06 -GDGAGASRQRKLEALIRD-P---RSPINVESLLDGLNSLVLDLDFPALRKNKNIDNFLN : .. : .::: :. : : .: ..::.::: : : . . :::..: . .::. KIAA11 RGTMSAKVRLKKLEQLLLDGPWRNESALSVETLLDVLVCLYTECSHSALRRDKYVAEFLE 50 60 70 80 90 100 120 130 140 150 160 170 KIAA06 RYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKVYAMKLLSKFEMIKRSD . ... .. .:.. ::....::::::::::: .:. : ....::::.:.:.::.::.. KIAA11 WAKPFTQLVKEMQLHREDFEIIKVIGRGAFGEVAVVKMKNTERIYAMKILNKWEMLKRAE 110 120 130 140 150 160 180 190 200 210 220 230 KIAA06 SAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD--VPEKWA .: : ::::... .. :.. : :::::. .::.::.:. ::::..:.:... .:: : KIAA11 TACFREERDVLVNGDCQWITALHYAFQDENHLYLVMDYYVGGDLLTLLSKFEDKLPEDMA 170 180 190 200 210 220 240 250 260 270 280 290 KIAA06 KFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTCMKMDETGMVHCDTAV .:: .:.:::.:.::.. .:::.::::.::: .::..:::::.:.::.. : :. ..:: KIAA11 RFYIGEMVLAIDSIHQLHYVHRDIKPDNVLLDVNGHIRLADFGSCLKMNDDGTVQSSVAV 230 240 250 260 270 280 300 310 320 330 340 350 KIAA06 GTPDYISPEVLKS-QGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMDHK :::::::::.:.. . : : :: ::::::.:: .:::: :.:::::.::: ::.:::.:. KIAA11 GTPDYISPEILQAMEDGMGKYGPECDWWSLGVCMYEMLYGETPFYAESLVETYGKIMNHE 290 300 310 320 330 340 360 370 380 390 400 KIAA06 NSLCFPEDA-EISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHPFFKNDQWHWDNIRETAA . . :: . ..:..::.:: .. .:: :::.::.:....: ::.. .:.:::. : KIAA11 ERFQFPSHVTDVSEEAKDLIQRLICSRERRLGQNGIEDFKKHAFFEG--LNWENIRNLEA 350 360 370 380 390 400 410 420 430 440 450 460 KIAA06 PVVPELSSDIDSSNFDDIEDDK-GDVETFPIPKA---FVGNQLPFIGFTYYRENLLLSDS : .:..:: :.:::: ..:: ..: .: : . : : .:::::::. :. . :: KIAA11 PYIPDVSSPSDTSNFD-VDDDVLRNTEILP-PGSHTGFSGLHLPFIGFTFTTESCF-SDR 410 420 430 440 450 460 470 480 490 500 510 520 KIAA06 PSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQKCKSVNTRLEKTAKELE : . . .:: .....:. : :: : .:.: :.. . :::. :: KIAA11 GSLK--SIMQSNTLTKDEDVQRDL----EH-SLQMEA---YERRIR----RLEQEKLELS 470 480 490 500 530 540 550 560 570 580 KIAA06 EEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNAEYQRKADHEADKKRNLENDVNSLKDQLEDLKK .. :..:.... .:: . . . .: ..: .. .: : : :. :::: KIAA11 RK--LQESTQTVQSLHGSSRALSNSNRDKEIKKLNEEIERLKNKIADSNRLERQLEDTVA 510 520 530 540 550 560 590 600 610 620 630 640 KIAA06 RNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAESSKQIQQLESNNRDLQDK :. . ::... :..: . ..: :.. .:.: .:.: ..:.:. ..:.: KIAA11 LRQEREDSTQRLRGLEKQ----HRVVRQEKE---ELHKQLVEAS---ERLKSQAKELKDA 570 580 590 600 610 650 660 670 680 690 700 KIAA06 NCLLETAKLKLEKEFINLQSALESERRDRTHGSEIINDLQGRICGLEEDLKNGKILLAKV . . :: :. :: .:. . : .. . :. . : . .. . . . . .. KIAA11 H---QQRKLALQ-EFSELNERMAELRAQKQKVSRQLRDKEEEMEVATQKVDAMRQEMRRA 620 630 640 650 660 670 710 720 730 740 750 760 KIAA06 ELEKRQLQERFTDLEKEKSNMEIDMTYQLKVIQQSL-EQEEAEHKATKARLADKNKIYES : ...:. .. : : :. . .:. .... .: :.: .: :.. . .. . KIAA11 EKLRKELEAQLDDAVAEASKER-----KLREHSENFCKQMESELEALKVKQGGRGA-GAT 680 690 700 710 720 770 780 790 800 810 KIAA06 IEEAK--SEAMKEMEKKLL--EERTLKQKVENLLLEAEKRCSLLDCDLKQ-SQQKINELL .:. . :. .:.:::.: ::. ..... ..: . . . : . .: . :: :.: KIAA11 LEHQQEISKIKSELEKKVLFYEEELVRREASHVLEVKNVKKEVHDSESHQLALQK--EIL 730 740 750 760 770 780 820 830 840 850 860 870 KIAA06 KQKDVLNEDVRNLTLKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSE-KQLKQENNHLMEMK :: :... :. ..:. . . .: . .. .. ..: :.: ::..: . KIAA11 MLKDKLEKSKRERHNEMEEAV-------GTIKDKYERERAMLFDENKKLTAENEKLCSFV 790 800 810 820 830 880 890 900 910 920 KIAA06 MNLEKQNAELRKERQDA----------DGQMKEL----QDQLEAEQYFSTLYKTQVRELK .: :: .:. : :: ..:. :. .:. .:. :...: . ...:: KIAA11 DKLTAQNRQLEDELQDLAAKKESVAHWEAQIAEIIQWVSDEKDARGYLQALASKMTEEL- 840 850 860 870 880 890 930 940 950 960 970 980 KIAA06 EECEEKTKLG-KELQQKKQELQDERDSLAAQLEITLTKADSEQLARSIAEEQYSDLEKEK : ....:: . :. . .... ...:.::. . ..: :.....:. .. . KIAA11 -EALRSSSLGSRTLDPLWKVRRSQKLDMSARLELQ-SALEAEIRAKQLVQEELRKVKDAN 900 910 920 930 940 950 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA06 IMKELEIKEMMARHKQELTEKDATIASLEETNRTLTS-DVANLANEKEELNNKLKDVQEQ . : ..:. :.... : : . ..:: :. :. . .. . : : ... KIAA11 LTLESKLKDSEAKNRELLEEMEILKKKMEEKFRADTGLKLPDFQDSIFEYFNTAPLAHDL 960 970 980 990 1000 1010 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA06 LSRLKDEEISAAAIKAQFEKQLLTERTLKTQAVNKLAEIMNRKEPVKRGNDTDVRRKEKE : . ::. ..: : . . :... : : : : .: . . . . KIAA11 TFRTS----SASEQETQAPKPEASPSM--SVAASEQQEDMAR--PPQRPSAVPLPTTQA- 1020 1030 1040 1050 1060 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA06 NRKLHMELKSEREKLTQQMIK-YQKELNEMQAQIAEESQIRIELQMTLDSKDSDIEQLRS . : . . : : :: ... . . . :: . : . . KIAA11 -----LALAGPKPKAHQFSIKSFSSPTQCSHCTSLMVGLIRQGYACEVCSFACHVSCKDG 1070 1080 1090 1100 1110 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA06 QLQALHIGLDSSSIGSGPGDAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKK :. : ..:. : .... :. . .: ...: ...:: :: . :..: . : KIAA11 APQVCPIPPEQSK---RPLGVDVQRGIG-TAYKGHVKVPKPTGVKK-GWQRAYAVVCDCK 1120 1130 1140 1150 1160 1170 1230 1240 1250 1260 1270 KIAA06 ILFYDSEQDKEQSNPYM----VLDI-DKLFHVRPVTQTDVYRADAKEIPRIFQILYANEG ...:: . : ...: . :::. : : : : .:: .: ..:: ::.. . : KIAA11 LFLYDLPEGK-STQPGVIASQVLDLRDDEFSVSSVLASDVIHATRRDIPCIFRVTASLLG 1180 1190 1200 1210 1220 1230 1280 1290 1300 1310 1320 1330 KIAA06 ESKKEQEFPV--EPVGEKSNYICHKGHEFIPTLYHFPTNCEACMKPLWHMFKPPPALECR .: . . . : .::.... KIAA11 APSKTSSLLILTENENEKKKWVGILEGLQSILHKNRLRNQVVHVPLEAYDSSLPLIKAIL 1240 1250 1260 1270 1280 1290 >>KIAA0965 ( 489 res) hj06174s1 (489 aa) initn: 774 init1: 353 opt: 580 Z-score: 287.3 bits: 64.2 E(): 6.9e-11 Smith-Waterman score: 962; 40.470% identity (68.668% similar) in 383 aa overlap (114-457:97-470) 90 100 110 120 130 140 KIAA06 ESLLDGLNSLVLDLDFPALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAF : : ... .. .:.. .:::::::: KIAA09 RETRQKKLEVAMEEEGLADEEKKLRRSQHARKETEFLRLKRTRLGLDDFESLKVIGRGAF 70 80 90 100 110 120 150 160 170 180 190 200 KIAA06 GEVQLVRHKASQKVYAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDR :::.::..: . ..::::.: : .:... . : . ::::.. :.. :::..::.::: : KIAA09 GEVRLVQKKDTGHIYAMKILRKSDMLEKEQVAHIRAERDILVEADGAWVVKMFYSFQDKR 130 140 150 160 170 180 210 220 230 240 250 260 KIAA06 YLYMVMEYMPGGDLVNLMSNYD-VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLL ::..::..::::...:. . : . :. ..:: .:.:::.::::..:.::::.::::.:: KIAA09 NLYLIMEFLPGGDMMTLLMKKDTLTEEETQFYISETVLAIDAIHQLGFIHRDIKPDNLLL 190 200 210 220 230 240 270 280 KIAA06 DKHGHLKLADFGTCMKMDET-------GMVHCD--------------------------- : .::.::.::: : . .. ...: KIAA09 DAKGHVKLSDFGLCTGLKKAHRTEFYRNLTHNPPSDFSFQNMNSKRKAETWKKNRRQLAY 250 260 270 280 290 300 290 300 310 320 330 340 KIAA06 TAVGTPDYISPEVLKSQGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMD ..:::::::.:::. . : :.. :::::.::..::::.: :: ... :: :.:. KIAA09 STVGTPDYIAPEVFMQTG----YNKLCDWWSLGVIMYEMLIGYPPFCSETPQETYRKVMN 310 320 330 340 350 360 350 360 370 380 390 400 KIAA06 HKNSLCFPEDAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHPFFKNDQWHWDNIRETA :..: :: .. ::..::.:: : : : :.: .:::::. ::::.. . :..::: KIAA09 WKETLVFPPEVPISEKAKDLILRFCIDSENRIGNSGVEEIKGHPFFEGVD--WEHIRERP 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 KIAA06 APVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPKA----FVGNQLPFIGFTYYRENLLLSD : . :..: :.:::::. .. :. :.:.. . ... :...:: : KIAA09 AAIPIEIKSIDDTSNFDDFPES--DILQ-PVPNTTEPDYKSKDWVFLNYTYKRFEGLTQR 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 KIAA06 SPSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQKCKSVNTRLEKTAKEL KIAA09 GSIPTYMKAGKL 480 >>KIAA0204 ( 1164 res) ha02801 (1164 aa) initn: 252 init1: 149 opt: 507 Z-score: 250.7 bits: 58.6 E(): 7.5e-09 Smith-Waterman score: 643; 23.402% identity (55.896% similar) in 1111 aa overlap (127-1162:40-1092) 100 110 120 130 140 150 KIAA06 LDFPALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDY-DVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQ .. ::. ... .: ::::.: ...: .. KIAA02 GGKMSFFSFRKIFKLGSEKKKKQYEHVKRDLNPEDFWEIIGELGDGAFGKVYKAQNKETS 10 20 30 40 50 60 160 170 180 190 200 210 KIAA06 KVYAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGG . : :... . : . : ::.: . : .:.:. :: . :....:. :: KIAA02 VLAAAKVIDTKSEEELED---YMVEIDILASCDHPNIVKLLDAFYYENNLWILIEFCAGG 70 80 90 100 110 120 220 230 240 250 260 270 KIAA06 DLVNLMSNYDVP--EKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADF . .: . . : :. . ... ::. .:. .::::.: :.:. : .::::: KIAA02 AVDAVMLELERPLTESQIQVVCKQTLDALNYLHDNKIIHRDLKAGNILFTLDGDIKLADF 130 140 150 160 170 180 280 290 300 310 320 330 KIAA06 GTCMKMDETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKSQGG-DGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDT :. : .: . . :. .::: ...:::. . . : : . : ::.:. : :: . KIAA02 GVSAKNTRT-IQRRDSFIGTPYWMAPEVVMCETSKDRPYDYKADVWSLGITLIEMAEIEP 190 200 210 220 230 240 340 350 360 370 380 390 KIAA06 PFYADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPEDAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHP : . . . . :: . . . .. :.. :... : ...: .: . .. ::: KIAA02 PHHELNPMRVLLKIAKSEPPT-LAQPSRWSSNFKDFLKKCL-EKNVD-ARWTTSQLLQHP 250 260 270 280 290 300 400 410 420 430 440 450 KIAA06 FFKNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPKA-FVGNQLPFI : :. . ::: : . :.. ...... .: :.. . ..::: . ....: . KIAA02 FVTVDSNK--PIRELIAEAKAEVTEEVEDGKEEDEEEETEN--SLPIPASKRASSDLSIA 310 320 330 340 350 460 470 480 490 500 KIAA06 GFTYYR--ENLLLSDSPSC---REN--DSIQSRK-NEE--SQEIQKKLYTLEEHLSN-EM . . .: . .: : : : :...:. ::. ..: .: . ..::... .. KIAA02 SSEEDKLSQNACILESVSEKTERSNSEDKLNSKILNEKPTTDEPEKAVEDINEHITDAQL 360 370 380 390 400 410 510 520 530 540 550 KIAA06 QAKEELEQKCKSV--NTRLEKTAK-----ELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKNA .: ::... . : : :: : . :.. :. ...:. . : . . . : KIAA02 EAMTELHDRTAVIKENER-EKRPKLENLPDTEDQETV--DINSVSEGKENNIMITLETNI 420 430 440 450 460 470 560 570 580 590 600 KIAA06 EYQRKADHEAD--KKRNLENDVNSLKDQLED--LKKRNQNSQISTEKVNQLQRQLDETNA :.. :...: : :.. .:: . . .....: :. . :: . :: ..: .: . KIAA02 EHNLKSEEEKDQEKQQMFENKLIK-SEEIKDTILQTVDLVSQETGEKEANIQ-AVDSEVG 480 490 500 510 520 530 610 620 630 640 650 660 KIAA06 LLRTESDTAARLRKTQAESSKQIQQLESNNRDLQDKNCLLETAKLKLEKEFINLQSALES : :. :: .: .:..: ... ::. :. .: :.: . . .. .:: .. KIAA02 L--TKEDTQEKL----GEDDKTQKDVISNTSDVIG-TC--EAADVAQK---VDEDSAEDT 540 550 560 570 580 670 680 690 700 710 KIAA06 ERRDRTH----GSEIIND-LQGRICGLEEDLKNGKIL-LAKVELEKRQLQ-----ERFTD . : . :...:: . : : ... .:. . ..: : . : : . : KIAA02 QSNDGKEVVEVGQKLINKPMVGPEAGGTKEVPIKEIVEMNEIEEGKNKEQAINSSENIMD 590 600 610 620 630 640 720 730 740 750 760 770 KIAA06 LEKEKSNME---IDMTYQLKVIQQSLEQEEAEHKATKARLADKNKIYESIEEAKSEAMKE ...: .. : : . . . .. ....:: ... : .:. .:.. :.: KIAA02 INEEPGTTEGEEITESSSTEEMEVRSVVADTDQKALGSEVQDASKVTTQIDKEKKEIPVS 650 660 670 680 690 700 780 790 800 810 820 830 KIAA06 MEKKLLEERTLKQKVEN--LLLEAEKRCSLLDCDLKQSQQKINELLKQKDVLNEDVRNLT . :: : ...: .: .:. . . .. : .....:. : : . .: . .: KIAA02 I-KKEPEVTVVSQPTEPQPVLIPSIN----INSDSGENKEEIGSLSKTETILPPESEN-- 710 720 730 740 750 840 850 860 870 880 890 KIAA06 LKIEQETQKRCLTQNDLKMQTQQVNTLKMSEKQLKQENNHLMEMKMNLEKQNAELRKERQ .:... : . .. ..: :..: : ... . .. . ..:. :.: :. KIAA02 ---PKENDNDSGTGSTADTSSIDLN-LSISSFLSKTKDSGSISLQ-ETRRQKKTLKKTRK 760 770 780 790 800 900 910 920 930 KIAA06 -DADG------QMKELQDQLEAEQYFSTLYKTQVREL----KEECEEKTKLGKELQQ--- .:: : . :. . . : . ..::: ::: . . .:...::: KIAA02 FIVDGVEVSVTTSKIVTDSDSKTEELRFLRRQELRELRFLQKEEQRAQQQLNSKLQQQRE 810 820 830 840 850 860 940 950 960 970 980 KIAA06 ------------KKQELQDERDSLAAQLEITLTKADSEQLARSIAEEQYSDLEKEKIMKE ::.. ..: ..: : . :. . ..:. : : . :.:: ... KIAA02 QIFRRFEQEMMSKKRQYDQEIENLEKQQKQTIERLEQEHTNRLRDEAKRIKGEQEKELSK 870 880 890 900 910 920 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA06 LEIKEMMARHKQELTEKDATIASLEETNRTLTSDV----ANLAN-EKEELNNKLKDVQEQ .. .:. .:.: :.. . . .: . .: . . :.::: :.: :::: .: KIAA02 FQ--NMLKNRKKE--EQEFVQKQQQELDGSLKKIIQQQKAELANIERECLNNK-----QQ 930 940 950 960 970 980 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA06 LSRLKDEEISAAAIKAQFEKQLLTERTLKTQAVNKLAEIMNRKEPVKRGNDTDVRRKEKE : : .. : . ::. : .. :: : .:.:.. .:: .. .... .. KIAA02 LMRAREAAIWELEERHLQEKHQLLKQQLKDQY------FMQRHQLLKR-HEKETEQMQRY 990 1000 1010 1020 1030 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA06 NRKLHMELKSEREKLTQQMIKYQKELNEMQAQIAE-ESQIRIELQMTLDSKDSDIEQLRS :..: :::... . .. : :. .: ....: ....::. : :. . :.:. . KIAA02 NQRLIEELKNRQTQERARLPKIQR--SEAKTRMAMFKKSLRINSTATPDQDRDKIKQFAA 1040 1050 1060 1070 1080 1090 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA06 QLQALHIGLDSSSIGSGPGDAEADDGFPESRLEGWLSLPVRNNTKKFGWVKKYVIVSSKK : KIAA02 QEEKRQKNERMAQHQKHENQMRDLQLQCEANVRELHQLQNEKCHLLVEHETQKLKELDEE 1100 1110 1120 1130 1140 1150 >>KIAA0973 ( 1583 res) hj06871 (1583 aa) initn: 704 init1: 276 opt: 462 Z-score: 229.1 bits: 55.1 E(): 1.2e-07 Smith-Waterman score: 753; 38.272% identity (69.444% similar) in 324 aa overlap (131-437:386-701) 110 120 130 140 150 160 KIAA06 ALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKVYAM :.:..:.:. ::.: : ::::. ... .:: KIAA09 EQDSGGSNTPEQDDLSEGRSSKAKKPPGENDFDTIKLISNGAYGAVYLVRHRDTRQRFAM 360 370 380 390 400 410 170 180 190 200 210 220 KIAA06 KLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNL : ..: ..: :.. . ::::..::..:.:: .: .:. :.: :::::. ::: ..: KIAA09 KKINKQNLILRNQIQQAFVERDILTFAENPFVVGMFCSFETRRHLCMVMEYVEGGDCATL 420 430 440 450 460 470 230 240 250 260 270 KIAA06 MSNYD-VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTC--- ..: .: . :..: ::.::::. .:..:..:::.::::.:. . ::.::.::: KIAA09 LKNIGALPVEMARMYFAETVLALEYLHNYGIVHRDLKPDNLLITSMGHIKLTDFGLSKMG 480 490 500 510 520 530 280 290 300 310 320 KIAA06 -MKMDET---GMVHCDT-------AVGTPDYISPEVLKSQGGDGFYGRECDWWSVGVFLY :.. . : .. :. . :::.::.:::. :: ::. :::..:..:: KIAA09 LMSLTTNLYEGHIEKDAREFLDKQVCGTPEYIAPEVILRQG----YGKPVDWWAMGIILY 540 550 560 570 580 590 330 340 350 360 370 380 KIAA06 EMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPE-DAEISKHAKNLICAFL-TDREVRLGRN :.::: .::..:. ...... ... .:: : . .:. :: ..: :. :::: . KIAA09 EFLVGCVPFFGDTPEELFGQVIS--DDILWPEGDEALPTEAQLLISSLLQTNPLVRLGAG 600 610 620 630 640 390 400 410 420 430 440 KIAA06 GVEEIRQHPFFKNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPKAF :. :..:: ::.. : .. . : .:.: :. :.: :: : :... KIAA09 GAFEVKQHSFFRD--LDWTGLLRQKAEFIPHLESEDDTSYFDTRSDRYHHVNSYDEDDTT 650 660 670 680 690 700 450 460 470 480 490 500 KIAA06 VGNQLPFIGFTYYRENLLLSDSPSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQAK KIAA09 EEEPVEIRQFSSCSPRFSKVYSSMEQLSQHEPKTPVAAAGSSKREPSTKGPEEKVAGKRE 710 720 730 740 750 760 >>KIAA0807 ( 1329 res) hk04449(revised) (1329 aa) initn: 739 init1: 280 opt: 460 Z-score: 228.9 bits: 54.8 E(): 1.2e-07 Smith-Waterman score: 734; 38.019% identity (69.649% similar) in 313 aa overlap (130-425:41-345) 100 110 120 130 140 150 KIAA06 PALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKVYA ::....:.:. ::.: : :::::.... .: KIAA08 SSCDSPDTPETDDSIEGHGASLPSKKTPSEEDFETIKLISNGAYGAVFLVRHKSTRQRFA 20 30 40 50 60 70 160 170 180 190 200 210 KIAA06 MKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVN :: ..: ..: :.. . ::::..::..:.::..: .:. :.: :::::. ::: .. KIAA08 MKKINKQNLILRNQIQQAFVERDILTFAENPFVVSMFCSFDTKRHLCMVMEYVEGGDCAT 80 90 100 110 120 130 220 230 240 250 260 270 KIAA06 LMSNYD-VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTC-- :..: .: ...: ::.::::. .:..:..:::.::::.:. . ::.::.::: KIAA08 LLKNIGALPVDMVRLYFAETVLALEYLHNYGIVHRDLKPDNLLITSMGHIKLTDFGLSKM 140 150 160 170 180 190 280 290 300 310 320 KIAA06 --MKMDET---GMVHCDT-------AVGTPDYISPEVLKSQGGDGFYGRECDWWSVGVFL :.. . : .. :. . :::.::.:::. :: ::. :::..:..: KIAA08 GLMSLTTNLYEGHIEKDAREFLDKQVCGTPEYIAPEVILRQG----YGKPVDWWAMGIIL 200 210 220 230 240 330 340 350 360 370 380 KIAA06 YEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPE-DAEISKHAKNLICAFLTDREV-RLGR ::.::: .::..:. ...... . . .:: : . :..: .: . . ::: KIAA08 YEFLVGCVPFFGDTPEELFGQVIS--DEIVWPEGDEALPPDAQDLTSKLLHQNPLERLGT 250 260 270 280 290 300 390 400 410 420 430 440 KIAA06 NGVEEIRQHPFFKNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPKA ... :..::::: . : .. . : .:.: :. :.: :: KIAA08 GSAYEVKQHPFFTG--LDWTGLLRQKAEFIPQLESEDDTSYFDTRSERYHHMDSEDEEEV 310 320 330 340 350 360 450 460 470 480 490 500 KIAA06 FVGNQLPFIGFTYYRENLLLSDSPSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTLEEHLSNEMQA KIAA08 SEDGCLEIRQFSSCSPRFNKVYSSMERLSLLEERRTPPPTKRSLSEEKEDHSDGLAGLKG 370 380 390 400 410 420 >>KIAA0303 ( 2137 res) hg00009 (2137 aa) initn: 714 init1: 276 opt: 460 Z-score: 227.0 bits: 55.1 E(): 1.6e-07 Smith-Waterman score: 758; 30.962% identity (61.538% similar) in 520 aa overlap (128-607:80-587) 100 110 120 130 140 150 KIAA06 DFPALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKV . :....:.:. ::.: : .:::: :.. KIAA03 GNYDSGTAETPETDESVSSSNASLKLRRKPRESDFETIKLISNGAYGAVYFVRHKESRQR 50 60 70 80 90 100 160 170 180 190 200 210 KIAA06 YAMKLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDL .::: ..: ..: :.. . ::::..::..:.::... .:. :.: :::::. ::: KIAA03 FAMKKINKQNLILRNQIQQAFVERDILTFAENPFVVSMYCSFETRRHLCMVMEYVEGGDC 110 120 130 140 150 160 220 230 240 250 260 270 KIAA06 VNLMSNYD-VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTC ..::.:. .: :..: ::.::::. .:..:..:::.::::.:. . ::.::.::: KIAA03 ATLMKNMGPLPVDMARMYFAETVLALEYLHNYGIVHRDLKPDNLLVTSMGHIKLTDFGLS 170 180 190 200 210 220 280 290 300 310 320 KIAA06 ----MKMDET---GMVHCDT-------AVGTPDYISPEVLKSQGGDGFYGRECDWWSVGV :.: . : .. :. . :::.::.:::. :: ::. :::..:. KIAA03 KVGLMSMTTNLYEGHIEKDAREFLDKQVCGTPEYIAPEVILRQG----YGKPVDWWAMGI 230 240 250 260 270 280 330 340 350 360 370 380 KIAA06 FLYEMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPE-DAEISKHAKNLICAFLTDREV-RL .:::.::: .::..:. ...... . . .:: : :..:: .: . . :: KIAA03 ILYEFLVGCVPFFGDTPEELFGQVIS--DEINWPEKDEAPPPDAQDLITLLLRQNPLERL 290 300 310 320 330 340 390 400 410 420 KIAA06 GRNGVEEIRQHPFFKNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFD-----------DIED : .:. :..:: ::.. :... . : .:.: :. :.: :: . :: KIAA03 GTGGAYEVKQHRFFRS--LDWNSLLRQKAEFIPQLESEDDTSYFDTRSEKYHHMETEEED 350 360 370 380 390 400 430 440 450 460 470 480 KIAA06 DKGDVETFPIP-KAFVGNQLPFIGFTYYRENLLLSDSPSCRENDSIQSRKNEE--SQEI- : .: : : . . : . . : . .. . . ..: .: ::... :. : : KIAA03 DTND-EDFNVEIRQFSSCSHRF-SKVFSSIDRITQNSAEEKE-DSVDKTKSTTLPSTETL 410 420 430 440 450 490 500 510 520 530 540 KIAA06 -QKKLYTLEEHLSNEMQAKEELEQKCKSVNTRLEKTAKELEEEITLRKSVESALRQLERE .. :. ..::. .. : .. : . : : : : : : . .. . KIAA03 SWSSEYSEMQQLSTSNSSDTE-SNRHKLSSGLLPKLAISTEGEQDEAASCPGDPHEEPGK 460 470 480 490 500 510 550 560 570 580 590 KIAA06 KALLQHKNAEYQRKADHEADKKRNLENDVNSLKDQLEDLKKRNQ-------NSQISTEKV :: .. :. . .. :. . .:.:....:.... :.. .:. :.: . KIAA03 PALPPEECAQEEPEVTTPASTISSSTLSVGSFSEHLDQINGRSECVDSTDNSSKPSSEPA 520 530 540 550 560 570 600 610 620 630 640 650 KIAA06 NQLQRQLDETNALLRTESDTAARLRKTQAESSKQIQQLESNNRDLQDKNCLLETAKLKLE ... :: :. KIAA03 SHMARQRLESTEKKKISGKVTKSLSASALSLMIPGDMFAVSPLGSPMSPHSLSSDPSSSR 580 590 600 610 620 630 >>KIAA0561 ( 1308 res) hh01676 (1308 aa) initn: 668 init1: 269 opt: 453 Z-score: 225.7 bits: 54.2 E(): 1.9e-07 Smith-Waterman score: 742; 33.813% identity (63.789% similar) in 417 aa overlap (131-519:365-770) 110 120 130 140 150 160 KIAA06 ALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKVYAM :....:.:. ::.: : ::::. ... .:. KIAA05 SHLEEEQPPAPESPESRALVGQSRRKPCESDFETIKLISNGAYGAVYLVRHRDTRQRFAI 340 350 360 370 380 390 170 180 190 200 210 220 KIAA06 KLLSKFEMIKRSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVNL : ..: ..: :.. . ::::..::..:.::..: .:. :.: :::::. ::: ..: KIAA05 KKINKQNLILRNQIQQVFVERDILTFAENPFVVSMFCSFETRRHLCMVMEYVEGGDCATL 400 410 420 430 440 450 230 240 250 260 270 KIAA06 MSNYD-VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTC--- ..:. .: :..: ::.::::. .:..:..:::.::::.:. . ::.::.::: KIAA05 LKNMGPLPVDMARLYFAETVLALEYLHNYGIVHRDLKPDNLLITSLGHIKLTDFGLSKIG 460 470 480 490 500 510 280 290 300 310 320 KIAA06 -MKMDET---GMVHCDT-------AVGTPDYISPEVLKSQGGDGFYGRECDWWSVGVFLY :.: . : .. :. . :::.::.:::. :: ::. :::..:: :: KIAA05 LMSMATNLYEGHIEKDAREFIDKQVCGTPEYIAPEVIFRQG----YGKPVDWWAMGVVLY 520 530 540 550 560 570 330 340 350 360 370 380 KIAA06 EMLVGDTPFYADSLVGTYSKIMDHKNSLCFPE-DAEISKHAKNLICAFLTDREV-RLGRN :.::: .::..:. ...... . . .:: : . :..:: .: . . ::: . KIAA05 EFLVGCVPFFGDTPEELFGQVVS--DEIMWPEGDEALPADAQDLITRLLRQSPLDRLGTG 580 590 600 610 620 390 400 410 420 430 KIAA06 GVEEIRQHPFFKNDQWHWDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDD---------IEDDKGDV :..:..::::: : .. . : ::.: .. :.: :: :::. . KIAA05 GTHEVKQHPFFLA--LDWAGLLRHKAEFVPQLEAEDDTSYFDTRSERYRHLGSEDDETND 630 640 650 660 670 680 440 450 460 470 480 490 KIAA06 E--TFPIPKAFVGNQLPFIGFTYYRENLLLSDSPSCRENDSIQSRKNEESQEIQKKLYTL : . ::. : . . : : : .. .:. : . ..: ::. : .. : KIAA05 EESSTEIPQ-FSSCSHRFSKVYSSSEFLAVQPTPTFAERSFSEDR--EEGWERSEVDYGR 690 700 710 720 730 740 500 510 520 530 540 550 KIAA06 EEHLSNEMQAKEELEQKCKSVNTRLEKTAKELEEEITLRKSVESALRQLEREKALLQHKN . . .... ..:.: ... :. KIAA05 RLSADIRLRSWTSSGSSCQSSSSQPERGPSPSLLNTISLDTMPKFAFSSEDEGVGPGPAG 750 760 770 780 790 800 >>KIAA1765 ( 608 res) fj12188(revised) (608 aa) initn: 391 init1: 128 opt: 439 Z-score: 222.4 bits: 52.5 E(): 2.9e-07 Smith-Waterman score: 439; 30.462% identity (58.462% similar) in 325 aa overlap (87-395:265-574) 60 70 80 90 100 110 KIAA06 APGDGAGASRQRKLEALIRDPRSPINVESLLDGLNSLVLDLDFPA-LRKNKNIDNFLNRY ..: ..: : :: :.:. . :. KIAA17 WLLREHQAGFEKLRRTRGEEKEAEKEKKPCMSGGRRMTLRDDQPAKLEKEPKTRPEENKP 240 250 260 270 280 290 120 130 140 150 160 170 KIAA06 EKIV-KKIRGLQMKAED----YDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQKVYAMKLLSKFEMIK :. .: : . . : . :.. .::: : :. :. ::. ....::::...: .. KIAA17 ERPSGRKPRPMGIIAANVEKHYETGRVIGDGNFAVVKECRHRETRQAYAMKIIDKSRLKG 300 310 320 330 340 350 180 190 200 210 220 KIAA06 RSDSAFFWEERDIMAFANSPWVVQLFYAFQDDRYLYMVMEYMPGGDLVN-LMSNYDVPEK . : . : :. . : .:.: ... : .:...::. :::: . .. . :: KIAA17 KED--MVDSEILIIQSLSHPNIVKLHEVYETDMEIYLILEYVQGGDLFDAIIESVKFPEP 360 370 380 390 400 410 230 240 250 260 270 280 KIAA06 WAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLL----DKHGHLKLADFGTCMKMDETGMV : .. .. :: .:. ...:::.::.:.:. :: ::::::: .. . .. KIAA17 DAALMIMDLCKALVHMHDKSIVHRDLKPENLLVQRNEDKSTTLKLADFGLAKHVVRPIFT 420 430 440 450 460 470 290 300 310 320 330 340 KIAA06 HCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYA-----DSLV : ::: :..::.:. .: :: : : :..::.:: .: : :: . : : KIAA17 VC----GTPTYVAPEILSEKG----YGLEVDMWAAGVILYILLCGFPPFRSPERDQDELF 480 490 500 510 520 350 360 370 380 390 400 KIAA06 GTYSKIMDHKNSLCFPEDAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHPFFKNDQWH . . . : . : : .:: ::.:. .:. . : .... :::... KIAA17 NIIQ--LGHFEFLP-PYWDNISDAAKDLVSRLLVVDPKK--RYTAHQVLQHPWIETAGKT 530 540 550 560 570 410 420 430 440 450 460 KIAA06 WDNIRETAAPVVPELSSDIDSSNFDDIEDDKGDVETFPIPKAFVGNQLPFIGFTYYRENL KIAA17 NTVKRQKQVSPSSEGHFRSQHKRVVEQVS 580 590 600 >>KIAA1860 ( 689 res) fh18358 (689 aa) initn: 331 init1: 131 opt: 440 Z-score: 222.3 bits: 52.6 E(): 2.9e-07 Smith-Waterman score: 440; 29.553% identity (60.825% similar) in 291 aa overlap (126-405:54-335) 100 110 120 130 140 150 KIAA06 DLDFPALRKNKNIDNFLNRYEKIVKKIRGLQMKAEDYDVVKVIGRGAFGEVQLVRHKASQ : .. .: ....::.: :..:.:.:: . 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KIAA01 IMDKNTL--GSDLPRIKTEIEALKNLRHQHICQLYHVLETANKIFMVLEYCPGGELFDYI 50 60 70 80 90 100 230 240 250 260 270 280 KIAA06 SNYD-VPEKWAKFYTAEVVLALDAIHSMGLIHRDVKPDNMLLDKHGHLKLADFGTCMKMD . : . :. .. ..: :. .::.: :::.::.:.:.:.. .::: ::: : : KIAA01 ISQDRLSEEETRVVFRQIVSAVAYVHSQGYAHRDLKPENLLFDEYHKLKLIDFGLCAKPK 110 120 130 140 150 160 290 300 310 320 330 340 KIAA06 ETGMVHCDTAVGTPDYISPEVLKSQGGDGFYGRECDWWSVGVFLYEMLVGDTPFYADSLV . : .: :. : .::... : .. : : : ::.:..:: .. : :: :... KIAA01 GNKDYHLQTCCGSLAYAAPELIQ---GKSYLGSEADVWSMGILLYVLMCGFLPFDDDNVM 170 180 190 200 210 220 350 360 370 380 390 400 KIAA06 GTYSKIMDHKNSLCFPEDAEISKHAKNLICAFLTDREVRLGRNGVEEIRQHPFFKNDQWH . :.::: : KIAA01 ALYKKIMRGKYDVPKWLSPSSILLLQQMLQVDPKKRISMKNLLNHPWIMQDYNYPVEWQS 230 240 250 260 270 280 1428 residues in 1 query sequences 1986077 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:09:26 2008 done: Thu Dec 18 15:09:27 2008 Total Scan time: 0.800 Total Display time: 0.470 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]