# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg03238a.fasta.huge -Q ../query/KIAA0605.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0605, 1031 aa vs ./tmplib.23663 library 1986474 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2158+/-0.00551; mu= 22.8411+/- 0.375 mean_var=116.9330+/-28.164, 0's: 0 Z-trim: 15 B-trim: 7 in 1/39 Lambda= 0.118606 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA2029 ( 1021 res) pj01256 (1021) 685 129.1 2.9e-30 KIAA0366 ( 1201 res) hh00124 (1201) 579 111.1 8.9e-25 KIAA0688 ( 849 res) hk03410 ( 849) 535 103.3 1.4e-22 KIAA1346 ( 999 res) fj00671 ( 999) 532 102.9 2.1e-22 KIAA1233 ( 1023 res) fh08611 (1023) 513 99.7 2.1e-21 KIAA0762 ( 724 res) hk04668s1 ( 724) 337 69.3 2e-12 KIAA0960 ( 1502 res) hj05779s1 (1502) 315 66.1 4e-11 KIAA1312 ( 1471 res) fh11767 (1471) 261 56.9 2.4e-08 KIAA1679 ( 1536 res) fh22954 (1536) 238 53.0 3.7e-07 KIAA2036 ( 1322 res) pf06513 (1322) 200 46.3 3.1e-05 KIAA1445 ( 1202 res) fg03469b (1202) 188 44.2 0.00012 >>KIAA2029 ( 1021 res) pj01256 (1021 aa) initn: 1160 init1: 303 opt: 685 Z-score: 635.3 bits: 129.1 E(): 2.9e-30 Smith-Waterman score: 914; 24.973% identity (43.087% similar) in 933 aa overlap (122-1026:378-1016) 100 110 120 130 140 150 KIAA06 WFLLVLAVVAGDTVSTGSTDNSPTSNSLEGGTDATAFWWGEWTKWTAFSRSCGGGVTSQE : : :..:..:. ::.:::::. . 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KIAA20 -------------------------------------------PS--------------- 630 640 650 660 670 680 KIAA06 ARTRPKARKQGVSPADMYRWKLSSHEPCSATCTTGVMSAYAMCVRYDGVEVDDSYCDALT : : . : ::..: : :.. : : .:. :.:. : KIAA20 -----------------YTWAIVRSE-CSVSCGGGQMTVREGCYRDLKFQVNMSFCNPKT 670 680 690 700 710 690 700 710 720 730 740 KIAA06 RPEPVHEFCAGRECQPRWETSSWSECSRTCGEGYQFRVVRCWKMLSPGFDSSVYSDLCEA :: : : : : ...:: :::::: : : : :.: . . .:: KIAA20 RPVTGLVPCKVSACPPSWSVGNWSACSRTCGGGAQSRPVQCTRRVH--YDS--------- 720 730 740 750 750 760 770 780 790 800 KIAA06 AEAVRPEERKTCRNPACGPQWEMSEWSECTAKCGERSVVTRDIRCSEDEKLCDPNTRPVG : : :: .:: :. : . 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KIAA20 MHEACLLQRCHKPKKLQWLVSAWSQCSVTCERGTQKRFLKCAEKYVSGKYRELASKKCSH 840 850 860 870 880 890 920 930 940 950 960 KIAA06 AKKPPEE--STCFERPCFK-------------WYTSPWSECTKTCGVGVRMRDVKCYQGT :: : .: :: . :..::::.:: .:: ::. :.:.: : KIAA20 LPKPSLELERACAPLPCPRHPPFAAAGPSRGSWFASPWSQCTASCGGGVQTRSVQCLAGG 900 910 920 930 940 950 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA06 DIVRGCDPLVKPVGRQACDLQPCP-TEPPDDSCQDQPGTNCALAIKVNLCGHWYYSKACC . :: :: . ::. . :: .: : :.: : :. . ..:.: .:.: :: KIAA20 RPASGCLLHQKPSASLACNTHFCPIAEKKDAFCKDYFHW-CYLVPQHGMCSHKFYGKQCC 960 970 980 990 1000 1010 1030 KIAA06 RSCRPPHS ..: KIAA20 KTCSKSNL 1020 >>KIAA0366 ( 1201 res) hh00124 (1201 aa) initn: 724 init1: 275 opt: 579 Z-score: 536.7 bits: 111.1 E(): 8.9e-25 Smith-Waterman score: 616; 25.138% identity (42.265% similar) in 724 aa overlap (130-845:550-1025) 100 110 120 130 140 150 KIAA06 VAGDTVSTGSTDNSPTSNSLEGGTDATAFWWGEWTKWTAFSRSCGGGVTSQERHCLQQRR :: :::. . ::.:: :: . :.: KIAA03 LDGTECAAGKWCYKGHCMWKNANQQKQDGNWGSWTKFGSCSRTCGTGVRFRTRQC----N 520 530 540 550 560 570 160 170 180 190 200 210 KIAA06 KSVPGPGNRTCTGTSKRYQLCRVQECPPDGRSFREEQCVSFNSHV-YNGRTHQWKPL-YP . .: :.. : :.. .:::: ..:: ..:: .:: . ::: :.. :.: : .: KIAA03 NPMPINGGQDCPGVNFEYQLCNTEECQKHFEDFRAQQCQQRNSHFEYQNTKHHWLPYEHP 580 590 600 610 620 630 220 230 240 250 260 270 KIAA06 DDYVHISSKPCDLHCTTVD-GQRQLMVP-ARDGTSCKLTDLRGVCVSGKCEPIGCDGVLF : .: : :.: . . :. : ..::: :. : ..:: :.: .::: . KIAA03 D-----PKKRCHLYCQSKETGDVAYMKQLVHDGTHCSYKDPYSICVRGECVKVGCDKEIG 640 650 660 670 680 690 280 290 300 310 320 330 KIAA06 STHTLDKCGICQGDGSSCTHVTGNYRKGNAHLGYSLVTHIPAGARDIQIVERKKSADVLA :... ::::.: ::.: : : :.. . .::: . :: ::: . : : . : .:: KIAA03 SNKVEDKCGVCGGDNSHCRTVKGTFTRTPRKLGYLKMFDIPPGARHVLIQEDEASPHILA 700 710 720 730 740 750 340 350 360 370 380 390 KIAA06 LADEA-GYYFFNGNYKVDSPKNFNIAGTVVKYRRPMDVYETGIEYIVAQGPTNQGLNVMV . ..: :.:..::. : .: : .:. :.: KIAA03 IKNQATGHYILNGK------------GEEAKSRTFIDL---GVE---------------- 760 770 400 410 420 430 440 450 KIAA06 WNQNGKSPSITFEYTLLQPPHESRPQPIYYGFSESAESQGLDGAGLMGFIPHNGSLYGQA :. :.. .. :: :: KIAA03 WD---------------------------YNIEDDIESLHTDG----------------- 780 790 460 470 480 490 500 510 KIAA06 SSERLGLDNRLFGHPGLDMELGPSQGQETNEVCEQAGGGACEGPPRGKGFRDRNVTGTPL :: KIAA03 ----------------------------------------------------------PL 520 530 540 550 560 570 KIAA06 TGDKDDEEVDTHFASQEFFSANAISDQLLGAGSDLKDFTLNETVNSIFAQGAPRSSLAES . : . . :: :.: ::::. . KIAA03 -----HDPVIVLIIPQE-----------------------NDT----------RSSLTYK 800 810 580 590 600 610 620 630 KIAA06 FFVDYEENEGAGPYLLNGSYLELSSDRVANSSSEAPFPNVSTSLLTSAGNRTHKARTRPK ... .: . : . ::. :: : KIAA03 YII----HEDSVPTI--------------NSN------NVIQEEL--------------- 820 830 840 640 650 660 670 680 690 KIAA06 ARKQGVSPADMYRWKLSSHEPCSATCTTGVMSAYAMCVRY-DGVEVDDSYCDALTRPEPV : ..: :.: : : : . . : : :. : :.:.: .:.:. KIAA03 ---------DTFEWALKSWSQVSKPCGGGFQYTKYGCRRKSDNKMVHRSFCEANKKPKPI 850 860 870 880 890 700 710 720 730 740 750 KIAA06 HEFCAGREC-QPRWETSSWSECSRTCGE-GYQFRVVRCWKMLSPGFDSSVYSDLCEAAEA ...: .:: .: : . : .:..::: :::.:.::: . : : . ::.: : . KIAA03 RRMCNIQECTHPLWVAEEWEHCTKTCGSSGYQLRTVRCLQPLLDGTNRSVHSKYCMGD-- 900 910 920 930 940 760 770 780 790 800 810 KIAA06 VRPEERKTCRNPACGPQWEMSEWSECTAKCGERSVVTRDIRCSEDEKLCDPNTRPVGEKN ::: :. : : ::. . ::::.. ::: . : :.. : .. :: . .: . . KIAA03 -RPESRRPCNRVPCPAQWKTGPWSECSVTCGEGTEV-RQVLCRAGDH-CD-GEKPESVRA 950 960 970 980 990 1000 820 830 840 850 860 870 KIAA06 CTGPPCDRQWTVSDWGPCSGSCGQGRTIRHVYCKTSDGRVVPESQCQMETKPLAIHPCGD : :::. . :: :. . ..:. 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KIAA06 DRIIGSKKKFDKCMVCGGDGSGCSKQSGSFRK--FRYGYNNVVTIPAGATHILVRQQGNP 680 690 700 710 720 730 340 350 360 370 380 KIAA06 AD---VLALADEAGYYFFNGNYKV-DSPKNFNIAGTV-VKYRRPMDVYETGIEYIVAQGP . ::: : : .::.: . :: . . :.: ..: . :: . ..:: KIAA06 GHRSIYLALKLPDGSYALNGEYTLMPSPTDVVLPGAVSLRYSGATAASET----LSGHGP 740 750 760 770 780 390 400 410 420 430 440 KIAA06 TNQGLNVMVWNQNGKSPSITFEYTLLQP-PHESRPQPIYYGFSESAESQGLDGAGLMGFI : :...: :. . ..:... : : : :.: KIAA06 LAQPLTLQVLVA-GNPQDTRLRYSFFVPRPTPSTPRPTPQDWLHRRAQILEILRRRPWAG 790 800 810 820 830 840 450 460 470 480 490 500 KIAA06 PHNGSLYGQASSERLGLDNRLFGHPGLDMELGPSQGQETNEVCEQAGGGACEGPPRGKGF KIAA06 RK >>KIAA1346 ( 999 res) fj00671 (999 aa) initn: 424 init1: 174 opt: 532 Z-score: 493.9 bits: 102.9 E(): 2.1e-22 Smith-Waterman score: 541; 29.863% identity (56.164% similar) in 365 aa overlap (68-417:548-880) 40 50 60 70 80 90 KIAA06 QLVPDNLEAWALAGPRGLFPKRTLVIWKRIGAGLVVTVALLPRMDGRWQCSCWAWFLLVL :. :: . .: :: .:. : KIAA13 RQCQFTFGEDSKHCPDAASTCSTLWCTGTSGGVLVCQTKHFPWADGT-SCGEGKW----- 520 530 540 550 560 570 100 110 120 130 140 150 KIAA06 AVVAGDTVSTGSTDNSPTSNSLEGGTDATAFWWGEWTKWTAFSRSCGGGVTSQERHCLQQ . : :. .:: . .. ..:. :: : : ::.::::: :.: KIAA13 -CINGKCVN--KTDRKHFDTPFHGS-------WGMWGPWGDCSRTCGGGVQYTMREC--- 580 590 600 610 160 170 180 190 200 210 KIAA06 RRKSVPGPGNRTCTGTSKRYQLCRVQECPPD-GRSFREEQCVSFN----SHVYNGRTHQW . :: :.. : : ::. : ...:: . :..:::::: . : . .: . .: KIAA13 -DNPVPKNGGKYCEGKRVRYRSCNLEDCPDNNGKTFREEQCEAHNEFSKASFGSGPAVEW 620 630 640 650 660 670 220 230 240 250 260 KIAA06 KPLYPDDYVHISSKP-CDLHCTTVD-GQRQLMVP-ARDGTSCKLTDLRGVCVSGKCEPIG : :. .: : : : : . : .. : . ::: :. : .:::.:.: : KIAA13 IP----KYAGVSPKDRCKLICQAKGIGYFFVLQPKVVDGTPCS-PDSTSVCVQGQCVKAG 680 690 700 710 720 730 270 280 290 300 310 320 KIAA06 CDGVLFSTHTLDKCGICQGDGSSCTHVTGNYRKGNAHLGYSLVTHIPAGARDIQIVER-- :: .. : . .::::.: :.::.: ...:. .:. :: . ::.:: .:.. .: KIAA13 CDRIIDSKKKFDKCGVCGGNGSTCKKISGSVT--SAKPGYHDIITIPTGATNIEVKQRNQ 740 750 760 770 780 790 330 340 350 360 370 380 KIAA06 ---KKSADVLALADEAGYYFFNGNYKVDS-PKNFNIAGTVVKYRRPMDVYETGIEYIVAQ ..... ::. : :..::.: ... ... :.:..: ...: : . KIAA13 RGSRNNGSFLAIKAADGTYILNGDYTLSTLEQDIMYKGVVLRYSGS----SAALERIRSF 800 810 820 830 840 390 400 410 420 430 440 KIAA06 GPTNQGLNVMVWN-QNGKSPSITFEYTLLQPPHESRPQPIYYGFSESAESQGLDGAGLMG .: .. :...: . :. :.: . : ... .:: KIAA13 SPLKEPLTIQVLTVGNALRPKIKYTY-FVKKKKESFNAIPTFSAWVIEEWGECSKSCELG 850 860 870 880 890 900 450 460 470 480 490 500 KIAA06 FIPHNGSLYGQASSERLGLDNRLFGHPGLDMELGPSQGQETNEVCEQAGGGACEGPPRGK KIAA13 WQRRLVECRDINGQPASECAKEVKPASTRPCADHPCPQWQLGEWSSCSKTCGKGYKKRSL 910 920 930 940 950 960 >>KIAA1233 ( 1023 res) fh08611 (1023 aa) initn: 697 init1: 225 opt: 513 Z-score: 476.3 bits: 99.7 E(): 2.1e-21 Smith-Waterman score: 514; 32.734% identity (53.957% similar) in 278 aa overlap (639-893:751-1023) 610 620 630 640 650 660 KIAA06 APFPNVSTSLLTSAGNRTHKARTRPKARKQGVSPADMYRWKLSSHEPCSATCT-TGVMSA : : . :. .. ::::: :. KIAA12 WPESRIVFLQGHKKYILQATNTRTNSNDPTGEPPPQEPFWEPGNWSHCSATCGHLGARIQ 730 740 750 760 770 780 670 680 690 700 710 720 KIAA06 YAMCVRYDGVEVDDSYCDALTRPEPVHEFCAGRECQPRWETSSWSECSRTCGEGYQFRVV .:: .: ::... :: : .: : : :.: :: :: ::.:: .:::::. : : KIAA12 RPQCVMANGQEVSEALCDHLQKPLAGFEPCNIRDCPARWFTSVWSQCSVSCGEGYHSRQV 790 800 810 820 830 840 730 740 750 760 770 780 KIAA06 RCWKMLSPGFDSSVYSDLCEAAEAVRPEERKTCRNPACGPQWEMSEWSECTAKCGERSVV : . . : . : : : :: :: : . : ::: . ..: ..: :.: KIAA12 TCKRTKANGTVQVVSPRAC--APKDRPLGRKPCFGHPC-VQWEPG--NRCPGRCMGRAVR 850 860 870 880 890 790 800 810 820 830 840 KIAA06 T--RDIRCSED--EKLCDPNTRPVGEKNCTGPPCDRQWTVSDWGPCSGSCGQGRTIRHVY : :... .. :: ::. ..:::. :: : .. : ::...::.: :.: KIAA12 MQQRHTACQHNSSDSNCDDRKRPTLRRNCTSGACDVCWHTGPWKPCTAACGRGFQSRKVD 900 910 920 930 940 950 850 860 870 880 KIAA06 C-KTSDGRVVPESQCQMETKPLAIHPC-G---DKNCP--AHW-----------LAQDWER : .: . . : . .: .. ::.. . : : :..: .:. : . .: KIAA12 CIHTRSCKPVAKRHCVQKKKPISWRHCLGPSCDRDCTDTTHYCMFVKHLNLCSLDRYKQR 960 970 980 990 1000 1010 890 900 910 920 930 940 KIAA06 CNTTCGRGVKKRLVLCMELANGKPQTRSGPECGLAKKPPEESTCFERPCFKWYTSPWSEC : .: .: KIAA12 CCQSCQEG 1020 >>KIAA0762 ( 724 res) hk04668s1 (724 aa) initn: 337 init1: 128 opt: 337 Z-score: 314.9 bits: 69.3 E(): 2e-12 Smith-Waterman score: 360; 28.529% identity (48.824% similar) in 340 aa overlap (679-991:339-641) 650 660 670 680 690 700 KIAA06 KLSSHEPCSATCTTGVMSAYAMCVRYDGVEVDDSYCDALTRPEPVHEFCAGREC-QPRWE ::: : :: : . . : : KIAA07 PEGGSITQVARVVIERIARKGEQCNIVPDNVDDIVAD--LAPEEKDEDDTPETCIYSNW- 310 320 330 340 350 360 710 720 730 740 750 760 KIAA06 TSSWSECSR-TCGEGYQFRVVRCWKMLSPGFDSSVYSDLCEAAEAVRPEERKTCRNPAC- : :: :: :: .: ..: .::. .: :: : .. .: : .:.: KIAA07 -SPWSACSSSTCDKGKRMR----QRMLKAQLDLSVP---CPDTQDFQP-----CMGPGCS 370 380 390 400 410 770 780 790 800 810 KIAA06 ---GPQWEMSEW---SECTAKCGE--RSVVTRDIRCSEDEKLCDPNTRPVGE----KNCT : :::: : :. .:: :: . :: ..: :. . . ..:. KIAA07 DEDGSTCTMSEWITWSPCSISCGMGMRSRERYVKQFPEDGSVCTLPTEETEKCTVNEECS 420 430 440 450 460 470 820 830 840 850 860 KIAA06 GPPCD-RQWTVSDWGPCSGSCGQGRTIRHVYCKTS--DGRVVPESQCQMETKPLA--IHP : .: ..: ::..::.: :: . : . :: :.:. ::. . : KIAA07 PSSCLMTEW--GEWDECSATCGMGMKKRHRMIKMNPADG-----SMCKAETSQAEKCMMP 480 490 500 510 520 870 880 890 900 910 920 KIAA06 -CGDKNCP-AHWLAQDWERCNTTCGRGVK--KRLVLCM-ELANGKPQTRSGPECGLAKKP : : . : ..: :..:::.:.. .:.. . ::.. . . .. .: : . : KIAA07 ECHTIPCLLSPW--SEWSDCSVTCGKGMRTRQRMLKSLAELGDCNEDLEQVEKCMLPECP 530 540 550 560 570 580 930 940 950 960 970 980 KIAA06 PEESTCFERPCFKWYTSPWSECTKTCGVG--VRMRDVKCYQGTDIVRGCDPLVKPVGRQA . : .: : ::::.:.:: : .: : .. . : : . : :. KIAA07 ID---C---ELTEW--SQWSECNKSCGKGHVIRTRMIQ----MEPQFGGAPCPETVQRKK 590 600 610 620 630 990 1000 1010 1020 1030 KIAA06 CDLQPCPTEPPDDSCQDQPGTNCALAIKVNLCGHWYYSKACCRSCRPPHS : .. : .: KIAA07 CRIRKCLRNPSIQKLRWREARESRRSEQLKEESEGEQFPGCRMRPWTAWSECTKLCGGGI 640 650 660 670 680 690 >>KIAA0960 ( 1502 res) hj05779s1 (1502 aa) initn: 275 init1: 114 opt: 315 Z-score: 291.7 bits: 66.1 E(): 4e-11 Smith-Waterman score: 444; 27.273% identity (50.689% similar) in 363 aa overlap (660-987:839-1185) 630 640 650 660 670 680 KIAA06 RTRPKARKQGVSPADMYRWKLSSHEPCSATCTTGVMSAYAMCVRYDGVEVDDSYCDALTR : : : .: :. : :.. KIAA09 QPVGNWSDCILPEGKVEVLLGMKVQGDIKECGQGYRYQAMACYDQNGRLVETSRCNSHGY 810 820 830 840 850 860 690 700 710 720 730 740 KIAA06 PEPVHEFCAGRECQ-PRWETSSWSECSRTCGEGYQFRVVRCWKMLSPGFDSSVYSDLCEA : . . .:. .: :.::.::..:: : . : : .: .... . KIAA09 IEEACIIPCPSDCKLSEW--SNWSRCSKSCGSGVKVR--SKWLREKP-YNGGRPCPKLDH 870 880 890 900 910 920 750 760 770 780 790 KIAA06 AEAVRPEERKTCRNPACGPQWEMSEWSECTA-------KCGERSVVTRDIRC-------- .. .. : :.. : :: : . .::: .: :: .:: KIAA09 VNQAQVYEVVPCHSDCNQYLWVTEPWSICKVTFVNMRENCGE-GVQTRKVRCMQNTADGP 930 940 950 960 970 980 800 810 820 830 840 KIAA06 SE--DEKLCDPNTRPVGEKNCTGPPCDRQWTVSDWGP---CSGSCGQGRTIRHVYCKTSD :: .. ::::. :.: . : : : .. ..:.::: : :.:. ..:. ...: KIAA09 SEHVEDYLCDPEEMPLGSRVCKLP-CPEDCVISEWGPWTQCVLPCNQS-SFRQ---RSAD 990 1000 1010 1020 1030 850 860 870 880 890 900 KIAA06 GRVVPESQCQMETKPLAIHPCG-DKNCPAH-WLAQDWERCNTT----CGRGVKKRLVLCM : .. . . . .::. .::: . . . :: :. . :: :.: :.. :. KIAA09 PIRQPADEGRSCPNAVEKEPCNLNKNCYHYDYNVTDWSTCQLSEKAVCGNGIKTRMLDCV 1040 1050 1060 1070 1080 1090 910 920 930 940 950 KIAA06 ELANGKP-QTRSGPECGLAKKPPEESTCF-ERP--CFKWYTSPWSECTKTCGVG---VRM . ..:: . . :: :. ...:. : : : ::::::..:::. .: KIAA09 R-SDGKSVDLKYCEALGLEKNWQMNTSCMVECPVNCQLSDWSPWSECSQTCGLTGKMIRR 1100 1110 1120 1130 1140 1150 960 970 980 990 1000 1010 KIAA06 RDV-KCYQGTDIVRGCDPLVKPVGRQACDLQPCPTEPPDDSCQDQPGTNCALAIKVNLCG : : . .:: : : :. . : ..:: KIAA09 RTVTQPFQGDG--RPCPSLMDQ--SKPCPVKPCYRWQYGQWSPCQVQEAQCGEGTRTRNI 1160 1170 1180 1190 1200 1210 1020 1030 KIAA06 HWYYSKACCRSCRPPHS KIAA09 SCVVSDGSADDFSKVVDEEFCADIELIIDGNKNMVLEESCSQPCPGDCYLKDWSSWSLCQ 1220 1230 1240 1250 1260 1270 >>KIAA1312 ( 1471 res) fh11767 (1471 aa) initn: 611 init1: 188 opt: 261 Z-score: 241.8 bits: 56.9 E(): 2.4e-08 Smith-Waterman score: 1173; 27.979% identity (51.606% similar) in 965 aa overlap (130-1014:433-1300) 100 110 120 130 140 150 KIAA06 VAGDTVSTGSTDNSPTSNSLEGGTDATAFWWGEWTKWTAFSRSCGGGVTSQERHCLQQRR :: :. . . ::.::::. . :.: KIAA13 ADGTECEPGKHCKYGFCVPKEMDVPVTDGSWGSWSPFGTCSRTCGGGIKTAIREC----N 410 420 430 440 450 160 170 180 190 200 210 KIAA06 KSVPGPGNRTCTGTSKRYQLCRVQECPPDGRSFREEQCVSFNSHVYN--GRTH--QWKPL . : :.. :.: ... : .. : . :.::.:::. :... .: : .: : KIAA13 RPEPKNGGKYCVGRRMKFKSCNTEPCLKQKRDFRDEQCAHFDGKHFNINGLLPNVRWVPK 460 470 480 490 500 510 220 230 240 250 260 270 KIAA06 YPDDYVHISSKPCDLHCTTVDGQRQLMVPAR--DGTSCKLTDLRGVCVSGKCEPIGCDGV : . .... : : : .. . .. : ::: : : .::.: :. ::: : KIAA13 YSG--ILMKDR-CKLFCRVAGNTAYYQLRDRVIDGTPCG-QDTNDICVQGLCRQAGCDHV 520 530 540 550 560 570 280 290 300 310 320 330 KIAA06 LFSTHTLDKCGICQGDGSSCTHVTGNYRKGNAHLGYSLVTHIPAGARDIQIVERKKSADV : : ::::.: ::.::: :.:.. ...: ::. :..::::: .:.. ... :... KIAA13 LNSKARRDKCGVCGGDNSSCKTVAGTF--NTVHYGYNTVVRIPAGATNIDVRQHSFSGET 580 590 600 610 620 630 340 350 360 370 380 KIAA06 -----LALADEAGYYFFNGNYKVDSPK-NFNIAGTVVKYRRPMDVYETGIEYIVAQGPTN :::.. : ...:::. : : .. :...::.: ::..: : . . KIAA13 DDDNYLALSSSKGEFLLNGNFVVTMAKREIRIGNAVVEYSGS----ETAVERINSTDRIE 640 650 660 670 680 390 400 410 420 430 440 KIAA06 QGLNVMVWNQNGK--SPSITFEYTLLQPPHESRPQPIYYGFSESAESQGLDGAGLMGFIP : : ..: . :: .:.. . ... : :..:: .:.. :.: : KIAA13 QELLLQVLSV-GKLYNPDVRYSFNI---PIEDKPQQFYWN------SHG----------P 690 700 710 720 450 460 470 480 490 500 KIAA06 HNGSLYGQASSERLGLDNRLFGHPGLDMELGPSQGQETNE-VCEQAGGGACEGPPRGKGF :: :. : ::.. . :: . . . : . KIAA13 W------QACSK-------------------PCQGERKRKLVCTRESDQLTVSDQRCDRL 730 740 750 760 510 520 530 540 550 KIAA06 RDRNVTGTPLTGDKDDEEVDTHFASQEFFSANA-----ISDQLLGAGSDLKDFTLNETVN . . : : : . : ::. ::. : . : : : : :. KIAA13 PQPGHITEPCGTDCD---LRWHVASRSECSAQCGLGYRTLDIYCAKYSRLDGKT--EKVD 770 780 790 800 810 560 570 580 590 600 610 KIAA06 SIFAQGAPRSSLAESFFVDYEENEGAGPYLLNGSYLELSSDRVANSSSE-APFPNVSTSL . : .. :. : :. . : : :. : ... : :.. .... . : :. ... KIAA13 DGFCSSHPKPSNREK--CSGECNTGGWRY---SAWTECSKSCDGGTQRRRAICVNTRNDV 820 830 840 850 860 870 620 630 640 650 660 670 KIAA06 LTSAGNRTHKARTRPKARKQGVSPADMYRWKLSSHEPCSATCTTGVMSAYAMCVRYDGVE : .. ::. :. : : .:: .. : .:: : . : .. . KIAA13 LDDSKC-THQ----EKVTIQRCSEFPCPQWKSGDWSECLVTCGKGHKHRQVWC-QFGEDR 880 890 900 910 920 680 690 700 710 720 730 KIAA06 VDDSYCDALTRPEPVHEFCAGRECQPRWETSSWSECSRTCGEGYQFRVVRCWKMLSPGFD ..: .:: :.: . . : :: :... :..:: :::.:::.:.:.: . . KIAA13 LNDRMCDPETKPTSM-QTCQQPECAS-WQAGPWGQCSVTCGQGYQLRAVKC---IIGTYM 930 940 950 960 970 980 740 750 760 770 780 KIAA06 SSVYSDLCEAAEAVRPEERKTCRNPACGP-----------------QWEMSEWSECTAKC : : .. :.: :.:: . . :. :.: : ::... :. :.: : KIAA13 SVVDDNDCNA--ATRPTDTQDCELPSCHPPPAAPETRRSTYSAPRTQWRFGSWTPCSATC 990 1000 1010 1020 1030 1040 790 800 810 820 830 KIAA06 GE----RSVVTRDIRCS-EDEKLCDPNTRPVGEKNCTGPPCDRQWTVSDWGPCSGSCGQG :. : : :: : ::. : :::....:. :: :: . ::. :: .:::: KIAA13 GKGTRMRYVSCRDENGSVADESACATLPRPVAKEECSVTPCG-QWKALDWSSCSVTCGQG 1050 1060 1070 1080 1090 840 850 860 870 KIAA06 RTIRHVYCKTSDGRVVPESQCQMETKPLAIHPCGDKNCPA-------------------- :. :.:.: . . .:. .:.:... : . . :. . :: KIAA13 RATRQVMCVNYSDHVIDRSECDQDYIPETDQDCSMSPCPQRTPDSGLAQHPFQNEDYRPR 1100 1110 1120 1130 1140 1150 880 890 900 910 920 KIAA06 -------------HWLAQDWERCNTTCGRGVKKRLVLCMELANGKPQTRSGPECGLAKKP .: . : :..::. : ..:.:.:.. :: .. .: :: KIAA13 SASPSRTHVLGGNQWRTGPWGACSSTCAGGSQRRVVVCQD-ENG----YTANDCVERIKP 1160 1170 1180 1190 1200 1210 930 940 950 960 970 KIAA06 PEESTCFERPCFKWYTSPWSECTKTCGVGVRMRDVKCYQGTDIVR----GCDPLVKPVGR :. .: :: .: . :.:::: :: :.: : : : : .. : .:. : :: : KIAA13 DEQRACESGPCPQWAYGNWGECTKLCGGGIRTRLVVC-QRSNGERFPDLSCEILDKPPDR 1220 1230 1240 1250 1260 1270 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA06 QACDLQPCPTEPPDDSCQDQPGTNCALAIKVNLCGHWYYSKACCRSCRPPHS . :. . :: : . . : ..:... :: KIAA13 EQCNTHACPH---DAAWSTGPWSSCSVS-----CGRGHKQRNVYCMAKDGSHLESDYCKH 1280 1290 1300 1310 1320 KIAA13 LAKPHGHRKCRGGRCPKWKAGAWSQCSVSCGRGVQQRHVGCQIGTHKIARETECNPYTRP 1330 1340 1350 1360 1370 1380 >>KIAA1679 ( 1536 res) fh22954 (1536 aa) initn: 360 init1: 90 opt: 238 Z-score: 220.4 bits: 53.0 E(): 3.7e-07 Smith-Waterman score: 469; 29.337% identity (49.490% similar) in 392 aa overlap (648-988:934-1298) 620 630 640 650 660 670 KIAA06 LLTSAGNRTHKARTRPKARKQGVSPADMYRWKLSSHEPCSATCTTGVM--SAYAMCVRYD : :: ::..: :: : . :. 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KIAA16 TECSQTCGHGGRMSRTRFIIMPTQGEGRP-------C--PTELTQEKTCPVTPCYSWVLG 1190 1200 1210 1220 1230 950 960 970 980 KIAA06 PWSECT---KTCGVGVRMRDVKC--YQGT---------DIVRGCDPLVKPVGRQACDLQP :: : :: ::..:...: ..:. : . : :. . .: :.. : KIAA16 NWSACKLEGGDCGEGVQIRSLSCMVHSGSISHAAGRVEDALCGEMPFQDSILKQLCSV-P 1240 1250 1260 1270 1280 1290 990 1000 1010 1020 1030 KIAA06 CPTEPPDDSCQDQPGTNCALAIKVNLCGHWYYSKACCRSCRPPHS :: KIAA16 CPGDCHLTEWSEWSTCELTCIDGRSFETVGRQSRSRTFIIQSFENQDSCPQQVLETRPCT 1300 1310 1320 1330 1340 1350 >>KIAA2036 ( 1322 res) pf06513 (1322 aa) initn: 107 init1: 89 opt: 200 Z-score: 185.8 bits: 46.3 E(): 3.1e-05 Smith-Waterman score: 259; 24.728% identity (45.109% similar) in 368 aa overlap (690-1031:695-1001) 660 670 680 690 700 710 KIAA06 CTTGVMSAYAMCVRYDGVEVDDSYCDALTRPEPVHEFCAGRECQPRWETSSWSECSRTCG : : .. :.. : : : :. :::::: KIAA20 MLPPSTRALTPLPPQVCDGQPDCGRPGQVGPSPEEQGCGAW--GP-W--SPWGPCSRTCG 670 680 690 700 710 720 730 740 750 760 770 KIAA06 EGYQFRVVRCWKMLSPGFDSSVYSDLCEAAEAVRPEERKTCRNPAC--GPQWEM-SEWSE : : :: :: . : .. : . : .. ..: . :: .: : :: KIAA20 PWGQGRSRRC----SP-LGLLVLQN-CPGPE----HQSQACFTAACPVDGEWSTWSPWSV 720 730 740 750 760 780 790 800 810 820 KIAA06 CTAKCGERSVVTRDIRCSEDE---KLCD--PN-------TRPVGEKNCTGPPCDRQWTVS :. : :...::. .: . . : :. :.: . .: . :. . . KIAA20 CSEPC--RGTMTRQRQCHSPQNGGRTCAALPGGLHSTRQTKPCPQDGCPNATCSGELMFQ 770 780 790 800 810 820 830 840 850 860 870 KIAA06 DWGPCSGSC----GQGRTIRHVYCKTSDGRVVPESQCQMETKPLAIHPCGDKNCPAHWL- .:: .: :: : : : ::.: . .. . : ..:: KIAA20 PCAPCPLTCDDISGQVTCPPDWPCG-SPGCWCPEGQV-LGSEGWCVWP---RQCPCLVDG 830 840 850 860 870 880 880 890 900 910 920 930 KIAA06 AQDWERCNTTCGRGVKKRLVLCMELANGKPQT-RSGPECGLAKKPPEESTCFERPCFKWY :. : :. .: ::. .:.:. : .:.:.. : : KIAA20 ARYWP------GQRIKADCQLCI-CQDGRPRRCRLNPDCAV-------------DC-GWS 890 900 910 920 940 950 960 970 980 990 KIAA06 T-SPWSECTKTCG---VGVRMRDVKCYQGTDIVRGCDPLVKPVGRQACDLQPCPTEPPDD . :::..: :: . .:. . . . : : . . . : :. .:: . KIAA20 SWSPWAKCLGPCGSQSIQWSFRSSNNPRPSGRGRQCRGIHRKARR--CQTEPC------E 930 940 950 960 970 1000 1010 1020 1030 KIAA06 SCQDQPGTNCALAIKVNLCGH-WYYSKACCRSCRPPHS .:. : : .:. :. :. . :: :. :. KIAA20 GCEHQ-G-------QVHRVGERWHGGP--CRVCQCLHNLTAHCSPYCPLGSCPQGWVLVE 980 990 1000 1010 1020 KIAA20 GTGESCCHCALPGENQTVQPMATPAAAPAPSPQIRFPLATYILPPSGDPCYSPLGLAGLA 1030 1040 1050 1060 1070 1080 1031 residues in 1 query sequences 1986474 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:08:51 2008 done: Thu Dec 18 15:08:52 2008 Total Scan time: 0.670 Total Display time: 0.340 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]