# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg01488b.fasta.nr -Q ../query/KIAA0603.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0603, 1348 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7822843 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7727+/-0.000197; mu= 13.0936+/- 0.011 mean_var=102.8066+/-19.832, 0's: 29 Z-trim: 49 B-trim: 361 in 1/65 Lambda= 0.126492 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|114650110|ref|XP_522684.2| PREDICTED: TBC1 doma (1535) 8984 1651.2 0 gi|153217463|gb|AAI51240.1| TBC1D4 protein [Homo s (1299) 8660 1592.0 0 gi|119600943|gb|EAW80537.1| TBC1 domain family, me (1298) 8640 1588.3 0 gi|67473227|sp|O60343.2|TBCD4_HUMAN RecName: Full= (1298) 8634 1587.2 0 gi|76631715|ref|XP_879978.1| PREDICTED: similar to (1299) 7958 1463.9 0 gi|67462068|sp|Q8BYJ6.2|TBCD4_MOUSE RecName: Full= (1307) 7748 1425.6 0 gi|126337602|ref|XP_001366189.1| PREDICTED: simila (1312) 7365 1355.7 0 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