# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj02929s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0595.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0595, 1666 aa vs ./tmplib.23663 library 1985839 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.8019+/-0.0139; mu= -32.3930+/- 0.942 mean_var=815.3703+/-194.681, 0's: 0 Z-trim: 25 B-trim: 5 in 1/39 Lambda= 0.044916 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552) 386 41.7 0.0015 KIAA1681 ( 1236 res) fh23697 (1236) 358 39.8 0.0043 KIAA0754 ( 1174 res) hh06485 (1174) 344 38.9 0.0079 KIAA0306 ( 1451 res) hg00063 (1451) 342 38.8 0.01 >>KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552 aa) initn: 273 init1: 115 opt: 386 Z-score: 155.9 bits: 41.7 E(): 0.0015 Smith-Waterman score: 514; 23.824% identity (47.548% similar) in 999 aa overlap (459-1394:571-1479) 430 440 450 460 470 480 KIAA05 LLKPREVVEPVVPKEPQNPPANAAPGSQRARKGRKKKSKEQPAACVEGYARRLRSSSRGQ :.::::. .: . . . .:::.:.. 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