# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj02824s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0593.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0593, 2005 aa vs ./tmplib.23663 library 1985500 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0097+/-0.0057; mu= 14.0767+/- 0.378 mean_var=289.3132+/-70.362, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 123 in 1/39 Lambda= 0.075403 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 42, opt: 30, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA1025 ( 1917 res) fg00971s1 (1917) 4157 467.6 1.3e-131 >>KIAA1025 ( 1917 res) fg00971s1 (1917 aa) initn: 4591 init1: 1745 opt: 4157 Z-score: 2454.5 bits: 467.6 E(): 1.3e-131 Smith-Waterman score: 6102; 51.943% identity (74.080% similar) in 1956 aa overlap (145-2005:21-1917) 120 130 140 150 160 170 KIAA05 LVPQSDIPTPSPVGSTHCSSSCLGVHQVPASTRDPAMSSVTLTPPTSPEEVQTVDPQSVQ :..::. .. ::::::::.. . ..: KIAA10 VSISLISAGGHIAVGQQGLGSVKDPSNCGMPLTPPTSPEQAILGESGGMQ 10 20 30 40 50 180 190 200 210 220 230 KIAA05 KWVKFSSVSDG-FNSDSTSHHGGKIPRKLANHVVDRVWQECNMNRAQNKRKYSASSGGLC . .. .:: . . . ...:::: :: ::.: :::.:: .::.:.:: : : KIAA10 SAASHLVSQDGGMITMHSPKRSGKIPPKLHNHMVHRVWKECILNRTQSKR--SQMSTPTL 60 70 80 90 100 240 250 260 270 280 KIAA05 EEATAAKVASWDFVEATQRTNCSCLRHKNLKSRNAGQQGQAPSLGQ--------QQQILP :: :.. :.::::. :::..::: ::: :: : : .. :...: ... :: KIAA10 EEEPASNPATWDFVDPTQRVSCSCSRHKLLK-RCAVGPNRPPTVSQPGFSAGPSSSSSLP 110 120 130 140 150 160 290 300 310 320 330 340 KIAA05 -----KHKTNEKQEKSEKPQKRPLTPFHHRVSVSDDVGMDADSASQRLVISAPDSQVRFS :::: :.:::..: ::::: ::::: ::.... :. :. .:.: ... ::... : KIAA10 PPASSKHKTAERQEKGDKLQKRPLIPFHHRPSVAEELCMEQDTPGQKLGLAGIDSSLEVS 170 180 190 200 210 220 350 360 370 380 KIAA05 NIRTNDVA-------KTPQMHGTEMAN-----SPQPPPLSPHPCDVVDEGVTKTPSTPQS . : : . ::. . : . :: :: :::.: :.. ::.: . 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KIAA10 E-QVFYIQYLKSMAFSVYCQCRRPLPTQIHIKSLTGFGPAASIEMTLKNPERPSPIQLYS 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1600 1610 1620 1630 1640 1650 KIAA05 PPFILAPVKDKQTELGETFGEAGQKYNVLFVGYCLSHDQRWILASCTDLYGELLETCIIN :::::::.::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::.:::::::..: KIAA10 PPFILAPIKDKQTELGETFGEASQKYNVLFVGYCLSHDQRWLLASCTDLHGELLETCVVN 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1660 1670 1680 1690 1700 1710 KIAA05 IDVPNRARRKKSSARKFGLQKLWEWCLGLVQMSSLPWRVVIGRLGRIGHGELKDWSCLLS : .:::.::.: ::::.:::::::::.:.:::.:::::::::::::.::::::::: ::. KIAA10 IALPNRSRRSKVSARKIGLQKLWEWCIGIVQMTSLPWRVVIGRLGRLGHGELKDWSILLG 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1720 1730 1740 1750 1760 1770 KIAA05 RRNLQSLSKRLKDMCRMCGISAADSPSILSACLVAMEPQGSFVIMPDSVSTGSVFGRSTT . .::..::.:::.:::::::::::::::::::::::::::::.:::.:. ::::::::. 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