# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj00601s1.fasta.nr -Q ../query/KIAA0580.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0580, 1631 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7822735 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3476+/-0.000192; mu= 14.6059+/- 0.011 mean_var=80.8787+/-16.413, 0's: 36 Z-trim: 58 B-trim: 4190 in 2/65 Lambda= 0.142612 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 41, opt: 29, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|152012529|gb|AAI50259.1| CENTD1 protein [Homo s (1634) 10743 2221.4 0 gi|73619952|sp|Q8WZ64.2|ARAP2_HUMAN RecName: Full= (1704) 10743 2221.4 0 gi|119613278|gb|EAW92872.1| centaurin, delta 1, is (1704) 10737 2220.1 0 gi|16974764|gb|AAL32459.1|AF439781_1 PARX protein (1704) 10736 2219.9 0 gi|114593527|ref|XP_001135477.1| PREDICTED: centau (1704) 10665 2205.3 0 gi|194209238|ref|XP_001498972.2| PREDICTED: simila (1709) 9514 1968.5 0 gi|109074104|ref|XP_001090397.1| PREDICTED: simila (1450) 9113 1886.0 0 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