# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hj00291.fasta.huge -Q ../query/KIAA0577.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0577, 1043 aa vs ./tmplib.23663 library 1986462 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.7107+/-0.00899; mu= 4.1691+/- 0.606 mean_var=340.0730+/-82.130, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.069549 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0224 ( 1256 res) ha04657 (1256) 2331 249.1 2.7e-66 KIAA1488 ( 852 res) fj07893 ( 852) 644 79.6 2e-15 KIAA0134 ( 587 res) ha04001 ( 587) 607 75.6 2.2e-14 KIAA0890 ( 1210 res) hk08057 (1210) 507 66.1 3.3e-11 KIAA1517 ( 998 res) fh11426(revised) ( 998) 472 62.4 3.4e-10 >>KIAA0224 ( 1256 res) ha04657 (1256 aa) initn: 2333 init1: 871 opt: 2331 Z-score: 1281.9 bits: 249.1 E(): 2.7e-66 Smith-Waterman score: 2353; 40.722% identity (69.588% similar) in 970 aa overlap (74-1022:255-1182) 50 60 70 80 90 KIAA05 EFVQRLRDTDTLDLSGPARDFALRLWNKVPRKAVVEKPA-----RAAEREAR-ALLEKNR :.. :.:. : .:: : . ...: KIAA02 EPESPRHRPKDAATPSRSTWEEEDSGYGSSRRSQWESPSPTPSYRDSERSHRLSTRDRDR 230 240 250 260 270 280 100 110 120 130 140 150 KIAA05 SYRLLEDSEESSEETVSRAGSSLQKKRKKRKHLRKKREEEEEEEASEKGKKKTGGSKQQT : : .. :.. . . . .. :.:: . . . .:... : . KIAA02 SVR----GKYSDDTPLPTPSYKYNEWADDRRHLGST-----PRLSRGRGRREEGEEGISF 290 300 310 320 330 160 170 180 190 200 210 KIAA05 EKPESEDEWERTERERLQDLEERDAFAERVRQRDKDRTRNVLERSDKKAYEEAQKRLKMA . : ...:: .:. .: : .. .. ... ..: ... ... :::. . KIAA02 DTEEERQQWEDDQRQADRDWYMMDEGYDEFHNPLAYSSEDYVRRREQHLHKQKQKRI--S 340 350 360 370 380 390 220 230 240 250 260 KIAA05 EEDRKAMVPELRKKSRREYLAK--REREKLEDLEAELADE----------EFLFGDVELS . :. . : .. : . .. : ::.: . : . :: : . .. KIAA02 AQRRQINEDNERWETNRMLTSGVVHRLEVDEDFEEDNAAKVHLMVHNLVPPFLDGRIVFT 400 410 420 430 440 450 270 280 290 300 310 320 KIAA05 RHERQELKYKRRVRDLAREYRAAGEQEKLEATNRYHMPKETRGQPARAVDLVEEESGAPG .. . . : . ::: : : : : : : .. : . KIAA02 KQPEPVIPVKDATSDLAIIARK-GSQ-----TVRKHREQKERKKA--------------- 460 470 480 490 330 340 350 360 370 380 KIAA05 EEQRRWEEARLGAASLKFGARDAASQEPKYQLVLEEEETIEFVRATQLQGDEEPSAPPTS ....:: :. :.: ....: . . .. :. ... :. : .:. .: KIAA02 -QHKHWE-----LAGTKLGDIMGVKKEEEPDKAVTEDGKVDY-RTEQKFADHMKRKSEAS 500 510 520 530 540 390 400 410 420 430 440 KIAA05 TQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELLAAIANHQVLIIEGETGSGKTTQIPQYLFEEGYTN .. .:.:: :. ::.: ..:::. : .....:. ::::::::::. ::: :.:::. KIAA02 SEFAKKKSILEQRQYLPIFAVQQELLTIIRDNSIVIVVGETGSGKTTQLTQYLHEDGYTD 550 560 570 580 590 600 450 460 470 480 490 500 KIAA05 KGMKIACTQPRRVAAMSVAARVAREMGVKLGNEVGYSIRFEDCTSERTVLRYMTDGMLLR :: :.::::::::::::: ::..::: .::.::::.::::::::: :...:::::.::: KIAA02 YGM-IGCTQPRRVAAMSVAKRVSEEMGGNLGEEVGYAIRFEDCTSENTLIKYMTDGILLR 610 620 630 640 650 660 510 520 530 540 550 560 KIAA05 EFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHTDILFGLIKDVARFRPELKVLVASATMDTARFSTF : : : :: ::....::::::.:.::.::::...:. : .::..:.:::::. .:..: KIAA02 ESLREADLDHYSAIIMDEAHERSLNTDVLFGLLREVVARRSDLKLIVTSATMDAEKFAAF 670 680 690 700 710 720 570 580 590 600 610 620 KIAA05 FDDAPVFRIPGRRFPVDIFYTKAPEADYLEACVVSVLQIHVTQPPGDILVFLTGQEEIEA : ..:.:.:::: :::::...:.:. ::.:: : . ::.:.. :::::.:. :::.::. KIAA02 FGNVPIFHIPGRTFPVDILFSKTPQEDYVEAAVKQSLQVHLSGAPGDILIFMPGQEDIEV 730 740 750 760 770 780 630 640 650 660 670 680 KIAA05 ACEMLQDRCRRLGSKIRELLVLPIYANLPSDMQARIFQPTPPGARKVVVATNIAETSLTI . ... .. ..: . : :::::..::::.::.::: .: :.:: .:::::::::::. KIAA02 TSDQIVEHLEEL-ENAPALAVLPIYSQLPSDLQAKIFQKAPDGVRKCIVATNIAETSLTV 790 800 810 820 830 840 690 700 710 720 730 740 KIAA05 EGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASANQRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAY .::..:.: :.:: : .::: ::..: . : :.:.::::.:::::.. :.:::::: :: KIAA02 DGIMFVIDSGYCKLKVFNPRIGMDALQIYPISQANANQRSGRAGRTGPGQCFRLYTQSAY 850 860 870 880 890 900 750 760 770 780 790 800 KIAA05 QHELEETTVPEIQRTSLGNVVLLLKSLGIHDLMHFDFLDPPPYETLLLALEQLYALGALN ..:: :::::::::.:.::::::::::..::..: :.:::: ...: .. ::. ::::. KIAA02 KNELLTTTVPEIQRTNLANVVLLLKSLGVQDLLQFHFMDPPPEDNMLNSMYQLWILGALD 910 920 930 940 950 960 810 820 830 840 850 860 KIAA05 HLGELTTSGRKMAELPVDPMLSKMILASEKYSCSEEILTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVH . : ::..:: :.:.:.:: ::::...: ..:: ::: ...:::: .:::::: . . KIAA02 NTGGLTSTGRLMVEFPLDPALSKMLIVSCDMGCSSEILLIVSMLSVP-AIFYRPKGREEE 970 980 990 1000 1010 1020 870 880 890 900 910 920 KIAA05 ADNARVNFFLPGGDHLVLLNVYTQWAESGYSSQWCYENFVQFRSMRRARDVREQLEGLLE .:. : .: .: .:::. :::: :: ...::. :: ..:.. ..::..:.:: ::. .. KIAA02 SDQIREKFAVPESDHLTYLNVYLQWKNNNYSTIWCNDHFIHAKAMRKVREVRAQLKDIMV 1030 1040 1050 1060 1070 1080 930 940 950 960 970 980 KIAA05 RVEVGLSSCQGDYIRVRKAITAGYFYHTARLTRSG-YRTVKQQQTVFIHPNSSLFEQ--Q . ...:.:: :. ::: : :.::...:.: : : ... . .::.:::: . KIAA02 QQRMSLASCGTDWDIVRKCICAAYFHQAAKLKGIGEYVNIRTGMPCHLHPTSSLFGMGYT 1090 1100 1110 1120 1130 1140 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA05 PRWLLYHELVLTTKEFMRQVLEIESSWLLEVAPHYYKAKELEDPHAKKMPKKIGKTREEL : ...:::::.::::.:. : ... :: :..: .:..:. KIAA02 PDYIVYHELVMTTKEYMQCVTAVDGEWLAELGPMFYSVKQAGKSRQENRRRAKEEASAME 1150 1160 1170 1180 1190 1200 KIAA05 G KIAA02 EEMALAEEQLRARRQEQEKRSPLGSVRSTKIYTPGRKEQGEPMAPRRTPARFGL 1210 1220 1230 1240 1250 >>KIAA1488 ( 852 res) fj07893 (852 aa) initn: 1016 init1: 290 opt: 644 Z-score: 368.7 bits: 79.6 E(): 2e-15 Smith-Waterman score: 1071; 32.406% identity (60.362% similar) in 719 aa overlap (394-1011:44-755) 370 380 390 400 410 420 KIAA05 TIEFVRATQLQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELLAAIANHQVLIIE .: :..:: . ...::. : :::: .: KIAA14 LLQENEPDGTLDQKLLEDLQKKKNDLRYIEMQHFREKLPSYGMQKELVNLIDNHQVTVIS 20 30 40 50 60 70 430 440 450 460 470 KIAA05 GETGSGKTTQIPQYLFEEGYTNKGM----KIACTQPRRVAAMSVAARVA--REMGVKLGN :::: :::::. :..... : ..: .:.::::::..:.::: ::: : . :: KIAA14 GETGCGKTTQVTQFILDN-YIERGKGSACRIVCTQPRRISAISVAERVAAERAESCGSGN 80 90 100 110 120 130 480 490 500 510 520 530 KIAA05 EVGYSIRFEDCTSER--TVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHTDILF .::.::... .. ..: : : :..:. . :.: :.: : ...:: :::.:..:.:. KIAA14 STGYQIRLQSRLPRKQGSIL-YCTTGIILQWLQSDPYLSSVSHIVLDEIHERNLQSDVLM 140 150 160 170 180 190 540 550 560 570 580 KIAA05 GLIKDVARFRPELKVLVASATMDTARFSTFFDDAPVFRIPGRRFPV------DIF--YTK ..::. :: .:::.. :::... .:: .: . :...::: ::: :.. KIAA14 TVVKDLLNFRSDLKVILMSATLNAEKFSEYFGNCPMIHIPGFTFPVVEYLLEDVIEKIRY 200 210 220 230 240 250 590 600 KIAA05 APEA---------------------------------DYLE-------ACVVSVLQIH-- .:: ::.. : .:.:... KIAA14 VPEQKEHRSQFKRGFMQGHVNRQEKEEKEAIYKERWPDYVRELRRRYSASTVDVIEMMED 260 270 280 290 300 310 610 620 630 640 KIAA05 ----------------VTQPPGDILVFLTGQEEIEAACEMLQDRCRRLGSKIRELLVLPI . . : ::::: : ..: . ..:... . : ..:..:. KIAA14 DKVDLNLIVALIRYIVLEEEDGAILVFLPGWDNISTLHDLLMSQ---VMFKSDKFLIIPL 320 330 340 350 360 650 660 670 680 690 700 KIAA05 YANLPSDMQARIFQPTPPGARKVVVATNIAETSLTIEGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGME .. .:. :...:. ::::.::.:.::::::::.::. ..::.: : :. .. .... KIAA14 HSLMPTVNQTQVFKRTPPGVRKIVIATNIAETSITIDDVVYVIDGGKIKETHFDTQNNIS 370 380 390 400 410 420 710 720 730 740 750 760 KIAA05 SLTVTPCSKASANQRAGRAGRVAAGKCFRLYTAWAYQHELEETTVPEIQRTSLGNVVLLL .... :::.:.:: :::::: :.:..::.. :.. .::: :: : .. : . KIAA14 TMSAEWVSKANAKQRKGRAGRVQPGHCYHLYNGL-RASLLDDYQLPEILRTPLEELCLQI 430 440 450 460 470 480 770 780 790 800 810 820 KIAA05 KSLGIHDLMHF--DFLDPPPYETLLLALEQLYALGALNHLGELTTSGRKMAELPVDPMLS : : . . .: ..::: :..::....:. :.::.. ::: : ..:.:::.: .. KIAA14 KILRLGGIAYFLSRLMDPPSNEAVLLSIRHLMELNALDKQEELTPLGVHLARLPVEPHIG 490 500 510 520 530 540 830 840 850 860 870 880 KIAA05 KMILASEKYSCSEEILTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVHADNARVNFFLPG-GDHLVLLNV :::: . . : . .::.:: :: .. : : : :: : .. .:::...:. KIAA14 KMILFGALFCCLDPVLTIAASLSFKDP-FVIPLGKEKIADARRKELAKDTRSDHLTVVNA 550 560 570 580 590 600 890 900 910 920 930 KIAA05 YTQWAES---G--YSSQWCYENFVQFRSMRRARDVREQL-EGLLERVEVGL-------SS . : :. : : ...:.: :.. ... .... :. : :: :. :. KIAA14 FEGWEEARRRGFRYEKDYCWEYFLSSNTLQMLHNMKGQFAEHLLGAGFVSSRNPKDPESN 610 620 630 640 650 660 940 950 960 970 980 KIAA05 CQGDYIRVRKA-ITAGYFYHTA--RLTRSGYRTV-----KQQQTVFIHPNSSLFEQQP-- ..: .. :: : :: . ..: ::. . : . : . : .::.: :: KIAA14 INSDNEKIIKAVICAGLYPKVAKIRLNLGKKRKMVKVYTKTDGLVAVHPKSVNVEQTDFH 670 680 690 700 710 720 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA05 -RWLLYHELVLTTKEFMRQVLEIESSWLLEVAPHYYKAKELEDPHAKKMPKKIGKTREEL ::.:: . :.. .. . :. :: KIAA14 YNWLIYHLKMRTSSIYLYDCTEVSPYCLLFFGGDISIQKDNDQETIAVDEWIVFQSPARI 730 740 750 760 770 780 >>KIAA0134 ( 587 res) ha04001 (587 aa) initn: 858 init1: 455 opt: 607 Z-score: 350.2 bits: 75.6 E(): 2.2e-14 Smith-Waterman score: 935; 31.918% identity (56.918% similar) in 636 aa overlap (226-858:15-546) 200 210 220 230 240 250 KIAA05 RNVLERSDKKAYEEAQKRLKMAEEDRKAMVPELRK-KSRREYL-AKREREKLEDLEAELA :. :. ..::.. : :.: :: . . KIAA01 SELRLLLWISNMPPPRTREGRDRRDHHRAPSEEEALEKWDWNCP 10 20 30 40 260 270 280 290 300 310 KIAA05 DEEFLFGDVELSRHERQELKYKRRVRDLAREYRAAGEQ-EKLEATNRYHMPKETRGQPAR . . :. :. . :.: : :. . ... . :. .... . . .. ::: . KIAA01 ETRRLLEDAFF----REE-DYIRQGSEECQKFWTFFERLQRFQNLKTSRKEEKDPGQPKH 50 60 70 80 90 320 330 340 350 360 370 KIAA05 AVDLVEEESGAPGEEQRRWEEARLGAASLKFGARDAASQEPKYQLVLEEEETIEFVRATQ .. . . . . . : . . :: :. :.. . . : :.. :: :: KIAA01 SIPALADLPRTY-DPRYRINLSVLGPATR--GSQGLGRHLPA-------ERVAEFRRALL 100 110 120 130 140 380 390 400 410 420 430 KIAA05 LQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELLAAIANHQVLIIEGETGSGKTT : . :.: : .::. . ...: .. .:::... :.:: ::.: KIAA01 HYLDFGQKQAFGRLAKLQRE-----RAALPIAQYGNRILQTLKEHQVVVVAGDTGCGKST 150 160 170 180 190 200 440 450 460 470 480 490 KIAA05 QIPQYLFEEGYTNKGMKIACTQPRRVAAMSVAARVAREMGVKLGNEVGYSIRFEDCTSER :.::::. :... .:::::::.: .:.: ::. : . :..:::.::::. : KIAA01 QVPQYLLAAGFSH----VACTQPRRIACISLAKRVGFESLSQYGSQVGYQIRFESTRSAA 210 220 230 240 250 260 500 510 520 530 540 550 KIAA05 TVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHTDILFGLIKDVARFRPELKVLV : . ..: :.:::.. ::.: .: :..:::.::: ::.:.:.:... . ::.:::.. KIAA01 TKIVFLTVGLLLRQIQREPSLPQYEVLIVDEVHERHLHNDFLLGVLQRLLPTRPDLKVIL 270 280 290 300 310 320 560 570 580 590 600 610 KIAA05 ASATMDTARFSTFFDDAPVFRIPGRRFPVDIFYTKAPEADYLEACVVSVLQIHVTQPPGD :::.. . ::..:..::: ..::: ::. .: : KIAA01 MSATINISLFSSYFSNAPVVQVPGRLFPITVF---------------------------D 330 340 350 620 630 640 650 660 670 KIAA05 ILVFLTGQEEIEAACEMLQDRCRRLGSKIRELLVLPIYANLPSDMQARIFQPTPPGARKV . .:::.:: KIAA01 V---------------------------------------------------APPGVRKC 360 680 690 700 710 720 730 KIAA05 VVATNIAETSLTIEGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASANQRAGRAGRVA ...:::::::.::.:: .:.: : :. ::.:.. .. : :.:::.:: :::::.. KIAA01 ILSTNIAETSVTIDGIRFVVDSGKVKEMSYDPQAKLQRLQEFWISQASAEQRKGRAGRTG 370 380 390 400 410 420 740 750 760 770 780 790 KIAA05 AGKCFRLYTAWAYQHELEETTVPEIQRTSLGNVVLLLKSLGIHDLMHFDFLDPPPYETLL : :::::. :. . ::::.:..: ..:: .::... : : :..::: .: KIAA01 PGVCFRLYAESDYD-AFAPYPVPEIRRVALDSLVLQMKSMSVGDPRTFPFIEPPPPASLE 430 440 450 460 470 480 800 810 820 830 840 850 KIAA05 LALEQLYALGALNHLGELTTSGRKMAELPVDPMLSKMILASEKYSCSEEILTVAAMLSVN :. : :::. :: : .:.:::: ...::.. . .: : .::.:: :::. KIAA01 TAILYLRDQGALDSSEALTPIGSLLAQLPVDVVIGKMLILGSMFSLVEPVLTIAAALSVQ 490 500 510 520 530 540 860 870 880 890 900 910 KIAA05 NSIFYRPKDKVVHADNARVNFFLPGGDHLVLLNVYTQWAESGYSSQWCYENFVQFRSMRR : : : KIAA01 -SPFTRSAQSSPECCTPPASSLAAPRCCTHRSWRPATATEAETTRTR 550 560 570 580 >>KIAA0890 ( 1210 res) hk08057 (1210 aa) initn: 927 init1: 281 opt: 507 Z-score: 293.0 bits: 66.1 E(): 3.3e-11 Smith-Waterman score: 1003; 29.140% identity (56.667% similar) in 930 aa overlap (133-1010:203-1090) 110 120 130 140 150 160 KIAA05 EDSEESSEETVSRAGSSLQKKRKKRKHLRKKREEEEEEEASEKGKKKTGGSKQQTEKPES ..:::.::: :.: . ..:.. KIAA08 EPTMPPTSWRQLNPESIRPGGPGGLSRSLGREEEEDEEEELEEGTIDVTDFLSMTQQDSH 180 190 200 210 220 230 170 180 190 200 210 220 KIAA05 EDEWERTERERLQDLEERDAFAERVRQRD--KDRTRNVLERSDKKAYEEAQKRLKMAEED : : .. . :. . . : :. .:.. . ... . ... . KIAA08 APL--RDSRGSSFEMTDDDSAIRALTQFPLPKNLLAKVIQIATSSSTAKNLMQFHTVGTK 240 250 260 270 280 290 230 240 250 260 270 KIAA05 RKAMVPELRKKSRREYLAK-REREKLEDLEAELADEEFLFGDVELSRHERQELKYKRRVR : . : ..:: :.. . :. : :: ... :. .:.. . . KIAA08 TKLSTLTLLWPCPMTFVAKGRRKAEAENKAAALACKKL----KSLGLVDRNNEPLTHAMY 300 310 320 330 340 280 290 300 310 320 330 KIAA05 DLAREYRAAGEQEKLEATNRYHMPKETRGQPARAVDLVEEESGAPGEEQRRWEEARLGAA .:: : :: .. : ..:. . .. ::. . : : . : . KIAA08 NLAS-LRELGETQRRPCT--IQVPEPILRKIETFLNHYPVESSWIAPELRLQSDDILPLG 350 360 370 380 390 400 340 350 360 370 380 390 KIAA05 SLKFGARDAASQEPKYQLVLEEEETIEFVRATQLQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAVRR . . : . .: : .:: :: :: .: . :. .: : KIAA08 KDSGPLSDPITGKP-YVPLLEAEE----VRLSQSLLELWRRRGPVWQEAPQ--------- 410 420 430 440 400 410 420 430 440 450 KIAA05 SLPVFPFREELLAAIANHQVLIIEGETGSGKTTQIPQYLFEEGYTNKGMKIAC----TQP ::: : :. .: :: .: :..: :.:: ::::.::: :.:. :...: : ::: KIAA08 -LPVDPHRDTILNAIEQHPVVVISGDTGCGKTTRIPQLLLER-YVTEGRGARCNVIITQP 450 460 470 480 490 500 460 470 480 490 500 510 KIAA05 RRVAAMSVAARVAREMGVKLGNEVGYSIRFEDCTSERT-VLRYMTDGMLLREFLSEPDLA ::..:.::: ::..:.: .: .::...:.:. : .: . : :.:::.. :.:.: KIAA08 RRISAVSVAQRVSHELGPSLRRNVGFQVRLESKPPSRGGALLFCTVGILLRKLQSNPSLE 510 520 530 540 550 560 520 530 540 550 560 570 KIAA05 SYSVVMVDEAHERTLHTDILFGLIKDVARFRPELKVLVASATMDTARFSTFFDDAPVFRI . : :.:::.::: ..::.:. :.: . :. : :.... ::: :. ::: .: ::... KIAA08 GVSHVIVDEVHERDVNTDFLLILLKGLQRLNPALRLVLMSATGDNERFSRYFGGCPVIKV 570 580 590 600 610 620 580 590 600 610 KIAA05 PGRRFPVDIFY-----TKAPEADYL---------EACVVS-------VLQIHVTQPPGDI :: .:: : .: . .:: . :... ::.: . :: : KIAA08 PGFMYPVKEHYLEDILAKLGKHQYLHRHRHHESEDECALDLDLVTDLVLHIDARGEPGGI 630 640 650 660 670 680 620 630 640 650 660 670 KIAA05 LVFLTGQEEIEAACEMLQDRCRRLGSKIRELLVLPIYANLPSDMQARIFQPTPPGARKVV : :: : .::... . ::. :: . . :.::...:.: : ::: : :.::.: KIAA08 LCFLPGWQEIKGVQQRLQEA---LGMHESKYLILPVHSNIPMMDQKAIFQQPPVGVRKIV 690 700 710 720 730 740 680 690 700 710 720 730 KIAA05 VATNIAETSLTIEGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASANQRAGRAGRVAA .::::::::.::. :..:.: :. :.. :. .: . : .. :.:.. :: ::::: . KIAA08 LATNIAETSITINDIVHVVDSGLHKEERYDLKTKVSCLETVWVSRANVIQRRGRAGRCQS 750 760 770 780 790 800 740 750 760 770 780 KIAA05 GKCFRLYTAWAYQHELEETTVPEIQRTSLGNVVLLLKSLGIHDLMHFDFL----DPPPYE : ..:. . ... :::: :: : :.:: : . . . .:: : : . KIAA08 GFAYHLFPR-SRLEKMVPFQVPEILRTPLENLVLQAK-IHMPEKTAVEFLSKAVDSPNIK 810 820 830 840 850 860 790 800 810 820 830 840 KIAA05 TLLLALEQLYALGALNHLGELTTSGRKMAELPVDPMLSKMILASEKYSCSEEILTVAAML .. :. : .:.:.. ::: :...:.. .:: :.: :. . . : . .:.:.. : KIAA08 AVDEAVILLQEIGVLDQREYLTTLGQRLAHISTDPRLAKAIVLAAIFRCLHPLLVVVSCL 870 880 890 900 910 920 850 860 870 880 890 900 KIAA05 SVNNSIFYRPKDKVVHADNARVNF-FLPGGDHLVLLNVYTQWAE----SGYSSQWCY--E . . : .. ...:.... . :.:::... . . : : . ::. : : KIAA08 TRDP--FSSSLQNRAEVDKVKALLSHDSGSDHLAFVRAVAGWEEVLRWQDRSSRENYLEE 930 940 950 960 970 980 910 920 930 940 950 KIAA05 NFVQFRSMRRARDVREQL-EGLLERVEVG------LSSCQ-GDYIR----VRKAITAGYF :.. :.: . . .:. :.. : :: :.: : ..: . :. .. :: . KIAA08 NLLYAPSLRFIHGLIKQFSENIYEAFLVGKPSDCTLASAQCNEYSEEEELVKGVLMAGLY 990 1000 1010 1020 1030 1040 960 970 980 990 1000 1010 KIAA05 YHTARLTRSGYRTVKQQQTVFIHPNSSLFEQQPRWLLYHELVLTTKEFMRQVLEIESSWL . .. :.: ....: . ..::: .. . .: :. ... :.. ...: :: KIAA08 PNLIQV-RQG-KVTRQGK---FKPNSVTYRTKSGNILLHKSTIN-----REATRLRSRWL 1050 1060 1070 1080 1090 1020 1030 1040 KIAA05 LEVAPHYYKAKELEDPHAKKMPKKIGKTREELG KIAA08 TYFMAVKSNGSVFVRDSSQVHPLAVLLLTDGDVHIRDDGRRATISLSDSDLLRLEGDSRT 1100 1110 1120 1130 1140 1150 >>KIAA1517 ( 998 res) fh11426(revised) (998 aa) initn: 1214 init1: 346 opt: 472 Z-score: 274.8 bits: 62.4 E(): 3.4e-10 Smith-Waterman score: 1201; 32.584% identity (57.553% similar) in 801 aa overlap (382-1034:56-852) 360 370 380 390 400 410 KIAA05 EPKYQLVLEEEETIEFVRATQLQGDEEPSAPPTSTQAQQKESIQAVRRSLPVFPFREELL : . .... .: : .::.. .. .. KIAA15 PAPSSQPVPAGMTVPPPPAAAPPLPRALAKPAVFIPVNRSPEMQEERLKLPILSEEQVIM 30 40 50 60 70 80 420 430 440 450 460 470 KIAA05 AAIANHQVLIIEGETGSGKTTQIPQYLFEEGYTNKGMKIACTQPRRVAAMSVAARVAREM :.:.: ..:. ::::::::::.::.:.: :.... :. :.::::::.... :::.:: KIAA15 EAVAEHPIVIVCGETGSGKTTQVPQFLYEAGFSSEDSIIGVTEPRRVAAVAMSQRVAKEM 90 100 110 120 130 140 480 490 500 510 520 530 KIAA05 GVKLGNEVGYSIRFEDCTSERTVLRYMTDGMLLREFLSEPDLASYSVVMVDEAHERTLHT ... :.:.::.: ..:.: ...::::.::.:. .. : :.::..::::::...: KIAA15 NLSQ-RVVSYQIRYEGNVTEETRIKFMTDGVLLKEIQKDFLLLRYKVVIIDEAHERSVYT 150 160 170 180 190 200 540 550 560 570 580 KIAA05 DILFGLIKDVARFRPE----LKVLVASATMDTARFST----FFDDAPVFRIPGRRFPVDI :::.::.. .. .: . ::.:. :::. . :. : ::... .:.::: . KIAA15 DILIGLLSRIVTLRAKRNLPLKLLIMSATLRVEDFTQNPRLFAKPPPVIKVESRQFPVTV 210 220 230 240 250 260 590 600 610 620 630 KIAA05 FYTK-APEADYLEACVVSVLQIHVTQPPGDILVFLTGQEEIEAACEMLQ----------- ..: .: :: : .: .:: : : :::::::: :..: :. :. KIAA15 HFNKRTPLEDYSGECFRKVCKIHRMLPAGGILVFLTGQAEVHALCRRLRKAFPPSRARPQ 270 280 290 300 310 320 640 KIAA05 ----------DRCRRL------------------------------GSKIRE-------- .. :.. :.. :: KIAA15 EKDDDQKDSVEEMRKFKKSRARAKKARAEVLPQINLDHYSVLPAGEGDEDREAEVDEEEG 330 340 350 360 370 380 650 660 670 KIAA05 --------------------------LLVLPIYANLPSDMQARIFQPTPPGARKVVVATN : :::.:. : . ::..:.: : :.: ::::: KIAA15 ALDSDLDLDLGDGGQDGGEQPDASLPLHVLPLYSLLAPEKQAQVFKPPPEGTRLCVVATN 390 400 410 420 430 440 680 690 700 710 720 730 KIAA05 IAETSLTIEGIIYVLDPGFCKQKSYNPRTGMESLTVTPCSKASANQRAGRAGRVAAGKCF .::::::: :: ::.: : :.. :. ::. :. :: :.:::.::::::::. :.:. KIAA15 VAETSLTIPGIKYVVDCGKVKKRYYDRVTGVSSFRVTWVSQASADQRAGRAGRTEPGHCY 450 460 470 480 490 500 740 750 760 770 780 790 KIAA05 RLYTAWAYQHELEETTVPEIQRTSLGNVVLLLKSLGIHDLMHFDFLDPPPYETLLLALEQ :::.. .. ..:. ::: : . ...: .:.:... ...: : :: :.:: : : KIAA15 RLYSSAVFG-DFEQFPPPEITRRPVEDLILQMKALNVEKVINFPFPTPPSVEALLAAEEL 510 520 530 540 550 560 800 810 820 830 840 KIAA05 LYALGAL--------------NHLG-ELTTSGRKMAELPVDPMLSKMILASEKYSCSEEI : ::::: :.:. .:. :: :: .:: : .::. :....: KIAA15 LIALGALQPPQKAERVKQLQENRLSCPITALGRTMATFPVAPRYAKMLALSRQHGCLPYA 570 580 590 600 610 620 850 860 870 880 KIAA05 LTVAAMLSVNNSIFYRPKDKVVHADN---------ARVNFF----------LPGGDHLVL .:..: ..: . ... :. . .:. ::: . : :: .:: KIAA15 ITIVASMTVRE--LFEELDRPAASDEELTRLKSKRARVAQMKRTWAGQGASLKLGDLMVL 630 640 650 660 670 680 890 900 910 920 930 KIAA05 LNVYTQWAESGYSSQWCYENFVQFRSMRRARDVREQLEGLLERV--EVGL-------SSC :.. .. . :.: : .....: . : .: :: .. : :. : KIAA15 LGAVGACEYASCTPQFCEANGLRYKAMMEIRRLRGQLTTSVNAVCPEAELFVDPKMQPPT 690 700 710 720 730 740 940 950 960 970 980 KIAA05 QGDYIRVRKAITAGYFYHTARLT----------RSGYRTVKQQQTVFIHPNSSLFEQQPR ... .:. .::: : :: . :..:.: .. :::::.: ::.. :. KIAA15 ESQVTYLRQIVTAGLGDHLARRVQSEEMLEDKWRNAYKTPLLDDPVFIHPSSVLFKELPE 750 760 770 780 790 800 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA05 WLLYHELVLTTKEFMRQVLEIESSWLLEVAPHYYK-AKELEDPHAKKMPKKIGKTREELG ...:.:.: ::: .:. : .: .:. . : : . : ::.: :.. KIAA15 FVVYQEIVETTKMYMKGVSSVEVQWIPALLPSYCQFDKPLEEPAPTYCPERGRVLCHRAS 810 820 830 840 850 860 KIAA15 VFYRVGWPLPAIEVDFPEGIDRYKHFARFLLEGQVFRKLASYRSCLLSSPGTMLKTWARL 870 880 890 900 910 920 1043 residues in 1 query sequences 1986462 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:07:44 2008 done: Thu Dec 18 15:07:45 2008 Total Scan time: 0.690 Total Display time: 0.230 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]