# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk03615s2.fasta.nr -Q ../query/KIAA0570.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0570, 3412 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7820526 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7014+/-0.000189; mu= 15.0358+/- 0.011 mean_var=94.6279+/-18.184, 0's: 34 Z-trim: 60 B-trim: 117 in 2/64 Lambda= 0.131845 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 47, opt: 35, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|40788033|emb|CAE51938.1| ubiquitin-specific pro (3395) 22862 4361.3 0 gi|119620404|gb|EAW99998.1| ubiquitin specific pep (3558) 22780 4345.7 0 gi|212276488|sp|Q70CQ2.2|UBP34_HUMAN RecName: Full (3546) 22774 4344.5 0 gi|73970188|ref|XP_855134.1| PREDICTED: similar to (3542) 22571 4305.9 0 gi|194671494|ref|XP_613697.4| PREDICTED: similar t (3578) 22521 4296.4 0 gi|194220701|ref|XP_001495735.2| PREDICTED: ubiqui (3575) 22491 4290.7 0 gi|149640884|ref|XP_001512478.1| PREDICTED: simila (3658) 21844 4167.7 0 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3.5e-120 gi|194200676|gb|EDX14252.1| GD18280 [Drosophila si (1887) 2185 428.0 7.1e-116 gi|159155009|gb|AAI54517.1| LOC562779 protein [Dan ( 582) 2175 425.7 1.1e-115 gi|115750981|ref|XP_001203408.1| PREDICTED: simila (1388) 2095 410.8 8.1e-111 gi|115760385|ref|XP_785288.2| PREDICTED: similar t (1037) 1974 387.7 5.5e-104 gi|115976635|ref|XP_001179652.1| PREDICTED: simila (1247) 1974 387.7 6.3e-104 gi|108871674|gb|EAT35899.1| ubiquitin specific pro (3561) 1943 382.2 8.3e-102 gi|190626482|gb|EDV42006.1| GF17759 [Drosophila an (3889) 1837 362.1 1e-95 gi|45446634|gb|AAS65209.1| CG5794, isoform E [Dros (2832) 1815 357.8 1.5e-94 gi|23172192|gb|AAN14009.1| CG5794, isoform B [Dros (3703) 1815 357.9 1.8e-94 gi|23172191|gb|AAF56319.2| CG5794, isoform D [Dros (3912) 1815 357.9 1.9e-94 gi|194151099|gb|EDW66533.1| GJ23566 [Drosophila vi (3908) 1808 356.6 4.8e-94 gi|194185304|gb|EDW98915.1| GE10785 [Drosophila ya (3947) 1808 356.6 4.8e-94 gi|194166641|gb|EDW81542.1| GK12120 [Drosophila wi (4007) 1808 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