# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hk03615s2.fasta.huge -Q ../query/KIAA0570.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0570, 3412 aa vs ./tmplib.23663 library 1984093 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.2777+/-0.00632; mu= 8.4902+/- 0.427 mean_var=167.8087+/-41.552, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.099007 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 47, opt: 35, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0729 ( 1196 res) hk03615 (1196) 7988 1155.2 0 KIAA1057 ( 977 res) hh11838 ( 977) 582 97.3 3.6e-20 KIAA1063 ( 593 res) hj04848 ( 593) 227 46.4 4.6e-05 KIAA1453 ( 1123 res) fh14729 (1123) 192 41.6 0.0023 KIAA1891 ( 780 res) fk02783 ( 780) 177 39.3 0.0079 >>KIAA0729 ( 1196 res) hk03615 (1196 aa) initn: 7988 init1: 7988 opt: 7988 Z-score: 6170.0 bits: 1155.2 E(): 0 Smith-Waterman score: 7988; 100.000% identity (100.000% similar) in 1196 aa overlap (2217-3412:1-1196) 2190 2200 2210 2220 2230 2240 KIAA05 EKPTMLQWIELLTKQFNNSQAACEWFLDRMADDDWWPMQILIKCPNQIVRQMFQRLCIHV 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KIAA10 QVQSLFGHLMESKLQYYVPENFWKIFKMWNKELYVREQQDAYEFFTSLIDQMDEYLKKMG 100 110 120 130 140 150 1870 1880 1890 1900 1910 1920 KIAA05 KNTV-KSLFGGVITNNVVSLDCEHVSQTAEEFYTVRCQVADMKNIYESLDEVTIKDTLEG .. . :. : :. ... . :: : . : :... :.. ... :::. . ..::: KIAA10 RDQIFKNTFQGIYSDQKICKDCPHRYEREEAFMALNLGVTSCQSLEISLDQFVRGEVLEG 160 170 180 190 200 210 1930 1940 1950 1960 1970 1980 KIAA05 DNMYTCSHCGKKVRAEKRACFKKLPRILSFNTMRYTFNMVTMMKEKVNTHFSFPLRLDMT .: : : .: .: . ::.:.:.:: .: .. ::. :. . . : . .. :: :.: KIAA10 SNAYYCEKCKEKRITVKRTCIKSLPSVLVIHLMRFGFDWESGRSIKYDEQIRFPWMLNME 220 230 240 250 260 270 1990 2000 2010 2020 2030 KIAA05 PYTEDFLM---GKSERKEGFKEV------SDHSKDSESYEYDLIGVTVHTGTADGGHYYS ::: . . ..:: :. . : : ..: . . .:.:.:: ::.: : .::::: KIAA10 PYTVSGMARQDSSSEVGENGRSVDQGGGGSPRKKVALTENYELVGVIVHSGQAHAGHYYS 280 290 300 310 320 330 2040 2050 2060 2070 2080 2090 KIAA05 FIRDIVNPHAYKNNKWYLFNDAEVKPFD--SAQLASECFGGEMTTKTYDSVTDKFMDFSF ::.: .. ..::: :::. .. :: . : ::::::. :.::. :. . : KIAA10 FIKD---RRGCGKGKWYKFNDTVIEEFDLNDETLEYECFGGEYRPKVYDQ-TNPYTDVR- 340 350 360 370 380 2100 2110 KIAA05 EKTHSAYMLFYKRME------------------------------PE---EENGREYK-- .. .::::::.:. :: . . : .. KIAA10 RRYWNAYMLFYQRVSDQNSPVLPKKSRVSVVRQEAEDLSLSAPSSPEISPQSSPRPHRPN 390 400 410 420 430 440 2120 2130 2140 2150 KIAA05 ---FDVSSELL------------------EWIWHDNMQFLQDKNIFEHTYFGFMWQLCSC ... ..:. . . .:..:....... ::.:. .: : KIAA10 NDRLSILTKLVKKGEKKGLFVEKMPARIYQMVRDENLKFMKNRDVYSSDYFSFVLSLASL 450 460 470 480 490 500 2160 2170 2180 2190 2200 2210 KIAA05 IPSTLPDP--KAVSLMTAKLSTSFVLETFIHSKEKPTM--LQWIELLTKQFNNSQAACEW . : : .. .. .:. .:...:....:.: . .:: . ...: ::.: KIAA10 NATKLKHPYYPCMAKVSLQLAIQFLFQTYLRTKKKLRVDTEEWIATIEALLSKSFDACQW 510 520 530 540 550 560 2220 2230 2240 2250 2260 KIAA05 FLDRMADDDWWPMQ--ILIKCPNQIVRQMFQRLCIHVIQRLRPVHAHLYLQPGMEDGSDD ... . ... . .:..: ::.. :. . .: . . . . :. : : KIAA10 LVEYFISSEGRELIKIFLLECN---VREV--RVAVATILE-KTLDSALFYQ-------DK 570 580 590 600 610 2270 2280 2290 2300 2310 2320 KIAA05 MDTSVEDIGGRSCVTRFVRTLLLIMEHGVKPHSKHLTEYFAFLYEFA-KMGEEESQFLLS . . . .....:: .... : . :. ..:: .. :. :.: . ...:: KIAA10 LKS----------LHQLLEVLLALLDKDVPENCKNCAQYFFLFNTFVQKQGIRAGDLLLR 620 630 640 650 660 2330 2340 2350 2360 2370 2380 KIAA05 LQAISTMVHFYMGTKGPENPQVEVLSEEEGEEEEEEEDILSLAEEKYRPAALEKMIALVA .:. :. : .:.. .: :.. : ...: KIAA10 HSALRHMISFLLGASR-QNNQIRRWSSAQAREFGNLHNTVALLVLHSDVSSQRNVAPGIF 670 680 690 700 710 720 2390 2400 2410 2420 2430 2440 KIAA05 LLVEQSRSERHLTLSQTDMAALTGGKGFPFLFQHIRDGINIRQTCNLIFSLCRYNNRLAE KIAA10 KQRPPISIAPSSPLLPLHEEVEALLFMSEGKPYLLEVMFALRELTGSLLALIEMVVYCCF 730 740 750 760 770 780 >>KIAA1063 ( 593 res) hj04848 (593 aa) initn: 200 init1: 87 opt: 227 Z-score: 182.8 bits: 46.4 E(): 4.6e-05 Smith-Waterman score: 303; 24.179% identity (52.836% similar) in 335 aa overlap (1761-2055:245-565) 1740 1750 1760 1770 1780 1790 KIAA05 WVMAQHMQSHAPYKWDYWPHEDVRAECRFVGLTNLGATCYLASTIQQLYMIPEARQAVFT :: ::: ::.. .: : : :. .. 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KIAA14 ----VLLQKIEFEPASKSFSYQLEALKSKYVLLNPKTEG-ASRHKSGDDPPARRQGSEHT 40 50 60 70 80 90 1730 1740 1750 1760 1770 KIAA05 YRLIHNWVMAQHMQSHAPYKWDYWPHE--DVRAECRF---VGLTNLGATCYLASTIQQLY :. . : :: : .: : ..: : : .:: ::: ::.: .::: : KIAA14 YESCGDGV-------PAPQKV-LFPTERLSLRWERVFRVGAGLHNLGNTCFLNATIQCLT 100 110 120 130 140 1780 1790 1800 1810 1820 1830 KIAA05 MIPEARQAVFTAKYSEDMKHKTTLLELQKMFTYLMESECKAYN---PRPFCKTYTMDKQP . : . ... ..... :. .. : : ...... .. : : : . . KIAA14 YTPPLANYLLSKEHARSC-HQGSFCMLCVMQNHIVQAFANSGNAIKPVSFIRDLKKIARH 150 160 170 180 190 200 1840 1850 1860 1870 1880 KIAA05 LNTGEQKDMTEFFTDLITKIEE--------MSPELKNT--VKSLFGGVITNNVVSLDCEH . :.:.: ::. : ... .. . . : :...::: . . : :. KIAA14 FRFGNQEDAHEFLRYTIDAMQKACLNGCAKLDRQTQATTLVHQIFGGYLRSRVKCSVCKS 210 220 230 240 250 260 1890 1900 1910 1920 1930 1940 KIAA05 VSQTAEEFYTVRCQVADMKNIYESLDEVTIKDTLEGDNMYTCSHCGKKVRAEKRACFKKL ::.: . . : .. . :: ..:. . :.: :.: : :..: ::: : :: ... 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