# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh02280.fasta.huge -Q ../query/KIAA0568.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0568, 1426 aa vs ./tmplib.23663 library 1986079 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.3032+/-0.0118; mu= -8.3153+/- 0.795 mean_var=576.0756+/-140.791, 0's: 0 Z-trim: 43 B-trim: 88 in 1/39 Lambda= 0.053436 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0866 ( 1984 res) hk00546s1 (1984) 464 52.6 8.2e-07 KIAA0004 ( 1307 res) ha00065 (1307) 408 48.1 1.3e-05 KIAA1319 ( 1208 res) fh13717 (1208) 362 44.5 0.00014 KIAA1000 ( 1956 res) hk09604y2 (1956) 362 44.8 0.00019 KIAA1081 ( 1003 res) bg00262 (1003) 341 42.7 0.0004 KIAA0635 ( 864 res) hj03253 ( 864) 320 41.0 0.0011 KIAA0336 ( 1635 res) hg01120 (1635) 316 41.1 0.002 KIAA1167 ( 834 res) hj01786(revised) ( 834) 300 39.4 0.0032 KIAA1074 ( 1715 res) hj06637 (1715) 305 40.3 0.0037 KIAA1276 ( 1068 res) fh00139s1 (1068) 300 39.6 0.0037 KIAA1009 ( 1345 res) hj03795(revised) (1345) 302 39.9 0.0038 KIAA2034 ( 1571 res) ah04445 (1571) 301 39.9 0.0044 KIAA1512 ( 2010 res) fg04660y1 (2010) 300 40.0 0.0053 KIAA0949 ( 1559 res) af07325 (1559) 291 39.2 0.0074 >>KIAA0866 ( 1984 res) hk00546s1 (1984 aa) initn: 257 init1: 79 opt: 464 Z-score: 214.2 bits: 52.6 E(): 8.2e-07 Smith-Waterman score: 636; 23.223% identity (57.425% similar) in 1266 aa overlap (154-1328:736-1960) 130 140 150 160 170 180 KIAA05 PTDPEALALADSLGSQYRSVRQKAAGSKRTLQQRYEVLKTENPGDASDLQGRQLLAGLDK ..::::.: . : . ..:.: . : KIAA08 LVLEQLRCNGVLEGIRICRQGFPNRIVFQEFRQRYEIL-AANAIPKGFMDGKQACILMIK 710 720 730 740 750 760 190 200 210 220 230 240 KIAA05 VASDLDRQEKAITGILRPPLEQGRAVQDSAERAKDLKNITNELLRIEPEKTRSTAEGEAF : .:: . : : . .. : : :. .::: ::. .. .. :. .:: KIAA08 -ALELDPNLYRI-GQSKIFFRTG--VLAHLEEERDLK-ITDVIMAFQAM-CRGYLARKAF 770 780 790 800 810 250 260 270 280 290 300 KIAA05 IQALPG-SGTTPLLRTQVEDTNRKYEHLLQLLDLAQEKVDVANRLEKSLQQSWELLATHE . .. . :. . . . . .:. .. ..:. . :. . :: :.: KIAA08 AKRQQQLTAMKVIQRNCAAYLKLRNWQWWRLFTKVKPLLQVTRQEEEMQAKEDELQKTKE 820 830 840 850 860 870 310 320 330 340 350 KIAA05 NHLNQDDTVPESSRVLDSKGQELAAMACELQAQKSLLGEVEQ---NLQAAKQ----CSST . . .. . : . .. .: . .:::. : .:.:. : : :: KIAA08 RQQKAENELKELEQKHSQLTEEKNLLQEQLQAETELYAEAEEMRVRLAAKKQELEEILHE 880 890 900 910 920 930 360 370 380 390 400 410 KIAA05 LASRFQEHCPDLERQEAEVHKLGQRFNNLRQQVERRA---QSLQSAKAAYE-HFHRGHDH . .:..:. .. .:: .:..:.. .:..:.:.. :.:: :.. : .... .:. 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KIAA13 EGFQKP--------SASLSQLESQNQ-------LLQERLQAEEREKTVLQSTNRKLERKV 1050 1060 1070 1080 1260 1270 1280 1290 1300 1310 KIAA05 NMAATETRDLRNMTVADSGTNHDSRLWSLERELDDLKRLSKDKDLE-IDELQKRLGSVAV . . . .: :. : :. . . :. .:.:..:. ....: .: :.:. . KIAA13 KELSIQIEDERQH-VNDQKDQLSLRVKALKRQVDE-----AEEEIERLDGLRKKAQREVE 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1320 1330 1340 1350 1360 1370 KIAA05 KREQRENHLRRSIVVIHPDTGRELSPEEAHRAGLIDWNMFVKLRSQECDWEEISVKGPNG .... ...:. : .. :. :. : :. : KIAA13 EQHEVNEQLQARIKSLEKDSWRKASRSAAESALKNEGLSSDEEFDSVYDPSSIASLLTES 1150 1160 1170 1180 1190 1200 1380 1390 1400 1410 1420 KIAA05 ESSVIHDRKSGKKFSIEEALQSGRLTPAQYDRYVNKDMSIQELAVLVSGQK KIAA13 NLQTSSC >>KIAA1000 ( 1956 res) hk09604y2 (1956 aa) initn: 243 init1: 85 opt: 362 Z-score: 171.8 bits: 44.8 E(): 0.00019 Smith-Waterman score: 500; 21.340% identity (56.410% similar) in 1209 aa overlap (154-1257:740-1912) 130 140 150 160 170 180 KIAA05 PTDPEALALADSLGSQYRSVRQKAAGSKRTLQQRYEVLKTENPGDASDLQGRQLLAGLDK ..::: .:. .. .. ...:. :. . KIAA10 LVLQQLRCNGVLEGTRICREGFPNRLQYADFKQRYCILNPRTFPKSKFVSSRK--AAEEL 710 720 730 740 750 760 190 200 210 220 230 KIAA05 VAS-DLDRQEKAITGILRPPLEQGRAVQDSAERAKDLKNI--------TNELLRIEPEKT ..: ..:. . . :: . .. : : : : . :... ..:.::. .: KIAA10 LGSLEIDHTQYRF-GITKVFFKAGFLGQLEAIRDERLSKVFTLFQARAQGKLMRIKFQKI 770 780 790 800 810 820 240 250 260 270 280 KIAA05 RSTAEGEAFIQ----ALPGSGTTPLLRT--QVEDTNRKYEHLLQLLDLAQEKVDVANRLE .. .:: :. . . : .: ... .. : .. : .: ... . :: KIAA10 LEERDALILIQWNIRAFMAVKNWPWMRLFFKIKPLVKSSEVGEEVAGLKEECAQLQKALE 830 840 850 860 870 880 290 300 310 320 330 KIAA05 KSLQQSWELLATHENHLNQD--DTVPESSRVLDSKGQELAAMA--CELQAQKSL-----L :: : :: : . . :.:. : . . :... . :: . :: .... . 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KIAA10 V-ENEKGLVAQL-------QKTVKELQTQIKDLKEKLEAERTTRAKMERERADL-TQDLA 1120 1130 1140 1150 1160 570 580 590 600 610 620 KIAA05 KIRKELDEETERRRQLENEVKSTQEEIWTLRNQGPQESVVRKEVLKKVPDPVLEESFQQL . ..: ::. . :. . :: . .. .:.... :. . .:. .: KIAA10 DLNERL-EEVGGSSLAQLEITKKQETKFQKLHRDMEEATLHFETTSASLKKRHADSLAEL 1170 1180 1190 1200 1210 1220 630 640 650 660 670 KIAA05 QRTLAEEQHKNQLLQEELEALQLQ----LRALEQETRD--GGQEYVVKEVLRIEPDRAQA . . . :. .: :... :::. : .:: :: .... . :.. :. KIAA10 EGQVENLQQVKQKLEKDKSDLQLEVDDLLTRVEQMTRAKANAEKLCTLYEERLHEATAKL 1230 1240 1250 1260 1270 1280 680 690 700 710 720 730 KIAA05 DEVLQLREELEALRRQKGAREAEVLLLQQRVAALAEEKSRAQEKVTEKEVVKLQNDPQLE :.: :: ..: : . . .. .: : .. :: .. :: . . : ... :... . : KIAA10 DKVTQLANDLAAQKTKLWSESGEFLRRLEEKEALINQLSREKSNFT-RQIEDLRGQLEKE 1290 1300 1310 1320 1330 1340 740 750 760 770 780 790 KIAA05 AEYQQ-----LQEDHQRQDQLREKQEEELSFLQDKLKRLEKERA-MAEGKITVKE-VLKV .. :. ::. .. : :::. ::: . . : : : :.. .. .. :.. 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KIAA10 LEMLQSKGLSAKATEEDHERTRRLAEA----EMHVHHLE---SLLEQKEKENSMLREEMH 330 340 350 360 370 560 570 580 590 600 KIAA05 R---NRPDSGVEEAWKIRKELDEETERRRQLENEVKSTQEEIWTLRNQGPQESVVRKEVL : : :::. .: . :. . . ..: ... .::: :...: . :.: . KIAA10 RRFENAPDSAKTKALQTVIEMKD--SKISSMERGLRDLEEEIQMLKSNGALSTEEREEEM 380 390 400 410 420 430 610 620 630 640 650 660 KIAA05 KKVPDPVLEESFQQLQRTLAEEQHKNQLLQEELEALQLQLRALEQETRDGGQEY-VVKEV :.. : . . .. ... ... . . :: ::: .:..: .. :. :. :.:: KIAA10 KQME--VYRSHSKFMKNKIGQVKQELSRKDTELLALQTKLETLTNQFSDSKQHIEVLKES 440 450 460 470 480 490 670 680 690 700 710 720 KIAA05 LRIEPDRAQADEVLQLREELEALRRQKGAREAEVLLLQQRVAALAEEK-SRAQEKVTEKE : . .:: .:: :..::: . .:. . ... .:::: ..: : :. KIAA10 LTAKEQRA---AILQT--EVDALRLRLEEKETMLNKKTKQIQDMAEEKGTQAGEIHDLKD 500 510 520 530 540 730 740 750 760 770 780 KIAA05 VVKLQNDPQLEAEYQQLQEDHQR-QDQLREKQEEELSFLQDKLKRLEKERAMAEGKITVK .. .. : . . ::. . :.:::.: :...: :....: :. . . .. .:. KIAA10 MLDVK-----ERKVNVLQKKIENLQEQLRDK-EKQMSSLKERVKSLQADTTNTDTALTTL 550 560 570 580 590 600 790 800 810 820 830 KIAA05 EVLKVEKDAATER-----EVSDLTRQYE-DEAAKARASQREKTELLRKIWALEEENAKVV : .::. . :: . .. .: : :. : . .::. ::. . :.: . . KIAA10 EEALAEKERTIERLKEQRDRDEREKQEEIDNYKKDLKDLKEKVSLLQGDLS-EKEASLLD 610 620 630 640 650 660 840 850 860 870 880 890 KIAA05 VQEKVREIVRPDPKAESEVANLRLELVEQERKYRGAEEQLR-SYQSELEALRRRGPQV-- ..:.. .. : .:.. .:.. : ..... : ::. .... ::: : .:.. KIAA10 LKEHASSLASSGLKKDSRLKTLEIALEQKKEECLKMESQLKKAHEAALEA--RASPEMSD 670 680 690 700 710 900 910 920 930 940 950 KIAA05 EVKEVTKEVIKYKTDP-EMEKELQRLREEIVDKTRLIERCDLEIYQLKKEIQALKDTKPQ ..... .:. .:: . . . :..:: : . : :. : . . :...: . . . KIAA10 RIQHLEREITRYKDESSKAQAEVDRLLE--ILKEVENEKNDKD--KKIAELESLTSRQVK 720 730 740 750 760 770 960 970 980 990 1000 1010 KIAA05 VQTKEVVQEILQFQEDPQTKEEVASLRAKLSEEQKKQVDLERERASQ-EEQIARKEEELS :.:.:.. :. .:. . :. :.. :: ... : . ..: .... .:.... KIAA10 DQNKKVAN--LKHKEQVEKKKS-----AQMLEEARRREDNLNDSSQQLQDSLRKKDDRIE 780 790 800 810 820 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA05 RVKERVVQQEVVRYEEEPGLRAEASAFAES---IDVELRQIDKLRAELRRLQRRRTELER ...: . .. . :.: : : :: ... .. : ..:.. ::. .. . . .. KIAA10 ELEEALRESVQITAEREMVLAQEESARTNAEKQVEELLMAMEKVKQELESMKAKLSSTQQ 830 840 850 860 870 880 1080 1090 1100 1110 1120 KIAA05 QLEELERE----RQARREAEREVQRLQQR--LAALEQEEAE-AREKVTHTQKVVLQQDPQ .: : : . : ::. .:: ...:. :::. ...:. : ... ..: . .. KIAA10 SLAEKETHLTNLRAERRKHLEEVLEMKQEALLAAISEKDANIALLELSSSKKKTQEEVAA 890 900 910 920 930 940 1130 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA05 QAREHALLRLQLEEE-QHRRQLLEGELETLRRKLAALEKAEVKEKVVLSESVQVEKGDTE ::. : ::... :.: .:. . : KIAA10 LKREKDRLVQQLKQQTQNRMKLMADNYEDDHFKSSHSNQTNHKPSPDQDEEEGIWA 950 960 970 980 990 1000 >>KIAA0635 ( 864 res) hj03253 (864 aa) initn: 162 init1: 86 opt: 320 Z-score: 157.8 bits: 41.0 E(): 0.0011 Smith-Waterman score: 377; 22.129% identity (56.220% similar) in 836 aa overlap (567-1346:37-831) 540 550 560 570 580 590 KIAA05 LRQQPEVEVTHETLQRNRPDSGVEEAWKIRKELDEETERRRQLENEVKSTQEEIWTLRNQ ..: .: . :: .... .::. :.. KIAA06 ANKDLEKRIRELMETKETVTSEVVNLSNKNEKLCQELTEIDQLAQQLERHKEEL--LETA 10 20 30 40 50 60 600 610 620 630 640 650 KIAA05 GPQESVVRKEVLKKVPD-PVLEESFQQLQRTLAEEQHKNQLLQEELEA---LQLQLRALE . . ..::. .:. . :::.. .:: : :.... :..:: . :. .. :: KIAA06 DKELGEAKKEIKRKLSEMQDLEETMAKLQLELNLCQKEKERLSDELLVKSDLETVVHQLE 70 80 90 100 110 120 660 670 680 690 700 KIAA05 QETRDGGQEY----VVKEVLRIEPDRAQADEVLQLREE--------LEALRRQKGAREAE :: . ... :... : .: .: . .. .. :.. :....... . : KIAA06 QEKQRLSKKVESFAVTERQLTLEVERMRLEHGIKRRDRSPSRLDTFLKGIEEERDYYKKE 130 140 150 160 170 180 710 720 730 740 KIAA05 VLLLQ---QR----VAALAEEKS---RAQEK---VTE-KEVVKLQNDPQLEAE-YQQLQE . :: :: .. :.::: :. :: .: ..... ... : : ... .: KIAA06 LERLQHIIQRRSCSTSYSAREKSSIFRTPEKGDYNSEIHQITRERDELQRMLERFEKYME 190 200 210 220 230 240 750 760 770 780 790 800 KIAA05 DHQRQDQLREKQEEELSFL----QDKLKRLEKERAMAEGKITVKEVLKVEKDAATEREVS : : . .: ....:: : :..:. :.:: ... . .. ... ::. : .: KIAA06 DIQSNVKLLTAERDKLSVLYNEAQEELSALRKESTQTTAPHNIVSLMEKEKELA----LS 250 260 270 280 290 300 810 820 830 840 850 860 KIAA05 DLTR-QYEDEAAKARASQREKTELLRKIWALEEENAKVVVQEKVREIVRPDPKAESEVAN :: : . : :: . . . :.. :. : ::. ... .. : . . :.. . . KIAA06 DLRRIMAEKEALREKLEHIEEVSLFGKS-ELEKTIEHLTCVNHQLESEKYELKSKVLIMK 310 320 330 340 350 870 880 890 900 910 KIAA05 LRLELVE-----QERKYRGAEEQLRSYQSELEALRRRGPQVE--VKEVTKEVIKYKTDPE .: .: : .:. . . ..:...:: . :.. : . ... . . : KIAA06 ETIESLENKLKVQAQKFSHVAGDSSHQKTEVNSLRIVNEQLQRSVDDYQHRLSIKRGELE 360 370 380 390 400 410 920 930 940 950 960 970 KIAA05 MEKELQRLREEIVDKTRL-IERCDLEIYQLKKEIQALKDTKPQVQ--TKEVVQEILQFQE . .. :: .:. : . : : . .:: : .. : .: . : ...: ..:: KIAA06 SAQAQIKILEEKIDELNLKMTSQDEEAHVMKKTIGVIDKEKDFLQETVDEKTEKIANLQE 420 430 440 450 460 470 980 990 1000 1010 1020 KIAA05 DPQTKEE-VASLRAKLSEEQKKQVDLERERASQEEQIARKEEELSRVKERVVQQEVVRYE . .::. ::... .:: ... .:. : .. ...:.. ... : .... : KIAA06 NLANKEKAVAQMKIMISECESSVNQLK-------ETLVNRDREINSLRR---QLDAAHKE 480 490 500 510 520 1030 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA05 EEPGLRAEASAFAESIDVELRQIDKLRAELRRLQRRRTELERQLEELERERQARREAERE . :.. :: :. : : : . :. :. ::: ..: :. .. .. : KIAA06 LDEVGRSREIAFKEN----RRLQDDLATMARENQEISLELEAAVQEKEEMKSRVHKYITE 530 540 550 560 570 580 1090 1100 1110 1120 1130 1140 KIAA05 VQRLQQRLAALEQEEAEA--REKVTHTQKVVLQQDPQQAR-EHALLRLQLEEEQHRRQLL :.: .. .:: :.:. . : .. :.. . .::. : . .::.: . KIAA06 VSRWESLMAAKEKENQDLLDRFQMLHNRAEDWEVKAHQAEGESSSVRLELLS-------I 590 600 610 620 630 1150 1160 1170 1180 1190 1200 KIAA05 EGELETLRRKLAALEKAEVKEKVVLSESVQVEKGDTEQEIQRLKSSLEEESRSKRELDVE . : . ::... ::: :..:.. .. . . .. . ..::. :... : . . KIAA06 DTERRHLRERVELLEK-EIQEHINAHHAYESQISSMAKAMSRLEEELRHQEDEKATVLND 640 650 660 670 680 690 1210 1220 1230 1240 1250 1260 KIAA05 VSRLEARLSELEFHNSKSSKELDFLREENHKLQLERENLQLETRRLQSEINMAATETRDL .: :. .:. .. ...:. : ... .: ::.. :. :..... ...: KIAA06 LSSLRELCIKLDSGKDIMTQQLNSKNLEFERVVVELENVKSESDLLKKQLSNERHTVKNL 700 710 720 730 740 750 1270 1280 1290 1300 1310 1320 KIAA05 RNMTVADSGTNHDSRLWSLERELDDLKRLSKDKDLEIDELQKRLGSVAVK--REQREN-H ... . ::.:... : . :..:: ::. :...: : ..::: KIAA06 ESLLA----TNRDKEFHS--------HLTSHEKDTEIQLLKEKLTLSESKLTSQSRENTM 760 770 780 790 800 1330 1340 1350 1360 1370 1380 KIAA05 LRRSIVVIHPDTG---RELSPEEAHRAGLIDWNMFVKLRSQECDWEEISVKGPNGESSVI :: ... .. : :..: :. .: KIAA06 LRAKVAQLQTDYDALKRQISTERYERERAIQEMRRHGLATPPLSSTLRSPSHSPEHRNV 810 820 830 840 850 860 >>KIAA0336 ( 1635 res) hg01120 (1635 aa) initn: 152 init1: 85 opt: 316 Z-score: 153.4 bits: 41.1 E(): 0.002 Smith-Waterman score: 581; 22.311% identity (55.887% similar) in 1376 aa overlap (134-1423:83-1385) 110 120 130 140 150 160 KIAA05 ELMDSAGNKLIAPAVCFVIPPTDPEALALADSLGSQYRSVRQKAAGSKRTLQQRYEVLKT ..: .. .::.: . .: .::.. : .. KIAA03 MKQEVEDSVTKMGDAHKELEQSHINYVKEIENLKNELMAVRSKYSEDKANLQKQLE--EA 60 70 80 90 100 110 170 180 190 200 210 KIAA05 ENPGDASDLQGRQLLAGLDKVASDLDRQEKAITGILRPPL---EQGRAVQD-SAERAKDL : . : . . :.: . .. :: :. . : .: :. : . : . .: KIAA03 MNTQLELSEQLKFQNNSEDNVKKLQEEIEKIRPGFEEQILYLQKQLDATTDEKKETVTQL 120 130 140 150 160 170 220 230 240 250 260 270 KIAA05 KNITNELLRIEPEKTRSTAEGEAFIQALPGSGTTPLLRTQVEDTNRKYE-HLLQLLDLAQ .:: . . .. : : ..:. . :. :.: . ...: .. .: .: . KIAA03 QNIIEANSQHYQKNINSLQEELLQLKAIHQEEVKELM-CQIEASAKEHEAEINKLNELKE 180 190 200 210 220 280 290 300 310 320 KIAA05 EKVDVANRLEKSLQQSWEL----LATHENHLNQDDTV-----PESS---RVLDSKGQELA . : . ::..:...: : .. :::. . :.. .:.. : ..: KIAA03 NLVKQCEASEKNIQKKYECELENLRKATSNANQDNQICSILLQENTFVEQVVNEKVKHLE 230 240 250 260 270 280 330 340 350 360 370 380 KIAA05 AMACELQAQKSLLGEVEQNLQAAKQCSSTLASRFQEHCPDLERQEAEVHKLGQRFNNLRQ ::..:.:.: . .. : :...... ::.. : ..:.: KIAA03 DTLKELESQHSILKDEVTYMNNLKLKLEMDAQHIKDEFFH-EREDLEF-----KINELLL 290 300 310 320 330 340 390 400 410 420 430 440 KIAA05 QVERRAQSLQSAKAAYEHFHRGHDH-VLQFLVSIPSYEPQETDSLSQM-ETKLKNQKNLL :... ... :. ... . : : . : . :. .:.. :: :..... KIAA03 AKEEQGCVIEKLKSELAGLNKQFCYTVEQHNREVQSLKEQHQKEISELNETFLSDSEKEK 350 360 370 380 390 400 450 460 470 480 490 500 KIAA05 DEIASREQEVQKICANSQQYQQ-AVKDYELEAEKLRSLLDLENGRSS-HVSKR--ARLQS . . : ... : : :: .: :. .:: : .. .:. : :.:. ..:.. . :. KIAA03 LTLMFEIQGLKEQCENLQQEKQEAILNYESLREIME-ILQTELGESAGKISQEFESMKQQ 410 420 430 440 450 460 510 520 530 540 550 KIAA05 PATKVKEEEAALAAKFTEVYAI--NRQRLQNLEFALNLLRQQ---PEVEVTHETLQRNRP :. :.: . : . ::: :. . .:::. . .:: :: ::.: : ..::.. KIAA03 QASDVHELQQKLRTAFTEKDALLETVNRLQGENE--KLLSQQELVPELENTIKNLQEKNG 470 480 490 500 510 520 560 570 580 590 600 KIAA05 DSGVEEAWK--IRKELDEE----TERRRQLENEVKSTQEEIWTLRNQGPQESVVRKEVLK . . . . :::. . ::.. .. :..:...::. ..... .: . :. : KIAA03 VYLLSLSQRDTMLKELEGKINSLTEEKDDFINKLKNSHEEMDNFHKKCEREERLILELGK 530 540 550 560 570 580 610 620 630 640 650 660 KIAA05 KVPDPV-----LEESFQQLQRTLAEEQHKNQLLQEELEALQLQLRALEQETRDGGQEYVV :: . . ::.. ..: : : .... ...:: :..:...: .. .: . KIAA03 KVEQTIQYNSELEQKVNELTGGLEETLKEKDQNDQKLEKLMVQMKVLSED-----KEVLS 590 600 610 620 630 670 680 690 700 710 720 KIAA05 KEVLRI-EPDRAQADEVLQLREELEALRRQKG--AREAEVLLLQQRVAALAEEKSRAQEK :: . : . ..: :: ..::.. :: . .. :.... ..::.. .. KIAA03 AEVKSLYEENNKLSSEKKQLSRDLEVFLSQKEDVILKEHITQLEKKLQLMVEEQDNLNKL 640 650 660 670 680 690 730 740 750 760 KIAA05 VTEKEVVKLQNDPQLEAEYQQL----QEDHQRQD----------QLREKQEEE--LSFLQ . ...: :: :: . ... .:: ...: .: . .::. :.: . KIAA03 LENEQVQKLFVKTQLYGFLKEMGSEVSEDSEEKDVVNVLQAVGESLAKINEEKCNLAFQR 700 710 720 730 740 750 770 780 790 800 810 820 KIAA05 D-KLKRLEKE-RAMAEGKITVKEVLK-VEKDAATEREVSDLTRQYEDEAAKARASQREKT : :. .:::: . . : ... : :: . .: :. . : .. :. .. .: : . KIAA03 DEKVLELEKEIKCLQEESVVQCEELKSLLRDYEQEKVL--LRKELEEIQSEKEALQSDLL 760 770 780 790 800 810 830 840 850 860 870 880 KIAA05 ELLRKIWALEEENAKVVVQEKVREIVRPDPKAESEVANLRLELVEQERKYRGAEEQLRSY :. . :: ....: :.:. . : ::. : :.:. . .:.:. KIAA03 EMKNANEKTRLENQNLLIQ--VEEVSQTCSK--SEIHN------EKEKCFIKEHENLKPL 820 830 840 850 860 890 900 910 920 930 KIAA05 QSELEALRRRGPQVEVKEVTKEVIKYKTDP-----EMEKELQRLREEIVDKTRLIERCDL . : ::. . .:. . . :.:: :.:.... :..: .: . :.. : KIAA03 LEQKELRDRRAELILLKDSLAKSPSVKNDPLSSVKELEEKIENLEKECKEKEEKINKIKL 870 880 890 900 910 920 940 950 960 970 980 KIAA05 EIYQLKKEIQALKDTKPQVQTKEVVQEILQFQEDP---------QTKEEVASLRAKLSEE . ::: : ... ..:: . : :. ..: : : .: . :. KIAA03 VAVKAKKE---LDSSRKETQTVKEELESLRSEKDQLSASMRDLIQGAESYKNLLLEY-EK 930 940 950 960 970 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA05 QKKQVDLERERASQEEQIARKEEELSRVKERVVQQEVVRYEEEPGL-RAEA-SAFAESID :..:.:.:.:::.. :. : :. .... ..: :.. ..: : : :. .. :. .. KIAA03 QSEQLDVEKERANNFEH--RIEDLTRQLRNSTLQCETINSDNEDLLARIETLQSNAKLLE 980 990 1000 1010 1020 1030 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA05 VELRQIDKLRAELRRLQRRRTELERQLEELERERQARREAER--EVQRLQQRLAALEQEE :.. .... .: . . ::: :.:..:.. ...: :...:: .: :.: KIAA03 VQILEVQRAKAMVDK------ELEA--EKLQKEQKIKEHATTVNELEELQVQL----QKE 1040 1050 1060 1070 1080 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA05 AEAREKVTHTQKVVLQQDPQQAREHALLRLQLEEEQHRRQLLEGELETLRRKLAALEKAE . .:. . ..: ..: ::. .:. ... . .. . :. .: . :. ::. : KIAA03 KKQLQKTMQELELV-KKDAQQT---TLMNMEIADYERLMKELNQKLTNKNNKIEDLEQ-E 1090 1100 1110 1120 1130 1140 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA05 VKEKVVLSESVQVEKGDTEQE-IQRLKSSLEEESRSKRELDVEVSRLEARLSELEFHNSK .: .: .: .: :: : :.::... .: ......: .. .. :. .:: KIAA03 IK--------IQKQKQETLQEEITSLQSSVQQY----EEKNTKIKQLLVKTKK-ELADSK 1150 1160 1170 1180 1230 1240 1250 1260 1270 1280 KIAA05 SSKELDFLREENHKLQLERENLQLETRRLQ-SEINMAATETRDLRNMTVADSGTNHDSRL ... .. . . : .:: . :.:. ..: .:: ..: . ... . :. .:. : KIAA03 QAETDHLILQASLKGELEASQQQVEVYKIQLAEI---TSEKHKIHEH-LKTSAEQHQRTL 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1290 1300 1310 1320 1330 1340 KIAA05 WSLERELDDLKRLSKDKDLEIDELQKRLGSVAVKREQRENHLR-RSIVVIHPDTGRELSP . .... :.. . : . ... : :. .. .. . .:. . . ... KIAA03 SAYQQRVTALQEECRAAKAEQATVTSEFESYKVRVHNVLKQQKNKSMSQAETEGAKQ--- 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1350 1360 1370 1380 1390 KIAA05 EEAHRAGLIDWNMFVKLRSQECDWE-EIS-VKGPNGESSVIHDR--KSGKKFSIEEALQS :. : ::: .. .::.... . . ..: .. ..: ... .: : .. .:: KIAA03 EREHLEMLID-QLKIKLQDSQNNLQINVSELQTLQSEHDTLLERHNKMLQETVSKEAELR 1310 1320 1330 1340 1350 1400 1410 1420 KIAA05 GRLTPAQYDRYVNKDMSIQELAVLVSGQK .: : . .. :. : .. :.: KIAA03 EKLCSIQSENMMMKSEHTQTVSQLTSQNEVLRNSFRDQVRHLQEEHRKTVETLQQQLSKM 1360 1370 1380 1390 1400 1410 >>KIAA1167 ( 834 res) hj01786(revised) (834 aa) initn: 160 init1: 70 opt: 300 Z-score: 149.6 bits: 39.4 E(): 0.0032 Smith-Waterman score: 351; 23.495% identity (55.360% similar) in 681 aa overlap (671-1320:2-635) 650 660 670 680 690 700 KIAA05 LEALQLQLRALEQETRDGGQEYVVKEVLRIEPDRAQADEVLQLREELEALRRQKGAREAE : .: :: ..:.:: . : . .: KIAA11 EEFQRMQA-QLLELRTNNYQLSDELRKNGVE 10 20 30 710 720 730 740 750 KIAA05 VLLLQQRVAALAEEKSRAQEKVTE----KEV-VKLQNDPQLEAEYQQLQEDHQRQDQLRE . :.:.:: : .: :.::. ... .:: : :... .:.:. .. .:: . :.. KIAA11 LTSLRQKVAYLDKEFSKAQKALSKSKKAQEVEVLLSENEMLQAKLHSQEEDFRLQNST-- 40 50 60 70 80 760 770 780 790 800 810 KIAA05 KQEEELSFLQDKLKRLEKERAMAEGKITVKEVLKVEKDAATEREVSDLTRQYEDEAAKAR :.: : .....::.: . :..:. :.. . : . . KIAA11 -LMAEFSKLCSQMEQLEQENQQL-------------KEGAAGAGVAQAGPLVDGELLRLQ 90 100 110 120 130 820 830 840 850 860 870 KIAA05 ASQREKTELLRKIWALEEENAKVVVQ-EKVREIVRPDPKAESEVANLRLELVEQERKYRG : :.: : ... ::.:. .: . . : : : . . .. . :.: : :.. KIAA11 A---ENTALQKNVAALQERYGKEAGKFSAVSEGQGDPPGGPAPTVLAPMPLAEVELKWEM 140 150 160 170 180 190 880 890 900 910 920 930 KIAA05 AEEQLRSYQSELEALRRRGPQVEVKEVTKEVIKYKTDPEMEKE----LQRLREEIVDKTR .:. : .:..:. . :.:.... .:. : . . ..: :: .: . . . KIAA11 EKEEKRLLWEQLQGLES-SKQAETSRLQEELAKLSEKLKKKQESFCRLQTEKETLFNDS- 200 210 220 230 240 940 950 960 970 980 KIAA05 LIERCDLEIYQLKKEI----QALKDTKPQVQTKEVVQEILQFQEDPQTK--EEVASLRAK : .: : .:: : . : : . . . : . ..... : . :..:.::: KIAA11 ---RNKIEELQQRKEADHKAQLARTQKLQQELEAANQSLAELRDQRQGERLEHAAALRAL 250 260 270 280 290 300 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA05 LSEEQKKQVDLERERA---SQEEQIARKEEELSRVKERVVQQEVVRYEEEPGLRAEASAF .. . ...: ... .... . . : ... .:. . :. :: :: . KIAA11 QDQVSIQSADAQEQVEGLLAENNALRTSLAALEQIQTAKTQELNMLREQTTGLAAELQQQ 310 320 330 340 350 360 1050 1060 1070 1080 1090 1100 KIAA05 AESIDVELRQIDKLRAELRRLQRRRTELERQLEELERERQARREAEREVQRLQQRLAALE . . : : : ..:.. : ..: .::.:. .:. :. .:.::. . : KIAA11 QAEYEDLMGQKDDLNSQLQESLRANSRLLEQLQEIGQEK------EQLTQELQEARKSAE 370 380 390 400 410 420 1110 1120 1130 1140 1150 1160 KIAA05 QEEAEAREKVTHTQKVVLQQDPQQAREHALLRLQLEEEQHRRQLLEGELETLRRKLAALE ...: : . .: ::. :. .: . .::. :....: : .:.: :. KIAA11 KRKAMLDELAMET----LQEKSQHKEELGAVRLR-----HEKEVL-GVRARYERELRELH 430 440 450 460 470 1170 1180 1190 1200 1210 1220 KIAA05 KAEVKEKVVLSESVQVEKGDTEQEIQRLKSSLEEESRSKRELDVEVSRLEARLSELEFHN . . ... : ... ::. : .:.. :....:: . . . .: . .: ::.: : KIAA11 EDKKRQEEELRGQIREEKART-RELETLQQTVEELQAQVHSMDGAKGWFERRLKEAEESL 480 490 500 510 520 1230 1240 1250 1260 1270 KIAA05 SKSSKELDF-LRE--ENHKLQLERENLQLETRRLQSEINMAATETRDLRNMTVAD----- .....: . :.. :.: .:. .. .:. : : : : : :: . :... KIAA11 QQQQQEQEEALKQCREQHAAELKGKEEELQDVRDQLE---QAQEERDCHLKTISSLKQEV 530 540 550 560 570 580 1280 1290 1300 1310 1320 KIAA05 SGTNHDSRLWSLERE----LDDLKRLSKDKDLEIDELQKRLGSVAVKREQRENHLRRSIV . : .:. ::.. : :::: . . . :.::.:: .. .. ..: KIAA11 KDTVDGQRI--LEKKGSAALKDLKRQLHLERKRADKLQERLQDILTNSKSRSGLEELVLS 590 600 610 620 630 640 1330 1340 1350 1360 1370 1380 KIAA05 VIHPDTGRELSPEEAHRAGLIDWNMFVKLRSQECDWEEISVKGPNGESSVIHDRKSGKKF KIAA11 EMNSPSRTQTGDSSSISSFSYREILREKESSAVPARSLSSSPQAQPPRPAELSDEEVAEL 650 660 670 680 690 700 >>KIAA1074 ( 1715 res) hj06637 (1715 aa) initn: 202 init1: 79 opt: 305 Z-score: 148.6 bits: 40.3 E(): 0.0037 Smith-Waterman score: 421; 20.331% identity (56.762% similar) in 1087 aa overlap (222-1256:645-1685) 200 210 220 230 240 250 KIAA05 EKAITGILRPPLEQGRAVQDSAERAKDLKNITNELLRIEPEKTRSTAEGEAFIQALPGSG .:. ::... ... : . . . :. KIAA10 LQMKEVKSTEKEKRTSKESVNSPVFGKASLLTGGLLQVDDDSSLSEIDEDEGRPTKKTSN 620 630 640 650 660 670 260 270 280 290 300 KIAA05 TTPLLRTQVEDTNRKYEHLLQLLDLAQEKVDVANRLEKSLQQSWELLATHENH----LNQ ...:... . . : : . :.: .. . :... : :. . . :. KIAA10 EKNKVKNQIQSMD-DVDDLTQSSETASEDCELPHSSYKNFMLLIEQLGMECKDSVSLLKI 680 690 700 710 720 730 310 320 330 340 350 360 KIAA05 DDTVPESSRVLDSKGQELAAMACELQAQKSLLGEVEQNLQAAKQCSSTLASRFQEHCPDL .:.. :.:. : .. .. ... ... .. ....:. .:. .: : :: KIAA10 QDAALSCERLLELKKNHCELLTVKIKKMEDKVNVLQRELSETKEIKSQL-----EH---- 740 750 760 770 780 370 380 390 400 410 420 KIAA05 ERQEAEVHKLGQRFNNLRQQVERRAQSLQSAKAAYEHFHRGHDHVLQFLVSIPSYEPQET .. : : . . ::. : :. :.: .. . :...: .. :. . . : KIAA10 QKVEWERELCSLRFS-LNQEEEKRRNADTLYEKIREQLRRKEE---QYRKEVEVKQQLEL 790 800 810 820 830 840 430 440 450 460 470 480 KIAA05 DSLSQMETKLKNQKNLLDEIASREQEVQKICA---NSQQYQQAVKDYELEAEKLRSLLDL ::. .: .:.. :. :..........:. . :... :... .: .: . . KIAA10 -SLQTLEMELRTVKSNLNQVVQERNDAQRQLSREQNARMLQDGILTNHLSKQKEIEMAQK 850 860 870 880 890 490 500 510 520 530 540 KIAA05 E-NGRSSHVSKRAR-LQSPATKVKEEEAALAAKFTEVYAINRQRLQNLEFALNLLRQQPE . :...:: .. . :. . ..:: : : .. . :... .. :...... : KIAA10 KMNSENSHSHEEEKDLSHKNSMLQEEIAMLRLEIDTIKNQNQEKEKKCFEDLKIVKEKNE 900 910 920 930 940 950 550 560 570 580 590 KIAA05 -----VEVTHETL-----QRN-RPDSGVEEAWKIRKELDEETERRRQLENEVKSTQEEIW .. ..::: : : : . . : . ..:..: . ...:: ::.: . .. KIAA10 DLQKTIKQNEETLTQTISQYNGRLSVLTAENAMLNSKLENEKQSKERLEAEVESYHSRLA 960 970 980 990 1000 1010 600 610 620 630 640 KIAA05 TLRNQGPQESVVRKEVLKKVPDPVLEESFQQ--LQRTLAEEQHKNQLLQEELEALQLQLR . .. : . ..:. : : : .. ... . .:..:...: . .: KIAA10 AAIHDRDQSETSKRELELAFQRARDECSRLQDKMNFDVSNLKDNNEILSQQLFKTESKLN 1020 1030 1040 1050 1060 1070 650 660 670 680 690 KIAA05 ALEQE---TRDGGQEYVVKEVLRIEPDRAQAD---EVLQLREELEALRRQK--GAREA-- .:: : :::. .: .. . :.. : .:.. . .. . . : .. .: : .:. KIAA10 SLEIEFHHTRDALREKTLG-LERVQKDLSQTQCQMKEMEQKYQNEQVKVNKYIGKQESVE 1080 1090 1100 1110 1120 1130 700 710 720 730 740 750 KIAA05 EVL-LLQQRVAALAEEKSRAQEKVTEKEVVKLQNDPQLEAEYQQLQEDHQRQDQLREKQE : : ::.. : .. . :..:. .:: . .. . :..: :.:: . ..:. : :... KIAA10 ERLSQLQSENMLLRQQLDDAHNKADNKEKTVINIQDQFHAIVQKLQAESEKQSLLLEERN 1140 1150 1160 1170 1180 1190 760 770 780 790 800 810 KIAA05 EEL----SFLQDKLKRLEKERAMAEGKITVKEVLKVEKDAATEREVSDLTRQYEDEAAKA .:: . :... . :.:.: : ...:... . :. .. .:. . . ... KIAA10 KELISECNHLKERQYQYENEKA--EREVVVRQLQQELADTLKKQSMSEASLEV---TSRY 1200 1210 1220 1230 1240 1250 820 830 840 850 860 KIAA05 RASQREKTELLRKIWALEEENAKVVVQEKVREIVR-----PDPKAESEVANLRLELVEQE : . ...:. :.: . . .: .:.. : :: : : . : : .:... .. KIAA10 RINLEDETQDLKKKLG-QIRNQLQEAQDRHTEAVRCAEKMQDHKQKLEKDNAKLKVTVKK 1260 1270 1280 1290 1300 1310 870 880 890 900 910 920 KIAA05 RKYRGAEEQLRSYQSELEALRRRGPQVEVKEVTKEVIKYKTDPEMEKELQRLREEIVDKT . . : : ...: ... :.. :. .. . : ::.:... :..::. 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KIAA10 RIKDLESELSKIKTSQEDFNKTELEKYKQLYLEELKVRKSL-SSKLTKTNERLAEVNTKL 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA05 -AEVKEKVVLSESVQVEKGDTEQEIQRLKSSLEEESR--SKRELDVEVSRLEARLSELEF .: ... : .. .. . :..::. . . ...: . .: .: . .: KIAA10 LVEKQQSRSLFTTLTTRPVMEPPCVGNLNNSLDLNRKLIPRENLVISTSNPRASNNSMEN 1600 1610 1620 1630 1640 1650 1220 1230 1240 1250 1260 1270 KIAA05 HNSKSSKELDFLREENHKLQLERENLQLETRRLQSEINMAATETRDLRNMTVADSGTNHD . :: ..:: :.: .:.. .::. . : . KIAA10 YLSKMQQEL----EKNITRELKEAAAELESGSIASPLGSTDESNLNQDLVWKASREYVQV 1660 1670 1680 1690 1700 1280 1290 1300 1310 1320 1330 KIAA05 SRLWSLERELDDLKRLSKDKDLEIDELQKRLGSVAVKREQRENHLRRSIVVIHPDTGREL KIAA10 LKKNYMI 1710 >>KIAA1276 ( 1068 res) fh00139s1 (1068 aa) initn: 221 init1: 79 opt: 300 Z-score: 148.5 bits: 39.6 E(): 0.0037 Smith-Waterman score: 412; 24.626% identity (54.835% similar) in 1003 aa overlap (371-1310:39-925) 350 360 370 380 390 KIAA05 EVEQNLQAAKQCSSTLASRFQEHCPDLERQEAEVH-KLGQRFNNLRQQVERRAQSLQSAK . ..: :. ... .: . . . :. 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KIAA12 IKSVRSSVEAERK--KLQREVEAQLEEVR----KKSE--KEIKQLEEEKAALNVKLQ--- 460 470 480 490 850 860 870 880 890 900 KIAA05 IVRPDPKAESEVANLRLELVEQERKYR--GAEEQLRSYQSELEALRRRGPQVEVKEVTKE .: . :::: :. : : :::: : : :.. .:... . KIAA12 --------NSLLEVLRLEEFIQQNKTRPTGAEE------SPQELGRQHCSILETQDPCLK 500 510 520 530 540 910 920 930 940 950 960 KIAA05 VIKYKTDPEMEKELQRLREEIVDKTRLIERCDLEIYQLKKEIQALKDTKPQVQT--KEVV . .:.:. :. ..: : .. :: . : :: .: .: . . :: . KIAA12 L--DETSPRGEEYQDKLAAEEGTSSDEEERTKV----LLKEG---SDPQPPLGSLLKEKT 550 560 570 580 590 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA05 QEILQFQEDPQTKEEVASLRAKLSEEQKKQVDLERERASQEEQIARKEEELSRVKERVVQ ..: ...:: :... :.:.:..:. :. ::. .. .:.. . ..:: .... .: KIAA12 SKIQRLEEDWQSQK--AKLQAQVSQMQQA---LEQCTSNYREDL-QALKQLSDLEREKLQ 600 610 620 630 640 650 1030 1040 1050 1060 1070 1080 KIAA05 QEVVRYEEEPGLRAEASAFAESIDVELRQIDKLRAELRRLQR-RRTELERQLEELERERQ .:. :.. ... ..: . .. :: :: :.. :. ::. :.:..: . KIAA12 HEL----------QETTQQNHAMKAQL-EASHQRA-LRMLEKARHQELKATEERLKKESS 660 670 680 690 1090 1100 1110 1120 1130 KIAA05 ARREAEREVQRLQQRLAALE----QEEAEAREKVTHTQKVVLQQDPQQAREHALLRLQLE . .....::. : ::: :: : ::.. : ..:.. :. :. : KIAA12 HSLQIQHQTHRLE--LQALEEKARQELQEERERMQAQQALLLESLRQELSEQ-----QAA 700 710 720 730 740 750 1140 1150 1160 1170 1180 KIAA05 EEQHRRQL--LEGELETLRRKLAALE-KAEVKEKVVLSE------SVQVEKGDTEQEIQR :...: :..::..: :. :. . .. :.... .: .. : . : . KIAA12 CSGHQKDLEALQAELRALGRQQASSQCPGDSKDHIIATEEWGGPGQAGSPPGAAGQGSGE 760 770 780 790 800 810 1190 1200 1210 1220 1230 1240 KIAA05 LKSSLEEESRSKRELDVEVSRLEARLSELEFHNSKSSKELDFLR--EENHKLQLERENLQ . ::.. .:. : ::.: :.: :.....: : : ::... : :: KIAA12 GCGLWEENA----QLQDAVRRLRA---EVEQHQQEAQKLRDQRRFLEETQQAQRARE--- 820 830 840 850 860 1250 1260 1270 1280 1290 KIAA05 LETRRLQSEINMAATETRDLRNMTVADSGTNH---DSRLWSLERELDDL-----KRLSKD .:: : . . .: : ::: .. . ..:: .:: :: : : :. KIAA12 VETLRQEHRKEMQAM---------VADFSSAQAQLQARLAALEAELKDSGEKPGKGASRP 870 880 890 900 910 1300 1310 1320 1330 1340 1350 KIAA05 KDLE-IDELQKRLGSVAVKREQRENHLRRSIVVIHPDTGRELSPEEAHRAGLIDWNMFVK .::. : .:: :: KIAA12 EDLQLIGRLQTRLKEREDIIKQLTEERRFHYAAFPSAMSHRNRSFSFNPHPGYLTPSMKK 920 930 940 950 960 970 1426 residues in 1 query sequences 1986079 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:07:21 2008 done: Thu Dec 18 15:07:23 2008 Total Scan time: 0.850 Total Display time: 0.840 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]