# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh01910.fasta.huge -Q ../query/KIAA0566.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0566, 1163 aa vs ./tmplib.23663 library 1986342 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6069+/-0.00563; mu= 14.5754+/- 0.383 mean_var=118.5278+/-28.243, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.117805 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0715 ( 1498 res) pf08610 (1498) 2463 430.7 7.7e-121 KIAA1487 ( 650 res) fj07249 ( 650) 2259 395.6 1.2e-110 KIAA1939 ( 1082 res) ah01164 (1082) 1181 212.7 2.4e-55 KIAA1137 ( 933 res) hj03907 ( 933) 1177 211.9 3.5e-55 KIAA1021 ( 1102 res) af10412 (1102) 1040 188.7 4e-48 KIAA0956 ( 672 res) hj05590 ( 672) 765 141.7 3.4e-34 KIAA0611 ( 912 res) hg00483 ( 912) 495 96.0 2.7e-20 >>KIAA0715 ( 1498 res) pf08610 (1498 aa) initn: 2473 init1: 1749 opt: 2463 Z-score: 2261.3 bits: 430.7 E(): 7.7e-121 Smith-Waterman score: 3205; 50.278% identity (73.933% similar) in 1078 aa overlap (1-1046:380-1429) 10 20 30 KIAA05 EKKSLFYVPKSDGSSLSPVTAAVYSFLTMI :.. : :: ..:: : . .. : ::::: KIAA07 MNIDIFFCIGILILMCLIGAVGHSIWNGTFEEHPPFDVPDANGSFLPSALGGFYMFLTMI 350 360 370 380 390 400 40 50 60 70 80 90 KIAA05 IVLQVLIPISLYVSIEIVKACRVYFINQDMQLYDEETDSQLQCRALNITEDLGQIQYIFS :.::::::::::::::.:: .:.:...:..::::::: ..:::::::.::::::::::: KIAA07 ILLQVLIPISLYVSIELVKLGQVFFLSNDLDLYDEETDLSIQCRALNIAEDLGQIQYIFS 410 420 430 440 450 460 100 110 120 130 140 KIAA05 DKTGTLTENKMVFRRCTVSGVEYSHDANAQRLARYQEADSEEEEVVPRGG-SVSQR---- :::::::::::::::::. : ::::. ::.:: .: ::. :: . : : : KIAA07 DKTGTLTENKMVFRRCTIMGSEYSHQENAKRLETPKELDSDGEEWTQYQCLSFSARWAQD 470 480 490 500 510 520 150 160 170 180 190 200 KIAA05 -GSIGSHQSVRVVHRTQSTK----SHRRTGSRAEAKRASMLSKHTAFSSPMEKDITPDPK ... :..... ..:.::.. .: : .:. ..: : . .:::: .:::.::: . KIAA07 PATMRSQKGAQPLRRSQSARVPIQGHYR--QRSMGHRESS-QPPVAFSSSIEKDVTPDKN 530 540 550 560 570 580 210 220 230 240 250 260 KIAA05 LLEKVSECDKSLAVARHQEHLLAHLSPELSDVFDFFIALTICNTVVVTSPDQPRTKVRVR :: :: . : . .. : :: :.. :::.::::::.:.:.. .:: .: .. 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KIAA14 SVASPDGASLEKQQMIVREKTQKHLDDYAKQGLRTLCIAKKVMSDTEYAEWLRNHFLAET 40 50 60 70 80 90 500 510 520 530 540 550 KIAA05 SLENSEELLFQSAIRLETNLHLLGATGIEDRLQDGVPETISKLRQAGLQIWVLTGDKQET :..: ::::..::.:::..: ::::::::::::.::::.: :..::..::.:::::::: KIAA14 SIDNREELLLESAMRLENKLTLLGATGIEDRLQEGVPESIEALHKAGIKIWMLTGDKQET 100 110 120 130 140 150 560 570 580 590 600 610 KIAA05 AVNIAYACKLLDHDEEVITLNATSQEACAALLDQCLCYVQSRGLQRAPEKTKGKVSMRFS :::::::::::. :.... ::. :..::. :.. : .:.. : ::. ::. . KIAA14 AVNIAYACKLLEPDDKLFILNTQSKDACGMLMSTILKELQKK-TQALPEQ----VSLSED 160 170 180 190 200 620 630 640 650 660 670 KIAA05 SLCPPSTSTASGRRPSLVIDGRSLAYALEKNLEDKFLFLAKQCRSVLCCRSTPLQKSMVV : :: . :: : .:.: :..: .::...:. .:: :.. :..:.:::.:::::: :: KIAA14 LLQPP-VPRDSGLRAGLIITGKTLEFALQESLQKQFLELTSWCQAVVCCRATPLQKSEVV 210 220 230 240 250 260 680 690 700 710 720 730 KIAA05 KLVRSKLKAMTLAIGDGANDVSMIQVADVGVGISGQEGMQAVMASDFAVPKFRYLERLLI :::::.:..:::::::::::::::::::.:.:.:::::::::::::::: .:..: .::. KIAA14 KLVRSHLQVMTLAIGDGANDVSMIQVADIGIGVSGQEGMQAVMASDFAVSQFKHLSKLLL 270 280 290 300 310 320 740 750 760 770 780 790 KIAA05 LHGHWCYSRLANMVLYFFYKNTMFVGLLFWFQFFCGFSASTMIDQWYLIFFNLLFSSLPP .::::::.::.::.:::::::. .:.::::.:::::::...: : : ::::::::.: :: KIAA14 VHGHWCYTRLSNMILYFFYKNVAYVNLLFWYQFFCGFSGTSMTDYWVLIFFNLLFTSAPP 330 340 350 360 370 380 800 810 820 830 840 850 KIAA05 LVTGVLDRDVPANVLLTNPQLYKSGQNMEEYRPRTFWFNMADAAFQSLVCFSIPYLAYYD .. :::..:: :..:. :.::.:::. : : :.:::... :: .:::::: .::..: KIAA14 VIYGVLEKDVSAETLMQLPELYRSGQKSEAYLPHTFWITLLDAFYQSLVCFFVPYFTYQG 390 400 410 420 430 440 860 870 880 890 900 910 KIAA05 SNVDLFTWGTPIVTIALLTFLLHLGIETKTWTWLNWITCGFSVLLFFTVALIYNASCATC :..:.:..:.:. : ::. :::: ::.:. ::.. .. :.: .: :....: :.:: KIAA14 SDTDIFAFGNPLNTAALFIVLLHLVIESKSLTWIHLLVIIGSILSYFLFAIVFGAMCVTC 450 460 470 480 490 500 920 930 940 950 960 970 KIAA05 YPPSNPYWTMQALLGDPVFYLTCLMTPVAALLPRLFFRSLQGRVFPTQLQLARQLTRKSP ::::::: :: . ::::::.:..: :::::. .: ::: .::. . :... : .: KIAA14 NPPSNPYWIMQEHMLDPVFYLVCILTTSIALLPRFVYRVLQGSLFPSPILRAKHFDRLTP 510 520 530 540 550 560 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA05 R-RCSAPKETFAQGRLPKDSG--TEHSSGRTVKTSVPLSQPSWHTQQPVCSLEASGEPST . : .: :. . :.. . .. ...:.:.. . :. :: KIAA14 EERTKALKKWRGAGKMNQVTSKYANQSAGKSGRR--PMPGPSAVFAMKSATSCAIEQGNL 570 580 590 600 610 620 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA05 VDMSMPVREHTLLEGLSAPAPMSSAPGEAVLRSPGGCPEESKVRAASTGRVTPLSSLFSL KIAA14 SLCETALDQGYSETKAFEMAGPSKGKES 630 640 650 >>KIAA1939 ( 1082 res) ah01164 (1082 aa) initn: 1594 init1: 830 opt: 1181 Z-score: 1085.4 bits: 212.7 E(): 2.4e-55 Smith-Waterman score: 1480; 32.143% identity (57.639% similar) in 1008 aa overlap (17-1006:208-1016) 10 20 30 40 KIAA05 EKKSLFYVPKSDGSSLSPVTAAVYSFLTMIIVLQVLIPISLYVSIE : : .. .: ..::.:....:::::::.: KIAA19 GIILAIGNSIWESQTGDQFRTFLFWNEGEKSSVFSGFLTFWSYIIILNTVVPISLYVSVE 180 190 200 210 220 230 50 60 70 80 90 100 KIAA05 IVKACRVYFINQDMQLYDEETDSQLQCRALNITEDLGQIQYIFSDKTGTLTENKMVFRRC ... . :::: : ..: . :. ...:.::::.:::::::::::.: :.:.:: KIAA19 VIRLGHSYFINWDRKMYYSRKAIPAVARTTTLNEELGQIEYIFSDKTGTLTQNIMTFKRC 240 250 260 270 280 290 110 120 130 140 150 160 KIAA05 TVSGVEYS--HDANAQRLARYQEADSEEEEVVPRGGSVSQRGSIGSHQSVRVVHRTQSTK ...: :. :: :. :: . : :: KIAA19 SINGRIYGEVHDDLDQKTEITQEKE-------PVDFSV---------------------- 300 310 320 170 180 190 200 210 220 KIAA05 SHRRTGSRAEAKRASMLSKHTAFSSPMEKDITPDPKLLEKVSECDKSLAVARHQEHLLAH ...: : .. : ::. ::: KIAA19 -------KSQADREFQFFDHHL----MESIKMGDPK------------------------ 330 340 350 230 240 250 260 270 280 KIAA05 LSPELSDVFDFFIALTICNTVVVTSPDQPRTKVRVRFELKSPVKTIEDFLRRFTPSCLTS : .:. :..:.::. KIAA19 -------VHEFLRLLALCHTVM-------------------------------------- 360 290 300 310 320 330 340 KIAA05 GCSSIGSLAANKSSHKLGSSFPSTPSSDGMLLRLEERLGQPTSAIASNGYSSQADNWASE KIAA19 ------------------------------------------------------------ 350 360 370 380 390 400 KIAA05 LAQEQESERELRYEAESPDEAALVYAARAYNCVLVERLHDQVSVELPHLGRL-TFELLHT .:..: :: :...::::.::: ::: .. .. : . ...: .:: : :..:: KIAA19 --SEENSAGELIYQVQSPDEGALVTAARNFGFIFKSRTPETITIE--ELGTLVTYQLLAF 370 380 390 400 410 420 410 420 430 440 450 460 KIAA05 LGFDSVRKRMSVVIRHPLTDEINVYTKGADSVVMDLLQPCSSVDARGRHQKKIRSKTQNY : :...::::::..:.: .:..:.::::..... :.: . : . : :... KIAA19 LDFNNTRKRMSVIVRNP-EGQIKLYSKGADTILFEKLHPSNEV---------LLSLTSDH 430 440 450 460 470 470 480 490 500 510 520 KIAA05 LNVYAAEGLRTLCIAKRVLSKEEYACWLQSHLEAESSLENSEELLFQSAIRLETNLHLLG :. .:.:::::: :: : :. . . : . .:... :. .: . . ..: .: ::: KIAA19 LSEFAGEGLRTLAIAYRDLDDKYFKEWHKMLEDANAATEERDERIAELYEEIERDLMLLG 480 490 500 510 520 530 530 540 550 560 570 KIAA05 ATGIEDRLQDGVPETISKLRQAGLQIWVLTGDKQETAVNIAYACKLLDHD-EEVITL--- ::..::.::.:: ::...: :...::::::::::::.::.:::..: : ..:... KIAA19 ATAVEDKLQEGVIETVTSLSLANIKIWVLTGDKQETAINIGYACNMLTDDMNDVFVIAGN 540 550 560 570 580 590 580 590 600 610 620 630 KIAA05 NATSQEACAALLDQCLCYVQSRGLQRAPEKTKGKVSMRFSSLCPPSTSTASGRRPSLVID ::. . : : . :.:... . . : .....:. : .: .:.:. KIAA19 NAVEVREELRKAKQNL-FGQNRNFSNGHVVCEKKQQLELDSIVE---ETITGDY-ALIIN 600 610 620 630 640 640 650 660 670 680 690 KIAA05 GRSLAYALEKNLEDKFLFLAKQCRSVLCCRSTPLQKSMVVKLVRSKLKAMTLAIGDGAND :.:::.:::..... .: :: .:..:.::: :::::..::.::.. .:.:::::::::: KIAA19 GHSLAHALESDVKNDLLELACMCKTVICCRVTPLQKAQVVELVKKYRNAVTLAIGDGAND 650 660 670 680 690 700 700 710 720 730 740 750 KIAA05 VSMIQVADVGVGISGQEGMQAVMASDFAVPKFRYLERLLILHGHWCYSRLANMVLYFFYK ::::. : .:::::::::.:::.:::.. .::::.:::..::.: : :. ... ::::: KIAA19 VSMIKSAHIGVGISGQEGLQAVLASDYSFAQFRYLQRLLLVHGRWSYFRMCKFLCYFFYK 710 720 730 740 750 760 760 770 780 790 800 810 KIAA05 NTMFVGLLFWFQFFCGFSASTMIDQWYLIFFNLLFSSLPPLVTGVLDRDVPANVLLTNPQ : :. . ::: :::::::.:. :::.. .::....::: :. :..:.:: . . :: KIAA19 NFAFTLVHFWFGFFCGFSAQTVYDQWFITLFNIVYTSLPVLAMGIFDQDVSDQNSVDCPQ 770 780 790 800 810 820 820 830 840 850 860 870 KIAA05 LYKSGQNMEEYRPRTFWFNMADAAFQSLVCFSIPYLAYYDSN-------VDLFTWGTPIV ::: :: . : :.. . . . ::: : ::: :.:. .: .... .. KIAA19 LYKPGQLNLLFNKRKFFICVLHGIYTSLVLFFIPYGAFYNVAGEDGQHIADYQSFAVTMA 830 840 850 860 870 880 880 890 900 910 920 930 KIAA05 TIALLTFLLHLGIETKTWTWLNWITCGFSVLLFFTVAL-IYNASCATCYPPSNPYW-TMQ : ... ......:. ::..: . :. ..:.. . ... . .: . :. . . KIAA19 TSLVIVVSVQIALDTSYWTFINHVFIWGSIAIYFSILFTMHSNGIFGIFPNQFPFVGNAR 890 900 910 920 930 940 940 950 960 970 980 KIAA05 ALLGDPVFYLTCLMTPVAALLPRLFFRSLQGRVFPTQLQLARQLTR--KSPRRCSAPKET : . ..:. :.: ::...: . :: :. ..:: :. :. : :. .. : KIAA19 HSLTQKCIWLVILLTTVASVMPVVAFRFLKVDLYPT---LSDQIRRWQKAQKKARPP--- 950 960 970 980 990 1000 990 1000 1010 1020 1030 1040 KIAA05 FAQGRLPKDSGTEHSSGRTVKTSVPLSQPSWHTQQPVCSLEASGEPSTVDMSMPVREHTL ..: :. :..::.: KIAA19 --SSRRPR---TRRSSSRRSGYAFAHQEGYGELITSGKNMRAKNPPPTSGLEKTHYNSTS 1010 1020 1030 1040 1050 >>KIAA1137 ( 933 res) hj03907 (933 aa) initn: 1601 init1: 807 opt: 1177 Z-score: 1082.5 bits: 211.9 E(): 3.5e-55 Smith-Waterman score: 1472; 32.899% identity (57.874% similar) in 997 aa overlap (7-982:52-858) 10 20 30 KIAA05 EKKSLFYVPKSDGSSLSPVTAAVYSFLTMIIVLQVL :.: : . : .. :: ..::.:... KIAA11 WIFGFLVCMGVILAIGNAIWEHEVGMRFQVYLPW-DEAVDSAFFSGFLSFWSYIIILNTV 30 40 50 60 70 80 40 50 60 70 80 90 KIAA05 IPISLYVSIEIVKACRVYFINQDMQLYDEETDSQLQCRALNITEDLGQIQYIFSDKTGTL .:::::::.:... . :::: : ... . . . :. ...:.:::..:::::::::: KIAA11 VPISLYVSVEVIRLGHSYFINWDKKMFCMKKRTPAEARTTTLNEELGQVEYIFSDKTGTL 90 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 KIAA05 TENKMVFRRCTVSGVEYSHDANAQRLARYQEADSEEEEVVPRGGSVSQRGSIGSHQSVRV :.: ::: .:...: : :.: . .: KIAA11 TQNIMVFNKCSINGHSY--------------------------GDVFD--VLG------- 150 160 160 170 180 190 200 210 KIAA05 VHRTQSTKSHRRTGSRAEAKRASMLSKHTAFS-SPM--EKDITPDPKLLEKVSECDKSLA :... : : : . :: .:. .: . ::.::: :. : KIAA11 -HKAE-------LGERPEP---------VDFSFNPLADKKFLFWDPSLLEAVKIGD---- 170 180 190 200 220 230 240 250 260 270 KIAA05 VARHQEHLLAHLSPELSDVFDFFIALTICNTVVVTSPDQPRTKVRVRFELKSPVKTIEDF : .: .:: :..:.::. KIAA11 -----PH--TH---------EFFRLLSLCHTVM--------------------------- 210 220 280 290 300 310 320 330 KIAA05 LRRFTPSCLTSGCSSIGSLAANKSSHKLGSSFPSTPSSDGMLLRLEERLGQPTSAIASNG KIAA11 ------------------------------------------------------------ 340 350 360 370 380 390 KIAA05 YSSQADNWASELAQEQESERELRYEAESPDEAALVYAARAYNCVLVERLHDQVSVELPHL .:...: :: :.:.::::.::: ::: .. :. : ..:. .. KIAA11 -------------SEEKNEGELYYKAQSPDEGALVTAARNFGFVFRSRTPKTITVH--EM 230 240 250 260 400 410 420 430 440 450 KIAA05 GR-LTFELLHTLGFDSVRKRMSVVIRHPLTDEINVYTKGADSVVMDLLQPCSSVDARGRH : .:..:: : :...::::::..:.: .: .: ::::....: :. . KIAA11 GTAITYQLLAILDFNNIRKRMSVIVRNP-EGKIRLYCKGADTILLDRLHHST-------- 270 280 290 300 310 460 470 480 490 500 510 KIAA05 QKKIRSKTQNYLNVYAAEGLRTLCIAKRVLSKEEYACWLQSHLEAESSLENSEELLFQSA ... . :...:: ::.:::::: .: . :..: : : . .:.: . .. :. : . KIAA11 -QELLNTTMDHLNEYAGEGLRTLVLAYKDLDEEYYEEWAERRLQASLAQDSREDRLASIY 320 330 340 350 360 370 520 530 540 550 560 570 KIAA05 IRLETNLHLLGATGIEDRLQDGVPETISKLRQAGLQIWVLTGDKQETAVNIAYACKLLDH ..:.:. :::::.:::.::.::::::. : :...:::::::::::::::.:.::.: KIAA11 EEVENNMMLLGATAIEDKLQQGVPETIALLTLANIKIWVLTGDKQETAVNIGYSCKMLTD 380 390 400 410 420 430 580 590 600 610 620 KIAA05 D--EEVITLNATSQEACAALLDQCLCYVQSRGLQRAPEKTKGKVSM-RFSSLCPPSTSTA : : :. . : : . . : .. . .. . .: . . ..:: :. : KIAA11 DMTEVFIVTGHTVLE-----VREELRKAREKMMDSSRSVGNGFTYQDKLSSSKLTSVLEA 440 450 460 470 480 490 630 640 650 660 670 680 KIAA05 SGRRPSLVIDGRSLAYALEKNLEDKFLFLAKQCRSVLCCRSTPLQKSMVVKLVRSKLKAM . . .:::.:.:::.::: ..: .:: : :..:.::: :::::..::.::.. ::. KIAA11 VAGEYALVINGHSLAHALEADMELEFLETACACKAVICCRVTPLQKAQVVELVKKYKKAV 500 510 520 530 540 550 690 700 710 720 730 740 KIAA05 TLAIGDGANDVSMIQVADVGVGISGQEGMQAVMASDFAVPKFRYLERLLILHGHWCYSRL :::::: :::::::..: .:::::::::.:::.:::.. .:..:.:::..::.: : :. KIAA11 TLAIGDEANDVSMIKTAHIGVGISGQEGIQAVLASDYSFSQFKFLQRLLLVHGRWSYLRM 560 570 580 590 600 610 750 760 770 780 790 800 KIAA05 ANMVLYFFYKNTMFVGLLFWFQFFCGFSASTMIDQWYLIFFNLLFSSLPPLVTGVLDRDV ... :::::: :. . ::: :::::::.:. ::... ..:....::: :. ::.:.:: KIAA11 CKFLCYFFYKNFAFTMVHFWFGFFCGFSAQTVYDQYFITLYNIVYTSLPVLAMGVFDQDV 620 630 640 650 660 670 810 820 830 840 850 860 KIAA05 PANVLLTNPQLYKSGQNMEEYRPRTFWFNMADAAFQSLVCFSIPYLAYYDSNVD----LF : . . :.::. :: . : :.. .:.. . :.. : ::: .. :.. : : KIAA11 PEQRSMEYPKLYEPGQLNLLFNKREFFICIAQGIYTSVLMFFIPYGVFADATRDDGTQLA 680 690 700 710 720 730 870 880 890 900 910 920 KIAA05 TWGTPIVTIA---LLTFLLHLGIETKTWTWLNWITCGFSVLLFFTVALIYNASCATCYPP . . ::.: ... ...:..: :: .: . :. ..:.. . .... . : KIAA11 DYQSFAVTVATSLVIVVSVQIGLDTGYWTAINHFFIWGSLAVYFAILFAMHSNGLFDMFP 740 750 760 770 780 790 930 940 950 960 970 KIAA05 SNPYWT--MQALLGDPVFYLTCLMTPVAALLPRLFFRSLQGRVFPTQLQLAR--QLTRKS .. .. : :..:. .:: ..: :. ..: . :: :. . : . .: ::.::. KIAA11 NQFRFVGNAQNTLAQPTVWLTIVLTTVVCIMPVVAFRFLRLNLKPDLSDTVRYTQLVRKK 800 810 820 830 840 850 980 990 1000 1010 1020 1030 KIAA05 PR---RCSAPKETFAQGRLPKDSGTEHSSGRTVKTSVPLSQPSWHTQQPVCSLEASGEPS . :: KIAA11 QKAQHRCMRRVGRTGSRRSGYAFSHQEGFGELIMSGKNMRLSSLALSSFTTRSSSSWIES 860 870 880 890 900 910 >>KIAA1021 ( 1102 res) af10412 (1102 aa) initn: 1438 init1: 523 opt: 1040 Z-score: 955.8 bits: 188.7 E(): 4e-48 Smith-Waterman score: 1173; 35.771% identity (65.819% similar) in 629 aa overlap (357-966:472-1071) 330 340 350 360 370 380 KIAA05 SAIASNGYSSQADNWASELAQEQESERELRYEAESPDEAALVYAARAYNCVLVERLHD-- : . ::::.::: ... . . . ::.: KIAA10 ALCLCHTVQVKDDDSVDGPRKSPDGGKSCVYISSSPDEVALVEGVQRLGFTYL-RLKDNY 450 460 470 480 490 500 390 400 410 420 430 440 KIAA05 -QVSVELPHLGRLTFELLHTLGFDSVRKRMSVVIRHPLTDEINVYTKGADSVVMDLLQPC .. . :. : ::::. :.:::::.::::... : :: .. ::::: .. . KIAA10 MEILNRENHIER--FELLEILSFDSVRRRMSVIVKSA-TGEIYLFCKGADSSIFPRVIE- 510 520 530 540 550 450 460 470 480 490 500 KIAA05 SSVDARGRHQKKIRSKTQNYLNVYAAEGLRTLCIAKRVLSKEEYACWLQSHLEAESSLEN ..:: .::.... :.:::::::.: . : .::: . :. .:.. KIAA10 GKVD-------QIRARVERN----AVEGLRTLCVAYKRLIQEEYEGICKLLQAAKVALQD 560 570 580 590 600 510 520 530 540 550 560 KIAA05 SEELLFQSAIRLETNLHLLGATGIEDRLQDGVPETISKLRQAGLQIWVLTGDKQETAVNI :. : .. ..: .: :::::..:::::. . .:: :..::...:::::::.:::. KIAA10 REKKLAEAYEQIEKDLTLLGATAVEDRLQEKAADTIEALQKAGIKVWVLTGDKMETAAAT 610 620 630 640 650 660 570 580 590 600 610 620 KIAA05 AYACKLLDHDEEVITLNATSQEACAALLDQCLCYVQSRGLQRAPEKTKGKVSMRFSSLCP :::::. .. ... : :... : . : ... :... :. ..: .: KIAA10 CYACKLFRRNTQLLEL--TTKRIEEQSLHDVLFELSKTVLRHSGSLTRDNLS----GL-- 670 680 690 700 710 630 640 650 660 670 KIAA05 PSTSTASGRRPSLVIDGRSLAYALEK-------NLEDKFLFLAKQCRSVLCCRSTPLQKS .:. . .:.::: .:. .. : .. :: . ..: .::::: .::::. KIAA10 ----SADMQDYGLIIDGAALSLIMKPREDGSSGNYRELFLEICRSCSAVLCCRMAPLQKA 720 730 740 750 760 770 680 690 700 710 720 730 KIAA05 MVVKLVR-SKLKAMTLAIGDGANDVSMIQVADVGVGISGQEGMQAVMASDFAVPKFRYLE ..:::.. :: . .:::::::::::::: : ::.:. :.:: ::. ::.:.:::..:. KIAA10 QIVKLIKFSKEHPITLAIGDGANDVSMILEAHVGIGVIGKEGRQAARNSDYAIPKFKHLK 780 790 800 810 820 830 740 750 760 770 780 790 KIAA05 RLLILHGHWCYSRLANMVLYFFYKNTMFVGLLFWFQFFCGFSASTMIDQWYLIFFNLLFS ..:..:::. : :....: ::::::. :. : .::::::: .:. : :: ..:. :. KIAA10 KMLLVHGHFYYIRISELVQYFFYKNVCFIFPQFLYQFFCGFSQQTLYDTAYLTLYNISFT 840 850 860 870 880 890 800 810 820 830 840 850 KIAA05 SLPPLVTGVLDRDVPANVLLTNPQLYKSGQNMEEYRPRTFWFNMADAAFQSLVCFSIPYL ::: :. ..... : .:: .: ::.. . : :.: . . :..:: : :. KIAA10 SLPILLYSLMEQHVGIDVLKRDPTLYRDVAKNALLRWRVFIYWTLLGLFDALVFFFGAYF 900 910 920 930 940 950 860 870 880 890 900 KIAA05 AYYD----SNVDLF---TWGTPIVTIALLTFLLHLGIETKTWTWLNWITCGFSVLLFFTV .. . :: ..: :.:: . :. ..: :.:...:. :::.: .. :.:.. . KIAA10 VFENTTVTSNGQIFGNWTFGTLVFTVMVFTVTLKLALDTHYWTWINHFVIWGSLLFYVVF 960 970 980 990 1000 1010 910 920 930 940 950 960 KIAA05 ALIYNASCATCYPPSNPYWT-MQALLGDPVFYLTCLMTPVAALLPRLFFRSLQGRVFPTQ .:.... . :.. .: : . :.. :.. .. ::: .. . : ...:: KIAA10 SLLWGGVIWPFLNYQRMYYVFIQMLSSGPAWLAIVLLVTIS-LLPDVLKKVLCRQLWPTA 1020 1030 1040 1050 1060 1070 970 980 990 1000 1010 1020 KIAA05 LQLARQLTRKSPRRCSAPKETFAQGRLPKDSGTEHSSGRTVKTSVPLSQPSWHTQQPVCS KIAA10 TERVQTKSQCLSVEQSTIFMLSQTSSSLSF 1080 1090 1100 >>KIAA0956 ( 672 res) hj05590 (672 aa) initn: 1071 init1: 510 opt: 765 Z-score: 705.8 bits: 141.7 E(): 3.4e-34 Smith-Waterman score: 1202; 34.170% identity (61.925% similar) in 717 aa overlap (341-1040:8-670) 320 330 340 350 360 370 KIAA05 SDGMLLRLEERLGQPTSAIASNGYSSQADNWASELAQEQESERELRYEAESPDEAALVYA : :.:: : :.: : :::: ::: : KIAA09 DCTGDGPWQSNLAPSQ-----LEYYASSPDEKALVEA 10 20 30 380 390 400 410 420 KIAA05 ARAYNCVLVERLHDQVSVELPHLGRLT-FELLHTLGFDSVRKRMSVVIRHPLTDEINVYT : . :.. ... ..:. ::.: ..::: : ::: :.::::... : . : ... KIAA09 AARIGIVFIG--NSEETMEVKTLGKLERYKLLHILEFDSDRRRMSVIVQAP-SGEKLLFA 40 50 60 70 80 430 440 450 460 470 480 KIAA05 KGADSVVMDLLQPCSSVDARGRHQKKIRSKTQNYLNVYAAEGLRTLCIAKRVLSKEEYAC :::.: ..: : . . . ::. ... .: .:::::::: : ....:: KIAA09 KGAES---SILPKCIGGEIE---------KTRIHVDEFALKGLRTLCIAYRKFTSKEYEE 90 100 110 120 130 490 500 510 520 530 540 KIAA05 WLQSHLEAESSLENSEELLFQSAIRLETNLHLLGATGIEDRLQDGVPETISKLRQAGLQI . .::...:.. :: : .: .: :::::..:::::: : ::: ::.::... KIAA09 IDKRIFEARTALQQREEKLAAVFQFIEKDLILLGATAVEDRLQDKVRETIEALRMAGIKV 140 150 160 170 180 190 550 560 570 580 590 600 KIAA05 WVLTGDKQETAVNIAYACKLLDHDEEVITL-NATSQEACAALLDQCLCYVQSRGLQRAPE :::::::.::::... .: . . ... : : :. :: : : : : . KIAA09 WVLTGDKHETAVSVSLSCGHFHRTMNILELINQKSDSECAE---------QLRQLAR--R 200 210 220 230 240 610 620 630 640 650 660 KIAA05 KTKGKVSMRFSSLCPPSTSTASGRRPSLVIDGRSLAYALEKNLEDKFLFLAKQCRSVLCC :. .: .. .::.:: ::. ::... : :. . ..: .:::: KIAA09 ITEDHVIQH-----------------GLVVDGTSLSLALREH-EKLFMEVCRNCSAVLCC 250 260 270 280 670 680 690 700 710 720 KIAA05 RSTPLQKSMVVKLVR-SKLKAMTLAIGDGANDVSMIQVADVGVGISGQEGMQAVMASDFA : .::::. :..:.. : : .:::.::::::::::: : ::.:: :.:: ::. ::.: KIAA09 RMAPLQKAKVIRLIKISPEKPITLAVGDGANDVSMIQEAHVGIGIMGKEGRQAARNSDYA 290 300 310 320 330 340 730 740 750 760 770 780 KIAA05 VPKFRYLERLLILHGHWCYSRLANMVLYFFYKNTMFVGLLFWFQFFCGFSASTMIDQWYL . .:..: .::..:::. : :.:..: ::::::. :. : .::.: :: .:. :. :: KIAA09 IARFKFLSKLLFVHGHFYYIRIATLVQYFFYKNVCFITPQFLYQFYCLFSQQTLYDSVYL 350 360 370 380 390 400 790 800 810 820 830 840 KIAA05 IFFNLLFSSLPPLVTGVLDRDVPANVLLTNPQLYKSGQNMEEYRPRTFWFNMADAAFQSL ..:. :.::: :. ..:.. : .:: ..: ::.. .. . .:: . . ... KIAA09 TLYNICFTSLPILIYSLLEQHVDPHVLQNKPTLYRDISKNRLLSIKTFLYWTILGFSHAF 410 420 430 440 450 460 850 860 870 880 890 KIAA05 VCFSIPYLAY-YDS----NVDLF---TWGTPIVTIALLTFLLHLGIETKTWTWLNWITCG . : :: :. : ..: :.:: . :. ..: .....::. :::.: .. KIAA09 IFFFGSYLLIGKDTSLLGNGQMFGNWTFGTLVFTVMVITVTVKMALETHFWTWINHLVTW 470 480 490 500 510 520 900 910 920 930 940 950 KIAA05 FSVLLFFTVALIYNASCATCYPPSNPYWTMQALLGDPVFYLTCLMTPVAALLPRLFFRSL :....:. .:.:.. .: :... ::.. ... .. :. :. .. . . KIAA09 GSIIFYFVFSLFYGGILWPFLGSQNMYFVFIQLLSSGSAWFAIILMVVTCLFLDIIKKVF 530 540 550 560 570 580 960 970 980 990 1000 1010 KIAA05 QGRVFPTQLQLARQLTRKSPRRCSAPKETFAQGRLPKDSGTEHSSGRTVKTSVPLSQP-- . .. ::. . :. .. .: : :. .. : :: .. . .: KIAA09 DRHLHPTSTEKAQLTETNAGIKCLDSMCCF-----PEGEAACASVGRMLERVIGRCSPTH 590 600 610 620 630 640 1020 1030 1040 1050 1060 1070 KIAA05 ---SWHTQQPVCSLEASGEP-STVDMSMPVREHTLLEGLSAPAPMSSAPGEAVLRSPGGC :: ...: . . : ::.: : KIAA09 ISRSWSASDPFYTNDRSILTLSTMDSSTC 650 660 670 >>KIAA0611 ( 912 res) hg00483 (912 aa) initn: 936 init1: 383 opt: 495 Z-score: 456.2 bits: 96.0 E(): 2.7e-20 Smith-Waterman score: 804; 29.683% identity (57.349% similar) in 694 aa overlap (246-912:237-862) 220 230 240 250 260 270 KIAA05 RHQEHLLAHLSPELSDVFDFFIALTICNTVVVTSPDQPRTKVRVRFELKSPVKTI---ED :: : :. :. . : . . :. : KIAA06 IIPISLRVNLDMGKIVYSWVIRRDSKIPGTVVRSSTIPEQLGRISYLLTDKTGTLTQNEM 210 220 230 240 250 260 280 290 300 310 320 KIAA05 FLRRFTPSCLTSGCSSIGSLAANKSSHKLGSSFPSTPSSDGMLLR------LEERLGQPT ...:. . .. : .:. . .. : .: . :.. : : . :. . . KIAA06 IFKRLHLGTVAYGLDSMDEVQSHIFSIYTQQS-QDPPAQKGPTLTTKVRRTMSSRVHEAV 270 280 290 300 310 320 330 340 350 360 370 KIAA05 SAIA----------SNGYSSQADNWASELAQEQESERELRYEAESPDEAALVYAARAYNC .::: ::: ..::. :..: . :.: ::::.::: ... . KIAA06 KAIALCHNVTPVYESNGVTDQAE------AEKQYEDSCRVYQASSPDEVALVQWTESVGL 330 340 350 360 370 380 390 400 410 420 430 KIAA05 VLVERLHDQVSVEL--PHLGRLTFELLHTLGFDSVRKRMSVVIRHPLTDEINVYTKGADS .:: : :: :..: : :.: .:. . : :::....: : ::. : :::: KIAA06 TLVGR--DQSSMQLRTPGDQILNFTILQIFPFTYESKRMGIIVRDESTGEITFYMKGADV 380 390 400 410 420 430 440 450 460 470 480 490 KIAA05 VVMDLLQPCSSVDARGRHQKKIRSKTQNYLNVYAAEGLRTLCIAKRVLSKEEYACWLQSH :. ..: .. .. . :. : ::::.: .::. :..:.: . . KIAA06 VMAGIVQ----------YNDWLEEECGNM----AREGLRVLVVAKKSLAEEQYQDFEARY 440 450 460 470 480 500 510 520 530 540 550 KIAA05 LEAESSLENSEELLFQSAIR-LETNLHLLGATGIEDRLQDGVPETISKLRQAGLQIWVLT ..:. :... . : ..:. :: ...:: ::.::.:: : :. ::.::...:.:: KIAA06 VQAKLSVHD-RSLKVATVIESLEMEMELLCLTGVEDQLQADVRPTLETLRNAGIKVWMLT 490 500 510 520 530 540 560 570 580 590 600 610 KIAA05 GDKQETAVNIAYACKLLDHDEEVITLNATSQEACAALLDQCLCYVQSRGLQRAPEKTKGK ::: :::. : .:. ..... .. ..... : : . ...: . KIAA06 GDKLETATCTAKNAHLVTRNQDIHVFRLVTNRGEAHL--------ELNAFRRKHD----- 550 560 570 580 620 630 640 650 660 670 KIAA05 VSMRFSSLCPPSTSTASGRRPSLVIDGRSLAYALEKNLEDKFLFLAKQCRSVLCCRSTPL : .:::.: :: : : : .:. :: :: .:.::: .: KIAA06 --------C------------ALVISGDSLEVCL-KYYEYEFMELACQCPAVVCCRCAPT 590 600 610 620 680 690 700 710 720 730 KIAA05 QKSMVVKLVRSKLKAMTLAIGDGANDVSMIQVADVGVGISGQEGMQAVMASDFAVPKFRY ::...:.:.. . .: :.:::.::::::: .: :::. :.:: :: .:.::.. .:.. KIAA06 QKAQIVRLLQERTGKLTCAVGDGGNDVSMIQESDCGVGVEGKEGKQASLAADFSITQFKH 630 640 650 660 670 680 740 750 760 770 780 790 KIAA05 LERLLILHGHWCYSRLANMVLYFFYKNTMFVGLLFWFQFFCGFSASTMIDQWYLIFFNLL : :::..::. :.: : . . .... . . :. : ::. . : .::. KIAA06 LGRLLMVHGRNSYKRSAALSQFVIHRSLCISTMQAVFSSVFYF-ASVPLYQGFLIIGYST 690 700 710 720 730 740 800 810 820 830 840 KIAA05 FSSLPPLVTGVLDRDVPANVLLTNPQLYKSGQNMEEYRP---RTFWFNMADAAFQ-SLVC . .. :. . :::.:: ..: . :.::: .. . :: .:: . . . .: : . KIAA06 IYTMFPVFSLVLDKDVKSEVAMLYPELYK---DLLKGRPLSYKTFLIWVLISIYQGSTIM 750 760 770 780 790 800 850 860 870 880 890 900 KIAA05 FSIPYLAYYDSNVDLFTWGTPIVTIAL-LTFLLHLGIETKTWTWLNWITCGFSVLLFFTV .. : ..:. :. . : .: :: :: ... .:: :: .. .: : . . KIAA06 YGA--LLLFESE---FVHIVAISFTSLILTELLMVALTIQTWHWLMTVAELLS-LACYIA 810 820 830 840 850 910 920 930 940 950 960 KIAA05 ALIYNASCATCYPPSNPYWTMQALLGDPVFYLTCLMTPVAALLPRLFFRSLQGRVFPTQL .:.. KIAA06 SLVFLHEFIDVYFIATLSFLWKVSVITLVSCLPLYVLKYLRRRFSPPSYSKLTS 860 870 880 890 900 910 1163 residues in 1 query sequences 1986342 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:07:16 2008 done: Thu Dec 18 15:07:17 2008 Total Scan time: 0.730 Total Display time: 0.340 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]