# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh01811.fasta.nr -Q ../query/KIAA0564.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0564, 1441 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826796 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6859+/-0.000185; mu= 13.2437+/- 0.010 mean_var=84.3044+/-16.592, 0's: 38 Z-trim: 41 B-trim: 3 in 1/65 Lambda= 0.139685 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|57160636|emb|CAI39586.1| novel protein [Homo sa (1429) 9458 1916.8 0 gi|109120580|ref|XP_001091849.1| PREDICTED: simila (1903) 9389 1903.0 0 gi|73989044|ref|XP_848634.1| PREDICTED: similar to (1904) 8969 1818.4 0 gi|109501906|ref|XP_214237.4| PREDICTED: similar t (2021) 8455 1714.8 0 gi|149266164|ref|XP_920456.3| PREDICTED: hypotheti (1905) 8432 1710.1 0 gi|126337713|ref|XP_001368914.1| PREDICTED: hypoth (1908) 8179 1659.2 0 gi|118084822|ref|XP_425624.2| PREDICTED: hypotheti (1908) 7736 1569.9 0 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1300010F03Rik protein [ (1038) 3484 712.8 3.1e-202 gi|37747612|gb|AAH59997.1| MGC68485 protein [Xenop ( 946) 3082 631.8 7e-178 gi|138519745|gb|AAI35963.1| LOC100125184 protein [ (1032) 3073 630.0 2.6e-177 gi|190588802|gb|EDV28824.1| hypothetical protein T (1828) 2888 592.9 6.9e-166 gi|56403835|emb|CAI29703.1| hypothetical protein [ ( 370) 2418 497.7 6.3e-138 gi|210124419|gb|EEA72115.1| hypothetical protein B (1547) 2214 457.0 4.7e-125 gi|210093454|gb|EEA41657.1| hypothetical protein B ( 449) 2176 449.0 3.5e-123 gi|26326005|dbj|BAC26746.1| unnamed protein produc ( 345) 2095 432.6 2.3e-118 gi|110757434|ref|XP_394829.3| PREDICTED: similar t (1748) 2012 416.3 9.2e-113 gi|212513468|gb|EEB16045.1| conserved hypothetical (1852) 2009 415.7 1.5e-112 gi|91095331|ref|XP_975275.1| PREDICTED: similar to (1083) 1684 350.1 5e-93 gi|167876849|gb|EDS40232.1| conserved hypothetical (1385) 1623 337.9 3e-89 gi|193617887|ref|XP_001946036.1| PREDICTED: simila (1333) 1619 337.1 5.2e-89 gi|108872420|gb|EAT36645.1| conserved hypothetical (1391) 1614 336.1 1.1e-88 gi|157018692|gb|EAA06275.4| AGAP000545-PA [Anophel (1411) 1576 328.4 2.2e-86 gi|187026276|emb|CAP34744.1| Hypothetical protein (1771) 1556 324.4 4.3e-85 gi|152003216|emb|CAA91030.2| C. elegans protein F1 (1804) 1508 314.8 3.6e-82 gi|211970373|emb|CAR97821.1| C. elegans protein F1 (1818) 1508 314.8 3.6e-82 gi|54643982|gb|EAL32725.1| GA11437 [Drosophila pse (1398) 1459 304.8 2.7e-79 gi|194104918|gb|EDW26961.1| GL16500 [Drosophila pe (1400) 1459 304.8 2.7e-79 gi|190622760|gb|EDV38284.1| GF21780 [Drosophila an (1079) 1456 304.1 3.4e-79 gi|193901420|gb|EDW00287.1| GH12781 [Drosophila gr (1386) 1457 304.4 3.6e-79 gi|22831999|gb|AAN09251.1| c12.2 [Drosophila melan (1386) 1452 303.4 7.2e-79 gi|194189259|gb|EDX02843.1| GE17792 [Drosophila ya (1325) 1445 302.0 1.8e-78 gi|190648980|gb|EDV46258.1| GG18311 [Drosophila er (1388) 1445 302.0 1.9e-78 gi|194167078|gb|EDW81979.1| GK25374 [Drosophila wi (1398) 1437 300.4 5.9e-78 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