# /usr/local/bin/fasta34 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hh00165s1.fasta.huge -Q ../query/KIAA0545.ptfa ./tmplib.23663 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0545, 1368 aa vs ./tmplib.23663 library 1986137 residues in 2037 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.2188+/-0.00753; mu= -6.1201+/- 0.503 mean_var=421.5933+/-101.966, 0's: 0 Z-trim: 8 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.062464 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 40, opt: 28, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2037) KIAA0440 ( 1817 res) ah05029 (1817) 3143 299.0 5.1e-81 KIAA1389 ( 1514 res) hh03860 (1514) 3108 295.7 4.1e-80 KIAA0474 ( 782 res) fj12051 ( 782) 672 75.8 3.2e-14 KIAA1039 ( 444 res) fh02337 ( 444) 595 68.6 2.8e-12 KIAA1272 ( 1023 res) hk07611 (1023) 254 38.3 0.0084 >>KIAA0440 ( 1817 res) ah05029 (1817 aa) initn: 3654 init1: 2286 opt: 3143 Z-score: 1546.4 bits: 299.0 E(): 5.1e-81 Smith-Waterman score: 4122; 51.220% identity (71.847% similar) in 1435 aa overlap (1-1359:415-1808) 10 20 30 KIAA05 DLGDDNSNDLLLSCPHFRNEIGGECERNVS : :::.::.:..:::.:::::::: ::..: KIAA04 LVSGPLSHSASFSSPMGSTEDLNSKGSLSMDQGDDKSNELVMSCPYFRNEIGGEGERKIS 390 400 410 420 430 440 40 50 60 70 80 KIAA05 FSRASVGSPSSGEGHLAEPALSAYRTNASISVLEVPKEQQRTQ-SRPRQYSIEHVDLGAR .:... :: :. :. : .::.. :::...:::::::. . .: ..: .::::::: KIAA04 LSKSNSGSFSGCESASFESTLSSHCTNAGVAVLEVPKENLVLHLDRVKRYIVEHVDLGAY 450 460 470 480 490 500 90 100 110 120 130 140 KIAA05 YYQDYFVGKEHANYFGVDEKLGPVAVSIKREKLEDHKEHGPQYQYRIIFRTRELITLRGS ::. .: ::: ::::.::.::::::::.::: .. ::.: :.::::::: ::.::::: KIAA04 YYRKFFYQKEHWNYFGADENLGPVAVSIRREKPDEMKENGSPYNYRIIFRTSELMTLRGS 510 520 530 540 550 560 150 160 170 180 190 200 KIAA05 ILEDATPTATKHGTGRGLPLKDALEYVIPELNIHCLRLALNTPKVTEQLLKLDEQGLCRK .:::: :...::.:.::::::..::.:.::::..:::::.:::::::::.::::::: . KIAA04 VLEDAIPSTAKHSTARGLPLKEVLEHVVPELNVQCLRLAFNTPKVTEQLMKLDEQGLNYQ 570 580 590 600 610 620 210 220 230 240 250 260 KIAA05 HKVGILYCKAGQSSEEEMYNNEEAGPAFEEFLSLIGEKVCLKGFTKYAAQLDVKTDSTGT .::::.:::::::.:::::::: :::::::::.:.::.: :::: :: ::::.::::::: KIAA04 QKVGIMYCKAGQSTEEEMYNNESAGPAFEEFLQLLGERVRLKGFEKYRAQLDTKTDSTGT 630 640 650 660 670 680 270 280 290 300 310 320 KIAA05 HSLYTMYQDYEIMFHVSTLLPYTPNNRQQLLRKRHIGNDIVTIIFQEPGALPFTPKNIRS ::::: :.::::::::::.:::::::.::::::::::::::::.:::::: ::.:::::: KIAA04 HSLYTTYKDYEIMFHVSTMLPYTPNNKQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGAQPFSPKNIRS 690 700 710 720 730 740 330 340 350 360 370 380 KIAA05 HFQHVFIIVRVHNPCTDNVCYSMAVTRSKDAPPFGPPIPSGTTFRKSDVFRDFLLAKVIN ::::::.::::::::.:.::::.:::::.:.: ::::::.:.:: ::.:::::::::::: KIAA04 HFQHVFVIVRVHNPCSDSVCYSVAVTRSRDVPSFGPPIPKGVTFPKSNVFRDFLLAKVIN 750 760 770 780 790 800 390 400 410 420 430 440 KIAA05 AENAAHKSDKFHTMATRTRQEYLKDLAENCVSNTPIDSTGKFNLISLTSKKKEKTKARAG ::::::::.::..:::::::::::::::. :.::::: .::: .:::.::::::.: : KIAA04 AENAAHKSEKFRAMATRTRQEYLKDLAEKNVTNTPIDPSGKFPFISLASKKKEKSKPYPG 810 820 830 840 850 860 450 460 470 480 490 500 KIAA05 AEQHSAGAIAWRVVAQDYAQGVEIDCILGISNEFVVLLDLRTKEVVFNCYCGDVIGWTPD :: : :::.: : :.:: ...:.::.:::::::.::.. .:: ::::: : :::::: KIAA04 AELSSMGAIVWAVRAEDYNKAMELDCLLGISNEFIVLIEQETKSVVFNCSCRDVIGWTST 870 880 890 900 910 920 510 520 530 540 550 560 KIAA05 SSTLKIFYGRGDHIFLQATEGSVEDIREIVQRLKVMTSGWETVDMTLRRNGLGQLGFHVK ...::::: ::. . . .. ..:.:.:::.::. ...: :.:.:::::::::::::::. KIAA04 DTSLKIFYERGECVSV-GSFINIEEIKEIVKRLQFVSKGCESVEMTLRRNGLGQLGFHVN 930 940 950 960 970 980 570 580 590 600 610 620 KIAA05 YDGTVAEVEDYGFAWQAGLRQGSRLVEICKVAVVTLTHDQMIDLLRTSVTVKVVIIPPFE :.: ::.:: ::.::::::::::::::::::::.::.:.::::::::::::::::::: . KIAA04 YEGIVADVEPYGYAWQAGLRQGSRLVEICKVAVATLSHEQMIDLLRTSVTVKVVIIPPHD 990 1000 1010 1020 1030 1040 630 640 650 660 670 680 KIAA05 DGTPRRGWPETYDMNTSEPKTEQESITPGGRPPYRSNAPWQWS---GPASHNSLPASKWA : ::::. ::: : . : : . :... . :.:.: :: . :: :. :. KIAA04 DCTPRRSCSETYRMPVMEYKMN-EGVSYEFKFPFRNNNKWQRNASKGP--HSPQVPSQVQ 1050 1060 1070 1080 1090 1100 690 700 710 720 730 KIAA05 TPTTP----GHAQSLSRPLKQTPIVPFR---ESQPLHSKRPVSFPETPYTVSPAGADRVP .: : :.... : ... .: ...::. .: . ::: . : KIAA04 SPMTSRLNAGKGDGKMPPPERAANIPRSISSDGRPLE-RRLSPGSDIYVTVSSMALARSQ 1110 1120 1130 1140 1150 740 750 760 770 780 790 KIAA05 PYRQPSG--SFSTPGSA--TYVRYKPSPERYTAAPHPLLSLDPHFSH-DGTSSGDSSSGG .::. : : ::. :: : : :: . .. . :.: . .. : .:: :. . KIAA04 CRNSPSNLSSSSDTGSVGGTY-RQKSMPEGFGVSRRSPASIDRQNTQSDIGGSGKSTPSW 1160 1170 1180 1190 1200 1210 800 810 820 830 KIAA05 LTSQES------------------TMERQK-PEPLWHVPAQARLSAIAGSSGNKHPSRQD :..: ..:... :: :.:: ... : . . ::: KIAA04 QRSEDSIADQMAYSYRGPQDFNSFVLEQHEYTEPTCHLPAVSKVLPAFRESPSGRLMRQD 1220 1230 1240 1250 1260 1270 840 850 860 870 880 890 KIAA05 AAGKDSPNRHSKGEPQYSSHSSSNTLSSNASSSHSDDRWFDPLDPLEPEQDPLS--KGGS . . :::...... .::::::::::::::::.:::..:.: : : : . . .: : KIAA04 PVVHLSPNKQGHSDSHYSSHSSSNTLSSNASSAHSDEKWYDG-DRTESELNSYNYLQGTS 1280 1290 1300 1310 1320 1330 900 910 920 930 940 KIAA05 SDSGIDTTLY-TSSPSCMSLAKA---PR--PAKPHKPP----GSMGLCGGGREAAGRSHH .::::::: : : : ::. : :: :.: . : .: . . : .:: KIAA04 ADSGIDTTSYGPSHGSTASLGAATSSPRSGPGKEKVAPLWHSSSEVISMADRTLETESHG 1340 1350 1360 1370 1380 1390 950 960 970 980 990 1000 KIAA05 ADRRREVSPAPAVAGQSKGYRPKLYSSGSSTPTGLAGGSRDPPRQPSDMGSRVGYPAQVY ::. : : . . ..:.. : .:. . : . : :.:: . :. KIAA04 LDRKTESSLSLDIHSKSQAGSTPLTRENSTFSIN------DAASHTSTMSSRHSASPVVF 1400 1410 1420 1430 1440 1450 1010 1020 1030 1040 1050 KIAA05 KTASAETPR-------PSQLAQP-SPFQLSASVPKSFFSKQPVRNKHPTGWKRTEEPPPR .: . .:. ::::: : . :.: :.::. .: . .:. :::. : KIAA04 TSARS-SPKEELHPAAPSQLAPSFSSSSSSSSGPRSFYPRQGATSKYLIGWKKPE-GTIN 1460 1470 1480 1490 1500 1060 1070 1080 1090 1100 1110 KIAA05 PLPFSDPKKQVDTNTKNVFGQPRLRASLRDLR-SPRKNYKSTIEDDLKKLIIMDNLGPEQ . : : .:. ... : ... ::::: :::: ::. . :::::.:::::: ... ::. KIAA04 SVGFMDTRKRHQSDG-NEIAHTRLRASTRDLRASPKPTSKSTIEEDLKKLIDLESPTPES 1510 1520 1530 1540 1550 1560 1120 1130 1140 1150 KIAA05 ERD-------TGQSP-------QKGLQRTLSDESLCSGRREPSFASPAGL-EPGLPSDVL ... . ::: ...:.:::::::. ...:: :.: :.: . .::.::: KIAA04 QKSFKFHALSSPQSPFPSTPTSRRALHRTLSDESIYNSQREHFFTSRASLLDQALPNDVL 1570 1580 1590 1600 1610 1620 1160 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA05 FTSTCAFPS--STLPARRQHQHPHPPVGPGATPAAGSGFPEKKSTISASELSLAD---GR :.:: .:: ..:: :: :. :. .. .:::. ::.: : KIAA04 FSST--YPSLPKSLPLRR--------------PSYTLGMKSLHGEFSASDSSLTDIQETR 1630 1640 1650 1660 1670 1220 1230 1240 1250 1260 1270 KIAA05 DRPLRRLDPGLMPLPDTAAGLEWSSLVNAAKAYEVQRAVSLFSLNDPALSPDIPPAHSPV .:. :::::::::::: :.::.::.:::::::::: :.:. .: : ..: KIAA04 RQPMP--DPGLMPLPDTAADLDWSNLVDAAKAYEVQRA-SFFAASDENHRPLSAASNSD- 1680 1690 1700 1710 1720 1280 1290 1300 1310 1320 1330 KIAA05 HSHLSLERGPPTPRTTPTMSEEPPLDLTGKVYQLEVMLKQLHTDLQKEKQDKVVLQSEVA .:: :. : :.. :..:: ::: :::.:. ::.:::.::. ::.:: KIAA04 ----QLE-DQALPQMKPYSSKDSSPTLASKVDQLEGMLKMLREDLKKEKEDKAHLQAEVQ 1730 1740 1750 1760 1770 1780 1340 1350 1360 KIAA05 SLRQNNQRLQEESQAASEQLRKFAEIFCREKKEL ::..: ::::::: ::..:.::.: KIAA04 HLREDNLRLQEESQNASDKLKKFTEWVFNTIDMS 1790 1800 1810 >>KIAA1389 ( 1514 res) hh03860 (1514 aa) initn: 3487 init1: 2587 opt: 3108 Z-score: 1530.2 bits: 295.7 E(): 4.1e-80 Smith-Waterman score: 3932; 50.179% identity (70.479% similar) in 1399 aa overlap (1-1361:188-1506) 10 20 30 KIAA05 DLGDDNSNDLLLSCPHFRNEIGGECERNVS : :: .::::.::::.:::: ::: .: .. KIAA13 QTQMPTGQTGNCESPLGSKEDLNSKENLDADEGDGKSNDLVLSCPYFRNETGGEGDRRIA 160 170 180 190 200 210 40 50 60 70 80 KIAA05 FSRASVGSPSSGEGHLAEPALSAYRTNASISVLEVPKEQQRTQS-RPRQYSIEHVDLGAR .:::. .: ::::. : .::.. :::..::::::.:.: . . ..: :::.:::: KIAA13 LSRANSSSFSSGESCSFESSLSSHCTNAGVSVLEVPRENQPIHREKVKRYIIEHIDLGAY 220 230 240 250 260 270 90 100 110 120 130 140 KIAA05 YYQDYFVGKEHANYFGVDEKLGPVAVSIKREKLEDHKEH-GPQYQYRIIFRTRELITLRG ::. .: :::: ::::.::.::::::::.:::.:: ::. : :..::. ::: :: :::: KIAA13 YYRKFFYGKEHQNYFGIDENLGPVAVSIRREKVEDAKEKEGSQFNYRVAFRTSELTTLRG 280 290 300 310 320 330 150 160 170 180 190 200 KIAA05 SILEDATPTATKHGTGRGLPLKDALEYVIPELNIHCLRLALNTPKVTEQLLKLDEQGLCR .::::: :....:::.::::::..::::::::.:.::: : :.:::.::::::::::: KIAA13 AILEDAIPSTARHGTARGLPLKEVLEYVIPELSIQCLRQASNSPKVSEQLLKLDEQGLSF 340 350 360 370 380 390 210 220 230 240 250 260 KIAA05 KHKVGILYCKAGQSSEEEMYNNEEAGPAFEEFLSLIGEKVCLKGFTKYAAQLDVKTDSTG .::.::::::::::.:::::::: :::::::::.:.:..: ::::.:: :::: :::::: KIAA13 QHKIGILYCKAGQSTEEEMYNNETAGPAFEEFLDLLGQRVRLKGFSKYRAQLDNKTDSTG 400 410 420 430 440 450 270 280 290 300 310 320 KIAA05 THSLYTMYQDYEIMFHVSTLLPYTPNNRQQLLRKRHIGNDIVTIIFQEPGALPFTPKNIR :::::: :.:::.:::::::::: ::::::::::::::::::::.::::::::::::.:: KIAA13 THSLYTTYKDYELMFHVSTLLPYMPNNRQQLLRKRHIGNDIVTIVFQEPGALPFTPKSIR 460 470 480 490 500 510 330 340 350 360 370 380 KIAA05 SHFQHVFIIVRVHNPCTDNVCYSMAVTRSKDAPPFGPPIPSGTTFRKSDVFRDFLLAKVI :::::::.::.::::::.:::::..:.::::.::::::::.:.:: :: ::::::::::: KIAA13 SHFQHVFVIVKVHNPCTENVCYSVGVSRSKDVPPFGPPIPKGVTFPKSAVFRDFLLAKVI 520 530 540 550 560 570 390 400 410 420 430 440 KIAA05 NAENAAHKSDKFHTMATRTRQEYLKDLAENCVSNTPIDSTGKFNLISLTSKKKEKTKARA :::::::::.::..:::::::::::::::: :... .:.. ::..:.: .:::::.: : KIAA13 NAENAAHKSEKFRAMATRTRQEYLKDLAENFVTTATVDTSVKFSFITLGAKKKEKVKPRK 580 590 600 610 620 630 450 460 470 480 490 500 KIAA05 GAEQHSAGAIAWRVVAQDYAQGVEIDCILGISNEFVVLLDLRTKEVVFNCYCGDVIGWTP :. : ::: :.:.:.:..:...:.:.:::::::..:.. .:.::::: : :::::: KIAA13 DAHLFSIGAIMWHVIARDFGQSADIECLLGISNEFIMLIEKDSKNVVFNCSCRDVIGWTS 640 650 660 670 680 690 510 520 530 540 550 560 KIAA05 DSSTLKIFYGRGDHIFLQATEGSVEDIREIVQRLKVMTSGWETVDMTLRRNGLGQLGFHV ..:.:: ::. ..:..... .:::::::::: ..: : :::.::::::::::::::: KIAA13 GLVSIKVFYERGECVLLSSVDNCAEDIREIVQRLVIVTRGCETVEMTLRRNGLGQLGFHV 700 710 720 730 740 750 570 580 590 600 610 620 KIAA05 KYDGTVAEVEDYGFAWQAGLRQGSRLVEICKVAVVTLTHDQMIDLLRTSVTVKVVIIPPF ...: ::.:: .::::.:::::::::::::::::.::::.::::::::::::::::: : KIAA13 NFEGIVADVEPFGFAWKAGLRQGSRLVEICKVAVATLTHEQMIDLLRTSVTVKVVIIQPH 760 770 780 790 800 810 630 640 650 660 670 680 KIAA05 EDGTPRRGWPETYDMNTSEPKTEQESITPGGRPPYRSNAPWQW-SGPASHNSLPASKWAT .::.:::: : . : : ..:. . :.: :. :. :: . : :. :. KIAA13 DDGSPRRGCSELCRIPMVEYKLDSEGTPCEYKTPFRRNTTWHRVPTPALQ---PLSR-AS 820 830 840 850 860 870 690 700 710 720 730 740 KIAA05 PTTPGHAQSLSRPLKQTPIVPFRESQPLHSKRPVSFPETPYTVSPAGADRVPPYRQPSGS : :: . : : .: ....: : .:: . : :. : : : :.: KIAA13 PI-PGTPDRL--PCQQL----LQQAQAA-IPRSTSFDRK----LPDGT-RSSPSNQSSSS 880 890 900 910 920 750 760 770 780 790 800 KIAA05 FSTPGSATYVRYKPSPERYTAAPHPLLSLDPHFSHDGTSSGDSSSGGLTSQESTMERQK- ::.. : . . : . ::: . :.: :: : .:.::: .. KIAA13 DPGPGGSGPWRPQVG---YDGCQSPLL-----LEHQG--SGPLECDGAREREDTMEASRH 930 940 950 960 970 810 820 830 840 850 860 KIAA05 PEPLWHVPAQARLSAIAGSSGNKHPSRQDAAGKDSPNRHSK-GEPQYSSHSSSNTLSSNA :: :: : : . :: ... ..:.. :::::. :. :. . :::::::::::: KIAA13 PETKWHGPP----SKVLGSY-KERALQKDGSCKDSPNKLSHIGDKSCSSHSSSNTLSSN- 980 990 1000 1010 1020 870 880 890 900 910 920 KIAA05 SSSHSDDRWFDPLDPLEPEQDPLS--KGGSSDSGIDTTLYTSSPSCMSLAKAPRPAKPHK .::.:::. : : ..:: :. ::.:.:::::: .: :: : KIAA13 TSSNSDDKHFGSGDLMDPELLGLTYIKGASTDSGIDT-----AP-CM----------PAT 1030 1040 1050 1060 930 940 950 960 970 980 KIAA05 PPGSMGLCGGGREAAGRSHH-ADRRREVSP--APAVAGQSKGYRPKLYSSGSSTPTGLAG : . : :. .:... :: .: :: . .:: . :.::.. .. KIAA13 ILGPVHLAGSRSLIHSRAEQWADAADVSGPDDEPAKLYSVHGYASAI-SAGSAAEGSM-- 1070 1080 1090 1100 1110 1120 990 1000 1010 1020 1030 KIAA05 GSRDPPRQPSDMGSRVGYP-AQVYKTA-SAETPRPSQLAQPSPFQLSASVPKSFFSKQPV :. . . :. . . : : :. :.. : .. . ... : :. .:. : . .: . KIAA13 GDLSEISSHSSGSHHSGSPSAHCSKSSGSLDSSKVYIVSHSSGQQVPGSMSKPYH-RQGA 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1040 1050 1060 1070 1080 1090 KIAA05 RNKHPTGWKRTEEPPPRPLPFSDPKKQVDTNTKNVFGQPRLRASLRDLRSPRKNYKSTIE ::. :::..: :: : . .. . . .. . : . .. : . KIAA13 VNKYVIGWKKSEGSPPPEEPEVTECPGMYSEMDVMSTATQHQTVVGDAVAETQHVLS--K 1190 1200 1210 1220 1230 1240 1100 1110 1120 1130 1140 1150 KIAA05 DDLKKLIIMDNLGPEQERDT----GQ-SPQKGLQRTLSDESLCSGRREPSFASPAG--LE .:. ::.. :. :. : :. ::...: :::::::.::.:: ::.: . :. KIAA13 EDFLKLMLPDSPLVEEGRRKFSFYGNLSPRRSLYRTLSDESICSNRRGSSFGSSRSSVLD 1250 1260 1270 1280 1290 1300 1160 1170 1180 1190 1200 1210 KIAA05 PGLPSDVLFTSTCAFPSSTLPARRQHQHPHPPVGPGATPAAGSGFPEKKSTISASELSLA .::.:.::..: . :::: : :: : .: .. . :. ::. KIAA13 QALPNDILFSTTPPY-HSTLPPR---AHPAPSMGS------------LRNEFWFSDGSLS 1310 1320 1330 1340 1220 1230 1240 1250 KIAA05 DGRDRPLRRLDPGLMPLPDTAAGLEWSSLVNAAKAYEV------------------QRAV : . :::::::::::.::.:. ::.::.:.: ::.. KIAA13 DKS----KCADPGLMPLPDTATGLDWTHLVDAARAFEGLDSDEELGLLCHHTSYLDQRVA 1350 1360 1370 1380 1390 1400 1260 1270 1280 1290 1300 1310 KIAA05 SLFSLNDPALSPDIPPAHSPVHSHLSLERGPPTPRT-TPTMSEEPPLDLTGKVYQLEVML :. .:.: . :. :. .: : : . . : .:. : ::::: :::..: KIAA13 SFCTLTDMQHGQDLEGAQ-----ELPLCVDPGSGKEFMDTTGERSPSPLTGKVNQLELIL 1410 1420 1430 1440 1450 1320 1330 1340 1350 1360 KIAA05 KQLHTDLQKEKQDKVVLQSEVASLRQNNQRLQEESQAASEQLRKFAEIFCREKKEL .::.:::.::::::.:::.:: :::.:.:::::::.:. :::::.: : KIAA13 RQLQTDLRKEKQDKAVLQAEVQHLRQDNMRLQEESQTATAQLRKFTEWFFTTIDKKS 1460 1470 1480 1490 1500 1510 >>KIAA0474 ( 782 res) fj12051 (782 aa) initn: 771 init1: 413 opt: 672 Z-score: 347.1 bits: 75.8 E(): 3.2e-14 Smith-Waterman score: 757; 37.535% identity (66.106% similar) in 357 aa overlap (62-417:164-500) 40 50 60 70 80 90 KIAA05 SRASVGSPSSGEGHLAEPALSAYRTNASISVLEVPKEQQRTQSRPRQYSIEHVDLGARYY . .: : . :: . ..: . :: : KIAA04 VHEVLGREGPFPLILLPQFGGYWIEGTNHEITSIP-ETEPLQSPTTKVKLE-CNPTARIY 140 150 160 170 180 190 100 110 120 130 140 150 KIAA05 QDYFVGKEHANYFGVDEKLGPVAVSIKREKLEDHKEHGPQYQYRIIFRTRELITLRGSIL . .:.:::: ::...: :: .. :.: . . : .:: :...::. KIAA04 RKHFLGKEHFNYYSLDAALGHLVFSLKYDVIGD-QEH-----LRLLLRTKC------RTY 200 210 220 230 160 170 180 190 200 210 KIAA05 EDATPTATKHGTGRGLP-LKDALEYVIPELNIHCLRLALNTPKVTEQLLKLDEQGLCRKH .:. : . .: . . . : ..:. . .: ::... .. .::. . . KIAA04 HDVIPISCL----TEFPNVVQMAKLVCEDVNVDRFYPVLY-PKASRLIVTFDEHVISNNF 240 250 260 270 280 290 220 230 240 250 260 270 KIAA05 KVGILYCKAGQSSEEEMYNNEEAGPAFEEFLSLIGEKVCLKGFTKYAAQLDVKTDSTGTH : :..: : ::.::::.....: .::: ::: ..:.:: :. : . . ::: .:::. KIAA04 KFGVIYQKLGQTSEEELFSTNEESPAFVEFLEFLGQKVKLQDFKGFRGGLDVTHGQTGTE 300 310 320 330 340 350 280 290 300 310 320 330 KIAA05 SLYTMYQDYEIMFHVSTLLPYTPNNRQQLLRKRHIGNDIVTIIFQEPGALPFTPKNIRSH :.: ... :::::::: :::: .. ::: ::::::::::...::. .. ::.: : :. KIAA04 SVYCNFRNKEIMFHVSTKLPYTEGDAQQLQRKRHIGNDIVAVVFQDENT-PFVPDMIASN 360 370 380 390 400 410 340 350 360 370 380 390 KIAA05 FQHVFIIVRVHNPCTDNVCYSMAVTRSKDAPPFGPPIPSGTTFRKSDVFRDFLLAKVINA : :....:.... :. :...:: :.: ::::.:. ..:::. :..:::.:.::: KIAA04 FLHAYVVVQAEGGGPDGPLYKVSVTARDDVPFFGPPLPDPAVFRKGPEFQEFLLTKLINA 420 430 440 450 460 470 400 410 420 430 440 450 KIAA05 ENAAHKSDKFHTMATRTRQEYLKDLAENCVSNTPIDSTGKFNLISLTSKKKEKTKARAGA : : .:..:: . ::: :. : : KIAA04 EYACYKAEKFAKLEERTRAALLETLYEELHIHSQSMMGLGGDEDKMENGSGGGGFFESFK 480 490 500 510 520 530 >>KIAA1039 ( 444 res) fh02337 (444 aa) initn: 661 init1: 306 opt: 595 Z-score: 312.4 bits: 68.6 E(): 2.8e-12 Smith-Waterman score: 595; 49.733% identity (75.401% similar) in 187 aa overlap (237-423:1-186) 210 220 230 240 250 260 KIAA05 CRKHKVGILYCKAGQSSEEEMYNNEEAGPAFEEFLSLIGEKVCLKGFTKYAAQLDVKTDS :.:::.:.:. . :. : . . ::: . KIAA10 FKEFLDLLGDTITLQDFKGFRGGLDVTHGQ 10 20 30 270 280 290 300 310 320 KIAA05 TGTHSLYTMYQDYEIMFHVSTLLPYTPNNRQQLLRKRHIGNDIVTIIFQEPGALPFTPKN ::..:.:: ..: :::::::: ::.: .. ::: ::::::::::.::::: .. ::.: KIAA10 TGVESVYTTFRDREIMFHVSTKLPFTDGDAQQLQRKRHIGNDIVAIIFQEENT-PFVPDM 40 50 60 70 80 330 340 350 360 370 380 KIAA05 IRSHFQHVFIIVRVHNPCTDNVCYSMAVTRSKDAPPFGPPIPSGTTFRKSDVFRDFLLAK : :.: :..:.:.:..: :.. :...:: .:.: ::::.:: .:.:. ::.:::.: KIAA10 IASNFLHAYIVVQVETPGTETPSYKVSVTAREDVPTFGPPLPSPPVFQKGPEFREFLLTK 90 100 110 120 130 140 390 400 410 420 430 440 KIAA05 VINAENAAHKSDKFHTMATRTRQEYLKDLAENCVSNTPIDSTGKFNLISLTSKKKEKTKA . ::::: ::::: . ::: : .: .. ..: KIAA10 LTNAENACCKSDKFAKLEDRTRAALLDNLHDELHAHTQAMLGLGPEEDKFENGGHGGFLE 150 160 170 180 190 200 450 460 470 480 490 500 KIAA05 RAGAEQHSAGAIAWRVVAQDYAQGVEIDCILGISNEFVVLLDLRTKEVVFNCYCGDVIGW KIAA10 SFKRAIRVRSHSMETMVGGQKKSHSGGIPGSLSGGISHNSMEVTKTTFSPPVVAATVKNQ 210 220 230 240 250 260 >>KIAA1272 ( 1023 res) hk07611 (1023 aa) initn: 192 init1: 95 opt: 254 Z-score: 142.2 bits: 38.3 E(): 0.0084 Smith-Waterman score: 256; 28.837% identity (61.395% similar) in 215 aa overlap (181-393:809-1009) 160 170 180 190 200 KIAA05 LEDATPTATKHGTGRGLPLKDALEYVIPELNIHCLRLALNTPKVTEQLLKLDEQGLCRK- :.: :. .. :. ..: .:: . ::. KIAA12 QPSPVEPRGPFYFCRLLLDDLGMNSWDRRKNFHLLK---KNSKLLRELKNLDSRQ-CRET 780 790 800 810 820 830 210 220 230 240 250 260 KIAA05 HKVGILYCKAGQSSEEEMYNNEEAGPAFEEFLSLIGEKVCLKGFTKYAAQLDVKTDSTGT ::....: :: .. . .::... :.:.:.. .: .: :. . . :. .. ::: KIAA12 HKIAVFYIAEGQEDKCSILSNERGSQAYEDFVAGLGWEVDLSTHCGFMGGLQ-RNGSTGQ 840 850 860 870 880 890 270 280 290 300 310 320 KIAA05 HSLYTMYQDYEIMFHVSTLLPYTPNNRQQLLRK-RHIGNDIVTIIFQEPGALPFTPKNIR . : . :..::::: .: .. ..: .: ::.::: : :...: . . : KIAA12 TAPYYATSTVEVIFHVSTRMP--SDSDDSLTKKLRHLGNDEVHIVWSEH-SRDYRRGIIP 900 910 920 930 940 950 330 340 350 360 370 380 KIAA05 SHFQHVFIIVRVHNPCTDNVCYSMAVTRSKDAPPFGPPIPSGTTFRKSDVFRDFLLAKVI . : : ::. : ... . .:.:.. ..: ::: . .. . : .. ... : : KIAA12 TAFGDVSIIIY---PMKNHMFF-IAITKKPEVPFFGPLFDGAIVSGK--LLPSLVCATCI 960 970 980 990 1000 390 400 410 420 430 440 KIAA05 NAENAAHKSDKFHTMATRTRQEYLKDLAENCVSNTPIDSTGKFNLISLTSKKKEKTKARA :: : KIAA12 NASRAVKCLIPLYQSPRVR 1010 1020 1368 residues in 1 query sequences 1986137 residues in 2037 library sequences Scomplib [34.26] start: Thu Dec 18 15:06:25 2008 done: Thu Dec 18 15:06:27 2008 Total Scan time: 0.800 Total Display time: 0.300 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]