# /hgtech/tools/fasta-34.26.5_v890/fasta34_t -T 8 -b50 -d10 -E0.01 -H -O./tmp/hg03847.fasta.nr -Q ../query/KIAA0535.ptfa /cdna2/lib/nr/nr 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 KIAA0535, 1047 aa vs /cdna2/lib/nr/nr library 2693465022 residues in 7827732 sequences statistics sampled from 60000 to 7826220 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6597+/-0.000191; mu= 11.8583+/- 0.011 mean_var=92.9955+/-18.065, 0's: 32 Z-trim: 37 B-trim: 0 in 0/67 Lambda= 0.132997 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(7827732) gi|114620080|ref|XP_528132.2| PREDICTED: suppressi (1047) 6994 1353.0 0 gi|194214933|ref|XP_001488773.2| PREDICTED: simila (1050) 6478 1254.0 0 gi|73999356|ref|XP_544076.2| PREDICTED: similar to (1031) 6369 1233.1 0 gi|149060963|gb|EDM11573.1| suppression of tumorig (1044) 6020 1166.2 0 gi|77628157|ref|NP_695222.2| suppression of tumori (1044) 6016 1165.4 0 gi|194672909|ref|XP_616463.4| PREDICTED: similar t (1134) 6010 1164.3 0 gi|94730576|sp|Q80TY4.2|ST18_MOUSE RecName: Full=S (1045) 5948 1152.3 0 gi|148596800|dbj|BAF63627.1| neural zinc finger pr (1045) 5944 1151.6 0 gi|74181162|dbj|BAE27844.1| unnamed protein produc (1045) 5942 1151.2 0 gi|74210290|dbj|BAE23351.1| unnamed protein produc (1045) 5939 1150.6 0 gi|1531645|gb|AAB40717.1| C2-HC type zinc finger p (1023) 5890 1141.2 0 gi|94730577|sp|Q9QX27.2|ST18_RAT RecName: Full=Sup (1032) 5889 1141.0 0 gi|2914751|gb|AAC40048.1| neural zinc finger facto (1032) 5867 1136.8 0 gi|149060964|gb|EDM11574.1| suppression of tumorig (1009) 5839 1131.4 0 gi|21595495|gb|AAH32273.1| St18 protein [Mus muscu ( 760) 4643 901.8 0 gi|74227511|dbj|BAE21817.1| unnamed protein produc ( 802) 4421 859.3 0 gi|119607122|gb|EAW86716.1| suppression of tumorig ( 617) 4167 810.4 0 gi|74200617|dbj|BAE24709.1| unnamed protein produc ( 615) 3256 635.6 2.3e-179 gi|47220361|emb|CAF98460.1| unnamed protein produc (1009) 3184 622.0 4.8e-175 gi|149734182|ref|XP_001495632.1| PREDICTED: simila (1094) 2569 504.0 1.7e-139 gi|149636000|ref|XP_001508606.1| PREDICTED: simila (1136) 2537 497.9 1.2e-137 gi|149033885|gb|EDL88668.1| myelin transcription f ( 922) 2506 491.9 6.5e-136 gi|148675515|gb|EDL07462.1| myelin transcription f (1078) 2502 491.2 1.2e-135 gi|76363256|sp|Q8CFC2.1|MYT1_MOUSE RecName: Full=M (1127) 2502 491.2 1.3e-135 gi|123232095|emb|CAM20796.1| myelin transcription (1169) 2502 491.2 1.3e-135 gi|148675514|gb|EDL07461.1| myelin transcription f (1008) 2491 489.0 5.1e-135 gi|13638422|sp|Q01538.2|MYT1_HUMAN RecName: Full=M (1121) 2484 487.7 1.4e-134 gi|73992779|ref|XP_543112.2| PREDICTED: similar to (1312) 2476 486.2 4.6e-134 gi|2209115|gb|AAC53456.1| myelin transcription fac (1078) 2474 485.8 5.2e-134 gi|76668584|ref|XP_581853.2| PREDICTED: similar to (1100) 2466 484.3 1.5e-133 gi|114683167|ref|XP_514796.2| PREDICTED: myelin tr ( 867) 2394 470.4 1.8e-129 gi|124297191|gb|AAI31678.1| Myt1l protein [Mus mus (1185) 2260 444.8 1.3e-121 gi|148704990|gb|EDL36937.1| myelin transcription f (1210) 2260 444.8 1.3e-121 gi|148271081|ref|NP_001087247.1| myelin transcript (1184) 2258 444.4 1.7e-121 gi|148271075|ref|NP_032692.2| myelin transcription (1185) 2258 444.4 1.7e-121 gi|149051058|gb|EDM03231.1| myelin transcription f (1185) 2257 444.2 1.9e-121 gi|111598918|gb|AAH94438.1| Myt1l protein [Mus mus (1185) 2255 443.8 2.5e-121 gi|152012544|gb|AAI50282.1| MYT1L protein [Homo sa (1132) 2249 442.6 5.3e-121 gi|187952561|gb|AAI37274.1| Myelin transcription f (1184) 2249 442.6 5.5e-121 gi|194220996|ref|XP_001503699.2| PREDICTED: simila (1185) 2246 442.1 8.2e-121 gi|73979689|ref|XP_540068.2| PREDICTED: similar to (1183) 2243 441.5 1.2e-120 gi|76363255|sp|P70475.2|MYT1L_RAT RecName: Full=My (1187) 2238 440.5 2.4e-120 gi|1531647|gb|AAB40718.1| C2-HC type zinc finger p ( 815) 2231 439.1 4.5e-120 gi|148704992|gb|EDL36939.1| myelin transcription f (1186) 2227 438.4 1e-119 gi|76363254|sp|P97500.2|MYT1L_MOUSE RecName: Full= (1187) 2227 438.4 1e-119 gi|1835755|gb|AAC53157.1| zinc finger protein Png- (1188) 2227 438.4 1e-119 gi|148704991|gb|EDL36938.1| myelin transcription f (1213) 2227 438.4 1e-119 gi|148271077|ref|NP_001087244.1| myelin transcript (1187) 2225 438.0 1.3e-119 gi|1511632|gb|AAC52728.1| neural zinc finger facto (1187) 2223 437.7 1.7e-119 gi|76789661|sp|Q9UL68.2|MYT1L_HUMAN RecName: Full= (1186) 2221 437.3 2.3e-119 >>gi|114620080|ref|XP_528132.2| PREDICTED: suppression o (1047 aa) initn: 6994 init1: 6994 opt: 6994 Z-score: 7249.5 bits: 1353.0 E(): 0 Smith-Waterman score: 6994; 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